Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400024153
CDS Infomation

pacid=37474790 polypeptide=PGSC0003DMP400016488 locus=PGSC0003DMG400009336 ID=PGSC0003DMT400024153.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTGCGGAAGTGGTACAACTACTACTACTATGTTGCCTGAAGTTTGTGGATCTAGCTTC
CTTTTATCACTGCCTGATGACGTGTTTGCGATAGTAAGTAGATCACTTTCACCAAGGGAT
GTATGTAATCTTGGTTTATGCTGTAGAAACTTGCATGATTTAGCTGCCTCTGAGAAGGTT
TGGCTATCGCAATGTGAAATGCTTGGGGTGGTTCCTTATCGGGACGTTATTGAATGGCGA
AAGGGAGTTTGTTCCTACAAGGCGCTTTGTCACTTCCTTGTAAGCATAAAGCCTTTGCTT
GGTATTTGGGTTCATCAAAATCCTGAACTTGGCAATGTTGTTTATGTTATGCCTGGTTTT
ATCTCCGCAGTTGGTTGTCGGATTATTCCCCAAGAACTCGGTCCATTAGGCCTTGAAGAC
AGTCCAATTTTGTGGTCGCCTGTATTTGAAGTCGTTTCTGATTTTGAGGGTTCTGCTGCG
TTTTTCCTTCATGGTAGGGAGAATGGAACTGACTATGTTTATCCTGGTTCACTCAAGAAG
GTCGAGAGGACTTGCAATGTGCTTCTGTTAGAGGTTGAGCCTCAGCAGTACACAAGTGGG
GGTAAGTTGTTCCACAGCAAGAGTTTTATTCATCCTTCAGAGAATGAGGCATCACGGAAG
ATATGCAGATCCAATAGTGGGGTTTCTGTGTCAGAGAAGGTAACGGAACAGCGTGCAACA
ACAGTGCCCTTTGGCCGGCTTGCATTTGCTGATAGGAGAAAGTTGCTTGACACAGTTACT
AACCAAGTTCGTCAAACGCTGCCAGATGCTAAAGATGCCATATTATTTCCTCGTTTGAGA
AGAGAGGAGGCTGATTTACGAGAGAATATGAAACTCTTGTATGAAAGGAGATTGCTCTTT
ATGCAAATGTACGATGGTGGTGGTGGTTTTACTGTCTGGAAGGCTGGTTCTGAGTTGCCT
TTGCATCCTTCTCCTGTTGGATTGAGTGAGTTCAGACAGAATCTTGATCTGATAAGTGGC
TGTCATGCATCACAAACTGCTACTGATCATGAGAGTCGGAGTCGGAAGTCACTGGCTGGA
TATGTTAAACACAGTCTAAAATATATACTCAAGAAGTCAAACTCTATCAATGGCAAACGT
GATCTCCTTGGAAAGAATTCCTCTGGCCACGGAAGTAAGCATGCCCAGCTTCACGAGTTC
TTGCAGCCAGGTGATGCAATAGGGCTGACATTACATGCTTCAACTGTGAAGTTATCCTCT
TATCGTGCTTGGCCAAATATGCACGAAAGTAAATATGCTCTGTACAAGTTGCCTATGCGG
GCACCAGAAGTGGGCCAAGAATATGCTGGTGTATGGGGAGGGACTTTTGGTTGGCCCCCG
GGGAGGCCTTCTGATGATAAGCCCGGAAAAGCATTGTTTCTTCTTTTGTTGTCTTATGAG
GAGTCCCAAGGTCAGAAGCTACTTATTGCGACCAAGATATTAGAAGGTACACATTATGTT
TTGCATCCTAATGGCTCAGCTATGTTTATAGTAAATATTGAAGAGCCTTCGAATGATCCA
TTCCCTTGGTGCACCGATGGGCATGATTCCAACCCTGTAGATGTTAAGCATGCTTTTACG
GGTGAAGGTATTGCTAACGGGTATGGTTTTCGATATCCTGGTTCAAAACCTGGTTCACTC
TTTGTAATCCATGATAAAATGCTTGCTTTTATATGGAAGGAGTCCAGGTCTGTGTTGGCC
TTGCAGAGGCTCGATTTGCAAGAGGTTTTGAGCAAGGGGGAAAGGATCCCTGCTCTACCT
CCGGTTTCCAATTTTGCATACCTTACCAGGTCCTATTCAAATGTGTTTGCCAATGGTCTG
ACTTCACCAAGGCAGAATCATCCGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400016488
PEP Infomation

pacid=37474790 transcript=PGSC0003DMT400024153 locus=PGSC0003DMG400009336 ID=PGSC0003DMT400024153.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MCGSGTTTTTMLPEVCGSSFLLSLPDDVFAIVSRSLSPRDVCNLGLCCRNLHDLAASEKV
WLSQCEMLGVVPYRDVIEWRKGVCSYKALCHFLVSIKPLLGIWVHQNPELGNVVYVMPGF
ISAVGCRIIPQELGPLGLEDSPILWSPVFEVVSDFEGSAAFFLHGRENGTDYVYPGSLKK
VERTCNVLLLEVEPQQYTSGGKLFHSKSFIHPSENEASRKICRSNSGVSVSEKVTEQRAT
TVPFGRLAFADRRKLLDTVTNQVRQTLPDAKDAILFPRLRREEADLRENMKLLYERRLLF
MQMYDGGGGFTVWKAGSELPLHPSPVGLSEFRQNLDLISGCHASQTATDHESRSRKSLAG
YVKHSLKYILKKSNSINGKRDLLGKNSSGHGSKHAQLHEFLQPGDAIGLTLHASTVKLSS
YRAWPNMHESKYALYKLPMRAPEVGQEYAGVWGGTFGWPPGRPSDDKPGKALFLLLLSYE
ESQGQKLLIATKILEGTHYVLHPNGSAMFIVNIEEPSNDPFPWCTDGHDSNPVDVKHAFT
GEGIANGYGFRYPGSKPGSLFVIHDKMLAFIWKESRSVLALQRLDLQEVLSKGERIPALP
PVSNFAYLTRSYSNVFANGLTSPRQNHP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400024153
Transcript Infomation

pacid=37474790 locus=PGSC0003DMG400009336 ID=PGSC0003DMT400024153.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTGCGGAAGTGGTACAACTACTACTACTATGTTGCCTGAAGTTTGTGGATCTAGCTTC
CTTTTATCACTGCCTGATGACGTGTTTGCGATAGTAAGTAGATCACTTTCACCAAGGGAT
GTATGTAATCTTGGTTTATGCTGTAGAAACTTGCATGATTTAGCTGCCTCTGAGAAGGTT
TGGCTATCGCAATGTGAAATGCTTGGGGTGGTTCCTTATCGGGACGTTATTGAATGGCGA
AAGGGAGTTTGTTCCTACAAGGCGCTTTGTCACTTCCTTGTAAGCATAAAGCCTTTGCTT
GGTATTTGGGTTCATCAAAATCCTGAACTTGGCAATGTTGTTTATGTTATGCCTGGTTTT
ATCTCCGCAGTTGGTTGTCGGATTATTCCCCAAGAACTCGGTCCATTAGGCCTTGAAGAC
AGTCCAATTTTGTGGTCGCCTGTATTTGAAGTCGTTTCTGATTTTGAGGGTTCTGCTGCG
TTTTTCCTTCATGGTAGGGAGAATGGAACTGACTATGTTTATCCTGGTTCACTCAAGAAG
GTCGAGAGGACTTGCAATGTGCTTCTGTTAGAGGTTGAGCCTCAGCAGTACACAAGTGGG
GGTAAGTTGTTCCACAGCAAGAGTTTTATTCATCCTTCAGAGAATGAGGCATCACGGAAG
ATATGCAGATCCAATAGTGGGGTTTCTGTGTCAGAGAAGGTAACGGAACAGCGTGCAACA
ACAGTGCCCTTTGGCCGGCTTGCATTTGCTGATAGGAGAAAGTTGCTTGACACAGTTACT
AACCAAGTTCGTCAAACGCTGCCAGATGCTAAAGATGCCATATTATTTCCTCGTTTGAGA
AGAGAGGAGGCTGATTTACGAGAGAATATGAAACTCTTGTATGAAAGGAGATTGCTCTTT
ATGCAAATGTACGATGGTGGTGGTGGTTTTACTGTCTGGAAGGCTGGTTCTGAGTTGCCT
TTGCATCCTTCTCCTGTTGGATTGAGTGAGTTCAGACAGAATCTTGATCTGATAAGTGGC
TGTCATGCATCACAAACTGCTACTGATCATGAGAGTCGGAGTCGGAAGTCACTGGCTGGA
TATGTTAAACACAGTCTAAAATATATACTCAAGAAGTCAAACTCTATCAATGGCAAACGT
GATCTCCTTGGAAAGAATTCCTCTGGCCACGGAAGTAAGCATGCCCAGCTTCACGAGTTC
TTGCAGCCAGGTGATGCAATAGGGCTGACATTACATGCTTCAACTGTGAAGTTATCCTCT
TATCGTGCTTGGCCAAATATGCACGAAAGTAAATATGCTCTGTACAAGTTGCCTATGCGG
GCACCAGAAGTGGGCCAAGAATATGCTGGTGTATGGGGAGGGACTTTTGGTTGGCCCCCG
GGGAGGCCTTCTGATGATAAGCCCGGAAAAGCATTGTTTCTTCTTTTGTTGTCTTATGAG
GAGTCCCAAGGTCAGAAGCTACTTATTGCGACCAAGATATTAGAAGGTACACATTATGTT
TTGCATCCTAATGGCTCAGCTATGTTTATAGTAAATATTGAAGAGCCTTCGAATGATCCA
TTCCCTTGGTGCACCGATGGGCATGATTCCAACCCTGTAGATGTTAAGCATGCTTTTACG
GGTGAAGGTATTGCTAACGGGTATGGTTTTCGATATCCTGGTTCAAAACCTGGTTCACTC
TTTGTAATCCATGATAAAATGCTTGCTTTTATATGGAAGGAGTCCAGGTCTGTGTTGGCC
TTGCAGAGGCTCGATTTGCAAGAGGTTTTGAGCAAGGGGGAAAGGATCCCTGCTCTACCT
CCGGTTTCCAATTTTGCATACCTTACCAGGTCCTATTCAAATGTGTTTGCCAATGGTCTG
ACTTCACCAAGGCAGAATCATCCGTAG