Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400023895
CDS Infomation

pacid=37464673 polypeptide=PGSC0003DMP400016300 locus=PGSC0003DMG400009239 ID=PGSC0003DMT400023895.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTTCAATTAGGTCAATTTCCAATACACTTGACACTAAAACTTGCTTTGAGCTTCTT
AAGACTTGCAAATCCATTACAAAACTCAAACAAATCCATGCCCAAGTTATCATTCTCAAT
TTCCACAAACACATTGGCATTTTACACAAGCTATTAGCTTTTACCACTCATGATGATACA
GACTTTAATTACGCCAAGAAAATCTTTAGTTGCTGTGAGAACCGAACATTGTTTATGTAC
AATGTAATGATTAAAGGGTATGTGAAAACGGGTCAATTCAAGAAACCCCTTTTCTTGTTT
GATGAATTAAGAATACATGGCTTGTTTCCTGATAATTTTACTTACCCATTTGTGTTTAAA
GCTATTGGTGAGTTGAAAATGGTGAAAGGAGGTGAAAAGATTCATGGGTATGTCTTGAAA
TCTGGTGTTTTGTTTGATAACTATGTGGGTAATTCTGTTATGGATATGTATGGTTTGTTT
GGTTATGTGGAGAGTTTGAACAAGGTGTTTGATGAAATGCCTCAGAGAGATTCGGTTGCT
TGGAATATATTGATTTCTGGATTTGTTAGATGTGGTAGGTTTCGGGATGCTGTTGTGGTT
TACAAGAAGATGAGGGAGGAAAATGGTGCTAGGCCTGATGAAGCTACAGTTGTGAGTACT
TTGTCAGCTTGCGCTGCGTTGAAAAGCTTGGAACTTGGTAGAGAAATTCATGGATATGTT
GTTGAAGAGCTTGAGTTCAGCCTTATTATTGGGAATGCATTGGTAGATATGTATTGTAAG
TGTGGGTGTTTGATGGTGGCTAGGGAGATATTTGATGATATGCCAATGAAAAATGTGATA
TGTTGGACTAGTATGGTGTCGGGGTATGTTAATAGTGGTCAATTGGATGAAGCTAGAAAG
CTTTTTGAGAGGAGTCCAGTAAGGGATCTAGTTCTGTGGACAACTATGATTAATGGGTAT
GTGCAATTCAATCGTGTTGATGATGCAATGGACCTATTTCGTTCGATGCAAATGCAGGGA
ATTAAACCTGACAAATACACACTGGTTGCTCTTCTCACTGGTTGTGCTCAGTTAGGAGCC
CTGCAGCAAGGGGAATGGATTCATGATTACATGAAGGAAAACAGAATAACTGTTACTGCC
GTTGTTGGTACTGCCCTTATAGAGATGTATGCAAAGTGTGGTTGTATAGAAAAATCGATG
GAAATATTTGATGAATTAGAGGAGAAAGACACTGCATCTTGGACTTCAATTATTTGTTCT
CTAGCCATGAGCGGGAACACTAGGAAGGCACTGGAACTGTTCTCAGAAATGGAACAAGCT
GGATTTCACCCTGATGATATCACTTATATTGGAGTGTTAAGTGCATGTAGCCATGGGGGC
TTGGTAGAAGAAGGTCGCAAGTATTTCCATGCAATGAGTAGGATTCATGCAATTCAGCCA
AAATTAGAACATTATGGTTGTTTGATAGACCTACTTGGTCGTGCTGGGCTCCTAAGTGAA
GCTGAAGTAATGATATCTCAGATACCCAATAGAGACAATGAGATTATAGTTCCAATATAC
GGGGCTTTGCTCAGTGCCTGCAGAATTTACGGCAATGTTGATGTTGGTGAACGTGTGGCT
GAACTGCTCATGGAGATTGAATCTTATGATTCTAGCACTCATACACTTCTGGCAAACACC
TATGCATCTGCTGGCAGATGGGAAGATGTATTAAAGGTCAGAGGAACTATGAGGGATTTA
GGTGTTAAGAAGTCACCTGGATGCAGTTCAATTGATATCAGTGGAAATGTGCACGAGTTC
ATTGTTGGACATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400016300
PEP Infomation

pacid=37464673 transcript=PGSC0003DMT400023895 locus=PGSC0003DMG400009239 ID=PGSC0003DMT400023895.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSSIRSISNTLDTKTCFELLKTCKSITKLKQIHAQVIILNFHKHIGILHKLLAFTTHDDT
DFNYAKKIFSCCENRTLFMYNVMIKGYVKTGQFKKPLFLFDELRIHGLFPDNFTYPFVFK
AIGELKMVKGGEKIHGYVLKSGVLFDNYVGNSVMDMYGLFGYVESLNKVFDEMPQRDSVA
WNILISGFVRCGRFRDAVVVYKKMREENGARPDEATVVSTLSACAALKSLELGREIHGYV
VEELEFSLIIGNALVDMYCKCGCLMVAREIFDDMPMKNVICWTSMVSGYVNSGQLDEARK
LFERSPVRDLVLWTTMINGYVQFNRVDDAMDLFRSMQMQGIKPDKYTLVALLTGCAQLGA
LQQGEWIHDYMKENRITVTAVVGTALIEMYAKCGCIEKSMEIFDELEEKDTASWTSIICS
LAMSGNTRKALELFSEMEQAGFHPDDITYIGVLSACSHGGLVEEGRKYFHAMSRIHAIQP
KLEHYGCLIDLLGRAGLLSEAEVMISQIPNRDNEIIVPIYGALLSACRIYGNVDVGERVA
ELLMEIESYDSSTHTLLANTYASAGRWEDVLKVRGTMRDLGVKKSPGCSSIDISGNVHEF
IVGH*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400023895
Transcript Infomation

pacid=37464673 locus=PGSC0003DMG400009239 ID=PGSC0003DMT400023895.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTTCAATTAGGTCAATTTCCAATACACTTGACACTAAAACTTGCTTTGAGCTTCTT
AAGACTTGCAAATCCATTACAAAACTCAAACAAATCCATGCCCAAGTTATCATTCTCAAT
TTCCACAAACACATTGGCATTTTACACAAGCTATTAGCTTTTACCACTCATGATGATACA
GACTTTAATTACGCCAAGAAAATCTTTAGTTGCTGTGAGAACCGAACATTGTTTATGTAC
AATGTAATGATTAAAGGGTATGTGAAAACGGGTCAATTCAAGAAACCCCTTTTCTTGTTT
GATGAATTAAGAATACATGGCTTGTTTCCTGATAATTTTACTTACCCATTTGTGTTTAAA
GCTATTGGTGAGTTGAAAATGGTGAAAGGAGGTGAAAAGATTCATGGGTATGTCTTGAAA
TCTGGTGTTTTGTTTGATAACTATGTGGGTAATTCTGTTATGGATATGTATGGTTTGTTT
GGTTATGTGGAGAGTTTGAACAAGGTGTTTGATGAAATGCCTCAGAGAGATTCGGTTGCT
TGGAATATATTGATTTCTGGATTTGTTAGATGTGGTAGGTTTCGGGATGCTGTTGTGGTT
TACAAGAAGATGAGGGAGGAAAATGGTGCTAGGCCTGATGAAGCTACAGTTGTGAGTACT
TTGTCAGCTTGCGCTGCGTTGAAAAGCTTGGAACTTGGTAGAGAAATTCATGGATATGTT
GTTGAAGAGCTTGAGTTCAGCCTTATTATTGGGAATGCATTGGTAGATATGTATTGTAAG
TGTGGGTGTTTGATGGTGGCTAGGGAGATATTTGATGATATGCCAATGAAAAATGTGATA
TGTTGGACTAGTATGGTGTCGGGGTATGTTAATAGTGGTCAATTGGATGAAGCTAGAAAG
CTTTTTGAGAGGAGTCCAGTAAGGGATCTAGTTCTGTGGACAACTATGATTAATGGGTAT
GTGCAATTCAATCGTGTTGATGATGCAATGGACCTATTTCGTTCGATGCAAATGCAGGGA
ATTAAACCTGACAAATACACACTGGTTGCTCTTCTCACTGGTTGTGCTCAGTTAGGAGCC
CTGCAGCAAGGGGAATGGATTCATGATTACATGAAGGAAAACAGAATAACTGTTACTGCC
GTTGTTGGTACTGCCCTTATAGAGATGTATGCAAAGTGTGGTTGTATAGAAAAATCGATG
GAAATATTTGATGAATTAGAGGAGAAAGACACTGCATCTTGGACTTCAATTATTTGTTCT
CTAGCCATGAGCGGGAACACTAGGAAGGCACTGGAACTGTTCTCAGAAATGGAACAAGCT
GGATTTCACCCTGATGATATCACTTATATTGGAGTGTTAAGTGCATGTAGCCATGGGGGC
TTGGTAGAAGAAGGTCGCAAGTATTTCCATGCAATGAGTAGGATTCATGCAATTCAGCCA
AAATTAGAACATTATGGTTGTTTGATAGACCTACTTGGTCGTGCTGGGCTCCTAAGTGAA
GCTGAAGTAATGATATCTCAGATACCCAATAGAGACAATGAGATTATAGTTCCAATATAC
GGGGCTTTGCTCAGTGCCTGCAGAATTTACGGCAATGTTGATGTTGGTGAACGTGTGGCT
GAACTGCTCATGGAGATTGAATCTTATGATTCTAGCACTCATACACTTCTGGCAAACACC
TATGCATCTGCTGGCAGATGGGAAGATGTATTAAAGGTCAGAGGAACTATGAGGGATTTA
GGTGTTAAGAAGTCACCTGGATGCAGTTCAATTGATATCAGTGGAAATGTGCACGAGTTC
ATTGTTGGACATTAA