Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400023794
CDS Infomation

pacid=37464164 polypeptide=PGSC0003DMP400016236 locus=PGSC0003DMG400009208 ID=PGSC0003DMT400023794.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGAGAAAGACCCTGATTTTTTCTCCCACAAACTGCCTACTGCTTCTCAGGTGGTG
GAGGAATTGAAGGAGCTATGGGGAATGGCTTTGCCAATAACAGCAATGAACTGCTTAGTC
TATGTTAGAGCAGTGGTTTCTGTTCTATTCTTGGGAAGGCTTGGAAGTCTAGAACTTGCT
GGTGGAGCACTTTCCATTGGGTTCACAAACATAACTGGTTACTCTGTTCTTGTTGGTCTT
GCTTCAGGTCTTGAGCCTGTTTGTAGCCAAGCTTATGGAAGCAAGAACTGGGACTTGCTT
TCACAGTCTCTACAACGTATGATTTGCATACTTTTGTTGGCTATCATTCCAATAAGTCTT
CTGTGGATTAATCTTGAGGGAATCATGCTTTTCATGCGTCAAGACAAGGAAATAACAGCA
ATGGCTGCAACTTACTGTATCTATTCACTCCCTGATCTTGCAACAAACACTTTGTTACAG
CCTCTGAGGGTGTATCTGAGGTCACAGGGGGTGACTAAGCCTCAGATGTGGTGTACTTTT
GTGGCAGTGCTCTTTCATGTGCCCTTGAACTATTTTTTGGTTGTGGTGATGGGGCTAGGA
GTTCCAGGAGTTGCTATGGCTTCAGTGCTGACTAATCTGCATATGATGGTACTGATGATG
GGGTATGTCTATGTTTATGGGAGGTGGGAGTGGAGATGGACGGATGGGATTGGAGGGATT
TGTGGTGGATTGGGGCCACTGCTGAAGTTGGCAGTTCCTAGTTGTATAGGTATCTGTTTA
GAATGGTGGTGGTATGAGATTGTAACTGTTCTTGCTGGATATTTGCCTAATCCAAGGCTT
GCTGTGGCTGCTACCGGGATTATGATACAGACCACTAGCCTTATGTACACTGTTCCCATG
GCCTTGGCAGGCTGTGTATCTGCTAGGGTCGGGAACGAGTTAGGATCTGGGAAACCATAC
AAAGCGAAGTTAGCTGCAGTAGTTGCATTAGCTTGTGCGTTTGTCATTGGATTCATAAAC
GTTATATGGACGGTAATCTTCAGGAACAAATGGGGAGGCCTATTTACAAAAGATGAGATG
CTTCAAGCACTTGTCGCATCAGTTTTACCAATAATAGGTTTGTGTGAGCTGGGTAACTGT
CCTCAGACCACCGGTTGTGGAATACTCCGTGGAACAGCTCAGCCGGTTATAGGTGCCCGG
ATCAACCTCGGCTCGTTTTACTTCGTTGGCACTCCGGTAGCATTATGCTTAGCCTTCTGG
CTAAAAGTTGGTTTTAGTGGTCTATGGTATGGTCTGTTATCAGCTCAAGCAGCCTGTGCT
ATCTCAATTCTATATACTGTCCATTGCTGCACAGATTGGGAAGGCGAGGCGTTGAAAGCG
AAGCGACTAACCAACTTGGAGATGATGGGACATAGAGATGGCACTAGTGATGATGAACAA
AATGTCCTTTTGGTTAATGAGATGATCAAGGACAAGTTTGATGATGTTCCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400016236
PEP Infomation

pacid=37464164 transcript=PGSC0003DMT400023794 locus=PGSC0003DMG400009208 ID=PGSC0003DMT400023794.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAEKDPDFFSHKLPTASQVVEELKELWGMALPITAMNCLVYVRAVVSVLFLGRLGSLELA
GGALSIGFTNITGYSVLVGLASGLEPVCSQAYGSKNWDLLSQSLQRMICILLLAIIPISL
LWINLEGIMLFMRQDKEITAMAATYCIYSLPDLATNTLLQPLRVYLRSQGVTKPQMWCTF
VAVLFHVPLNYFLVVVMGLGVPGVAMASVLTNLHMMVLMMGYVYVYGRWEWRWTDGIGGI
CGGLGPLLKLAVPSCIGICLEWWWYEIVTVLAGYLPNPRLAVAATGIMIQTTSLMYTVPM
ALAGCVSARVGNELGSGKPYKAKLAAVVALACAFVIGFINVIWTVIFRNKWGGLFTKDEM
LQALVASVLPIIGLCELGNCPQTTGCGILRGTAQPVIGARINLGSFYFVGTPVALCLAFW
LKVGFSGLWYGLLSAQAACAISILYTVHCCTDWEGEALKAKRLTNLEMMGHRDGTSDDEQ
NVLLVNEMIKDKFDDVP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400023794
Transcript Infomation

pacid=37464164 locus=PGSC0003DMG400009208 ID=PGSC0003DMT400023794.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGGAGAAAGACCCTGATTTTTTCTCCCACAAACTGCCTACTGCTTCTCAGGTGGTG
GAGGAATTGAAGGAGCTATGGGGAATGGCTTTGCCAATAACAGCAATGAACTGCTTAGTC
TATGTTAGAGCAGTGGTTTCTGTTCTATTCTTGGGAAGGCTTGGAAGTCTAGAACTTGCT
GGTGGAGCACTTTCCATTGGGTTCACAAACATAACTGGTTACTCTGTTCTTGTTGGTCTT
GCTTCAGGTCTTGAGCCTGTTTGTAGCCAAGCTTATGGAAGCAAGAACTGGGACTTGCTT
TCACAGTCTCTACAACGTATGATTTGCATACTTTTGTTGGCTATCATTCCAATAAGTCTT
CTGTGGATTAATCTTGAGGGAATCATGCTTTTCATGCGTCAAGACAAGGAAATAACAGCA
ATGGCTGCAACTTACTGTATCTATTCACTCCCTGATCTTGCAACAAACACTTTGTTACAG
CCTCTGAGGGTGTATCTGAGGTCACAGGGGGTGACTAAGCCTCAGATGTGGTGTACTTTT
GTGGCAGTGCTCTTTCATGTGCCCTTGAACTATTTTTTGGTTGTGGTGATGGGGCTAGGA
GTTCCAGGAGTTGCTATGGCTTCAGTGCTGACTAATCTGCATATGATGGTACTGATGATG
GGGTATGTCTATGTTTATGGGAGGTGGGAGTGGAGATGGACGGATGGGATTGGAGGGATT
TGTGGTGGATTGGGGCCACTGCTGAAGTTGGCAGTTCCTAGTTGTATAGGTATCTGTTTA
GAATGGTGGTGGTATGAGATTGTAACTGTTCTTGCTGGATATTTGCCTAATCCAAGGCTT
GCTGTGGCTGCTACCGGGATTATGATACAGACCACTAGCCTTATGTACACTGTTCCCATG
GCCTTGGCAGGCTGTGTATCTGCTAGGGTCGGGAACGAGTTAGGATCTGGGAAACCATAC
AAAGCGAAGTTAGCTGCAGTAGTTGCATTAGCTTGTGCGTTTGTCATTGGATTCATAAAC
GTTATATGGACGGTAATCTTCAGGAACAAATGGGGAGGCCTATTTACAAAAGATGAGATG
CTTCAAGCACTTGTCGCATCAGTTTTACCAATAATAGGTTTGTGTGAGCTGGGTAACTGT
CCTCAGACCACCGGTTGTGGAATACTCCGTGGAACAGCTCAGCCGGTTATAGGTGCCCGG
ATCAACCTCGGCTCGTTTTACTTCGTTGGCACTCCGGTAGCATTATGCTTAGCCTTCTGG
CTAAAAGTTGGTTTTAGTGGTCTATGGTATGGTCTGTTATCAGCTCAAGCAGCCTGTGCT
ATCTCAATTCTATATACTGTCCATTGCTGCACAGATTGGGAAGGCGAGGCGTTGAAAGCG
AAGCGACTAACCAACTTGGAGATGATGGGACATAGAGATGGCACTAGTGATGATGAACAA
AATGTCCTTTTGGTTAATGAGATGATCAAGGACAAGTTTGATGATGTTCCATAA