Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400023427
CDS Infomation	pacid=37458862 polypeptide=PGSC0003DMP400015973 locus=PGSC0003DMG400009071 ID=PGSC0003DMT400023427.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTGGACGAATTGAAGCAAGGAGAAAATTCATGGATAGACACGGCTGAGCAGTCGGAT AGAGTATTGAATGTTGATAATAATGTTTCCTTGATGTCTCAATCAATAGTTATCACTGAT GGGGTAGAACCCTTACATCCTCAGCAGCCTCCACCTCAGGGTACCAGCCCCTCCTCGGAT GTCCGATTGGGCTTTCCTGAACGAGCCATCTCAGCAGCTGGTGCAGCATTTCTCTCTGCT GTCCTTGTTAATCCACTTGATGTTGTCAAGACTAGATTGCAAGCACAGGCAGCTGGAGTT GCTTATTCACATCCAATGAGTAACATGACTAGCCGCATGGCAGTTTTTGGGCCAAATATG ATGTTTGCAGACCTGAGGTGTTCACCTTCATGTACCCGAGCTGGTGTTCATGGTACAGTA TCAATCTGCCCACCTGATTGTTTCCAGTACAAAGGAGCACTTGATGTCTTCTACAAAATT ATTCGGCAGGAGGGTATTTCTAAGCTATGGAGAGGTACAAATGCTGGTCTAGCTCTGGCT GTACCAACAGTCGGAATTTACTTGCCTTGCTATGACATTTTTCGCAACAAGTTAGAGGAG TTCACAGCTCAACATACCCCAAGCTTGACACCATATGCCCCTTTATTAGCTGGTTCTCTG GCACGGTCTTTAGCTTGCACAAGTTGCTATCCTATTGAACTTGCCAGAACACGAATGCAG GCATTTAAGGATATGAACAAGAAGCCTGCTGGAGTCTGGAAGACTTTGTTTGAAGTTATT GCCAATGTCAGGAGCACAACTAGTACCAATTTTGGCTTACAAAGTTATCGTGTACTTTGG TCTGGACTTGGGGCACAGCTTGCTCGCGACGTCCCTTTTTCTGCAATTTGTTGGTCAACT CTTGAACCGGTAAGAAGGCGGCTTCTTAGTCCGCTGGGAGATGAAGCTAATGCTGTCGGT GTCCTAGGTGCAAACTTTTCTGCTGGTTTTGTTGCAGGAAGCATTGCTGCTGCTGCAACA TGTCCCCTTGATGTTGCTAAGACTAGAAGACAGATTGAGATGGACCCTGCCAGGGCGTTG ACAATGACGACAAGGCAAACTCTACTTGAAATTTGGAGGGATGGAGGGCTCAAGGGACTG TTTACTGGAGTAGGTCCTCGTGTTGGTCGTGCTGGCCCTTCAGTTGGAATTGTAGTTTCG TTTTATGAAGTTGTCAAATATATGTTACACCAACAATATGCTTCTTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400015973
PEP Infomation	pacid=37458862 transcript=PGSC0003DMT400023427 locus=PGSC0003DMG400009071 ID=PGSC0003DMT400023427.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MVDELKQGENSWIDTAEQSDRVLNVDNNVSLMSQSIVITDGVEPLHPQQPPPQGTSPSSD VRLGFPERAISAAGAAFLSAVLVNPLDVVKTRLQAQAAGVAYSHPMSNMTSRMAVFGPNM MFADLRCSPSCTRAGVHGTVSICPPDCFQYKGALDVFYKIIRQEGISKLWRGTNAGLALA VPTVGIYLPCYDIFRNKLEEFTAQHTPSLTPYAPLLAGSLARSLACTSCYPIELARTRMQ AFKDMNKKPAGVWKTLFEVIANVRSTTSTNFGLQSYRVLWSGLGAQLARDVPFSAICWST LEPVRRRLLSPLGDEANAVGVLGANFSAGFVAGSIAAAATCPLDVAKTRRQIEMDPARAL TMTTRQTLLEIWRDGGLKGLFTGVGPRVGRAGPSVGIVVSFYEVVKYMLHQQYASS*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400023427
Transcript Infomation	pacid=37458862 locus=PGSC0003DMG400009071 ID=PGSC0003DMT400023427.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGTGGACGAATTGAAGCAAGGAGAAAATTCATGGATAGACACGGCTGAGCAGTCGGAT AGAGTATTGAATGTTGATAATAATGTTTCCTTGATGTCTCAATCAATAGTTATCACTGAT GGGGTAGAACCCTTACATCCTCAGCAGCCTCCACCTCAGGGTACCAGCCCCTCCTCGGAT GTCCGATTGGGCTTTCCTGAACGAGCCATCTCAGCAGCTGGTGCAGCATTTCTCTCTGCT GTCCTTGTTAATCCACTTGATGTTGTCAAGACTAGATTGCAAGCACAGGCAGCTGGAGTT GCTTATTCACATCCAATGAGTAACATGACTAGCCGCATGGCAGTTTTTGGGCCAAATATG ATGTTTGCAGACCTGAGGTGTTCACCTTCATGTACCCGAGCTGGTGTTCATGGTACAGTA TCAATCTGCCCACCTGATTGTTTCCAGTACAAAGGAGCACTTGATGTCTTCTACAAAATT ATTCGGCAGGAGGGTATTTCTAAGCTATGGAGAGGTACAAATGCTGGTCTAGCTCTGGCT GTACCAACAGTCGGAATTTACTTGCCTTGCTATGACATTTTTCGCAACAAGTTAGAGGAG TTCACAGCTCAACATACCCCAAGCTTGACACCATATGCCCCTTTATTAGCTGGTTCTCTG GCACGGTCTTTAGCTTGCACAAGTTGCTATCCTATTGAACTTGCCAGAACACGAATGCAG GCATTTAAGGATATGAACAAGAAGCCTGCTGGAGTCTGGAAGACTTTGTTTGAAGTTATT GCCAATGTCAGGAGCACAACTAGTACCAATTTTGGCTTACAAAGTTATCGTGTACTTTGG TCTGGACTTGGGGCACAGCTTGCTCGCGACGTCCCTTTTTCTGCAATTTGTTGGTCAACT CTTGAACCGGTAAGAAGGCGGCTTCTTAGTCCGCTGGGAGATGAAGCTAATGCTGTCGGT GTCCTAGGTGCAAACTTTTCTGCTGGTTTTGTTGCAGGAAGCATTGCTGCTGCTGCAACA TGTCCCCTTGATGTTGCTAAGACTAGAAGACAGATTGAGATGGACCCTGCCAGGGCGTTG ACAATGACGACAAGGCAAACTCTACTTGAAATTTGGAGGGATGGAGGGCTCAAGGGACTG TTTACTGGAGTAGGTCCTCGTGTTGGTCGTGCTGGCCCTTCAGTTGGAATTGTAGTTTCG TTTTATGAAGTTGTCAAATATATGTTACACCAACAATATGCTTCTTCATAG