Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400023083
CDS Infomation

pacid=37457874 polypeptide=PGSC0003DMP400015725 locus=PGSC0003DMG400008939 ID=PGSC0003DMT400023083.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTGGACGGAAAAAGATGTCGAGAATGGAAAAGAAAGTGACTCACTTGGTAACAAT
GGTTTTCTGAAGGGAGGGCAATCTTCTTCTGGTTCCAAAGGTTCTCCTGGTAGAATAAGT
CATGTAAAGAAGATTTTTGAAGACAAGGATGCCATCACTTATGCAAATATTCTTCGCTCT
AGGAACAAGTTTGTTGATGCACTTGCAATCTATGAGAGTGTGTTGCAGAAGGATAGCGAG
AGTATTGAGTCTCTGATTGGCAAAGGTATTTGCCTGCAGATGCAAAATATGGGGAGGCTT
GCTTTTGAAAGTTTTTCTGAAGCTATCAAAGTGGACCCACAAAATGCATGTGCCCTCACC
CATTGCGGAATTTTGTACAAAGATGAGGGTCGCCTGGTCGAGGCTGCTGAGTCCTATGAG
AAAGCACTTAAAGCTGACCCCTCATATAAACCAGCAGCAGAATGCCTTGCAATTGTATTG
ACTGATATTGGAACCAGCCTGAAGCTTGCTGGCAACACTCAGGAGGGAATTCAAAAATAC
TATGAAGCTATCAAAATTGATTCACACTATGCGCCTGCTTACTATAACCTTGGCGTTGTA
TATTCAGAAATGATGCAATACGATATGGCCCTTAATTGCTATGAGAAGGCTGCACTGGAG
CGACCCATGTATGCTGAAGCTTATTGCAATATGGGTGTTATATTCAAAAATCGTGGGGAT
TTGGAGTCTGCAATTGCTTGTTATGAGAGGTGTTTAGCTGTGTCCCCAAATTTTGAGATC
GCAAAGAATAACATGGCAATTGCTCTGACTGATTTAGGCACAAAGGTTAAGTTGGAAGGA
GACATCAACCAAGGTGTGGCATATTACAAGAAAGCTCTTTGCTATAACTGGCACTATGCT
GATGCTATGTATAATCTGGGTGTTGCCTATGGTGAAATGCTGAAATTTGACATGGCTATT
GTGTTCTATGAACTTGCTTTCCACTTTAATCCTCATTGTGCTGAAGCATGCAACAATTTG
GGAGTGATATACAAGGATAGGGACAACCTTGATAAAGCAGTTGAATGTTATCAGATGGCT
TTGTCAATCAAACCAAGCTTCTCTCAGTCATTAAACAATCTCGGAGTAGTTTACACTGTT
CAGGGTAAAATGGATGCTGCTGCTAGCATGATTGAGAAAGCTATCATTGCAAACCCAACA
TATGCAGAGGCATATAATAATTTAGGAGTTCTTTACAGGGATGCAGGCAATATATCCCTG
GCCATTGAAGCATATGAGCAATGCCTCAAGATAGATCCTGATTCCCGAAATGCAGGCCAG
AACCGGTTACTTGCCATGAACTACATTAATGAAGGAACTGATGACAAGTTATATGAGGCT
CACAGAGACTGGGGTCGGCGTTTTATGAAATTATATCCACAGTACACTTCATGGGACAAC
TCAAAAGTTCCGGAAAGGCCACTTGTGATTGGATATGTCTCACCTGATTATTTTACTCAC
TCTGTTTCATACTTCATCGAAGCACCACTTGCGCATCATGATTACACAAACTACAAGGTG
GTGGTTTATTCATCTGTTGTAAAGGCAGATGCAAAAACAAACAGGTTTAGGGACAAAGTC
ATGAAAAAGGGTGGTCTCTGGAGGGATATCTACGGGATTGATGAGAAAAAGGTATCCAGC
ATGATCAGAGAAGATAAAGTTGATATCATGGTTGAACTTACAGGCCATACAGCAAACAAT
AAACTGGGAACCATGGCTTGCCGACCTGCGCCTGTACAGGTGACTTGGATTGGATACCCT
AACACAACTGGTTTGCCCACTATTGATTATAGAATCACTGATGCTATGGCTGACCCTCCT
AATGCAAAACAGAAACACGTGGAAGAGTTGGTCCGATTGCCAAATAGCTTTCTTTGTTAC
ACACCCTCTCCTGAAGCTGGGCCAGTGTGTCCAGCACCTGCTTTATCCAATGGCTTCGTT
ACATTTGGTAGCTTCAACAATCTTGCCAAGATAACACCGAAAGTTCTACAAGTTTGGGCA
AGAATTCTATCTGCAGTTCCACATTCTCGGCTAATTGTTAAGTGCAAGCCTTTCTGTTGC
GATAGTGTGAGGCAGAGATTTCTTTCTATTCTAGAGCAATTGGGATTGGAGCCACAGAGA
GTTGATCTTTTACCCTTAATCCTTCTAAATCATGATCATATGCAAGCATATTCCCTCATG
GACATTAGCTTGGATACTTTTCCTTATGCTGGAACAACCACCACATGTGAATCACTATAC
ATGGGAGTTCCTTGTGTCACTATGGGAGGTTCCGTACACGCTCACAATGTTGGTGTGAGT
CTTCTTAAGACAGTCGGGTTAGAAAACCTTGTGGCTAGGAATGAAGATGAGTACGTTGAG
TCAGCTATACAGCTGGCTTCAGATGTTACATCTCTATCAAACTTGAGAATGAGTCTGCGA
GAACTGATGTCAAAATCACCACTTTGTGACGGGGCCAAGTTCACCCGAAACATCGAGTCA
ATATATAGGAGTATGTGGCGCAGGTACTGTGATGGCGATGTGCCATCTCTGAGGCGTATG
GAATTATTACAGCAGCAGCAGACAAAAACTGAGTCGGTGGTTCCAGAAGAGTCACCTGTT
AATTCATTGGAAAGGACCATCACTTCTGCTCCTACAGACGGGTCAATTAAAGAGAATGGA
TTCACCACGATACCAGCCTTGGTACTTAACTCTTCCACTAGTGAAGAAAATGGGGTGCAG
TCAAATCAAAATGGTAATCATGGTAACTTGAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015725
PEP Infomation

pacid=37457874 transcript=PGSC0003DMT400023083 locus=PGSC0003DMG400008939 ID=PGSC0003DMT400023083.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAWTEKDVENGKESDSLGNNGFLKGGQSSSGSKGSPGRISHVKKIFEDKDAITYANILRS
RNKFVDALAIYESVLQKDSESIESLIGKGICLQMQNMGRLAFESFSEAIKVDPQNACALT
HCGILYKDEGRLVEAAESYEKALKADPSYKPAAECLAIVLTDIGTSLKLAGNTQEGIQKY
YEAIKIDSHYAPAYYNLGVVYSEMMQYDMALNCYEKAALERPMYAEAYCNMGVIFKNRGD
LESAIACYERCLAVSPNFEIAKNNMAIALTDLGTKVKLEGDINQGVAYYKKALCYNWHYA
DAMYNLGVAYGEMLKFDMAIVFYELAFHFNPHCAEACNNLGVIYKDRDNLDKAVECYQMA
LSIKPSFSQSLNNLGVVYTVQGKMDAAASMIEKAIIANPTYAEAYNNLGVLYRDAGNISL
AIEAYEQCLKIDPDSRNAGQNRLLAMNYINEGTDDKLYEAHRDWGRRFMKLYPQYTSWDN
SKVPERPLVIGYVSPDYFTHSVSYFIEAPLAHHDYTNYKVVVYSSVVKADAKTNRFRDKV
MKKGGLWRDIYGIDEKKVSSMIREDKVDIMVELTGHTANNKLGTMACRPAPVQVTWIGYP
NTTGLPTIDYRITDAMADPPNAKQKHVEELVRLPNSFLCYTPSPEAGPVCPAPALSNGFV
TFGSFNNLAKITPKVLQVWARILSAVPHSRLIVKCKPFCCDSVRQRFLSILEQLGLEPQR
VDLLPLILLNHDHMQAYSLMDISLDTFPYAGTTTTCESLYMGVPCVTMGGSVHAHNVGVS
LLKTVGLENLVARNEDEYVESAIQLASDVTSLSNLRMSLRELMSKSPLCDGAKFTRNIES
IYRSMWRRYCDGDVPSLRRMELLQQQQTKTESVVPEESPVNSLERTITSAPTDGSIKENG
FTTIPALVLNSSTSEENGVQSNQNGNHGNLS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400023083
Transcript Infomation

pacid=37457874 locus=PGSC0003DMG400008939 ID=PGSC0003DMT400023083.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTGGACGGAAAAAGATGTCGAGAATGGAAAAGAAAGTGACTCACTTGGTAACAAT
GGTTTTCTGAAGGGAGGGCAATCTTCTTCTGGTTCCAAAGGTTCTCCTGGTAGAATAAGT
CATGTAAAGAAGATTTTTGAAGACAAGGATGCCATCACTTATGCAAATATTCTTCGCTCT
AGGAACAAGTTTGTTGATGCACTTGCAATCTATGAGAGTGTGTTGCAGAAGGATAGCGAG
AGTATTGAGTCTCTGATTGGCAAAGGTATTTGCCTGCAGATGCAAAATATGGGGAGGCTT
GCTTTTGAAAGTTTTTCTGAAGCTATCAAAGTGGACCCACAAAATGCATGTGCCCTCACC
CATTGCGGAATTTTGTACAAAGATGAGGGTCGCCTGGTCGAGGCTGCTGAGTCCTATGAG
AAAGCACTTAAAGCTGACCCCTCATATAAACCAGCAGCAGAATGCCTTGCAATTGTATTG
ACTGATATTGGAACCAGCCTGAAGCTTGCTGGCAACACTCAGGAGGGAATTCAAAAATAC
TATGAAGCTATCAAAATTGATTCACACTATGCGCCTGCTTACTATAACCTTGGCGTTGTA
TATTCAGAAATGATGCAATACGATATGGCCCTTAATTGCTATGAGAAGGCTGCACTGGAG
CGACCCATGTATGCTGAAGCTTATTGCAATATGGGTGTTATATTCAAAAATCGTGGGGAT
TTGGAGTCTGCAATTGCTTGTTATGAGAGGTGTTTAGCTGTGTCCCCAAATTTTGAGATC
GCAAAGAATAACATGGCAATTGCTCTGACTGATTTAGGCACAAAGGTTAAGTTGGAAGGA
GACATCAACCAAGGTGTGGCATATTACAAGAAAGCTCTTTGCTATAACTGGCACTATGCT
GATGCTATGTATAATCTGGGTGTTGCCTATGGTGAAATGCTGAAATTTGACATGGCTATT
GTGTTCTATGAACTTGCTTTCCACTTTAATCCTCATTGTGCTGAAGCATGCAACAATTTG
GGAGTGATATACAAGGATAGGGACAACCTTGATAAAGCAGTTGAATGTTATCAGATGGCT
TTGTCAATCAAACCAAGCTTCTCTCAGTCATTAAACAATCTCGGAGTAGTTTACACTGTT
CAGGGTAAAATGGATGCTGCTGCTAGCATGATTGAGAAAGCTATCATTGCAAACCCAACA
TATGCAGAGGCATATAATAATTTAGGAGTTCTTTACAGGGATGCAGGCAATATATCCCTG
GCCATTGAAGCATATGAGCAATGCCTCAAGATAGATCCTGATTCCCGAAATGCAGGCCAG
AACCGGTTACTTGCCATGAACTACATTAATGAAGGAACTGATGACAAGTTATATGAGGCT
CACAGAGACTGGGGTCGGCGTTTTATGAAATTATATCCACAGTACACTTCATGGGACAAC
TCAAAAGTTCCGGAAAGGCCACTTGTGATTGGATATGTCTCACCTGATTATTTTACTCAC
TCTGTTTCATACTTCATCGAAGCACCACTTGCGCATCATGATTACACAAACTACAAGGTG
GTGGTTTATTCATCTGTTGTAAAGGCAGATGCAAAAACAAACAGGTTTAGGGACAAAGTC
ATGAAAAAGGGTGGTCTCTGGAGGGATATCTACGGGATTGATGAGAAAAAGGTATCCAGC
ATGATCAGAGAAGATAAAGTTGATATCATGGTTGAACTTACAGGCCATACAGCAAACAAT
AAACTGGGAACCATGGCTTGCCGACCTGCGCCTGTACAGGTGACTTGGATTGGATACCCT
AACACAACTGGTTTGCCCACTATTGATTATAGAATCACTGATGCTATGGCTGACCCTCCT
AATGCAAAACAGAAACACGTGGAAGAGTTGGTCCGATTGCCAAATAGCTTTCTTTGTTAC
ACACCCTCTCCTGAAGCTGGGCCAGTGTGTCCAGCACCTGCTTTATCCAATGGCTTCGTT
ACATTTGGTAGCTTCAACAATCTTGCCAAGATAACACCGAAAGTTCTACAAGTTTGGGCA
AGAATTCTATCTGCAGTTCCACATTCTCGGCTAATTGTTAAGTGCAAGCCTTTCTGTTGC
GATAGTGTGAGGCAGAGATTTCTTTCTATTCTAGAGCAATTGGGATTGGAGCCACAGAGA
GTTGATCTTTTACCCTTAATCCTTCTAAATCATGATCATATGCAAGCATATTCCCTCATG
GACATTAGCTTGGATACTTTTCCTTATGCTGGAACAACCACCACATGTGAATCACTATAC
ATGGGAGTTCCTTGTGTCACTATGGGAGGTTCCGTACACGCTCACAATGTTGGTGTGAGT
CTTCTTAAGACAGTCGGGTTAGAAAACCTTGTGGCTAGGAATGAAGATGAGTACGTTGAG
TCAGCTATACAGCTGGCTTCAGATGTTACATCTCTATCAAACTTGAGAATGAGTCTGCGA
GAACTGATGTCAAAATCACCACTTTGTGACGGGGCCAAGTTCACCCGAAACATCGAGTCA
ATATATAGGAGTATGTGGCGCAGGTACTGTGATGGCGATGTGCCATCTCTGAGGCGTATG
GAATTATTACAGCAGCAGCAGACAAAAACTGAGTCGGTGGTTCCAGAAGAGTCACCTGTT
AATTCATTGGAAAGGACCATCACTTCTGCTCCTACAGACGGGTCAATTAAAGAGAATGGA
TTCACCACGATACCAGCCTTGGTACTTAACTCTTCCACTAGTGAAGAAAATGGGGTGCAG
TCAAATCAAAATGGTAATCATGGTAACTTGAGTTGA