Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400023039
CDS Infomation

pacid=37458417 polypeptide=PGSC0003DMP400015694 locus=PGSC0003DMG400008917 ID=PGSC0003DMT400023039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGAAAGGGTGAAGGTCCAGCTATCGGTATTGATCTTGGTACCACATACTCTTGC
GTTGGTGTTTGGCAGCATGATCGTGTTGAGATCATCGCTAATGATCAAGGTAACAGGACT
ACACCGTCTTATGTTGGATTCACTGACTCTGAGCGTCTCATTGGTGATGCTGCTAAGAAT
CAGGTCGCTATGAACCCTATCAACACTGTATTCGATGCAAAAAGGTTGATTGGTAGGAGA
TTTAGTGATGCCACAGTGCAAAGTGACATCAAGCACTGGCCATTTAAGGTCATTCCTGGA
CCTGGTGATAAGCCAATGATTGTTGTTAACTACAAGGGTGAGGAAAAGCAGTTTGCTGCT
GAGGAAATCTCTTCTATGGTGCTCATTAAGATGAGGGAGATTGCTGAAGCTTTCCTTGGT
TCCACTGTCAAGAATGCTGTGGTTACCGTGCCAGCCTACTTTAACGACTCTCAGCGTCAG
GCCACTAAGGATGCTGGTGTTATTGCTGGTTTGAATGTCATGCGTATTATCAACGAGCCT
ACAGCAGCTGCCATTGCTTATGGTCTGGATAAGAAGGCAACTAGTGTTGGTGAGAAGAAT
GTGTTGATCTTTGATCTTGGTGGTGGTACCTTCGATGTATCTCTCCTCACCATTGAGGAA
GGTATCTTTGAGGTGAAGGCTACTGCTGGAGACACTCATCTTGGAGGTGAGGACTTTGAC
AACAGGATGGTCACCCATTTTGTTCAAGAATTTAAGAGGAAGAACAAAAAGGATATCAGC
GGTAACCCTAGGGCACTTAGAAGGTTGAGAACTGCTTGTGAGAGGGCGAAGAGGACCCTT
TCATCCACTGCTCAGACCACAATTGAGATTGATTCTCTCTATGAGGGTATTGATTTCTAT
TCCACCATCACCCGTGCTAGATTTGAGGAGCTTAACATGGATCTGTTCAGGAAGTGTATG
GAACCAGTTGAAAAGTGTTTGAGAGATGCTAAGATGGACAAGAACTCTATCCATGATGTT
GTACTTGTTGGTGGCTCCACCAGGATTCCCAAGGTTCAGCAGCTATTGCAAGACTTTTTC
AATGGGAAGGAGCTCTGCAAGAGCATCAACCCTGATGAAGCTGTTGCTTACGGTGCTGCT
GTACAAGCTGCAATTTTGAGTGGTGAAGGTAACGAGAAGGTGCAAGACCTGTTGTTGTTG
GATGTTACCCCTCTTTCCCTTGGACTGGAAACTGCTGGAGGTGTCATGACTGTATTGATC
CCTAGAAACACCACTATCCCAACCAAGAAAGAACAGGTCTTCTCAACCTACTCAGACAAT
CAGCCAGGTGTGTTGATCCAGGTCTATGAAGGTGAGAGAACTAGGACCAGGGACAACAAC
TTGCTTGGCAAATTTGAGCTCTCTGGTATTCCTCCTGCTCCCAGGGGAGTTCCTCAGATC
ACAGTGTGCTTTGACATTGATGCCAATGGTATCTTGAATGTTTCTGCTGAGGACAAGACT
ACTGGACAAAAGAACAAGATCACCATCACCAACGACAAGGGCAGGCTCTCCAAGGAGGAG
ATTGAGAAGATGGTTCAAGAAGCAGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAAGACCACAAGAAG
AAGGTAGAGGCAAAGAATGCTTTGGAGAACTATGCATACAACATGAGGAACACCATCAAG
GATGAGAAGATTGCATCCAAGCTGCCTGAGGCAGACAGGAAGAAGATTGAGGAAGCCATT
GAGCAGGCCATCCAGTGGCTCGATGCCAACCAGCTTGCTGAGTCTGATGAATTTGAGGAC
AAGATGAAGGAGTTGGAGAGCATCTGCAATCCAATTATTGCCAAGATGTACCAAGGTGCT
GGTGGTGACATGGGTGCTGACATGGGTGATGATGGTCCTGCTCCTAGTGGTGGCAGCGGT
GCCGGTCCTAAGATCGAGGAGGTCGACTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015694
PEP Infomation

pacid=37458417 transcript=PGSC0003DMT400023039 locus=PGSC0003DMG400008917 ID=PGSC0003DMT400023039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAGKGEGPAIGIDLGTTYSCVGVWQHDRVEIIANDQGNRTTPSYVGFTDSERLIGDAAKN
QVAMNPINTVFDAKRLIGRRFSDATVQSDIKHWPFKVIPGPGDKPMIVVNYKGEEKQFAA
EEISSMVLIKMREIAEAFLGSTVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVMRIINEP
TAAAIAYGLDKKATSVGEKNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEEGIFEVKATAGDTHLGGEDFD
NRMVTHFVQEFKRKNKKDISGNPRALRRLRTACERAKRTLSSTAQTTIEIDSLYEGIDFY
STITRARFEELNMDLFRKCMEPVEKCLRDAKMDKNSIHDVVLVGGSTRIPKVQQLLQDFF
NGKELCKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGEGNEKVQDLLLLDVTPLSLGLETAGGVMTVLI
PRNTTIPTKKEQVFSTYSDNQPGVLIQVYEGERTRTRDNNLLGKFELSGIPPAPRGVPQI
TVCFDIDANGILNVSAEDKTTGQKNKITITNDKGRLSKEEIEKMVQEAEKYKSEDEDHKK
KVEAKNALENYAYNMRNTIKDEKIASKLPEADRKKIEEAIEQAIQWLDANQLAESDEFED
KMKELESICNPIIAKMYQGAGGDMGADMGDDGPAPSGGSGAGPKIEEVD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400023039
Transcript Infomation

pacid=37458417 locus=PGSC0003DMG400008917 ID=PGSC0003DMT400023039.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTGGAAAGGGTGAAGGTCCAGCTATCGGTATTGATCTTGGTACCACATACTCTTGC
GTTGGTGTTTGGCAGCATGATCGTGTTGAGATCATCGCTAATGATCAAGGTAACAGGACT
ACACCGTCTTATGTTGGATTCACTGACTCTGAGCGTCTCATTGGTGATGCTGCTAAGAAT
CAGGTCGCTATGAACCCTATCAACACTGTATTCGATGCAAAAAGGTTGATTGGTAGGAGA
TTTAGTGATGCCACAGTGCAAAGTGACATCAAGCACTGGCCATTTAAGGTCATTCCTGGA
CCTGGTGATAAGCCAATGATTGTTGTTAACTACAAGGGTGAGGAAAAGCAGTTTGCTGCT
GAGGAAATCTCTTCTATGGTGCTCATTAAGATGAGGGAGATTGCTGAAGCTTTCCTTGGT
TCCACTGTCAAGAATGCTGTGGTTACCGTGCCAGCCTACTTTAACGACTCTCAGCGTCAG
GCCACTAAGGATGCTGGTGTTATTGCTGGTTTGAATGTCATGCGTATTATCAACGAGCCT
ACAGCAGCTGCCATTGCTTATGGTCTGGATAAGAAGGCAACTAGTGTTGGTGAGAAGAAT
GTGTTGATCTTTGATCTTGGTGGTGGTACCTTCGATGTATCTCTCCTCACCATTGAGGAA
GGTATCTTTGAGGTGAAGGCTACTGCTGGAGACACTCATCTTGGAGGTGAGGACTTTGAC
AACAGGATGGTCACCCATTTTGTTCAAGAATTTAAGAGGAAGAACAAAAAGGATATCAGC
GGTAACCCTAGGGCACTTAGAAGGTTGAGAACTGCTTGTGAGAGGGCGAAGAGGACCCTT
TCATCCACTGCTCAGACCACAATTGAGATTGATTCTCTCTATGAGGGTATTGATTTCTAT
TCCACCATCACCCGTGCTAGATTTGAGGAGCTTAACATGGATCTGTTCAGGAAGTGTATG
GAACCAGTTGAAAAGTGTTTGAGAGATGCTAAGATGGACAAGAACTCTATCCATGATGTT
GTACTTGTTGGTGGCTCCACCAGGATTCCCAAGGTTCAGCAGCTATTGCAAGACTTTTTC
AATGGGAAGGAGCTCTGCAAGAGCATCAACCCTGATGAAGCTGTTGCTTACGGTGCTGCT
GTACAAGCTGCAATTTTGAGTGGTGAAGGTAACGAGAAGGTGCAAGACCTGTTGTTGTTG
GATGTTACCCCTCTTTCCCTTGGACTGGAAACTGCTGGAGGTGTCATGACTGTATTGATC
CCTAGAAACACCACTATCCCAACCAAGAAAGAACAGGTCTTCTCAACCTACTCAGACAAT
CAGCCAGGTGTGTTGATCCAGGTCTATGAAGGTGAGAGAACTAGGACCAGGGACAACAAC
TTGCTTGGCAAATTTGAGCTCTCTGGTATTCCTCCTGCTCCCAGGGGAGTTCCTCAGATC
ACAGTGTGCTTTGACATTGATGCCAATGGTATCTTGAATGTTTCTGCTGAGGACAAGACT
ACTGGACAAAAGAACAAGATCACCATCACCAACGACAAGGGCAGGCTCTCCAAGGAGGAG
ATTGAGAAGATGGTTCAAGAAGCAGAGAAGTACAAGTCTGAGGATGAAGACCACAAGAAG
AAGGTAGAGGCAAAGAATGCTTTGGAGAACTATGCATACAACATGAGGAACACCATCAAG
GATGAGAAGATTGCATCCAAGCTGCCTGAGGCAGACAGGAAGAAGATTGAGGAAGCCATT
GAGCAGGCCATCCAGTGGCTCGATGCCAACCAGCTTGCTGAGTCTGATGAATTTGAGGAC
AAGATGAAGGAGTTGGAGAGCATCTGCAATCCAATTATTGCCAAGATGTACCAAGGTGCT
GGTGGTGACATGGGTGCTGACATGGGTGATGATGGTCCTGCTCCTAGTGGTGGCAGCGGT
GCCGGTCCTAAGATCGAGGAGGTCGACTAA