Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400022809
CDS Infomation

pacid=37454900 polypeptide=PGSC0003DMP400015533 locus=PGSC0003DMG400008849 ID=PGSC0003DMT400022809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTTTAATGTAACCAATTCCATAAAAACATCATCAGATGGAGTATGGCAAGGAGAA
AATACTTTACACTATGCTTTTCCATTATTAATTATTCAAACAACGTTAGTTGTGTTCCTT
AGTCGATTACTTGCTTTCCTTCTCAAGCCCCTCCGCCAACCTAAAGTCGTCGCGGAGATC
CTCGCAGGGATTATGCTTGGGCCATCAGCATTTGGGAGGAACAAAACATTCACAAATTGT
ATTTTTCCATCATGGAGTACTCCAATTCTTGAATGTGTATCAAACATAGGCCTATTATTT
TTCTTATTTCTTGTTGGTCTTGAATTGGACTTAAACACCATACATAAAAGTGGAAAAAAA
GCTATTGGAATAGCATTTGCTGGAATTTCATTGCCCTTTCTATTTAGCATTGGAGTTGCT
TTTGTTCTAAGAAAGATAATCAAAGGGATTGATAGTGTTGGATATGGAGAATTTTTCTTG
TTCATTGGTGTTTCACTTTCAATCACTGCCTTTCCTGTTCTTGCTCGAATCCTCGCGGAA
TTAAGGTTACTGACTACACAAATTGGTGAAATGGCTATGGCAGCAGCTGCATTCAATGAT
GTTGCTGCATGGATTTTACTTGCTCTTGCAATTGCTCTAGCAGGAGGAGGAGGAGTTCAT
CATAGTCCTTTAATTTCACTATGGGTTTTTCTAAGTGGAATTGGATTTGTGGTTTTTATG
TTCCTAATTATTAGGCCAATTATGATTTGGGTGGCAAAAAAATCATCAAATGGGAACAAC
AATATTGTTGAAGAAACTTGTATATGTTTAACCCTAGTTGGAGTTATGTTATTTGGTTTT
ATGACTGATTTTATTGGTATACATGCAATATTTGGAGGATTTATATTTGGATTAATTATT
CCAAAAAATGGGGACTTTTCAGAAAAATTGATTTTGAGAATTGAAGATTTTGTGTCTGGA
TTATTATTACCACTTTATTTTGCATCAAGTGGTATTAAGACAAATATTTCACAAATTCAT
AGTGTTAAGGCTTGGGGACTTGTGGTTCTTGTTGTGTCCACAGCTTGTGTAGGCAAAGTT
TTGGGGACTTTTGTTGTGGGAATAATGTTGTGTTCAATGCCAATGAGAGAAGCTTTAGCA
CTTGGATTTTTGATGAATACAAAAGGGTTGGTGGAGCTAATTGTTCTAAATATTGGAAAG
GAGAAAAAGGTTTTGGACGATGAGACGTTTGCAATATTGGTGATCATGGCACTTTTTACA
ACCTTTATCACAACTCCTATAGTAATGGCTATTCATAAACCATCATCAACACAAAATCCT
CAACTCGAAAAACCACAAAAAAAGATCAAAAAACAAAACAATCTTCGAATCCTAGCGTGC
TTACGTGGCCCGAGGGATGCACGTGCACTCATTAACCTCATCGAGTCACTAAGGTCTGAA
AAAAATAACAATAACTACGCCTCAGTCACAAAACTCTATGTGATGAGACTCGTGGAGTTC
ACCGACCGACTCTCATCCATATCGATGGTCCAACGTGCCCGAAAAAATGGTTTTCCGTTC
ATCGGCCGAGTGCTTTTCCGAGATGACGCGACCGATCAAGTGGGCGCGGCGTTCGAGGCG
TATAGCACGCTAGGAAAGGTCATAGTCCGACCCACAATGGCTATCTCGGGTTTATCGGAT
TTGGATGAGGATATTATTCATGTTGCGGAGAAAAAACGAGTTGAACTGATTATTTTGCCG
TTCGATAAATATTGGCAAATGGAAGGAAATGAAGAAGTGGAGATTCATGCAGGGCACGGA
TGGAGGATGGCAAATGAGAGAGTGATGAGTCAAGCGTGGTGCTCGGTGGCGGTGGTGGTT
GATCGTGGATTACAATTGGTTGATAATGGGATGAGAATTTGCATTGTGTTTTTTGGTGGA
GCTGATTGTAGTAAAGCTTTGGAAATTGGTAGTAGAATGGTTGAACATCCTGCTATTAGG
GTTACATTAGTAAGATTCATTCATCATGGAAGTACTAATTTTGATGAAGTTGAAAGGACT
TTGGATGATTCTACTATTGCAGAATTCAAGATGAAGTGGGGTAAACAAATTGTATATAGT
GAGAAAGAAGCAAATAATTTGGTGAATGAAGTGTTGGAAATTGGAAAAAGTGGAGAATTT
GAACTTATGATAATAGGGAATAATAAAAGTAAGTTTCCACAAGGCATAATGGCAAAACTA
TTTGATGAGCAACAATTGAATAATTCAGAATTTGGGCCATTGGCTAATTTGTTGGCTTCA
TCAGACAAAGGGATAAAAAGTTCTGTTCTAGTGATTCAACAACAACAACAAGAAGCTAAG
TTTGGGAACTCAAAAGTGGCTAGTAGCTTTATTGATAAGGATATTGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015533
PEP Infomation

pacid=37454900 transcript=PGSC0003DMT400022809 locus=PGSC0003DMG400008849 ID=PGSC0003DMT400022809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGFNVTNSIKTSSDGVWQGENTLHYAFPLLIIQTTLVVFLSRLLAFLLKPLRQPKVVAEI
LAGIMLGPSAFGRNKTFTNCIFPSWSTPILECVSNIGLLFFLFLVGLELDLNTIHKSGKK
AIGIAFAGISLPFLFSIGVAFVLRKIIKGIDSVGYGEFFLFIGVSLSITAFPVLARILAE
LRLLTTQIGEMAMAAAAFNDVAAWILLALAIALAGGGGVHHSPLISLWVFLSGIGFVVFM
FLIIRPIMIWVAKKSSNGNNNIVEETCICLTLVGVMLFGFMTDFIGIHAIFGGFIFGLII
PKNGDFSEKLILRIEDFVSGLLLPLYFASSGIKTNISQIHSVKAWGLVVLVVSTACVGKV
LGTFVVGIMLCSMPMREALALGFLMNTKGLVELIVLNIGKEKKVLDDETFAILVIMALFT
TFITTPIVMAIHKPSSTQNPQLEKPQKKIKKQNNLRILACLRGPRDARALINLIESLRSE
KNNNNYASVTKLYVMRLVEFTDRLSSISMVQRARKNGFPFIGRVLFRDDATDQVGAAFEA
YSTLGKVIVRPTMAISGLSDLDEDIIHVAEKKRVELIILPFDKYWQMEGNEEVEIHAGHG
WRMANERVMSQAWCSVAVVVDRGLQLVDNGMRICIVFFGGADCSKALEIGSRMVEHPAIR
VTLVRFIHHGSTNFDEVERTLDDSTIAEFKMKWGKQIVYSEKEANNLVNEVLEIGKSGEF
ELMIIGNNKSKFPQGIMAKLFDEQQLNNSEFGPLANLLASSDKGIKSSVLVIQQQQQEAK
FGNSKVASSFIDKDIV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400022809
Transcript Infomation

pacid=37454900 locus=PGSC0003DMG400008849 ID=PGSC0003DMT400022809.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTTTTAATGTAACCAATTCCATAAAAACATCATCAGATGGAGTATGGCAAGGAGAA
AATACTTTACACTATGCTTTTCCATTATTAATTATTCAAACAACGTTAGTTGTGTTCCTT
AGTCGATTACTTGCTTTCCTTCTCAAGCCCCTCCGCCAACCTAAAGTCGTCGCGGAGATC
CTCGCAGGGATTATGCTTGGGCCATCAGCATTTGGGAGGAACAAAACATTCACAAATTGT
ATTTTTCCATCATGGAGTACTCCAATTCTTGAATGTGTATCAAACATAGGCCTATTATTT
TTCTTATTTCTTGTTGGTCTTGAATTGGACTTAAACACCATACATAAAAGTGGAAAAAAA
GCTATTGGAATAGCATTTGCTGGAATTTCATTGCCCTTTCTATTTAGCATTGGAGTTGCT
TTTGTTCTAAGAAAGATAATCAAAGGGATTGATAGTGTTGGATATGGAGAATTTTTCTTG
TTCATTGGTGTTTCACTTTCAATCACTGCCTTTCCTGTTCTTGCTCGAATCCTCGCGGAA
TTAAGGTTACTGACTACACAAATTGGTGAAATGGCTATGGCAGCAGCTGCATTCAATGAT
GTTGCTGCATGGATTTTACTTGCTCTTGCAATTGCTCTAGCAGGAGGAGGAGGAGTTCAT
CATAGTCCTTTAATTTCACTATGGGTTTTTCTAAGTGGAATTGGATTTGTGGTTTTTATG
TTCCTAATTATTAGGCCAATTATGATTTGGGTGGCAAAAAAATCATCAAATGGGAACAAC
AATATTGTTGAAGAAACTTGTATATGTTTAACCCTAGTTGGAGTTATGTTATTTGGTTTT
ATGACTGATTTTATTGGTATACATGCAATATTTGGAGGATTTATATTTGGATTAATTATT
CCAAAAAATGGGGACTTTTCAGAAAAATTGATTTTGAGAATTGAAGATTTTGTGTCTGGA
TTATTATTACCACTTTATTTTGCATCAAGTGGTATTAAGACAAATATTTCACAAATTCAT
AGTGTTAAGGCTTGGGGACTTGTGGTTCTTGTTGTGTCCACAGCTTGTGTAGGCAAAGTT
TTGGGGACTTTTGTTGTGGGAATAATGTTGTGTTCAATGCCAATGAGAGAAGCTTTAGCA
CTTGGATTTTTGATGAATACAAAAGGGTTGGTGGAGCTAATTGTTCTAAATATTGGAAAG
GAGAAAAAGGTTTTGGACGATGAGACGTTTGCAATATTGGTGATCATGGCACTTTTTACA
ACCTTTATCACAACTCCTATAGTAATGGCTATTCATAAACCATCATCAACACAAAATCCT
CAACTCGAAAAACCACAAAAAAAGATCAAAAAACAAAACAATCTTCGAATCCTAGCGTGC
TTACGTGGCCCGAGGGATGCACGTGCACTCATTAACCTCATCGAGTCACTAAGGTCTGAA
AAAAATAACAATAACTACGCCTCAGTCACAAAACTCTATGTGATGAGACTCGTGGAGTTC
ACCGACCGACTCTCATCCATATCGATGGTCCAACGTGCCCGAAAAAATGGTTTTCCGTTC
ATCGGCCGAGTGCTTTTCCGAGATGACGCGACCGATCAAGTGGGCGCGGCGTTCGAGGCG
TATAGCACGCTAGGAAAGGTCATAGTCCGACCCACAATGGCTATCTCGGGTTTATCGGAT
TTGGATGAGGATATTATTCATGTTGCGGAGAAAAAACGAGTTGAACTGATTATTTTGCCG
TTCGATAAATATTGGCAAATGGAAGGAAATGAAGAAGTGGAGATTCATGCAGGGCACGGA
TGGAGGATGGCAAATGAGAGAGTGATGAGTCAAGCGTGGTGCTCGGTGGCGGTGGTGGTT
GATCGTGGATTACAATTGGTTGATAATGGGATGAGAATTTGCATTGTGTTTTTTGGTGGA
GCTGATTGTAGTAAAGCTTTGGAAATTGGTAGTAGAATGGTTGAACATCCTGCTATTAGG
GTTACATTAGTAAGATTCATTCATCATGGAAGTACTAATTTTGATGAAGTTGAAAGGACT
TTGGATGATTCTACTATTGCAGAATTCAAGATGAAGTGGGGTAAACAAATTGTATATAGT
GAGAAAGAAGCAAATAATTTGGTGAATGAAGTGTTGGAAATTGGAAAAAGTGGAGAATTT
GAACTTATGATAATAGGGAATAATAAAAGTAAGTTTCCACAAGGCATAATGGCAAAACTA
TTTGATGAGCAACAATTGAATAATTCAGAATTTGGGCCATTGGCTAATTTGTTGGCTTCA
TCAGACAAAGGGATAAAAAGTTCTGTTCTAGTGATTCAACAACAACAACAAGAAGCTAAG
TTTGGGAACTCAAAAGTGGCTAGTAGCTTTATTGATAAGGATATTGTGTGA