Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400022696
CDS Infomation

pacid=37434717 polypeptide=PGSC0003DMP400015462 locus=PGSC0003DMG400008802 ID=PGSC0003DMT400022696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAGCAAGGTACAACTTTTGTAATGAATGAGAGGCAAAGGTTGGCTGAACTACTGAGA
AATTGTTCCAAGATTTTGTCTTTAGATGTGGGAAAGCAAGTTCATGGAGCTGTATTAAGG
ATGGGTTATGCATTTGATTTGATGATATGCAATGATCTCATTGATATGTACGGGAAGTGC
AGTAGAGTGGAACTGGCTCGCTCAGTGTTTCACAAAATGCCTGAAAGAAATGTGGTTTCT
TGGACGGCTTTAATGTGTGGATATTTAAAACACGCTAATGCTCAACAATCCTTGTTGCTT
CTCTCTCGGATGCTCTTCTCAAATGTAAGACCCAATGAATACACTTTTTCCACCAACTTA
AAGGCATGTGGTATTCTTGGTGTTCTGGAAAATGGACAACAGATTCATGGTTTGTGTGCT
AAAAGTGGGTTTGAAAAGTATCCAGTTGCAGGTAATTCAATTATCGATATGTACTCAAGA
TGTGGGAAACTTGGTGAGGCTGAAAACAAGTTCCATGAAATGCCAGAAAAGAGTCTCATA
ACTTGGAATGTAATGATAGCAGGGTATGCAATGGGAGGATTTGGTGATAAATCTTTGTAT
CTGTTCAAACAAATGCAACAACAAGGAGAAATGCCAGACGAGTTTACGTTTGCAAGCACG
TTGAAGGCTTGCAGTGGTTTTAAGGCGGTGCGTGAAGGAAGCCAAATTCATGGTTTTCTT
ATTACTAGAGGATTCCTTATTTCCAGCCAAAAAGTTATTGCAGGCGCCCTAATTGATTTG
TATGTCAAATCAGGAAACTTGTTTGAAGCTCATAAGGTGTTTAGTCAAGTTGAACAGAAA
AGTGTGATATCATGGACGACACTGACCGTAGGGTATGCTCAAGAAGGCAAACTAACAGAG
GCAATGAACTTGTTCAAGCAGCTCAGGGAAAGTAGCATCACATTGGATGGGTTTGTGCTG
TCAAGCATGATGGGTATCTTTGCTGATTTTGCTCTAATTGAGCTTGGGAAACAATTGCAT
TGTTGTGCAGTAAAAATACCTTCTGGGTTAGACATATCTGTATTGAATTCAATCATGGAT
ATGTATCTAAAATGTGGGTTAATAGAGGAAGCCGAAACACTTTTTGATGTTATGCCAGAA
AAAAATGTGATTTCATGGACCGTTATGATCACCGGGTATGGGAAGTATGGTCTTGGTGGA
GAAGCAGTTGAACTATTCAAGAAAATGCATATGGATAGGATTGAGCCTGATGAGGTTTCC
TACTTAGCTCTGCTCACAGCTTGTAGTCATTCGGGGTTAGTTCAAGAAAGTGAAGAATAC
TTTTCAAAACTATGCAATTCAAATTGTTTAAAACCCTCAGTAGAGCATTATGCTTGCATG
GTTGATATCCTAGGTCGAGCTGGACGCCTAAGAGAAGCTAAGGTTGTGATAGAGAACATG
CCAGTAAAACCAAATGTTGGTATTTGGCAGACACTGCTTGGTGCATGTAGAGTACACAAG
AATGTAGAAATAGGAAGAGAAGTTGGGGAGATTCTCTTAAAATTAGATGGCAATAATCCG
GTGAATTATGTTATGATGTCAAACATTTTCGCTGATGCCCGCCTATGGGAAGAATGTGAG
GGATTAAGAGGACTGGTGAAAACAAAAGGTTTAAGAAAAGAAGCAGGACAAAGTTGGGTG
GAGATCGACAAGAAGATGCACTTTTTCTACAACAGAGATGAGACACATCCACTTACTAAA
GCTATCCATGAATTTTTGTATAAGATGGAGAAGAAAATGAAATATGAACTCGGTTACACA
CGGGAAGTAAGCTTTTCATTACACGATGTTGAAGATGAAACAAGGGATGAGAGCCTGAGA
TTTCACAGCGAGAAATTGGCAATTGGTTTGGCACTTCTTTCTGGTGCCGATGAAATTGAG
GGGAAGCCAATTCGTGTTTTCAAGAATTTGAGAGTTTGTGGAGATTGTCATGAGTACATC
AAGGGTTTGTCAAAGATTTTGAAGAAAATATTTCTTGTTAGAGATGCCAATAGGTTCCAT
AAGTTTGAGAACGGAACATGTTCCTGCAGAGACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015462
PEP Infomation

pacid=37434717 transcript=PGSC0003DMT400022696 locus=PGSC0003DMG400008802 ID=PGSC0003DMT400022696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MQQGTTFVMNERQRLAELLRNCSKILSLDVGKQVHGAVLRMGYAFDLMICNDLIDMYGKC
SRVELARSVFHKMPERNVVSWTALMCGYLKHANAQQSLLLLSRMLFSNVRPNEYTFSTNL
KACGILGVLENGQQIHGLCAKSGFEKYPVAGNSIIDMYSRCGKLGEAENKFHEMPEKSLI
TWNVMIAGYAMGGFGDKSLYLFKQMQQQGEMPDEFTFASTLKACSGFKAVREGSQIHGFL
ITRGFLISSQKVIAGALIDLYVKSGNLFEAHKVFSQVEQKSVISWTTLTVGYAQEGKLTE
AMNLFKQLRESSITLDGFVLSSMMGIFADFALIELGKQLHCCAVKIPSGLDISVLNSIMD
MYLKCGLIEEAETLFDVMPEKNVISWTVMITGYGKYGLGGEAVELFKKMHMDRIEPDEVS
YLALLTACSHSGLVQESEEYFSKLCNSNCLKPSVEHYACMVDILGRAGRLREAKVVIENM
PVKPNVGIWQTLLGACRVHKNVEIGREVGEILLKLDGNNPVNYVMMSNIFADARLWEECE
GLRGLVKTKGLRKEAGQSWVEIDKKMHFFYNRDETHPLTKAIHEFLYKMEKKMKYELGYT
REVSFSLHDVEDETRDESLRFHSEKLAIGLALLSGADEIEGKPIRVFKNLRVCGDCHEYI
KGLSKILKKIFLVRDANRFHKFENGTCSCRDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400022696
Transcript Infomation

pacid=37434717 locus=PGSC0003DMG400008802 ID=PGSC0003DMT400022696.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCAGCAAGGTACAACTTTTGTAATGAATGAGAGGCAAAGGTTGGCTGAACTACTGAGA
AATTGTTCCAAGATTTTGTCTTTAGATGTGGGAAAGCAAGTTCATGGAGCTGTATTAAGG
ATGGGTTATGCATTTGATTTGATGATATGCAATGATCTCATTGATATGTACGGGAAGTGC
AGTAGAGTGGAACTGGCTCGCTCAGTGTTTCACAAAATGCCTGAAAGAAATGTGGTTTCT
TGGACGGCTTTAATGTGTGGATATTTAAAACACGCTAATGCTCAACAATCCTTGTTGCTT
CTCTCTCGGATGCTCTTCTCAAATGTAAGACCCAATGAATACACTTTTTCCACCAACTTA
AAGGCATGTGGTATTCTTGGTGTTCTGGAAAATGGACAACAGATTCATGGTTTGTGTGCT
AAAAGTGGGTTTGAAAAGTATCCAGTTGCAGGTAATTCAATTATCGATATGTACTCAAGA
TGTGGGAAACTTGGTGAGGCTGAAAACAAGTTCCATGAAATGCCAGAAAAGAGTCTCATA
ACTTGGAATGTAATGATAGCAGGGTATGCAATGGGAGGATTTGGTGATAAATCTTTGTAT
CTGTTCAAACAAATGCAACAACAAGGAGAAATGCCAGACGAGTTTACGTTTGCAAGCACG
TTGAAGGCTTGCAGTGGTTTTAAGGCGGTGCGTGAAGGAAGCCAAATTCATGGTTTTCTT
ATTACTAGAGGATTCCTTATTTCCAGCCAAAAAGTTATTGCAGGCGCCCTAATTGATTTG
TATGTCAAATCAGGAAACTTGTTTGAAGCTCATAAGGTGTTTAGTCAAGTTGAACAGAAA
AGTGTGATATCATGGACGACACTGACCGTAGGGTATGCTCAAGAAGGCAAACTAACAGAG
GCAATGAACTTGTTCAAGCAGCTCAGGGAAAGTAGCATCACATTGGATGGGTTTGTGCTG
TCAAGCATGATGGGTATCTTTGCTGATTTTGCTCTAATTGAGCTTGGGAAACAATTGCAT
TGTTGTGCAGTAAAAATACCTTCTGGGTTAGACATATCTGTATTGAATTCAATCATGGAT
ATGTATCTAAAATGTGGGTTAATAGAGGAAGCCGAAACACTTTTTGATGTTATGCCAGAA
AAAAATGTGATTTCATGGACCGTTATGATCACCGGGTATGGGAAGTATGGTCTTGGTGGA
GAAGCAGTTGAACTATTCAAGAAAATGCATATGGATAGGATTGAGCCTGATGAGGTTTCC
TACTTAGCTCTGCTCACAGCTTGTAGTCATTCGGGGTTAGTTCAAGAAAGTGAAGAATAC
TTTTCAAAACTATGCAATTCAAATTGTTTAAAACCCTCAGTAGAGCATTATGCTTGCATG
GTTGATATCCTAGGTCGAGCTGGACGCCTAAGAGAAGCTAAGGTTGTGATAGAGAACATG
CCAGTAAAACCAAATGTTGGTATTTGGCAGACACTGCTTGGTGCATGTAGAGTACACAAG
AATGTAGAAATAGGAAGAGAAGTTGGGGAGATTCTCTTAAAATTAGATGGCAATAATCCG
GTGAATTATGTTATGATGTCAAACATTTTCGCTGATGCCCGCCTATGGGAAGAATGTGAG
GGATTAAGAGGACTGGTGAAAACAAAAGGTTTAAGAAAAGAAGCAGGACAAAGTTGGGTG
GAGATCGACAAGAAGATGCACTTTTTCTACAACAGAGATGAGACACATCCACTTACTAAA
GCTATCCATGAATTTTTGTATAAGATGGAGAAGAAAATGAAATATGAACTCGGTTACACA
CGGGAAGTAAGCTTTTCATTACACGATGTTGAAGATGAAACAAGGGATGAGAGCCTGAGA
TTTCACAGCGAGAAATTGGCAATTGGTTTGGCACTTCTTTCTGGTGCCGATGAAATTGAG
GGGAAGCCAATTCGTGTTTTCAAGAATTTGAGAGTTTGTGGAGATTGTCATGAGTACATC
AAGGGTTTGTCAAAGATTTTGAAGAAAATATTTCTTGTTAGAGATGCCAATAGGTTCCAT
AAGTTTGAGAACGGAACATGTTCCTGCAGAGACTATTGGTGA