Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400022574
CDS Infomation

pacid=37468214 polypeptide=PGSC0003DMP400015385 locus=PGSC0003DMG400008752 ID=PGSC0003DMT400022574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAGAGTGCATTTCAATCCATATTGGTCAGGCCGGTATTCAGGTCGGAAATGCTTGC
TGGGAACTTTATTGCCTCGAGCACGGCATTCAGCCTGATGGCCAAATGCCAGGTGACAAA
ACTGTTGGAGGGGGTGATGATGCATTCAACACCTTCTTCAGTGAAACTGGAGCTGGAAAG
CATGTGCCTAGAGCTGTCTTTGTAGATCTTGAGCCCACTGTCATTGATGAAGTGAGGACA
GGAACTTACCGTCAGCTCTTTCACCCTGAACAGCTCATAAGTGGCAAAGAAGATGCAGCC
AACAACTTTGCTCGTGGCCACTATACCATTGGGAAAGAGATAGTTGATCTCTGCTTGGAT
CGCATCCGAAAGCTTGCAGACAACTGTACTGGTCTTCAAGGGTTCCTGGTCTTTAATGCT
GTTGGTGGTGGTACCGGTTCAGGTCTGGGGTCACTTCTGCTGGAGCGTCTATCAGTTGAC
TATGGAAAGAAATCCAAACTTGGTTTCACAATTTATCCCTCACCACAGGTCTCAACTTCT
GTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTGTCAACTCATTCTCTACTTGAGCACACTGATGTG
TCAATCCTTTTGGATAATGAAGCCATTTATGACATTTGCAGGCGCTCATTGGACATTGAG
CGCCCTACCTACACCAACCTCAATCGCCTTATCTCACAGGTTATATCTTCTCTGACAGCT
TCTTTGAGGTTTGATGGAGCTCTGAATGTTGATGTGAATGAGTTCCAGACCAATCTTGTC
CCCTATCCCAGGATCCATTTTATGCTTTCCTCATACGCCCCTGTCATTTCTGCTGAGAAG
GCATACCATGAGCAGCTTTCAGTTGCAGAAATCACTAACAGTGCCTTTGAGCCATCTTCT
ATGATGGTTAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCTTGCTGTCTCATGTTCCGT
GGTGATGTGGTGCCAAAGGATGTTAATGCTGCTGTGGCCACCATCAAGACTAAGCGCACC
ATCCAATTTGTTGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAGTGTGGTATCAACTACCAGCCACCA
ACTGTTGTACCTGGTGGTGACCTTGCTAAGGTGCAGAGGGCTGTGTGCATGATTTCCAAC
TCAACGAGTGTTGCTGAGGTCTTCTCACGCATTGACCACAAGTTTGATCTGATGTATGCC
AAGCGTGCTTTTGTGCATTGGTATGTCGGTGAGGGCATGGAGGAAGGTGAATTCAGTGAA
GCACGTGAAGATCTTGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGCTGAAGCTGAT
GGAGTAGGTGATGATGATGATGAGGAGTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015385
PEP Infomation

pacid=37468214 transcript=PGSC0003DMT400022574 locus=PGSC0003DMG400008752 ID=PGSC0003DMT400022574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRECISIHIGQAGIQVGNACWELYCLEHGIQPDGQMPGDKTVGGGDDAFNTFFSETGAGK
HVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLISGKEDAANNFARGHYTIGKEIVDLCLD
RIRKLADNCTGLQGFLVFNAVGGGTGSGLGSLLLERLSVDYGKKSKLGFTIYPSPQVSTS
VVEPYNSVLSTHSLLEHTDVSILLDNEAIYDICRRSLDIERPTYTNLNRLISQVISSLTA
SLRFDGALNVDVNEFQTNLVPYPRIHFMLSSYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNSAFEPSS
MMVKCDPRHGKYMACCLMFRGDVVPKDVNAAVATIKTKRTIQFVDWCPTGFKCGINYQPP
TVVPGGDLAKVQRAVCMISNSTSVAEVFSRIDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSE
AREDLAALEKDYEEVGAEADGVGDDDDEEY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400022574
Transcript Infomation

pacid=37468214 locus=PGSC0003DMG400008752 ID=PGSC0003DMT400022574.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAGAGTGCATTTCAATCCATATTGGTCAGGCCGGTATTCAGGTCGGAAATGCTTGC
TGGGAACTTTATTGCCTCGAGCACGGCATTCAGCCTGATGGCCAAATGCCAGGTGACAAA
ACTGTTGGAGGGGGTGATGATGCATTCAACACCTTCTTCAGTGAAACTGGAGCTGGAAAG
CATGTGCCTAGAGCTGTCTTTGTAGATCTTGAGCCCACTGTCATTGATGAAGTGAGGACA
GGAACTTACCGTCAGCTCTTTCACCCTGAACAGCTCATAAGTGGCAAAGAAGATGCAGCC
AACAACTTTGCTCGTGGCCACTATACCATTGGGAAAGAGATAGTTGATCTCTGCTTGGAT
CGCATCCGAAAGCTTGCAGACAACTGTACTGGTCTTCAAGGGTTCCTGGTCTTTAATGCT
GTTGGTGGTGGTACCGGTTCAGGTCTGGGGTCACTTCTGCTGGAGCGTCTATCAGTTGAC
TATGGAAAGAAATCCAAACTTGGTTTCACAATTTATCCCTCACCACAGGTCTCAACTTCT
GTTGTTGAGCCTTACAACAGTGTCCTGTCAACTCATTCTCTACTTGAGCACACTGATGTG
TCAATCCTTTTGGATAATGAAGCCATTTATGACATTTGCAGGCGCTCATTGGACATTGAG
CGCCCTACCTACACCAACCTCAATCGCCTTATCTCACAGGTTATATCTTCTCTGACAGCT
TCTTTGAGGTTTGATGGAGCTCTGAATGTTGATGTGAATGAGTTCCAGACCAATCTTGTC
CCCTATCCCAGGATCCATTTTATGCTTTCCTCATACGCCCCTGTCATTTCTGCTGAGAAG
GCATACCATGAGCAGCTTTCAGTTGCAGAAATCACTAACAGTGCCTTTGAGCCATCTTCT
ATGATGGTTAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCTTGCTGTCTCATGTTCCGT
GGTGATGTGGTGCCAAAGGATGTTAATGCTGCTGTGGCCACCATCAAGACTAAGCGCACC
ATCCAATTTGTTGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAGTGTGGTATCAACTACCAGCCACCA
ACTGTTGTACCTGGTGGTGACCTTGCTAAGGTGCAGAGGGCTGTGTGCATGATTTCCAAC
TCAACGAGTGTTGCTGAGGTCTTCTCACGCATTGACCACAAGTTTGATCTGATGTATGCC
AAGCGTGCTTTTGTGCATTGGTATGTCGGTGAGGGCATGGAGGAAGGTGAATTCAGTGAA
GCACGTGAAGATCTTGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGCTGAAGCTGAT
GGAGTAGGTGATGATGATGATGAGGAGTACTGA