Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400022056
CDS Infomation

pacid=37449609 polypeptide=PGSC0003DMP400015021 locus=PGSC0003DMG400008553 ID=PGSC0003DMT400022056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAACTTATTCATCATGTGCAAAGAAATTACTTTTTGTCTACTACTTGTTCATCATT
TCTTCTTGTTGCATATTTAATTTTTCATATGGAAGAAATTTAAATCCTAATTTCAAAGTT
AAAGCTGTTAATCTTGGTGGCTGGCTTATTACTGAAGGATGGATTAAACCTTCTCTTTTT
GATGGCATCCCAAATAAAGATTTTCTGGATGGGACTGGATTGCAATTCAAATCAGTAACT
GTTGGGAAGTATTTATGTGCTGAATTAGGAGGAGGAAATATTATTGTTGCTAATAGAACA
GATGCTTCTGGATGGGAAACATTCAAAATTTGGAGGATAAATAGCACCACATTTAATTTT
AGGGTGTTTAATAAAGAATTTGTGGGAATTGATGGAAGTGGAAATGTTGTAGCAGTTGAA
AACAAAGTTGGAATTTCAGAGACTTTTGAGATTGTGAGAAATTCTGATGATCCAAATCGT
GTAAGGATTAAATCAACAAATGGTTTCTTCTTACAGGTAAAAACAGAAGAACTTGTGACA
GCTGATAATGGAGGTAATGGGGGGTGGGGTGATAATGATCCTTCTGTTTTCATCATCAAA
ACTAGTGGAAGACTTGAAGGAGAATTTCAAATAACTAATGGCTATGGTCCAATCATGGCA
CCACAAGTTATGAGAGAACATTGGAGAACATATATAGTAGAAGAAGACTTCAAGTTCATA
GCAAACAATGGACTAAATGCAGTGAGAATTCCAATTGGATGGTGGATTGCAAGTGACCCA
ACACCTCCAAAACCCTATGTTGGAGGCTCATTACTTGCCTTAGACAATGCCTTTTTATGG
GCCAGGAAATATGGACTTAAAGTTATAATAGATCTACATGCTGCACCTGGTTCCCAAAAT
CCTTGGGAGCACAGTTCCAACAGAGATGGTACTATAGAATGGGGAAAAACTGATGACACC
ATTCAACAAACAGTTGAAGTAATTGACTTCCTAACAGCCAGGTATGCCAAGAATCCAAGC
CTATATGCAGTGGAGTTAATCAATGAGCCATTAGCACCTGAAGTTACATTAGACATGGTC
AAAAAATTGTACCAAGATGGATACAATGCTGTCAGAAAACATTCTTCTACAGCATATGTT
GTAATGTCCAACAGATTAGGATCTCCAGACGCAACAGAACTTTTGACATTTGCAAGTGGC
TTAAAGGGATCTGTTATTGATGTTCATTATTACAACCTATTCTCTGGCATATATGACAAC
ATGTCTGTCCAACAAAATCTTGATTATGTCAACACTAATCGTACTGCTCAACTCAATACT
GTCACTCAATCTAATGGTCCTCTCACTTTTGTTGGGGAATGGGTTGCTGAATGGCAAGTT
AGAGATGCAACAAAAGAGGATTACCAAAAGTATGCTAAGGCTCAATTAGAAGTGTTTGGA
CGTGCAACATTTGGTTGGGCTTATTGGACATTGAAAAATGTCAACAACCATTGGAGTATG
GAGTGGATGATTAAAAATGGCTATATCAAACTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400015021
PEP Infomation

pacid=37449609 transcript=PGSC0003DMT400022056 locus=PGSC0003DMG400008553 ID=PGSC0003DMT400022056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MTTYSSCAKKLLFVYYLFIISSCCIFNFSYGRNLNPNFKVKAVNLGGWLITEGWIKPSLF
DGIPNKDFLDGTGLQFKSVTVGKYLCAELGGGNIIVANRTDASGWETFKIWRINSTTFNF
RVFNKEFVGIDGSGNVVAVENKVGISETFEIVRNSDDPNRVRIKSTNGFFLQVKTEELVT
ADNGGNGGWGDNDPSVFIIKTSGRLEGEFQITNGYGPIMAPQVMREHWRTYIVEEDFKFI
ANNGLNAVRIPIGWWIASDPTPPKPYVGGSLLALDNAFLWARKYGLKVIIDLHAAPGSQN
PWEHSSNRDGTIEWGKTDDTIQQTVEVIDFLTARYAKNPSLYAVELINEPLAPEVTLDMV
KKLYQDGYNAVRKHSSTAYVVMSNRLGSPDATELLTFASGLKGSVIDVHYYNLFSGIYDN
MSVQQNLDYVNTNRTAQLNTVTQSNGPLTFVGEWVAEWQVRDATKEDYQKYAKAQLEVFG
RATFGWAYWTLKNVNNHWSMEWMIKNGYIKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400022056
Transcript Infomation

pacid=37449609 locus=PGSC0003DMG400008553 ID=PGSC0003DMT400022056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGACAACTTATTCATCATGTGCAAAGAAATTACTTTTTGTCTACTACTTGTTCATCATT
TCTTCTTGTTGCATATTTAATTTTTCATATGGAAGAAATTTAAATCCTAATTTCAAAGTT
AAAGCTGTTAATCTTGGTGGCTGGCTTATTACTGAAGGATGGATTAAACCTTCTCTTTTT
GATGGCATCCCAAATAAAGATTTTCTGGATGGGACTGGATTGCAATTCAAATCAGTAACT
GTTGGGAAGTATTTATGTGCTGAATTAGGAGGAGGAAATATTATTGTTGCTAATAGAACA
GATGCTTCTGGATGGGAAACATTCAAAATTTGGAGGATAAATAGCACCACATTTAATTTT
AGGGTGTTTAATAAAGAATTTGTGGGAATTGATGGAAGTGGAAATGTTGTAGCAGTTGAA
AACAAAGTTGGAATTTCAGAGACTTTTGAGATTGTGAGAAATTCTGATGATCCAAATCGT
GTAAGGATTAAATCAACAAATGGTTTCTTCTTACAGGTAAAAACAGAAGAACTTGTGACA
GCTGATAATGGAGGTAATGGGGGGTGGGGTGATAATGATCCTTCTGTTTTCATCATCAAA
ACTAGTGGAAGACTTGAAGGAGAATTTCAAATAACTAATGGCTATGGTCCAATCATGGCA
CCACAAGTTATGAGAGAACATTGGAGAACATATATAGTAGAAGAAGACTTCAAGTTCATA
GCAAACAATGGACTAAATGCAGTGAGAATTCCAATTGGATGGTGGATTGCAAGTGACCCA
ACACCTCCAAAACCCTATGTTGGAGGCTCATTACTTGCCTTAGACAATGCCTTTTTATGG
GCCAGGAAATATGGACTTAAAGTTATAATAGATCTACATGCTGCACCTGGTTCCCAAAAT
CCTTGGGAGCACAGTTCCAACAGAGATGGTACTATAGAATGGGGAAAAACTGATGACACC
ATTCAACAAACAGTTGAAGTAATTGACTTCCTAACAGCCAGGTATGCCAAGAATCCAAGC
CTATATGCAGTGGAGTTAATCAATGAGCCATTAGCACCTGAAGTTACATTAGACATGGTC
AAAAAATTGTACCAAGATGGATACAATGCTGTCAGAAAACATTCTTCTACAGCATATGTT
GTAATGTCCAACAGATTAGGATCTCCAGACGCAACAGAACTTTTGACATTTGCAAGTGGC
TTAAAGGGATCTGTTATTGATGTTCATTATTACAACCTATTCTCTGGCATATATGACAAC
ATGTCTGTCCAACAAAATCTTGATTATGTCAACACTAATCGTACTGCTCAACTCAATACT
GTCACTCAATCTAATGGTCCTCTCACTTTTGTTGGGGAATGGGTTGCTGAATGGCAAGTT
AGAGATGCAACAAAAGAGGATTACCAAAAGTATGCTAAGGCTCAATTAGAAGTGTTTGGA
CGTGCAACATTTGGTTGGGCTTATTGGACATTGAAAAATGTCAACAACCATTGGAGTATG
GAGTGGATGATTAAAAATGGCTATATCAAACTTTAA