Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400021616
CDS Infomation	pacid=37477599 polypeptide=PGSC0003DMP400014719 locus=PGSC0003DMG400008386 ID=PGSC0003DMT400021616.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGCCTCCAAATCCCCAACAATTTCAGCAATTTCTCAGCAGTGTTCTCTCTCAGCGT GGCCCATCTGCACTTCCTTATGCTGAAGATGTCAAATGGCTGATCCGTCAACATCTCCTT TCTTTAATCGATATTTACCCTTCACTTCAGCCGAAAACTGCTTCATTTACTCATAATGAT GGAAGGACTGTGAATCTATTGCAAGCTGTAGGTACTGTTCCGATGGTTTATCTAGATCGT CCGTATAATATTCCGGTGATTATTTGGTTGATGGAATCTTACCCACGTCATCCGCCTTTG GTTTTTGTGAATCCGACTAGGGATATGGTTATTAAAAAACCTCATCCGTTTGTGAATCCA TCTGGGGTTGTGTCGATTCCATATTTGCAGAATTGGATATACCCTAGTTCGAATCTTGTT GAATTGGTTCGTAATTTGAGTCATTTTTTTGGAAGGGATCCTCCGCTTTATGCGAAAGTA CAAGCACATCCATCAAACCCTAACCCTAGTCCTACTCCTACCTCTCATCCTCCGCCAAGT ACGAGTTTTCCTAATCACAGTTCGCCAGTTGGGTCATCTGGGATTCGGCCGGCGATACCT CCTAGGCCAGTTCAACAACCACCTTATGGTGCAGTGAAACAGGATGATTGGGAGGATGTT TTTAGGCGGAACGCGACAGATAAGCTGCTTGTTGACTTGCATAATGATATAGTTGGGTTG AGGAATGCACAGGAGAAGGATATGGATGGGTTGTTTAATGCTCAGGGAGTGTTGAAGCAG CGGGAGGAGCAGTTGAAACAAGGGTTAAAGGAAATGCAGGATGAGAAAGAGGGGTTGGAG CAGCAATTACAGATGGTTTTGATGAATAGTGATGTATTAGAGGGATGGCTGAGGGAGAAT GAGGGGAAAGTGACCAATTTAGGGAATGTGGATGTGGATACGGCCTTTGAGCCATGTGAT AGTCTTTCCAAGCAGATGCTCGATTGCACGGCGTCAGATTTGGCATTAGAGGATGTGATT TATTCGTTGGACAAAGCTATACAGGGTGGGGCAATACCATTTGACCAGTACTTGAGGAAC ATAAGGTTGTTATCGCGTGAGCAATTCTTTCATCGTGCTACAGCATCAAAAGTTAGGGCT GCTCAGATGCAGGCTCAAGTTGCTAATATGGCTGCTAGAACATCACAATATGCATTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400014719
PEP Infomation	pacid=37477599 transcript=PGSC0003DMT400021616 locus=PGSC0003DMG400008386 ID=PGSC0003DMT400021616.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MEPPNPQQFQQFLSSVLSQRGPSALPYAEDVKWLIRQHLLSLIDIYPSLQPKTASFTHND GRTVNLLQAVGTVPMVYLDRPYNIPVIIWLMESYPRHPPLVFVNPTRDMVIKKPHPFVNP SGVVSIPYLQNWIYPSSNLVELVRNLSHFFGRDPPLYAKVQAHPSNPNPSPTPTSHPPPS TSFPNHSSPVGSSGIRPAIPPRPVQQPPYGAVKQDDWEDVFRRNATDKLLVDLHNDIVGL RNAQEKDMDGLFNAQGVLKQREEQLKQGLKEMQDEKEGLEQQLQMVLMNSDVLEGWLREN EGKVTNLGNVDVDTAFEPCDSLSKQMLDCTASDLALEDVIYSLDKAIQGGAIPFDQYLRN IRLLSREQFFHRATASKVRAAQMQAQVANMAARTSQYAL*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400021616
Transcript Infomation	pacid=37477599 locus=PGSC0003DMG400008386 ID=PGSC0003DMT400021616.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGAGCCTCCAAATCCCCAACAATTTCAGCAATTTCTCAGCAGTGTTCTCTCTCAGCGT GGCCCATCTGCACTTCCTTATGCTGAAGATGTCAAATGGCTGATCCGTCAACATCTCCTT TCTTTAATCGATATTTACCCTTCACTTCAGCCGAAAACTGCTTCATTTACTCATAATGAT GGAAGGACTGTGAATCTATTGCAAGCTGTAGGTACTGTTCCGATGGTTTATCTAGATCGT CCGTATAATATTCCGGTGATTATTTGGTTGATGGAATCTTACCCACGTCATCCGCCTTTG GTTTTTGTGAATCCGACTAGGGATATGGTTATTAAAAAACCTCATCCGTTTGTGAATCCA TCTGGGGTTGTGTCGATTCCATATTTGCAGAATTGGATATACCCTAGTTCGAATCTTGTT GAATTGGTTCGTAATTTGAGTCATTTTTTTGGAAGGGATCCTCCGCTTTATGCGAAAGTA CAAGCACATCCATCAAACCCTAACCCTAGTCCTACTCCTACCTCTCATCCTCCGCCAAGT ACGAGTTTTCCTAATCACAGTTCGCCAGTTGGGTCATCTGGGATTCGGCCGGCGATACCT CCTAGGCCAGTTCAACAACCACCTTATGGTGCAGTGAAACAGGATGATTGGGAGGATGTT TTTAGGCGGAACGCGACAGATAAGCTGCTTGTTGACTTGCATAATGATATAGTTGGGTTG AGGAATGCACAGGAGAAGGATATGGATGGGTTGTTTAATGCTCAGGGAGTGTTGAAGCAG CGGGAGGAGCAGTTGAAACAAGGGTTAAAGGAAATGCAGGATGAGAAAGAGGGGTTGGAG CAGCAATTACAGATGGTTTTGATGAATAGTGATGTATTAGAGGGATGGCTGAGGGAGAAT GAGGGGAAAGTGACCAATTTAGGGAATGTGGATGTGGATACGGCCTTTGAGCCATGTGAT AGTCTTTCCAAGCAGATGCTCGATTGCACGGCGTCAGATTTGGCATTAGAGGATGTGATT TATTCGTTGGACAAAGCTATACAGGGTGGGGCAATACCATTTGACCAGTACTTGAGGAAC ATAAGGTTGTTATCGCGTGAGCAATTCTTTCATCGTGCTACAGCATCAAAAGTTAGGGCT GCTCAGATGCAGGCTCAAGTTGCTAATATGGCTGCTAGAACATCACAATATGCATTGTGA