Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400021424
CDS Infomation

pacid=37428870 polypeptide=PGSC0003DMP400014579 locus=PGSC0003DMG400008311 ID=PGSC0003DMT400021424.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCAATGCAATCTCTATCATTTCGTCCATCTCCACTCGATCCTCTTCGAAAAAAC
ATGCCCCAATTCACCAATGTAAGGTCATTGGGTGCTAAAAGAGTGCCTTTTATTATATCA
GCTTCTGCATCCACTGTTTCTGCTCCCAAAAGAGAGAAAGACCCAAAGAAAAGGGTTGTT
ATAACTGGGACGGGTCTTGTTTCTGTGTTCGGGAATGATGTCGATACTTACTATGAAAGA
CTTTTGGCTGGTGAAAGTGGGATTTCGCTTATTGATCGTTTTGATGCTTCTAAGTTTCCT
ACAAGATTTGGGGGACAAATTCGTGGGTTTACATCTGAAGGGTATATTGATGGGAAGAAT
GATAGGAGGCTTGATGATTGTTTAAGGTATGCCATTGTTGCTGGCAAGAAAGCTTTGGAA
AATGCAGATCTTGGGGGTGATAGATTAGAAAAGATTGATAAGGAGCGAGCAGGTGTTCTT
GTAGGAACAGGAATGGGTGGTCTTACGGTTTTCTCAGATGGCGTCCAGAATTTAATTGAA
AAGGGTCATAGGAAAATTACTCCATTTTTTATACCATATGCCATAACAAACATGGGTTCT
GCTTTGCTTGGTATTGATCTAGGTTTTATGGGACCAAACTACTCAATCTCAACTGCTTGT
GCTACCTCCAATTACTGTTTTTATGCTGCCGCAAATCATATTCGCAGAGGTGAAGCTGAT
TTGATGCTTGCTGGTGGAACTGAAGCTGCCATGATACCTATTGGTTTAGGAGGTTTTGTG
GCATGCAGAGCTTTGTCTCAAAGGAATGATGATCCACAAACTGCTTCCAGACCATGGGAC
AAAGATAGAGATGGATTTGTTATGGGAGAGGGGGCTGGAATCTTGGTGATGGAAAGTTTG
GAGCATGCAATGAAACGAGGAGCACCAATAATTGCAGAGTATTTGGGTGGTGCAGTTAAT
TGTGATGCTTATCACATGACTGATCCCCGAGCTGATGGTCTTGGTGTTTCTTCATGTATT
CTTAGCAGCCTTGAAGATGCTGGAGTGTCACCAGAAGAGGTTAACTACATTAATGCTCAT
GCAACTTCCACCATTGTTGGTGATCTAGCCGAAATAAATGCTGTCAAGAAGGTTTTCAAG
ACCACCTCAGGAATCAAAATGAATGCAACCAAGTCTATGATAGGGCATTGCCTCGGTGCT
GCTGGTGGTCTGGAAGCTATCGCAACAATTAAAGCTATTACAACCGGCTGGGTGCATCCT
TCAATTAACCAATTCAATCCTGAGCCTTCAGTGGAGTTTGATACTGTTCCAAACAAAAAA
CAGCAGCATGAAGTGAATGTTGCAATTTCCAATTCCTTTGGTTTTGGTGGTCACAACTCT
GTCGTCGCCTTTTCTGCATTCAAGCCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400014579
PEP Infomation

pacid=37428870 transcript=PGSC0003DMT400021424 locus=PGSC0003DMG400008311 ID=PGSC0003DMT400021424.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEAMQSLSFRPSPLDPLRKNMPQFTNVRSLGAKRVPFIISASASTVSAPKREKDPKKRVV
ITGTGLVSVFGNDVDTYYERLLAGESGISLIDRFDASKFPTRFGGQIRGFTSEGYIDGKN
DRRLDDCLRYAIVAGKKALENADLGGDRLEKIDKERAGVLVGTGMGGLTVFSDGVQNLIE
KGHRKITPFFIPYAITNMGSALLGIDLGFMGPNYSISTACATSNYCFYAAANHIRRGEAD
LMLAGGTEAAMIPIGLGGFVACRALSQRNDDPQTASRPWDKDRDGFVMGEGAGILVMESL
EHAMKRGAPIIAEYLGGAVNCDAYHMTDPRADGLGVSSCILSSLEDAGVSPEEVNYINAH
ATSTIVGDLAEINAVKKVFKTTSGIKMNATKSMIGHCLGAAGGLEAIATIKAITTGWVHP
SINQFNPEPSVEFDTVPNKKQQHEVNVAISNSFGFGGHNSVVAFSAFKP*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400021424
Transcript Infomation

pacid=37428870 locus=PGSC0003DMG400008311 ID=PGSC0003DMT400021424.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCAATGCAATCTCTATCATTTCGTCCATCTCCACTCGATCCTCTTCGAAAAAAC
ATGCCCCAATTCACCAATGTAAGGTCATTGGGTGCTAAAAGAGTGCCTTTTATTATATCA
GCTTCTGCATCCACTGTTTCTGCTCCCAAAAGAGAGAAAGACCCAAAGAAAAGGGTTGTT
ATAACTGGGACGGGTCTTGTTTCTGTGTTCGGGAATGATGTCGATACTTACTATGAAAGA
CTTTTGGCTGGTGAAAGTGGGATTTCGCTTATTGATCGTTTTGATGCTTCTAAGTTTCCT
ACAAGATTTGGGGGACAAATTCGTGGGTTTACATCTGAAGGGTATATTGATGGGAAGAAT
GATAGGAGGCTTGATGATTGTTTAAGGTATGCCATTGTTGCTGGCAAGAAAGCTTTGGAA
AATGCAGATCTTGGGGGTGATAGATTAGAAAAGATTGATAAGGAGCGAGCAGGTGTTCTT
GTAGGAACAGGAATGGGTGGTCTTACGGTTTTCTCAGATGGCGTCCAGAATTTAATTGAA
AAGGGTCATAGGAAAATTACTCCATTTTTTATACCATATGCCATAACAAACATGGGTTCT
GCTTTGCTTGGTATTGATCTAGGTTTTATGGGACCAAACTACTCAATCTCAACTGCTTGT
GCTACCTCCAATTACTGTTTTTATGCTGCCGCAAATCATATTCGCAGAGGTGAAGCTGAT
TTGATGCTTGCTGGTGGAACTGAAGCTGCCATGATACCTATTGGTTTAGGAGGTTTTGTG
GCATGCAGAGCTTTGTCTCAAAGGAATGATGATCCACAAACTGCTTCCAGACCATGGGAC
AAAGATAGAGATGGATTTGTTATGGGAGAGGGGGCTGGAATCTTGGTGATGGAAAGTTTG
GAGCATGCAATGAAACGAGGAGCACCAATAATTGCAGAGTATTTGGGTGGTGCAGTTAAT
TGTGATGCTTATCACATGACTGATCCCCGAGCTGATGGTCTTGGTGTTTCTTCATGTATT
CTTAGCAGCCTTGAAGATGCTGGAGTGTCACCAGAAGAGGTTAACTACATTAATGCTCAT
GCAACTTCCACCATTGTTGGTGATCTAGCCGAAATAAATGCTGTCAAGAAGGTTTTCAAG
ACCACCTCAGGAATCAAAATGAATGCAACCAAGTCTATGATAGGGCATTGCCTCGGTGCT
GCTGGTGGTCTGGAAGCTATCGCAACAATTAAAGCTATTACAACCGGCTGGGTGCATCCT
TCAATTAACCAATTCAATCCTGAGCCTTCAGTGGAGTTTGATACTGTTCCAAACAAAAAA
CAGCAGCATGAAGTGAATGTTGCAATTTCCAATTCCTTTGGTTTTGGTGGTCACAACTCT
GTCGTCGCCTTTTCTGCATTCAAGCCTTAA