Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400021049
CDS Infomation

pacid=37476771 polypeptide=PGSC0003DMP400014331 locus=PGSC0003DMG400008146 ID=PGSC0003DMT400021049.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTAACTTTGAGGTTGTTCACTGTTTTGCTGGTGGGGTTGTTGTTAAGGTCTCAATTT
GGGATTGTAAAGGCTCTTCATGAACAAGCCATTTTGGAAGCAATTGGCAAAGAGCTAGCA
ATACCTGGTTGGGATCTGAATAGCACTGATTTCTGTTCTTGGCATAGCATTAGTTGCAGC
AGCTCAAACAGTTCAATGGTGGAAAGGCTGAATCTTTCGGGTTTTCGATTACAAGGTAAT
GTGACTCTAATATCTGAGCTCAAAGGATTGAAATGGCTGGACCTTTCTAATAACAATTTC
CAAGGTTCAATCCCACAAGCATTTGGGAATTTGTCTGAGCTTCAGTTTCTTGATTTGTCT
TTTAACATGTTTAGAAACTCTATTCCTGGTGAATTAGGTAAGCTCAAGAACCTTAGAGCA
TTGAATCTTTCAAACAATATGCTCACTGGTTCAATACCTGATGAGCTTGAAGGGATGGAG
AATTTGCTTTATTTCCAATTATTTACCAATAAATTGAGTGGTTTTATTCCAATGTGGATT
GGGAATTTGACTAATCTTAGAGTGTTTGCAGCCTATGAGAATGAGTTTAGTGGTGATATT
CCAGTTAACTTAGGCTTACATTCTGAGCTTTTGTTGTTAAATCTTCATTCAAATCAGCTT
GAAGGGACAATTCCTGAGAGTATTTTTACTATGGAAAAGCTTGAATTTTTAGTTCTGACT
AATAATAAGTTGACTGGCACTATTCCTGATTCAATTGTGAATTGCAAAGGCCTTTCAAGC
ATTAGAATTGGGAATAACAAGCTGATAGGTGGTATCCCTAAAGGAATTGGAAATATAAGT
AGTCTTGCTTATTTTGAAGCAGATAATAATACACTTTCCGGGGAAATCGTCTCAGGATTT
GCGAAATGCTCTAATCTCACTCTTCTTAATTTAGCTTCGAATGGATTTTCCGGAACTATC
ACTCCAGAGTTTGGTGAGCTCGATAATCTACAGGAGTTGATTGTTCCGGGGAATAATCTC
TATGGAGAGATTCCAACTTCAGTTCTGAGGTGCAAGAATCTCAACAAGCTTGATTTAAGT
AACAACAAGTTCAATGGAACCATTCCAGGAGATATATGCAACACAACCAAATTGCAGTTC
TTGTTGTTGGGACAGAATTCCTTGAAAGGGGAAATACCCCGTGAGATAGGGAACTGCGTA
AAACTGCTTGAGTTGCAAATGGGGAGTAACTATCTTACTGGAAGCATCCCTTCTGAGATT
GGTCATATGAAGAACTTACAGATTTCATTGAATTTGAGTCATAATCATCTCCATGGACAG
TTGCCTAAGGATCTTGGAAAACTTGACAAGTTGGTTTCTTTAGATGTATCTAATAATCAG
CTGTCGGGGAATATTCCGTTGGAATTGAAAGGCATGTTGAGCTTGATAGAGGTTAACTTT
TCGAGCAATCAATTCACAGGACCAATACCTGCTTTTGCTCCATTTGAGAAGAGCTTAAAT
TCAAGCTTTCTTGGAAACAAAGGGCTCTGTGGTGAGCCTTTGAGTAGTGATTGTGGATAT
GATTTTGAACACAACGGTAATCATCACCGAGTTTCCTACCGGCTCATCTTGGCTGTTGTT
GGTTCTGGTTTGGCAATTTTTACAGTTGTCACAGTGGTTGTTTTACTATACATGATGAGG
GAGAAACAAGAGAAAACCACCATGGAAGATGGAAATACCACTGATGAAACTTGTAGCAAA
CCAGTGATCATAGCAGGGAATGTTTTCGATGAAAATCTCAAGCAAGCAATAGATTTTGAT
GCAGTTGTAAAGGCAGTCAGGAAAGATACAAATAAGATTAGTACTGGAACTTTCAGTGAT
GTGTATAGAGCAGACATGCCTTCCGGGATGATTTTGTATGTTAAGAGCCTAAAGTCGATG
GACAAGACTATAGTTCATCACCAGAGCAAGATGATCAGAGAGCTTGAAAAGCTAAGTAAA
CTCTGTCATGATAATCTGACGAGGCCTCTCGGGTTTGCAATCTATGAGGAAGTTGTTCTA
CTCTTACATCAATACTATCCCAATGGGACATTGGCTCAGTTTCTTCATGAGTTTAGCCAG
AAACCTGAGTACGAACCTGACTGGCCTACAAGACTTTCCATTGCCATTGGCGTTGCAGAA
GGGTTAGCGTTCCTTCATCATGTGGCCATAATCCATCTTGATGTTTCTTCAGGGAATGTG
TTTCTTGATTCTAAATTCACCCCTTTGGTTGCTGAAGTTGAAATATCCCGACTTCTTGAT
CCATCTAGAGGGACTGCAAGTATTAGTGCTGTTGCTGGCTCATTTGGATACATTCCCCCA
GAGTATGCATATACAATGCAAGTAACAGCTCCCGGAAATGTTTATAGCTATGGCGTTGTT
TTGCTCGAGATCCTTACCACCCGACTACCCGTTGATGAAGCTTTTGGTGAAGGAGTTGAT
CTGGTCAGGTGGGTACATGGTGCTTCTGCGAGAGGAGAAACACCAGAGCAGATACTTGAT
GCAAGACTTAGCACCATTTCTTTTGCTTGGAGGAAAGAAATGCTTGCAACTCTAAAAGTC
GCATTGATGTGCACCGATACCATTCCAGCAAAACGACCAAGAATGAAGAAGGTGATAGAA
ATGCTTCAAGAGGTTACACAGAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400014331
PEP Infomation

pacid=37476771 transcript=PGSC0003DMT400021049 locus=PGSC0003DMG400008146 ID=PGSC0003DMT400021049.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVTLRLFTVLLVGLLLRSQFGIVKALHEQAILEAIGKELAIPGWDLNSTDFCSWHSISCS
SSNSSMVERLNLSGFRLQGNVTLISELKGLKWLDLSNNNFQGSIPQAFGNLSELQFLDLS
FNMFRNSIPGELGKLKNLRALNLSNNMLTGSIPDELEGMENLLYFQLFTNKLSGFIPMWI
GNLTNLRVFAAYENEFSGDIPVNLGLHSELLLLNLHSNQLEGTIPESIFTMEKLEFLVLT
NNKLTGTIPDSIVNCKGLSSIRIGNNKLIGGIPKGIGNISSLAYFEADNNTLSGEIVSGF
AKCSNLTLLNLASNGFSGTITPEFGELDNLQELIVPGNNLYGEIPTSVLRCKNLNKLDLS
NNKFNGTIPGDICNTTKLQFLLLGQNSLKGEIPREIGNCVKLLELQMGSNYLTGSIPSEI
GHMKNLQISLNLSHNHLHGQLPKDLGKLDKLVSLDVSNNQLSGNIPLELKGMLSLIEVNF
SSNQFTGPIPAFAPFEKSLNSSFLGNKGLCGEPLSSDCGYDFEHNGNHHRVSYRLILAVV
GSGLAIFTVVTVVVLLYMMREKQEKTTMEDGNTTDETCSKPVIIAGNVFDENLKQAIDFD
AVVKAVRKDTNKISTGTFSDVYRADMPSGMILYVKSLKSMDKTIVHHQSKMIRELEKLSK
LCHDNLTRPLGFAIYEEVVLLLHQYYPNGTLAQFLHEFSQKPEYEPDWPTRLSIAIGVAE
GLAFLHHVAIIHLDVSSGNVFLDSKFTPLVAEVEISRLLDPSRGTASISAVAGSFGYIPP
EYAYTMQVTAPGNVYSYGVVLLEILTTRLPVDEAFGEGVDLVRWVHGASARGETPEQILD
ARLSTISFAWRKEMLATLKVALMCTDTIPAKRPRMKKVIEMLQEVTQS*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400021049
Transcript Infomation

pacid=37476771 locus=PGSC0003DMG400008146 ID=PGSC0003DMT400021049.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTAACTTTGAGGTTGTTCACTGTTTTGCTGGTGGGGTTGTTGTTAAGGTCTCAATTT
GGGATTGTAAAGGCTCTTCATGAACAAGCCATTTTGGAAGCAATTGGCAAAGAGCTAGCA
ATACCTGGTTGGGATCTGAATAGCACTGATTTCTGTTCTTGGCATAGCATTAGTTGCAGC
AGCTCAAACAGTTCAATGGTGGAAAGGCTGAATCTTTCGGGTTTTCGATTACAAGGTAAT
GTGACTCTAATATCTGAGCTCAAAGGATTGAAATGGCTGGACCTTTCTAATAACAATTTC
CAAGGTTCAATCCCACAAGCATTTGGGAATTTGTCTGAGCTTCAGTTTCTTGATTTGTCT
TTTAACATGTTTAGAAACTCTATTCCTGGTGAATTAGGTAAGCTCAAGAACCTTAGAGCA
TTGAATCTTTCAAACAATATGCTCACTGGTTCAATACCTGATGAGCTTGAAGGGATGGAG
AATTTGCTTTATTTCCAATTATTTACCAATAAATTGAGTGGTTTTATTCCAATGTGGATT
GGGAATTTGACTAATCTTAGAGTGTTTGCAGCCTATGAGAATGAGTTTAGTGGTGATATT
CCAGTTAACTTAGGCTTACATTCTGAGCTTTTGTTGTTAAATCTTCATTCAAATCAGCTT
GAAGGGACAATTCCTGAGAGTATTTTTACTATGGAAAAGCTTGAATTTTTAGTTCTGACT
AATAATAAGTTGACTGGCACTATTCCTGATTCAATTGTGAATTGCAAAGGCCTTTCAAGC
ATTAGAATTGGGAATAACAAGCTGATAGGTGGTATCCCTAAAGGAATTGGAAATATAAGT
AGTCTTGCTTATTTTGAAGCAGATAATAATACACTTTCCGGGGAAATCGTCTCAGGATTT
GCGAAATGCTCTAATCTCACTCTTCTTAATTTAGCTTCGAATGGATTTTCCGGAACTATC
ACTCCAGAGTTTGGTGAGCTCGATAATCTACAGGAGTTGATTGTTCCGGGGAATAATCTC
TATGGAGAGATTCCAACTTCAGTTCTGAGGTGCAAGAATCTCAACAAGCTTGATTTAAGT
AACAACAAGTTCAATGGAACCATTCCAGGAGATATATGCAACACAACCAAATTGCAGTTC
TTGTTGTTGGGACAGAATTCCTTGAAAGGGGAAATACCCCGTGAGATAGGGAACTGCGTA
AAACTGCTTGAGTTGCAAATGGGGAGTAACTATCTTACTGGAAGCATCCCTTCTGAGATT
GGTCATATGAAGAACTTACAGATTTCATTGAATTTGAGTCATAATCATCTCCATGGACAG
TTGCCTAAGGATCTTGGAAAACTTGACAAGTTGGTTTCTTTAGATGTATCTAATAATCAG
CTGTCGGGGAATATTCCGTTGGAATTGAAAGGCATGTTGAGCTTGATAGAGGTTAACTTT
TCGAGCAATCAATTCACAGGACCAATACCTGCTTTTGCTCCATTTGAGAAGAGCTTAAAT
TCAAGCTTTCTTGGAAACAAAGGGCTCTGTGGTGAGCCTTTGAGTAGTGATTGTGGATAT
GATTTTGAACACAACGGTAATCATCACCGAGTTTCCTACCGGCTCATCTTGGCTGTTGTT
GGTTCTGGTTTGGCAATTTTTACAGTTGTCACAGTGGTTGTTTTACTATACATGATGAGG
GAGAAACAAGAGAAAACCACCATGGAAGATGGAAATACCACTGATGAAACTTGTAGCAAA
CCAGTGATCATAGCAGGGAATGTTTTCGATGAAAATCTCAAGCAAGCAATAGATTTTGAT
GCAGTTGTAAAGGCAGTCAGGAAAGATACAAATAAGATTAGTACTGGAACTTTCAGTGAT
GTGTATAGAGCAGACATGCCTTCCGGGATGATTTTGTATGTTAAGAGCCTAAAGTCGATG
GACAAGACTATAGTTCATCACCAGAGCAAGATGATCAGAGAGCTTGAAAAGCTAAGTAAA
CTCTGTCATGATAATCTGACGAGGCCTCTCGGGTTTGCAATCTATGAGGAAGTTGTTCTA
CTCTTACATCAATACTATCCCAATGGGACATTGGCTCAGTTTCTTCATGAGTTTAGCCAG
AAACCTGAGTACGAACCTGACTGGCCTACAAGACTTTCCATTGCCATTGGCGTTGCAGAA
GGGTTAGCGTTCCTTCATCATGTGGCCATAATCCATCTTGATGTTTCTTCAGGGAATGTG
TTTCTTGATTCTAAATTCACCCCTTTGGTTGCTGAAGTTGAAATATCCCGACTTCTTGAT
CCATCTAGAGGGACTGCAAGTATTAGTGCTGTTGCTGGCTCATTTGGATACATTCCCCCA
GAGTATGCATATACAATGCAAGTAACAGCTCCCGGAAATGTTTATAGCTATGGCGTTGTT
TTGCTCGAGATCCTTACCACCCGACTACCCGTTGATGAAGCTTTTGGTGAAGGAGTTGAT
CTGGTCAGGTGGGTACATGGTGCTTCTGCGAGAGGAGAAACACCAGAGCAGATACTTGAT
GCAAGACTTAGCACCATTTCTTTTGCTTGGAGGAAAGAAATGCTTGCAACTCTAAAAGTC
GCATTGATGTGCACCGATACCATTCCAGCAAAACGACCAAGAATGAAGAAGGTGATAGAA
ATGCTTCAAGAGGTTACACAGAGTTGA