Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400020595
CDS Infomation

pacid=37474880 polypeptide=PGSC0003DMP400014031 locus=PGSC0003DMG400007976 ID=PGSC0003DMT400020595.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGCTAATCACAGTCGTGAAGATCTGGAGCTTTCCGACTCCGAGTCTGAATCCGAA
TACGGATCGGAATCTCGAACCAGGGAGGAAGAGGAAGACGAAGATAACTACTCAGATGCT
AAAACGACGCCGTCTTCCATTGACCGGAAACAGAGCAAAACCCCATCTTCTTTGGATGAT
GTTGAAGCTAAGCTGAAAGCTTTAAAGCTTAAGTATGGTACTCCTCATGCTAAAACCCCC
ACAGCGAAAAACGCTGTTAAACTTTACCTTCATGTTGGTGGGAACACTGCGAATTCCAAA
TGGGTCGTTTCTGATAAGGTGACGGCTTATTCGTTTGTTAAATTGGGTAGTGGGGATGGA
TCGGATGATGATGAAAATGAAGAAACTGAGGAAAATGCTTGGTGGGTTTTGAAAATTGGG
TCGAAGGTTCGGGTTAAGATTGATGAGAATTTGCAGCTGAAGGCGTTTAAGGAGCAGAAA
CGGGTGGATTTTGTGGCGAATGGGGTTTGGGCTGTGAGATTCTTTGGGGAGGAAGAGTAT
AAGGCGTTCATTGACTTATATCAGAGCTGTTTGTTTGAGAATACTTATGGGTTTGAGGCA
AATGATGAGAATAGAGTTAAGGTGTATGGTAAGGACTTTATGGGGTGGGCGAATCCAGAA
GCTGCGGATGATTCGATGTGGGAGGATGCTGGGGATAGCTTTGCGAAGAGCCCTGCGTCT
GAGAAGAAGACACCTTTGAGGGTTAACCATGATTTGAGGGAGGAGTTTGAGGAGGCAGCT
AAAGGAGGAGCTATTCAGAGCTTGGCATTAGGTGCATTGGATAATAGTTTTCTTATAAGT
GATTCTGGAATTCAGGTTGTGAGGAACTATACTCATGGAATAAGTGGAAAAGGTGTTTGT
GTCAATTTTGATAAGGAAAGGTCTGCTGTTCCTAATTCCACTCCAAGGAAAGCTCTACTT
CTAAGAGCTGAGACTAATATGCTTCTCATGAGTCCAGTGACTGATAGGAAGCCTCACTCT
CGGGGATTACATCAGTTTGATATCGAGACTGGGAAGGTTGTTAGTGAGTGGAAGTTTGAG
AAAGATGGAACTGATATAACGATGAGGGATATCACTAATGATAGCAAAGGAGCTCAAATG
GATCCCTCGGGGTCTACTTTCTTAGGGCTAGATGATAACAGATTATGTAGGTGGGATATG
CGTGATCGGCATGGGATGGTTCAGAATCTAGTCGATGAAAGTACTCCTGTGCTGAATTGG
ACTCAAGGACATCAATTTTCGAGGGGAACTAACTTTCAGTGTTTTGCTACTGCTGGTGAT
GGATCAATTGTTGTTGGTTCACTTGATGGCAAGATTAGATTGTACTCAAGCAGTTCCATG
AGACAGGCTAAAACAGCTTTTCCAGGCCTTGGTTCTCCTATCACTCATGTGGATGTTACC
TATGATGGGAAGTGGATATTGGGGACAACTGATAGTTACTTGATATTGATATGCACCTTG
TTTATCGACAAGAATGGAACTACTAAGACTGGTTTTTCTGGTCGCATGGGGAATAAGATT
TCCGCTCCAAGATTGTTAAAGCTAAACCCTCTCGATTCACATATGGCTGGAGCTAACAAG
TTCCGCAGTGCTCAATTTTCATGGGTCACCGAGAACGGGAAGCAGGAGCGCCACCTTGTT
GCTACTGTTGGGAAGTTTAGTGTGATATGGAATTTTCAACAGGTGAAGGATGGTTCTCAT
GAGTGTTACCAGAATCAGGTGGGGTTGAAGAGCTGCTATTGTTACAAGATAGTTCTAAGA
GACGACTCTATTGTAGAAAGTCGTTTCATGCATGACAAGTATGCTGTTTCTGACTCACCT
GAAGCACCACTGGTGGTAGCAACCCCCATGAAAGTCAGCTCATTCAGCATCTCTAGCAGG
CGCTTACAAATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400014031
PEP Infomation

pacid=37474880 transcript=PGSC0003DMT400020595 locus=PGSC0003DMG400007976 ID=PGSC0003DMT400020595.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGANHSREDLELSDSESESEYGSESRTREEEEDEDNYSDAKTTPSSIDRKQSKTPSSLDD
VEAKLKALKLKYGTPHAKTPTAKNAVKLYLHVGGNTANSKWVVSDKVTAYSFVKLGSGDG
SDDDENEETEENAWWVLKIGSKVRVKIDENLQLKAFKEQKRVDFVANGVWAVRFFGEEEY
KAFIDLYQSCLFENTYGFEANDENRVKVYGKDFMGWANPEAADDSMWEDAGDSFAKSPAS
EKKTPLRVNHDLREEFEEAAKGGAIQSLALGALDNSFLISDSGIQVVRNYTHGISGKGVC
VNFDKERSAVPNSTPRKALLLRAETNMLLMSPVTDRKPHSRGLHQFDIETGKVVSEWKFE
KDGTDITMRDITNDSKGAQMDPSGSTFLGLDDNRLCRWDMRDRHGMVQNLVDESTPVLNW
TQGHQFSRGTNFQCFATAGDGSIVVGSLDGKIRLYSSSSMRQAKTAFPGLGSPITHVDVT
YDGKWILGTTDSYLILICTLFIDKNGTTKTGFSGRMGNKISAPRLLKLNPLDSHMAGANK
FRSAQFSWVTENGKQERHLVATVGKFSVIWNFQQVKDGSHECYQNQVGLKSCYCYKIVLR
DDSIVESRFMHDKYAVSDSPEAPLVVATPMKVSSFSISSRRLQI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400020595
Transcript Infomation

pacid=37474880 locus=PGSC0003DMG400007976 ID=PGSC0003DMT400020595.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGTGCTAATCACAGTCGTGAAGATCTGGAGCTTTCCGACTCCGAGTCTGAATCCGAA
TACGGATCGGAATCTCGAACCAGGGAGGAAGAGGAAGACGAAGATAACTACTCAGATGCT
AAAACGACGCCGTCTTCCATTGACCGGAAACAGAGCAAAACCCCATCTTCTTTGGATGAT
GTTGAAGCTAAGCTGAAAGCTTTAAAGCTTAAGTATGGTACTCCTCATGCTAAAACCCCC
ACAGCGAAAAACGCTGTTAAACTTTACCTTCATGTTGGTGGGAACACTGCGAATTCCAAA
TGGGTCGTTTCTGATAAGGTGACGGCTTATTCGTTTGTTAAATTGGGTAGTGGGGATGGA
TCGGATGATGATGAAAATGAAGAAACTGAGGAAAATGCTTGGTGGGTTTTGAAAATTGGG
TCGAAGGTTCGGGTTAAGATTGATGAGAATTTGCAGCTGAAGGCGTTTAAGGAGCAGAAA
CGGGTGGATTTTGTGGCGAATGGGGTTTGGGCTGTGAGATTCTTTGGGGAGGAAGAGTAT
AAGGCGTTCATTGACTTATATCAGAGCTGTTTGTTTGAGAATACTTATGGGTTTGAGGCA
AATGATGAGAATAGAGTTAAGGTGTATGGTAAGGACTTTATGGGGTGGGCGAATCCAGAA
GCTGCGGATGATTCGATGTGGGAGGATGCTGGGGATAGCTTTGCGAAGAGCCCTGCGTCT
GAGAAGAAGACACCTTTGAGGGTTAACCATGATTTGAGGGAGGAGTTTGAGGAGGCAGCT
AAAGGAGGAGCTATTCAGAGCTTGGCATTAGGTGCATTGGATAATAGTTTTCTTATAAGT
GATTCTGGAATTCAGGTTGTGAGGAACTATACTCATGGAATAAGTGGAAAAGGTGTTTGT
GTCAATTTTGATAAGGAAAGGTCTGCTGTTCCTAATTCCACTCCAAGGAAAGCTCTACTT
CTAAGAGCTGAGACTAATATGCTTCTCATGAGTCCAGTGACTGATAGGAAGCCTCACTCT
CGGGGATTACATCAGTTTGATATCGAGACTGGGAAGGTTGTTAGTGAGTGGAAGTTTGAG
AAAGATGGAACTGATATAACGATGAGGGATATCACTAATGATAGCAAAGGAGCTCAAATG
GATCCCTCGGGGTCTACTTTCTTAGGGCTAGATGATAACAGATTATGTAGGTGGGATATG
CGTGATCGGCATGGGATGGTTCAGAATCTAGTCGATGAAAGTACTCCTGTGCTGAATTGG
ACTCAAGGACATCAATTTTCGAGGGGAACTAACTTTCAGTGTTTTGCTACTGCTGGTGAT
GGATCAATTGTTGTTGGTTCACTTGATGGCAAGATTAGATTGTACTCAAGCAGTTCCATG
AGACAGGCTAAAACAGCTTTTCCAGGCCTTGGTTCTCCTATCACTCATGTGGATGTTACC
TATGATGGGAAGTGGATATTGGGGACAACTGATAGTTACTTGATATTGATATGCACCTTG
TTTATCGACAAGAATGGAACTACTAAGACTGGTTTTTCTGGTCGCATGGGGAATAAGATT
TCCGCTCCAAGATTGTTAAAGCTAAACCCTCTCGATTCACATATGGCTGGAGCTAACAAG
TTCCGCAGTGCTCAATTTTCATGGGTCACCGAGAACGGGAAGCAGGAGCGCCACCTTGTT
GCTACTGTTGGGAAGTTTAGTGTGATATGGAATTTTCAACAGGTGAAGGATGGTTCTCAT
GAGTGTTACCAGAATCAGGTGGGGTTGAAGAGCTGCTATTGTTACAAGATAGTTCTAAGA
GACGACTCTATTGTAGAAAGTCGTTTCATGCATGACAAGTATGCTGTTTCTGACTCACCT
GAAGCACCACTGGTGGTAGCAACCCCCATGAAAGTCAGCTCATTCAGCATCTCTAGCAGG
CGCTTACAAATTTGA