Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400020230
CDS Infomation

pacid=37449170 polypeptide=PGSC0003DMP400013788 locus=PGSC0003DMG400007821 ID=PGSC0003DMT400020230.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGTCTTTTGATAAATTCAAGATTTGGGTTTTGTGTATCTGTTTGGTTTCTGAATTG
GGTTGTGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTATCCTCACAAATATGGGGTTGGTGATTACTTG
AATGTTAAGGTCAATTCATTGACTTCAATTGACACTGAATTGCCTTATAGTTATTATAGT
TTGCCTTTCTGTAATCCTGAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCAGAAAATCTAGGTGAGCTT
CTTATGGGTGATAGGATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT
GAGGTTTTCTTGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGCTGATGAATTTAAGCTTTTAAAAGAG
AGGATTGATGAGATGTATCAGGTGAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATAT
ACCAAGAAGGAGAATTACTTCTTGCGTTGGACTGGTTATCCAGTTGGGATCAAGGTTCAA
GATGCATATTATGTGTTTAACCATTTGAAGTTCACTGTTCTTGTTCATAAATTTGAGGAG
ACCAATGTGGCTCGTGTGATGGGTACCGGGGATGGATCAGAGGTGATTTCGACAGTTGGA
AACGAAGGATCTGATGCACCTGGATATATGGTTGTTGGATTTGAGGTTGTACCTTGTAGT
GTCCAGCATACGCCTGATTCGTTAAAGAATCTTAAAATGTACAATAAGCTTCCTTCTCCA
ATCAAGTGTGACCCGACATCTGTGTCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTGAGTTTT
ACTTATGAGGTGGACTTTGTGGAGAGTGACATCAAGTGGCCATCGAGATGGGATGCTTAT
TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCACTGGTTCTCGATACTCAATTCCCTTATGGTGATC
ACTTTCTTGGCTGGTATTGTGCTTGTGATCTTTTTGAGAACAATCCGCCGTGATCTGGCA
AGGTATGATGAACTAGACAAAGAAGCTCAGGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCTGGGTGG
AAACTTGTTGTTGGTGATGTTTTCCGAGCCCCTAGTAACCCTGGCCTTCTCTGCGCGATG
GTTGGGGATGGAGTTCAAATCTTGGGGATGGCTGTAGTGACTATTATGTTTGCTGCCCTT
GGATTCATGTCCCCAGCATCTCGTGGAACATTGATTACAGGTATGCTATTCTTTTACATG
ATTCTTGGTGTTGCAGCTGGCTATGTTTCTGTTCGTCTTTGGAGGACAATCTTCTGTGGT
GATCACAAGGGATGGGTTGGAGTCGCGTGGAAGGCTGCTTGTTTCTTCCCTGGACTTTCT
TTCCTAATTCTTACTGTATTGAACTTCTTGTTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATT
CCCTTTTCTTTGTTTGTCGTGCTCATTTTACTTTGGTTCTGTATCTCCGTCCCCCTAACC
CTGATTGGTGGCTACCTTGGGGCAAAGGCACCTCACATCGAATATCCAGTCCGAACCAAC
CAGATCCCACGCGAAATTCCAGCACAGAAATATCCATCTTGGCTTTTGGTTCTCGGGGCA
GGCACCCTTCCTTTTGGCACTCTGTTCATTGAGCTCTTTTTTATCATGTCAAGTCTCTGG
ATGGGTCGTGTGTACTACGTCTTCGGATTCCTCCTCATCGTTATGATCCTCCTTGTTGTC
GTTTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTAACCTACATGCATCTATGTGTGGAGGACTGGAAA
TGGTGGTGGAAGTCATTCTTTGCTTCCGGTTCAGTCGCAATATACATTTTCCTATACTCC
ATCAACTATCTAATATTCGACCTCAAGAGCTTAAGCGGCCCTGTTTCCGCCACCCTTTAC
CTCGGATACTCCCTCTTCATGGTCTTGGCTATTATGTTTGCAACAGGCACCGTCGGGTTC
CTTTCGTCCTTCTGGTTTGTACATTATTTGTTCTCTTCAGTGAAGTTCGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013788
PEP Infomation

pacid=37449170 transcript=PGSC0003DMT400020230 locus=PGSC0003DMG400007821 ID=PGSC0003DMT400020230.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVSFDKFKIWVLCICLVSELGCGFYLPGSYPHKYGVGDYLNVKVNSLTSIDTELPYSYYS
LPFCNPEEGVKDSAENLGELLMGDRIENSPYRFKMYTNETEVFLCQTKPLSADEFKLLKE
RIDEMYQVNLILDNLPAIRYTKKENYFLRWTGYPVGIKVQDAYYVFNHLKFTVLVHKFEE
TNVARVMGTGDGSEVISTVGNEGSDAPGYMVVGFEVVPCSVQHTPDSLKNLKMYNKLPSP
IKCDPTSVSMAIKENEPVSFTYEVDFVESDIKWPSRWDAYLKMEGAKVHWFSILNSLMVI
TFLAGIVLVIFLRTIRRDLARYDELDKEAQAQMNEELSGWKLVVGDVFRAPSNPGLLCAM
VGDGVQILGMAVVTIMFAALGFMSPASRGTLITGMLFFYMILGVAAGYVSVRLWRTIFCG
DHKGWVGVAWKAACFFPGLSFLILTVLNFLLWGSHSTGAIPFSLFVVLILLWFCISVPLT
LIGGYLGAKAPHIEYPVRTNQIPREIPAQKYPSWLLVLGAGTLPFGTLFIELFFIMSSLW
MGRVYYVFGFLLIVMILLVVVCAEVSLVLTYMHLCVEDWKWWWKSFFASGSVAIYIFLYS
INYLIFDLKSLSGPVSATLYLGYSLFMVLAIMFATGTVGFLSSFWFVHYLFSSVKFD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400020230
Transcript Infomation

pacid=37449170 locus=PGSC0003DMG400007821 ID=PGSC0003DMT400020230.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTGTCTTTTGATAAATTCAAGATTTGGGTTTTGTGTATCTGTTTGGTTTCTGAATTG
GGTTGTGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTATCCTCACAAATATGGGGTTGGTGATTACTTG
AATGTTAAGGTCAATTCATTGACTTCAATTGACACTGAATTGCCTTATAGTTATTATAGT
TTGCCTTTCTGTAATCCTGAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCAGAAAATCTAGGTGAGCTT
CTTATGGGTGATAGGATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT
GAGGTTTTCTTGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGCTGATGAATTTAAGCTTTTAAAAGAG
AGGATTGATGAGATGTATCAGGTGAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATAT
ACCAAGAAGGAGAATTACTTCTTGCGTTGGACTGGTTATCCAGTTGGGATCAAGGTTCAA
GATGCATATTATGTGTTTAACCATTTGAAGTTCACTGTTCTTGTTCATAAATTTGAGGAG
ACCAATGTGGCTCGTGTGATGGGTACCGGGGATGGATCAGAGGTGATTTCGACAGTTGGA
AACGAAGGATCTGATGCACCTGGATATATGGTTGTTGGATTTGAGGTTGTACCTTGTAGT
GTCCAGCATACGCCTGATTCGTTAAAGAATCTTAAAATGTACAATAAGCTTCCTTCTCCA
ATCAAGTGTGACCCGACATCTGTGTCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTGAGTTTT
ACTTATGAGGTGGACTTTGTGGAGAGTGACATCAAGTGGCCATCGAGATGGGATGCTTAT
TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCACTGGTTCTCGATACTCAATTCCCTTATGGTGATC
ACTTTCTTGGCTGGTATTGTGCTTGTGATCTTTTTGAGAACAATCCGCCGTGATCTGGCA
AGGTATGATGAACTAGACAAAGAAGCTCAGGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCTGGGTGG
AAACTTGTTGTTGGTGATGTTTTCCGAGCCCCTAGTAACCCTGGCCTTCTCTGCGCGATG
GTTGGGGATGGAGTTCAAATCTTGGGGATGGCTGTAGTGACTATTATGTTTGCTGCCCTT
GGATTCATGTCCCCAGCATCTCGTGGAACATTGATTACAGGTATGCTATTCTTTTACATG
ATTCTTGGTGTTGCAGCTGGCTATGTTTCTGTTCGTCTTTGGAGGACAATCTTCTGTGGT
GATCACAAGGGATGGGTTGGAGTCGCGTGGAAGGCTGCTTGTTTCTTCCCTGGACTTTCT
TTCCTAATTCTTACTGTATTGAACTTCTTGTTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATT
CCCTTTTCTTTGTTTGTCGTGCTCATTTTACTTTGGTTCTGTATCTCCGTCCCCCTAACC
CTGATTGGTGGCTACCTTGGGGCAAAGGCACCTCACATCGAATATCCAGTCCGAACCAAC
CAGATCCCACGCGAAATTCCAGCACAGAAATATCCATCTTGGCTTTTGGTTCTCGGGGCA
GGCACCCTTCCTTTTGGCACTCTGTTCATTGAGCTCTTTTTTATCATGTCAAGTCTCTGG
ATGGGTCGTGTGTACTACGTCTTCGGATTCCTCCTCATCGTTATGATCCTCCTTGTTGTC
GTTTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTAACCTACATGCATCTATGTGTGGAGGACTGGAAA
TGGTGGTGGAAGTCATTCTTTGCTTCCGGTTCAGTCGCAATATACATTTTCCTATACTCC
ATCAACTATCTAATATTCGACCTCAAGAGCTTAAGCGGCCCTGTTTCCGCCACCCTTTAC
CTCGGATACTCCCTCTTCATGGTCTTGGCTATTATGTTTGCAACAGGCACCGTCGGGTTC
CTTTCGTCCTTCTGGTTTGTACATTATTTGTTCTCTTCAGTGAAGTTCGATTGA