Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400020095
CDS Infomation

pacid=37449075 polypeptide=PGSC0003DMP400013703 locus=PGSC0003DMG400007783 ID=PGSC0003DMT400020095.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGATTCTCAGTAATGATAACAAAGCTGAACTCTTTACATGTATCCCTTCTTCTCTCT
TTCTCAGAATTTTCACTTTCCAACCTTAAATACTCAACTTCTTCGAAGACCCTTTTCAAC
GCCGGCACTAAAACGAACAAATTCTTGATTTACTGTAACACCCAAATCGCAGAAAATGGC
CGAAACGGGGACATTAAAGAAGCTGAATCCATTTTCTACAGTATGCCCAGCAAAAATATC
GTTTCTTGGACGGCAATGCTCACTGCATACTCACAAAACAGACAACTCAAGAATGCACGT
GAAGTGTTCGATAAAATGCCTGAGAGGAGTGTTGCTTCGTGGAATGCAATGCTGACTGCT
TACATGAGGAATAGAGTTGAAATTGGTGAGATTTTTAGTTTCTTTCAGCTTATGCCGGAG
AGAAATTCGGTGTCTTTTGCTGCGATGATTACCGGGTTTGTTAATGCAGGGAGAGTTGAT
ATGGCAGAGGATTTGTATAATCGGACACCTATGGTTTTTCGGGAACCTGTTTGTTCAAAT
GTATTGATTAATGGATATTTGAAAGTTCGGAAGTTAGAGGATGCAGTTCGTGTTTTTGAT
GGTATGGTGCGGAAAGATATTGTTTCTTGTAGTGCAATGATTGATGGGTACTCCAAGAAT
GGGAGAGTTATTAAGGGTCGGGAGTTGTTTGATATGATGAAGGAGAGAAATGAGGTAACT
TGGGGTGCTATGATTGATGGGTATATGAAAGTTTGTTGTTTCGAGGATGGGTTTGATTTG
TTTCTAACAATGAGAAGAGAAGGTGATGTGAGACTGGAGCCTACTATACTAACAATCGTC
TTAGAAGCTTGTGGAAGATTTAGTAAGCGTCAACAAGGCTATCAAGTCCACGGGTTGGTA
TCTCGTTTGGGATTTGAATTTGATGTTTTCTTGGGTAATTCATTGATCACTATGTACTCT
AGATTTGGTTGTGTAAATGCAGCTAAAAGTTTGTTTGATTCAATGTTAAGGAAAGACGTC
ATTTCATGGAATTCACTTATTAGTGGTTTTGTTCAAGCTGGAAAACTTGAAGAGGGATAT
GAGATTTTCAAAAGAGCTCCGGAAAAGGATGTTGTTTCGTGGACAGCCATGATTACAGGG
TTTTCTGAAAAGGGGTTGACTGAAATTTGTGTCGAGCTATTTAAAATGATCCCCGAGAAA
GATGATGTTGCATGGACAGCTCTTATATCTAGTTTTGTAAATAAAGGGGAATATGAGGAG
GCTTTTTGCTGGTTTGTTAAAATGCTTCAAAGTGCAGTTAGACCAAATCCTCTAACTTTA
AGTAGCATGCTTAGTGCTTCAGCTGGTATGGCCATGTTGAATCAAGGACTGCAAATTCAT
GCTCTTGTTTTGAAAATGGATATGGAGTTAGATTTGTCTATCCAAAGTTCTCTAATCTCA
ATGTATTCGAAGTGTGGAAGTTTAGATGATGCCTATAGGATTTTTAAATTCATAAATTAC
CCGAATATTGTTTCTTTCAATGCAATGATTACTGGATTTGCACAAAATGGCTATGCCAGA
GAAGCACTTAAGTTGTTTCACCAGTTGCAGAATGAAGGTGAGCAACCTAATGGTATCACT
TTTCTAGGGGTTCTATCAGCATGTATGCATGCAGGGCTCGTAGAAGAAGGATGGAACTAC
TTCAAATCGATGAAATCATTATACAACATTGAACCAGAGCCTGATCATTATACTATAATG
GTTGATATCCTAGGACGAGCTGATTTACTTGATGAAGCAGTTAGTCTAATCGATTCTATG
CCATTCAAGACACATTCTGGGGTTTGGGGTGCTCTTCTTGGTGCCAGCAAGACTCGGTTG
CGCCTTGATCTTGCAAAGCTTGCAGCTCAAAAGATTTTGGACTTAGAACCAAGTAATGCA
GCTCCATACGTGGTCTTGTCTGATCTTTATTGTATTGTCGGAAAGAAGAAAGACGAGGAA
CGAGTTAGGCTGGCAAAGAAATTGAAAAGAATAAAGAAAATTCCAGGTTGCAGTTGGGTT
TTGTTGAAAAACAATATTGGTTTATTTCTCTCTGGAGATCAGTCCCATTTGAACTTTGAT
GAGATCAGCTGCACATTGTGGACGATAATGGATGACACGAAACAAGTAAGTTGCATAGAT
CATGACTTGTTATCACTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013703
PEP Infomation

pacid=37449075 transcript=PGSC0003DMT400020095 locus=PGSC0003DMG400007783 ID=PGSC0003DMT400020095.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGFSVMITKLNSLHVSLLLSFSEFSLSNLKYSTSSKTLFNAGTKTNKFLIYCNTQIAENG
RNGDIKEAESIFYSMPSKNIVSWTAMLTAYSQNRQLKNAREVFDKMPERSVASWNAMLTA
YMRNRVEIGEIFSFFQLMPERNSVSFAAMITGFVNAGRVDMAEDLYNRTPMVFREPVCSN
VLINGYLKVRKLEDAVRVFDGMVRKDIVSCSAMIDGYSKNGRVIKGRELFDMMKERNEVT
WGAMIDGYMKVCCFEDGFDLFLTMRREGDVRLEPTILTIVLEACGRFSKRQQGYQVHGLV
SRLGFEFDVFLGNSLITMYSRFGCVNAAKSLFDSMLRKDVISWNSLISGFVQAGKLEEGY
EIFKRAPEKDVVSWTAMITGFSEKGLTEICVELFKMIPEKDDVAWTALISSFVNKGEYEE
AFCWFVKMLQSAVRPNPLTLSSMLSASAGMAMLNQGLQIHALVLKMDMELDLSIQSSLIS
MYSKCGSLDDAYRIFKFINYPNIVSFNAMITGFAQNGYAREALKLFHQLQNEGEQPNGIT
FLGVLSACMHAGLVEEGWNYFKSMKSLYNIEPEPDHYTIMVDILGRADLLDEAVSLIDSM
PFKTHSGVWGALLGASKTRLRLDLAKLAAQKILDLEPSNAAPYVVLSDLYCIVGKKKDEE
RVRLAKKLKRIKKIPGCSWVLLKNNIGLFLSGDQSHLNFDEISCTLWTIMDDTKQVSCID
HDLLSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400020095
Transcript Infomation

pacid=37449075 locus=PGSC0003DMG400007783 ID=PGSC0003DMT400020095.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGATTCTCAGTAATGATAACAAAGCTGAACTCTTTACATGTATCCCTTCTTCTCTCT
TTCTCAGAATTTTCACTTTCCAACCTTAAATACTCAACTTCTTCGAAGACCCTTTTCAAC
GCCGGCACTAAAACGAACAAATTCTTGATTTACTGTAACACCCAAATCGCAGAAAATGGC
CGAAACGGGGACATTAAAGAAGCTGAATCCATTTTCTACAGTATGCCCAGCAAAAATATC
GTTTCTTGGACGGCAATGCTCACTGCATACTCACAAAACAGACAACTCAAGAATGCACGT
GAAGTGTTCGATAAAATGCCTGAGAGGAGTGTTGCTTCGTGGAATGCAATGCTGACTGCT
TACATGAGGAATAGAGTTGAAATTGGTGAGATTTTTAGTTTCTTTCAGCTTATGCCGGAG
AGAAATTCGGTGTCTTTTGCTGCGATGATTACCGGGTTTGTTAATGCAGGGAGAGTTGAT
ATGGCAGAGGATTTGTATAATCGGACACCTATGGTTTTTCGGGAACCTGTTTGTTCAAAT
GTATTGATTAATGGATATTTGAAAGTTCGGAAGTTAGAGGATGCAGTTCGTGTTTTTGAT
GGTATGGTGCGGAAAGATATTGTTTCTTGTAGTGCAATGATTGATGGGTACTCCAAGAAT
GGGAGAGTTATTAAGGGTCGGGAGTTGTTTGATATGATGAAGGAGAGAAATGAGGTAACT
TGGGGTGCTATGATTGATGGGTATATGAAAGTTTGTTGTTTCGAGGATGGGTTTGATTTG
TTTCTAACAATGAGAAGAGAAGGTGATGTGAGACTGGAGCCTACTATACTAACAATCGTC
TTAGAAGCTTGTGGAAGATTTAGTAAGCGTCAACAAGGCTATCAAGTCCACGGGTTGGTA
TCTCGTTTGGGATTTGAATTTGATGTTTTCTTGGGTAATTCATTGATCACTATGTACTCT
AGATTTGGTTGTGTAAATGCAGCTAAAAGTTTGTTTGATTCAATGTTAAGGAAAGACGTC
ATTTCATGGAATTCACTTATTAGTGGTTTTGTTCAAGCTGGAAAACTTGAAGAGGGATAT
GAGATTTTCAAAAGAGCTCCGGAAAAGGATGTTGTTTCGTGGACAGCCATGATTACAGGG
TTTTCTGAAAAGGGGTTGACTGAAATTTGTGTCGAGCTATTTAAAATGATCCCCGAGAAA
GATGATGTTGCATGGACAGCTCTTATATCTAGTTTTGTAAATAAAGGGGAATATGAGGAG
GCTTTTTGCTGGTTTGTTAAAATGCTTCAAAGTGCAGTTAGACCAAATCCTCTAACTTTA
AGTAGCATGCTTAGTGCTTCAGCTGGTATGGCCATGTTGAATCAAGGACTGCAAATTCAT
GCTCTTGTTTTGAAAATGGATATGGAGTTAGATTTGTCTATCCAAAGTTCTCTAATCTCA
ATGTATTCGAAGTGTGGAAGTTTAGATGATGCCTATAGGATTTTTAAATTCATAAATTAC
CCGAATATTGTTTCTTTCAATGCAATGATTACTGGATTTGCACAAAATGGCTATGCCAGA
GAAGCACTTAAGTTGTTTCACCAGTTGCAGAATGAAGGTGAGCAACCTAATGGTATCACT
TTTCTAGGGGTTCTATCAGCATGTATGCATGCAGGGCTCGTAGAAGAAGGATGGAACTAC
TTCAAATCGATGAAATCATTATACAACATTGAACCAGAGCCTGATCATTATACTATAATG
GTTGATATCCTAGGACGAGCTGATTTACTTGATGAAGCAGTTAGTCTAATCGATTCTATG
CCATTCAAGACACATTCTGGGGTTTGGGGTGCTCTTCTTGGTGCCAGCAAGACTCGGTTG
CGCCTTGATCTTGCAAAGCTTGCAGCTCAAAAGATTTTGGACTTAGAACCAAGTAATGCA
GCTCCATACGTGGTCTTGTCTGATCTTTATTGTATTGTCGGAAAGAAGAAAGACGAGGAA
CGAGTTAGGCTGGCAAAGAAATTGAAAAGAATAAAGAAAATTCCAGGTTGCAGTTGGGTT
TTGTTGAAAAACAATATTGGTTTATTTCTCTCTGGAGATCAGTCCCATTTGAACTTTGAT
GAGATCAGCTGCACATTGTGGACGATAATGGATGACACGAAACAAGTAAGTTGCATAGAT
CATGACTTGTTATCACTGTAA