Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400019880
CDS Infomation

pacid=37479692 polypeptide=PGSC0003DMP400013591 locus=PGSC0003DMG400007692 ID=PGSC0003DMT400019880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCAATTGTTGAGCAATGTGAAGTTGCACCACCTTCATGTGCCACAGATAAGTTG
ACACTCCCTTTAACCTATTTTGATATGGTGTGGTTAAATAACCAACGTGTACCTAGGATT
CTATTCTATAAGCTCCCTATTGACAAAAATAGTTTCATCCAAAAAACTATTCCTACTCTC
AAACATTCACTCTCCCTGACTCTCAAACACTATCTACCACTAGCTGGTAACTTTGTTTGT
CCATTGAATTCGACCGATCATCCTGAATTACGTTATGTGAAGGGAGATTCTGTATCTGTT
ACTTTTTCTGAAACTGACATGGATTTTGATTATCTTGTTAGTAATGATCATCCACGTAAC
GCTAAGGATATTTATCACTTTGTTCCTCACTTGACGGAACCTAAGGATGTATTAGGGGTC
CAATTTGCACCGGTTTTAGCTATTCAGGTGACACTTTTTCCGAATCATGGCATATCTATT
TGTTTCATTAACCATCACATCGTTGGTGACGGATGTACTATAGTAGGGTTCATAAAGTCA
TGGGCTTTGCTGAATAAATACGGTGGAAATGATGAGTTCATGATGATTCCGTTTTATGAT
CGGTCTATTGTTAAAGAGCCTTATGGACTAAAAGGTTTACTATGGGATGAAATGAAAGAA
CATAAAAGTACTGCTGATCATGTAATTTTGACACCTCCTGATAACATAGTTCGAGGTACT
TTTATTATAACACGAAATGAAATTGAAAAACTCAAGAATTTAATATCGTCAAGACGACCT
AGCCTGACTCATGTAACATCATACACCGTAACATGTGGTTATGTATGGGCTTGCTTGATA
AAATCAGAGGATACTGATACTGATCATATAATAATAGATGACAATGTAATGGAATATTTC
TCATGTACGGTTGATTACAGAGCGCGATTTGATCCTCCACTTCCTTCATCTTACTTTGGG
AATTGTGTCGTCTGGTACATTGTAAAAACAAGGCATGTTGATTTAGTTGGAAATGAAGGC
TTTATAATCGCGGCAGAATCAATTGGAGAAACTATTCATAAAAGGAACAAGGATAAGGAA
TATGTGTTGAGTGGTGAGTGGTTGAACGAAGACGATCATCGATTTAAATCTCTTTCAGTT
GCTGGATCGCCAAAGTTTGATTTATACGCCACTGATTTTGGCTGGGGAAGGCCAGAAAAA
TGGGAATTCGTTTCTCTTCAAACTGGTATATTGATGTCTCTTATTAAGTCCAAGGACTCC
AATGGAGATTTGGAAATTGGTTTGTCTTTGCCTAAAACTCGAATGAATGCTTTTGCTGCT
ATATTTACCCACGGGTTAGAGGAGTTTAAGATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013591
PEP Infomation

pacid=37479692 transcript=PGSC0003DMT400019880 locus=PGSC0003DMG400007692 ID=PGSC0003DMT400019880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASIVEQCEVAPPSCATDKLTLPLTYFDMVWLNNQRVPRILFYKLPIDKNSFIQKTIPTL
KHSLSLTLKHYLPLAGNFVCPLNSTDHPELRYVKGDSVSVTFSETDMDFDYLVSNDHPRN
AKDIYHFVPHLTEPKDVLGVQFAPVLAIQVTLFPNHGISICFINHHIVGDGCTIVGFIKS
WALLNKYGGNDEFMMIPFYDRSIVKEPYGLKGLLWDEMKEHKSTADHVILTPPDNIVRGT
FIITRNEIEKLKNLISSRRPSLTHVTSYTVTCGYVWACLIKSEDTDTDHIIIDDNVMEYF
SCTVDYRARFDPPLPSSYFGNCVVWYIVKTRHVDLVGNEGFIIAAESIGETIHKRNKDKE
YVLSGEWLNEDDHRFKSLSVAGSPKFDLYATDFGWGRPEKWEFVSLQTGILMSLIKSKDS
NGDLEIGLSLPKTRMNAFAAIFTHGLEEFKI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400019880
Transcript Infomation

pacid=37479692 locus=PGSC0003DMG400007692 ID=PGSC0003DMT400019880.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCAATTGTTGAGCAATGTGAAGTTGCACCACCTTCATGTGCCACAGATAAGTTG
ACACTCCCTTTAACCTATTTTGATATGGTGTGGTTAAATAACCAACGTGTACCTAGGATT
CTATTCTATAAGCTCCCTATTGACAAAAATAGTTTCATCCAAAAAACTATTCCTACTCTC
AAACATTCACTCTCCCTGACTCTCAAACACTATCTACCACTAGCTGGTAACTTTGTTTGT
CCATTGAATTCGACCGATCATCCTGAATTACGTTATGTGAAGGGAGATTCTGTATCTGTT
ACTTTTTCTGAAACTGACATGGATTTTGATTATCTTGTTAGTAATGATCATCCACGTAAC
GCTAAGGATATTTATCACTTTGTTCCTCACTTGACGGAACCTAAGGATGTATTAGGGGTC
CAATTTGCACCGGTTTTAGCTATTCAGGTGACACTTTTTCCGAATCATGGCATATCTATT
TGTTTCATTAACCATCACATCGTTGGTGACGGATGTACTATAGTAGGGTTCATAAAGTCA
TGGGCTTTGCTGAATAAATACGGTGGAAATGATGAGTTCATGATGATTCCGTTTTATGAT
CGGTCTATTGTTAAAGAGCCTTATGGACTAAAAGGTTTACTATGGGATGAAATGAAAGAA
CATAAAAGTACTGCTGATCATGTAATTTTGACACCTCCTGATAACATAGTTCGAGGTACT
TTTATTATAACACGAAATGAAATTGAAAAACTCAAGAATTTAATATCGTCAAGACGACCT
AGCCTGACTCATGTAACATCATACACCGTAACATGTGGTTATGTATGGGCTTGCTTGATA
AAATCAGAGGATACTGATACTGATCATATAATAATAGATGACAATGTAATGGAATATTTC
TCATGTACGGTTGATTACAGAGCGCGATTTGATCCTCCACTTCCTTCATCTTACTTTGGG
AATTGTGTCGTCTGGTACATTGTAAAAACAAGGCATGTTGATTTAGTTGGAAATGAAGGC
TTTATAATCGCGGCAGAATCAATTGGAGAAACTATTCATAAAAGGAACAAGGATAAGGAA
TATGTGTTGAGTGGTGAGTGGTTGAACGAAGACGATCATCGATTTAAATCTCTTTCAGTT
GCTGGATCGCCAAAGTTTGATTTATACGCCACTGATTTTGGCTGGGGAAGGCCAGAAAAA
TGGGAATTCGTTTCTCTTCAAACTGGTATATTGATGTCTCTTATTAAGTCCAAGGACTCC
AATGGAGATTTGGAAATTGGTTTGTCTTTGCCTAAAACTCGAATGAATGCTTTTGCTGCT
ATATTTACCCACGGGTTAGAGGAGTTTAAGATTTGA