Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400019654
CDS Infomation

pacid=37465225 polypeptide=PGSC0003DMP400013441 locus=PGSC0003DMG400007598 ID=PGSC0003DMT400019654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAGCCTTACAAAGAGGCAAGTTTTCCAATCTCTGTAATGCTCGCCGGAGAAATTTA
TCTTCCGTCGCCGATGCTACACTTCATAAATCCGACGATGAAGAATACATAGTTAATGGG
GAGTCCAAAAATTCAATTATTCTACCATATTTGCACCGGGCAGTACAAGAATGCGCAAAA
CAAAGGAATGCAATGACTGGAAAATCGATGCATACCCAGATTATAAAATATGGATATGAA
GTTGATATATTGACAACAAACATGCTCATCAATATGTACTCGAAATGCGGCATTGTTGAT
TTTGCTCGCAAGGTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAACACTTGTTTCTTGGAACACCCTG
ATGGGTTCGTATATACAGAACAGAGATGAAGATGAAGCTCTGCGTCTTTTCGTTCGAATG
CAAAGGGAAGGGAGTCAGGTTAATGGGTTTACTGTTTCAGGTGTTCTTTGTGCTTGTGCT
GCTAAGTTTGCTGTTTTAGAAAGTAAACAATTGCATGGTTTTGCTATTAAGGTATCAGTG
GAATCTAATGTTTTTGTGTCAACTGCTTTGCTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGTTGATG
AAAGATGCTTTTCGTGTTTTTGATTCTATGAATGAGAGGAATGAGGTTACTTGGAGTTCA
ATGGTTGCTGGATATGTCCAAAATGAGTTATATGAGGAGGCTATAATGTTTTTTCATAGG
CTACAAAAGTTCGGGGTAGAGCATAATCAGTTTACTCTTTCTTCAGTTATATCTGCTTGT
GCTGCGATGGCTGCTTTGTTAGAAGGGAACGAAACACATGCTATAGTATGGAAAACTGGT
TTTGGTGCTAATGTTTATGTGGCTTCATCTCTTGTGGACTTATATGCAAGATGTGGAAGT
GTTGACGAAGCGTATATTGTTTTTTCAAATGCTGAGGTGAAGAATGATGTAATATGGAAT
TCAATGATTTCTGGCTTGGCTAGAAATGCGCGGTCTTTAGAGGCGATGATGTTGTTTGAG
AAAATGCAGTTAGCAGGATTTTACCCGAATGAATGGACTTATGTCTCTGTGTTATCTGCT
TGTAGTCATATGGGTCTTGTTGACAAGGGGCGGATATATTTTGCCAAGATGAAGAAAGAA
CATAACTTGTCTCCCAATGTATATCATTATTCATGTATGGTTGACATTCTTGGTAGAAAA
GGTTTGGTTGAAGAAGCTAAGGATTTAATAGAAAATATGCCGTTTGCTGCAACTGCTTCC
ATGTGGGGTTCTGTATTGGCCTCTTGCAGGGTCTATGGAAATGTTGAGGTGGCTGAAATT
GCTGCTAAACATCTGTTTGAGCTCGAGCCTAATAATGCTGGAAACCACGTCTTGCTTTCA
AACATATATGCTTCCAAGAGAAGGTGGGGCGATGTTGCATCAACAAGAAAGCTTCTTAAA
GACAGTGAAGCGAAGAAAGAAAGAGGCAAGAGTTGGATACAGATAAAAGACAAGGTTCAC
ACGTTCATGGTCGGGGAGAGAAATCATCCAAGCATTATAGAGGTTTATTCAAGATTAGAT
GAATTGTTGGTAGGTATGGAGAAGTTAGGTTACAAAGGTGAAACCGAACACGACTTGCAT
GATGTGGAAGTGAGCAGAAAACATGAGCTTCTGAGACATCATAGTGAGAAGCTTGCTTTT
ACATATGGATTGATGTGTTTGCCCTCAACTGCTCCTATAAGAATTATGAAGAACCTCAGG
ATCTGTGGGGACTGTCATTCTTTCATGAAGTTTGCTTCAAAAGTAACACGGAGGGAAATC
ATCGTCAGAGATGTTAGTCGTTTTCATCACTTTACTAATGGATCATGTTCATGTGGAGAG
TTTTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013441
PEP Infomation

pacid=37465225 transcript=PGSC0003DMT400019654 locus=PGSC0003DMG400007598 ID=PGSC0003DMT400019654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKALQRGKFSNLCNARRRNLSSVADATLHKSDDEEYIVNGESKNSIILPYLHRAVQECAK
QRNAMTGKSMHTQIIKYGYEVDILTTNMLINMYSKCGIVDFARKVFDEMPQRTLVSWNTL
MGSYIQNRDEDEALRLFVRMQREGSQVNGFTVSGVLCACAAKFAVLESKQLHGFAIKVSV
ESNVFVSTALLDVYAKCGLMKDAFRVFDSMNERNEVTWSSMVAGYVQNELYEEAIMFFHR
LQKFGVEHNQFTLSSVISACAAMAALLEGNETHAIVWKTGFGANVYVASSLVDLYARCGS
VDEAYIVFSNAEVKNDVIWNSMISGLARNARSLEAMMLFEKMQLAGFYPNEWTYVSVLSA
CSHMGLVDKGRIYFAKMKKEHNLSPNVYHYSCMVDILGRKGLVEEAKDLIENMPFAATAS
MWGSVLASCRVYGNVEVAEIAAKHLFELEPNNAGNHVLLSNIYASKRRWGDVASTRKLLK
DSEAKKERGKSWIQIKDKVHTFMVGERNHPSIIEVYSRLDELLVGMEKLGYKGETEHDLH
DVEVSRKHELLRHHSEKLAFTYGLMCLPSTAPIRIMKNLRICGDCHSFMKFASKVTRREI
IVRDVSRFHHFTNGSCSCGEFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400019654
Transcript Infomation

pacid=37465225 locus=PGSC0003DMG400007598 ID=PGSC0003DMT400019654.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAAGCCTTACAAAGAGGCAAGTTTTCCAATCTCTGTAATGCTCGCCGGAGAAATTTA
TCTTCCGTCGCCGATGCTACACTTCATAAATCCGACGATGAAGAATACATAGTTAATGGG
GAGTCCAAAAATTCAATTATTCTACCATATTTGCACCGGGCAGTACAAGAATGCGCAAAA
CAAAGGAATGCAATGACTGGAAAATCGATGCATACCCAGATTATAAAATATGGATATGAA
GTTGATATATTGACAACAAACATGCTCATCAATATGTACTCGAAATGCGGCATTGTTGAT
TTTGCTCGCAAGGTGTTCGATGAAATGCCTCAAAGAACACTTGTTTCTTGGAACACCCTG
ATGGGTTCGTATATACAGAACAGAGATGAAGATGAAGCTCTGCGTCTTTTCGTTCGAATG
CAAAGGGAAGGGAGTCAGGTTAATGGGTTTACTGTTTCAGGTGTTCTTTGTGCTTGTGCT
GCTAAGTTTGCTGTTTTAGAAAGTAAACAATTGCATGGTTTTGCTATTAAGGTATCAGTG
GAATCTAATGTTTTTGTGTCAACTGCTTTGCTTGATGTTTATGCTAAATGTGGGTTGATG
AAAGATGCTTTTCGTGTTTTTGATTCTATGAATGAGAGGAATGAGGTTACTTGGAGTTCA
ATGGTTGCTGGATATGTCCAAAATGAGTTATATGAGGAGGCTATAATGTTTTTTCATAGG
CTACAAAAGTTCGGGGTAGAGCATAATCAGTTTACTCTTTCTTCAGTTATATCTGCTTGT
GCTGCGATGGCTGCTTTGTTAGAAGGGAACGAAACACATGCTATAGTATGGAAAACTGGT
TTTGGTGCTAATGTTTATGTGGCTTCATCTCTTGTGGACTTATATGCAAGATGTGGAAGT
GTTGACGAAGCGTATATTGTTTTTTCAAATGCTGAGGTGAAGAATGATGTAATATGGAAT
TCAATGATTTCTGGCTTGGCTAGAAATGCGCGGTCTTTAGAGGCGATGATGTTGTTTGAG
AAAATGCAGTTAGCAGGATTTTACCCGAATGAATGGACTTATGTCTCTGTGTTATCTGCT
TGTAGTCATATGGGTCTTGTTGACAAGGGGCGGATATATTTTGCCAAGATGAAGAAAGAA
CATAACTTGTCTCCCAATGTATATCATTATTCATGTATGGTTGACATTCTTGGTAGAAAA
GGTTTGGTTGAAGAAGCTAAGGATTTAATAGAAAATATGCCGTTTGCTGCAACTGCTTCC
ATGTGGGGTTCTGTATTGGCCTCTTGCAGGGTCTATGGAAATGTTGAGGTGGCTGAAATT
GCTGCTAAACATCTGTTTGAGCTCGAGCCTAATAATGCTGGAAACCACGTCTTGCTTTCA
AACATATATGCTTCCAAGAGAAGGTGGGGCGATGTTGCATCAACAAGAAAGCTTCTTAAA
GACAGTGAAGCGAAGAAAGAAAGAGGCAAGAGTTGGATACAGATAAAAGACAAGGTTCAC
ACGTTCATGGTCGGGGAGAGAAATCATCCAAGCATTATAGAGGTTTATTCAAGATTAGAT
GAATTGTTGGTAGGTATGGAGAAGTTAGGTTACAAAGGTGAAACCGAACACGACTTGCAT
GATGTGGAAGTGAGCAGAAAACATGAGCTTCTGAGACATCATAGTGAGAAGCTTGCTTTT
ACATATGGATTGATGTGTTTGCCCTCAACTGCTCCTATAAGAATTATGAAGAACCTCAGG
ATCTGTGGGGACTGTCATTCTTTCATGAAGTTTGCTTCAAAAGTAACACGGAGGGAAATC
ATCGTCAGAGATGTTAGTCGTTTTCATCACTTTACTAATGGATCATGTTCATGTGGAGAG
TTTTGGTAA