Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400019653
CDS Infomation

pacid=37466106 polypeptide=PGSC0003DMP400013440 locus=PGSC0003DMG400007597 ID=PGSC0003DMT400019653.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGACCTATGGCTCCTCTTTCTCTAATGTCAAATCCTACCTCCGAGCCCTTTCCGAT
ACTCCACACAGATTAGCTCGCCGGGCTTGTTCTGTCTCGACTTCTTTCGAAGAAACAAGT
CGACTCAGAGCTCGGTCTGGTGGAGATATGAAACGGAGTCTCCGGTGGTATGACCTCGTC
GGATTTGGCGTCGGCGGTATGGTTGGTGCCGGAGTATTTGTTACTTCCGGTCGTGCTAGC
CGTATGTGTGCTGGACCTGCTGTTGTTCTCTCTTACGCCATTGCTGGATTCTGTGCTCTG
TTATCTGCTTTTTGCTACACTGAGTTCGCCGTCGATATGCCGGTTGCTGGCGGTGCCTTT
AGCTATATCCGTATCACTTTTGGTGAATTTCTAGCGTTTTTGACCGGTGCGAATCTGATC
ATCGATTACGTATTATCAAATGCCGCTGTAGCGAGGAGTTTCACCGGTTATTTATGTACA
GCCCTCGGTATATCCACTGAAAGCAGATTGAGAATCACCGTCAATGGATTACCGAAAGGA
TTCAACGAAATCGATATTGTTGCTGTTTTAGTAGTTTTAGCTCTCACCGTAATCATCTGC
TACAGTACAAGAGAGAGTTCGATGTTGAATATGGTGTTAACAGTGCTACATCTAGTGTTC
ATAGTATTCGTGATAGTAATTGGATTTACCAGAGGAGATACGAAGAATTTCAGAGAAGCA
GGGGATGAGAATCATGCGAGTGGATTCTTCCCATTCGGTGCTTCAGGAGTGTTCAATGGA
GCAGCAATGGTTTATCTGAGTTACATAGGGTACGACGCCGTTTCAACCATGGCTGAAGAG
GTTAGAAATCCTGTTAAGGATATACCTGCTGGTGTCTCGGGTTCCGTTATACTCGTGACA
GTTCTTTACTGCCTCATGGCTGCTTCAATGTCCATGCTCCTTCCTTATGATATGATTGAT
ACAGATGCGCCATTTTCGGGGGCATTTATGGGATCAGACGGGTGGAGATGGGTATCAAAT
GTGATAGGAGTTGGGGCTAGTTTCGGTATTTTAACATCTTTATTAGTAGCTATGTTGGGC
CAAGCTCGATACATGTGCGTGATCGGACGGTCCAGCGTTGTTCCCGCTTGGTTTGCTAGG
GTCCATCCTAAAACATCAACGCCTGTGAATGCTTCCGTTTTTCTCGGAATTTGTACAGCA
GCAATTGCACTTTTCACTGATTTACAAATACTACTCAACCTTGTATCAATCGGTACACTG
TTTGTATTTTACATGGTAGCAAATGCTGTTATTTACAAGCGTTATGTTTCGATTGGCGTA
ACAAATCCATGGCCTACACTATCTTTCCTTTTTTGCTTCTCATTGACATCCATTTTATTC
ACTCTGTTATGGCAATTTGCCCCACCAGGCAAGCCAAAAGCCTTAATGCTTGGTGCTTGT
ACTGCTATTGCCATTGCTGTATTACAACTCTTCCATTATATGGTACCACAAGCGCAAAAA
CCCGAGTTTTGGGGTGTCCCTTTAATGCCATGGATTCCTTCCATGTCCATATTCCTCAAT
ATATTCTTGTTAGGTTCACTTGATAGACCATCCTACATCCGATTCGGATTCTTCTCAGCT
CTCGCTGTTCTGGTTTATGTTCTCTACAGTGTTCATGCTAGTTTTGATGCTGAGGAAGAT
GGGACACTTAGTCAAAAGAGAATTGAACTAGTGAAGGAATCTATTGAAGTCCAGGACCAT
ACTTTCAAAGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013440
PEP Infomation

pacid=37466106 transcript=PGSC0003DMT400019653 locus=PGSC0003DMG400007597 ID=PGSC0003DMT400019653.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

METYGSSFSNVKSYLRALSDTPHRLARRACSVSTSFEETSRLRARSGGDMKRSLRWYDLV
GFGVGGMVGAGVFVTSGRASRMCAGPAVVLSYAIAGFCALLSAFCYTEFAVDMPVAGGAF
SYIRITFGEFLAFLTGANLIIDYVLSNAAVARSFTGYLCTALGISTESRLRITVNGLPKG
FNEIDIVAVLVVLALTVIICYSTRESSMLNMVLTVLHLVFIVFVIVIGFTRGDTKNFREA
GDENHASGFFPFGASGVFNGAAMVYLSYIGYDAVSTMAEEVRNPVKDIPAGVSGSVILVT
VLYCLMAASMSMLLPYDMIDTDAPFSGAFMGSDGWRWVSNVIGVGASFGILTSLLVAMLG
QARYMCVIGRSSVVPAWFARVHPKTSTPVNASVFLGICTAAIALFTDLQILLNLVSIGTL
FVFYMVANAVIYKRYVSIGVTNPWPTLSFLFCFSLTSILFTLLWQFAPPGKPKALMLGAC
TAIAIAVLQLFHYMVPQAQKPEFWGVPLMPWIPSMSIFLNIFLLGSLDRPSYIRFGFFSA
LAVLVYVLYSVHASFDAEEDGTLSQKRIELVKESIEVQDHTFKV*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400019653
Transcript Infomation

pacid=37466106 locus=PGSC0003DMG400007597 ID=PGSC0003DMT400019653.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGACCTATGGCTCCTCTTTCTCTAATGTCAAATCCTACCTCCGAGCCCTTTCCGAT
ACTCCACACAGATTAGCTCGCCGGGCTTGTTCTGTCTCGACTTCTTTCGAAGAAACAAGT
CGACTCAGAGCTCGGTCTGGTGGAGATATGAAACGGAGTCTCCGGTGGTATGACCTCGTC
GGATTTGGCGTCGGCGGTATGGTTGGTGCCGGAGTATTTGTTACTTCCGGTCGTGCTAGC
CGTATGTGTGCTGGACCTGCTGTTGTTCTCTCTTACGCCATTGCTGGATTCTGTGCTCTG
TTATCTGCTTTTTGCTACACTGAGTTCGCCGTCGATATGCCGGTTGCTGGCGGTGCCTTT
AGCTATATCCGTATCACTTTTGGTGAATTTCTAGCGTTTTTGACCGGTGCGAATCTGATC
ATCGATTACGTATTATCAAATGCCGCTGTAGCGAGGAGTTTCACCGGTTATTTATGTACA
GCCCTCGGTATATCCACTGAAAGCAGATTGAGAATCACCGTCAATGGATTACCGAAAGGA
TTCAACGAAATCGATATTGTTGCTGTTTTAGTAGTTTTAGCTCTCACCGTAATCATCTGC
TACAGTACAAGAGAGAGTTCGATGTTGAATATGGTGTTAACAGTGCTACATCTAGTGTTC
ATAGTATTCGTGATAGTAATTGGATTTACCAGAGGAGATACGAAGAATTTCAGAGAAGCA
GGGGATGAGAATCATGCGAGTGGATTCTTCCCATTCGGTGCTTCAGGAGTGTTCAATGGA
GCAGCAATGGTTTATCTGAGTTACATAGGGTACGACGCCGTTTCAACCATGGCTGAAGAG
GTTAGAAATCCTGTTAAGGATATACCTGCTGGTGTCTCGGGTTCCGTTATACTCGTGACA
GTTCTTTACTGCCTCATGGCTGCTTCAATGTCCATGCTCCTTCCTTATGATATGATTGAT
ACAGATGCGCCATTTTCGGGGGCATTTATGGGATCAGACGGGTGGAGATGGGTATCAAAT
GTGATAGGAGTTGGGGCTAGTTTCGGTATTTTAACATCTTTATTAGTAGCTATGTTGGGC
CAAGCTCGATACATGTGCGTGATCGGACGGTCCAGCGTTGTTCCCGCTTGGTTTGCTAGG
GTCCATCCTAAAACATCAACGCCTGTGAATGCTTCCGTTTTTCTCGGAATTTGTACAGCA
GCAATTGCACTTTTCACTGATTTACAAATACTACTCAACCTTGTATCAATCGGTACACTG
TTTGTATTTTACATGGTAGCAAATGCTGTTATTTACAAGCGTTATGTTTCGATTGGCGTA
ACAAATCCATGGCCTACACTATCTTTCCTTTTTTGCTTCTCATTGACATCCATTTTATTC
ACTCTGTTATGGCAATTTGCCCCACCAGGCAAGCCAAAAGCCTTAATGCTTGGTGCTTGT
ACTGCTATTGCCATTGCTGTATTACAACTCTTCCATTATATGGTACCACAAGCGCAAAAA
CCCGAGTTTTGGGGTGTCCCTTTAATGCCATGGATTCCTTCCATGTCCATATTCCTCAAT
ATATTCTTGTTAGGTTCACTTGATAGACCATCCTACATCCGATTCGGATTCTTCTCAGCT
CTCGCTGTTCTGGTTTATGTTCTCTACAGTGTTCATGCTAGTTTTGATGCTGAGGAAGAT
GGGACACTTAGTCAAAAGAGAATTGAACTAGTGAAGGAATCTATTGAAGTCCAGGACCAT
ACTTTCAAAGTGTAA