Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400019167
CDS Infomation

pacid=37466053 polypeptide=PGSC0003DMP400013136 locus=PGSC0003DMG400007415 ID=PGSC0003DMT400019167.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAATGTTGATGATGGTCAGAAAATGTTTGATGAAATGGAGGATAACAAGAATGTT
GTGACTTGGACTTCGTTGCTTTCGGGTTATTCGTGTAATAAGTTGGTTGATAGAGCGTTA
GAAGTGTTTCGTGTAATGTTAGTTGGAGGAGTTAAGCCTAATGCGTTTACTTTCGCGACA
GTTCTTGGAGTTTTGGCTGATAAATGTGTAGTTGAAAAAGGGATTCAAGTGCATAGTATG
GTTATCAAGTGTGGTTTTGAGGCGACAACATCTGTTGGGAATTCTTTGATTAATATGTAT
TTGAAATCTGGGATGGTTAGAGAGGCTACAGCTGTATTTGAGGGTATGGGAGATAGGAAT
GAAGTATCTTGGAATGGTATGATAGCTGGTCTGGTGACTAATGGGCTTTATTCCGAAGCA
CTTAAGTTGTTCCACATGATGAGACTTGCAGGTGTGGAACTGACACGATCGATTTATGTT
ACAGCTGTTAAATTATGTACTAAACTTAAAGAATTGGTTTTTGCAAGACAACTTCATGGT
CGAGTTATGAAGAACGGGTTCTATTTTGACAATAATATCAGAACAGCACTCATGGTCTCT
TATACTAAGTGTGGAGAGATGGACGATGCCTTCAAGTTATTCTCTATAATGCATAAATTC
AGGAACGTGGTTTCTTGGACCGCAATGATTGGCGGGTATATGCAGAATAACAGACAAGAG
CAAGCGGCGAATCTCTTTTGCCAAATGAAAAAGGATGGGATAAGGCCAAACGATTTCACT
TATTCAACTATTCTTGCAGCTCATCCATCTATTTCGCTGTTCCAAGTACATGCAGAAGTC
ATCAAGACTGAGTACCAGAGCTCACCTACCGTCGGAACTGCATTATTAGACGCCTATGTG
AAAACAGGAGATACTGATGAGGCTGCGAAAGTTTTTGAAGAGATTGATGAGAAGGACATT
ATTGCATGGTCTGCTATGTTATCTGGTTATGCGCAAAAAGGAAACATTCAAGGTGCTGTC
AGAGTCTTCCGGCAACTAGTCAAAGATGGGGTCAGGCCAAATGAGTTTACCTTCTCCAGT
GTCATCAATGCGTGTGTTACTTCCATGGCATCAGTGGAGCAAGGAAAACAATTTCATTGT
AGCGCGATCAAATCAGGTCACAGTAATGCCTTATGTGTGAGCAGTGCCTTGGTAACTATG
TATGCTAAGAGAGGAAACATAGAAAGTGCAAATGAGATTTTCAAGAGACAACCAGAAAGA
GACTTAGTTTCATGGAATTCAATGATATCAGGATATGCCCAACATGGTTATGGCAGAAAA
GCTCTAAAGATATTCGAGGAAATGCGGAAAAGGAATTTGGATATGGACAATATAACGTTC
ATTGGAGTTATCTCTGCTTGTACTCATGCTGGACTGCTAAATGAAGGTCAAACATATTTT
GAGATGATGGTAAACGACTTTCATATTTCACCAAAAATGGAGATATACTCTTGCATGGTA
GACTTGTATAGCCGAGCTGGAATGCTGGATAAAGCCATGGCTCTTATCAATGAAATGCCA
TTTCCTGCTGGTGCAATTGTGTGGCGTACTCTTCTGGCAGCAAGTCGAGTTCATCGCAAT
GTAGAGCTGGGGAAACTGGCGGCCGAGAATCTCATTTCTCTTCAGCCTCAGGACTCAGCT
GCATATGTCCTTCTATCCAATCTCTATGCTGCAACGGGAGATTGGCAAGAAAGAGCGAAA
GTAAGGAAACTAATGGATGTGAGAAAAGTTAAAAAAGAGATTGGGTATAGCTGGATTGAG
GTTAAGAATAAGACCTACTCATTCATGGCAGGTGATGCTTCGCATCCCCTATCTGACAGT
ATATACATGAAACTCGAAGAGTTACGTGGCCGATTGAAGGATGCAGGATATCAACCGGAT
ACAAATTATGTTCTTCATGATGTGGAAGATGAACATAAAGAAGCCATTCTTTCTCGGCAC
AGTGAAAGGTTAGCTATTGCTTTTGGATTGATTGCCACGCCTCCAGGAATTCCCATTCAG
ATTGTGAAGAATCTCAGAGTTTGTGGTGACTGTCACACTGTTATTAAATTAATATCAAAG
ATAGAAGGAAGGCAAATAGTCGTCAGGGATTCAAATAGATTCCATCACTTTAAAGGAGGT
CTATGTTCTTGCGGTGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013136
PEP Infomation

pacid=37466053 transcript=PGSC0003DMT400019167 locus=PGSC0003DMG400007415 ID=PGSC0003DMT400019167.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MENVDDGQKMFDEMEDNKNVVTWTSLLSGYSCNKLVDRALEVFRVMLVGGVKPNAFTFAT
VLGVLADKCVVEKGIQVHSMVIKCGFEATTSVGNSLINMYLKSGMVREATAVFEGMGDRN
EVSWNGMIAGLVTNGLYSEALKLFHMMRLAGVELTRSIYVTAVKLCTKLKELVFARQLHG
RVMKNGFYFDNNIRTALMVSYTKCGEMDDAFKLFSIMHKFRNVVSWTAMIGGYMQNNRQE
QAANLFCQMKKDGIRPNDFTYSTILAAHPSISLFQVHAEVIKTEYQSSPTVGTALLDAYV
KTGDTDEAAKVFEEIDEKDIIAWSAMLSGYAQKGNIQGAVRVFRQLVKDGVRPNEFTFSS
VINACVTSMASVEQGKQFHCSAIKSGHSNALCVSSALVTMYAKRGNIESANEIFKRQPER
DLVSWNSMISGYAQHGYGRKALKIFEEMRKRNLDMDNITFIGVISACTHAGLLNEGQTYF
EMMVNDFHISPKMEIYSCMVDLYSRAGMLDKAMALINEMPFPAGAIVWRTLLAASRVHRN
VELGKLAAENLISLQPQDSAAYVLLSNLYAATGDWQERAKVRKLMDVRKVKKEIGYSWIE
VKNKTYSFMAGDASHPLSDSIYMKLEELRGRLKDAGYQPDTNYVLHDVEDEHKEAILSRH
SERLAIAFGLIATPPGIPIQIVKNLRVCGDCHTVIKLISKIEGRQIVVRDSNRFHHFKGG
LCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400019167
Transcript Infomation

pacid=37466053 locus=PGSC0003DMG400007415 ID=PGSC0003DMT400019167.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGAATGTTGATGATGGTCAGAAAATGTTTGATGAAATGGAGGATAACAAGAATGTT
GTGACTTGGACTTCGTTGCTTTCGGGTTATTCGTGTAATAAGTTGGTTGATAGAGCGTTA
GAAGTGTTTCGTGTAATGTTAGTTGGAGGAGTTAAGCCTAATGCGTTTACTTTCGCGACA
GTTCTTGGAGTTTTGGCTGATAAATGTGTAGTTGAAAAAGGGATTCAAGTGCATAGTATG
GTTATCAAGTGTGGTTTTGAGGCGACAACATCTGTTGGGAATTCTTTGATTAATATGTAT
TTGAAATCTGGGATGGTTAGAGAGGCTACAGCTGTATTTGAGGGTATGGGAGATAGGAAT
GAAGTATCTTGGAATGGTATGATAGCTGGTCTGGTGACTAATGGGCTTTATTCCGAAGCA
CTTAAGTTGTTCCACATGATGAGACTTGCAGGTGTGGAACTGACACGATCGATTTATGTT
ACAGCTGTTAAATTATGTACTAAACTTAAAGAATTGGTTTTTGCAAGACAACTTCATGGT
CGAGTTATGAAGAACGGGTTCTATTTTGACAATAATATCAGAACAGCACTCATGGTCTCT
TATACTAAGTGTGGAGAGATGGACGATGCCTTCAAGTTATTCTCTATAATGCATAAATTC
AGGAACGTGGTTTCTTGGACCGCAATGATTGGCGGGTATATGCAGAATAACAGACAAGAG
CAAGCGGCGAATCTCTTTTGCCAAATGAAAAAGGATGGGATAAGGCCAAACGATTTCACT
TATTCAACTATTCTTGCAGCTCATCCATCTATTTCGCTGTTCCAAGTACATGCAGAAGTC
ATCAAGACTGAGTACCAGAGCTCACCTACCGTCGGAACTGCATTATTAGACGCCTATGTG
AAAACAGGAGATACTGATGAGGCTGCGAAAGTTTTTGAAGAGATTGATGAGAAGGACATT
ATTGCATGGTCTGCTATGTTATCTGGTTATGCGCAAAAAGGAAACATTCAAGGTGCTGTC
AGAGTCTTCCGGCAACTAGTCAAAGATGGGGTCAGGCCAAATGAGTTTACCTTCTCCAGT
GTCATCAATGCGTGTGTTACTTCCATGGCATCAGTGGAGCAAGGAAAACAATTTCATTGT
AGCGCGATCAAATCAGGTCACAGTAATGCCTTATGTGTGAGCAGTGCCTTGGTAACTATG
TATGCTAAGAGAGGAAACATAGAAAGTGCAAATGAGATTTTCAAGAGACAACCAGAAAGA
GACTTAGTTTCATGGAATTCAATGATATCAGGATATGCCCAACATGGTTATGGCAGAAAA
GCTCTAAAGATATTCGAGGAAATGCGGAAAAGGAATTTGGATATGGACAATATAACGTTC
ATTGGAGTTATCTCTGCTTGTACTCATGCTGGACTGCTAAATGAAGGTCAAACATATTTT
GAGATGATGGTAAACGACTTTCATATTTCACCAAAAATGGAGATATACTCTTGCATGGTA
GACTTGTATAGCCGAGCTGGAATGCTGGATAAAGCCATGGCTCTTATCAATGAAATGCCA
TTTCCTGCTGGTGCAATTGTGTGGCGTACTCTTCTGGCAGCAAGTCGAGTTCATCGCAAT
GTAGAGCTGGGGAAACTGGCGGCCGAGAATCTCATTTCTCTTCAGCCTCAGGACTCAGCT
GCATATGTCCTTCTATCCAATCTCTATGCTGCAACGGGAGATTGGCAAGAAAGAGCGAAA
GTAAGGAAACTAATGGATGTGAGAAAAGTTAAAAAAGAGATTGGGTATAGCTGGATTGAG
GTTAAGAATAAGACCTACTCATTCATGGCAGGTGATGCTTCGCATCCCCTATCTGACAGT
ATATACATGAAACTCGAAGAGTTACGTGGCCGATTGAAGGATGCAGGATATCAACCGGAT
ACAAATTATGTTCTTCATGATGTGGAAGATGAACATAAAGAAGCCATTCTTTCTCGGCAC
AGTGAAAGGTTAGCTATTGCTTTTGGATTGATTGCCACGCCTCCAGGAATTCCCATTCAG
ATTGTGAAGAATCTCAGAGTTTGTGGTGACTGTCACACTGTTATTAAATTAATATCAAAG
ATAGAAGGAAGGCAAATAGTCGTCAGGGATTCAAATAGATTCCATCACTTTAAAGGAGGT
CTATGTTCTTGCGGTGATTATTGGTGA