Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400018994
CDS Infomation

pacid=37464899 polypeptide=PGSC0003DMP400013033 locus=PGSC0003DMG400007359 ID=PGSC0003DMT400018994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTCTTTGGCCCTAACCTCAGCCGTCAACCTTCGTCTCCGGCCAACCCCATCTCAA
AAACCACGTATTTCCATCACCCAATCTCTTCATTTCACTCAAACATCACTAAAAACCACA
AATCTTGGAAAAAGTTTGAATCTTGGAGGAAAAAGATTGAATCATGAGAAATCAAGAAGG
GTTATTGTAAAGACTTCGGCTTCAGCTTCAGCTTCTTCTCCTGCAATAGTTCCACAGCAG
CAGCCTCCATGGCAAGGTGCAGCAATGAAGCCTTTGATTGCTTCAATAGCAACTGGGGTT
ATTCTCTGGTTTATCCCTGCACCTGCTGGTGTTACAAAAAATGCATGGCAGTTATTGGCT
ATCTTTCTTGCTACAATTGTTGGGATTATTACTCAACCATTACCTCTTGGAGCTGTAGCT
CTTATGGGTCTTGGTGCTTGTGTGTTGACTAAAACTCTTACTTTTGCTGCTGCATTTTCA
GCTTTTGGTGATCCAATTCCATGGTTAATTGCTCTTGCTTTTTTCTTTGCAAGAGGGTTT
ATTAAAACTGGATTAGGTAATAGGATTGCTTATCAGTTTGTGAAATTGTTTGGTAGTTCT
TCATTGGGGTTGGGTTATAGTTTGGTTTTCAGTGAAGCCCTTTTGGCTCCTGCTATTCCT
TCTGTTTCTGCAAGGGCGGGTGGGATTTTTCTGCCATTGGTTAAGTCACTTTGTGTGGCT
TGTGGAAGTAATGCAGGTGATGGAACTGAACATAAGTTGGGATCTTGGTTGATGCTTACT
TGTTTTCAGACATCTGTTATTTCATCCTCTATGTTCTTGACAGCTATGGCCGCTAATCCT
TTGAGTGCAAATTTGACTCTAAGTACTATTAATCAGACAATTGGGTGGATGGATTGGGCT
AAGGCAGCTATAGTTCCTGGTTTGGTATCTTTGATTGTAGTTCCATTGTTGTTGTACATC
ATTTATCCACCTACAGTGAAGAGTAGCCCTGATGCTCCTAGGTTGGCTAAGGAAAGGTTG
GAGCAGATGGGGCCAATGTCTAAGAATGAGATTATTATGGCTGGAACTCTGCTTCTTACG
GTCGGACTTTGGGTTTTTGGCGGTGCATTAAAGGTTGATGCTGTTACTGCAGCAATTCTT
GGTCTATCTGTACTCCTTGTGACTGGGGTAGTCACATGGAAGGAATGCTTGGGTGAGGCT
GTTGCTTGGGACACCCTTACTTGGTTTGCTGCACTGATTGCAATGGCTGGCTATCTGAAC
AAATATGGTCTCATCTCTTGGTTTAGTGAGACCGTTGTCAAGGTTGTTGGTGGATTAAGT
CTTTCATGGCAGTTATCATTCGGAATTCTTGTACTTCTATACTTCTACTCCCACTATTTC
TTTGCAAGTGGAGCTGCTCATATCGGAGCAATGTTCACAGCATTCTTATCTGTGGCCAGT
GCACTAGGTACTCCACCATACTTGGGAGCATTGGTGCTCTCATTCCTCTCGAACCTTATG
GGTGGCATTACTCACTATGGAATTGGATCAGCCCCTGTATTCTATGGTGCAAACTATGTC
CCCCTTGCGAAATGGTGGGGATACGGGTTTGTATGTTCTGTTGTCAACCTTATTATCTGG
CTTGGTGTTGGTGGAATTTGGTGGAAGGCCATTGGCTTATGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400013033
PEP Infomation

pacid=37464899 transcript=PGSC0003DMT400018994 locus=PGSC0003DMG400007359 ID=PGSC0003DMT400018994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASLALTSAVNLRLRPTPSQKPRISITQSLHFTQTSLKTTNLGKSLNLGGKRLNHEKSRR
VIVKTSASASASSPAIVPQQQPPWQGAAMKPLIASIATGVILWFIPAPAGVTKNAWQLLA
IFLATIVGIITQPLPLGAVALMGLGACVLTKTLTFAAAFSAFGDPIPWLIALAFFFARGF
IKTGLGNRIAYQFVKLFGSSSLGLGYSLVFSEALLAPAIPSVSARAGGIFLPLVKSLCVA
CGSNAGDGTEHKLGSWLMLTCFQTSVISSSMFLTAMAANPLSANLTLSTINQTIGWMDWA
KAAIVPGLVSLIVVPLLLYIIYPPTVKSSPDAPRLAKERLEQMGPMSKNEIIMAGTLLLT
VGLWVFGGALKVDAVTAAILGLSVLLVTGVVTWKECLGEAVAWDTLTWFAALIAMAGYLN
KYGLISWFSETVVKVVGGLSLSWQLSFGILVLLYFYSHYFFASGAAHIGAMFTAFLSVAS
ALGTPPYLGALVLSFLSNLMGGITHYGIGSAPVFYGANYVPLAKWWGYGFVCSVVNLIIW
LGVGGIWWKAIGLW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400018994
Transcript Infomation

pacid=37464899 locus=PGSC0003DMG400007359 ID=PGSC0003DMT400018994.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCGTCTTTGGCCCTAACCTCAGCCGTCAACCTTCGTCTCCGGCCAACCCCATCTCAA
AAACCACGTATTTCCATCACCCAATCTCTTCATTTCACTCAAACATCACTAAAAACCACA
AATCTTGGAAAAAGTTTGAATCTTGGAGGAAAAAGATTGAATCATGAGAAATCAAGAAGG
GTTATTGTAAAGACTTCGGCTTCAGCTTCAGCTTCTTCTCCTGCAATAGTTCCACAGCAG
CAGCCTCCATGGCAAGGTGCAGCAATGAAGCCTTTGATTGCTTCAATAGCAACTGGGGTT
ATTCTCTGGTTTATCCCTGCACCTGCTGGTGTTACAAAAAATGCATGGCAGTTATTGGCT
ATCTTTCTTGCTACAATTGTTGGGATTATTACTCAACCATTACCTCTTGGAGCTGTAGCT
CTTATGGGTCTTGGTGCTTGTGTGTTGACTAAAACTCTTACTTTTGCTGCTGCATTTTCA
GCTTTTGGTGATCCAATTCCATGGTTAATTGCTCTTGCTTTTTTCTTTGCAAGAGGGTTT
ATTAAAACTGGATTAGGTAATAGGATTGCTTATCAGTTTGTGAAATTGTTTGGTAGTTCT
TCATTGGGGTTGGGTTATAGTTTGGTTTTCAGTGAAGCCCTTTTGGCTCCTGCTATTCCT
TCTGTTTCTGCAAGGGCGGGTGGGATTTTTCTGCCATTGGTTAAGTCACTTTGTGTGGCT
TGTGGAAGTAATGCAGGTGATGGAACTGAACATAAGTTGGGATCTTGGTTGATGCTTACT
TGTTTTCAGACATCTGTTATTTCATCCTCTATGTTCTTGACAGCTATGGCCGCTAATCCT
TTGAGTGCAAATTTGACTCTAAGTACTATTAATCAGACAATTGGGTGGATGGATTGGGCT
AAGGCAGCTATAGTTCCTGGTTTGGTATCTTTGATTGTAGTTCCATTGTTGTTGTACATC
ATTTATCCACCTACAGTGAAGAGTAGCCCTGATGCTCCTAGGTTGGCTAAGGAAAGGTTG
GAGCAGATGGGGCCAATGTCTAAGAATGAGATTATTATGGCTGGAACTCTGCTTCTTACG
GTCGGACTTTGGGTTTTTGGCGGTGCATTAAAGGTTGATGCTGTTACTGCAGCAATTCTT
GGTCTATCTGTACTCCTTGTGACTGGGGTAGTCACATGGAAGGAATGCTTGGGTGAGGCT
GTTGCTTGGGACACCCTTACTTGGTTTGCTGCACTGATTGCAATGGCTGGCTATCTGAAC
AAATATGGTCTCATCTCTTGGTTTAGTGAGACCGTTGTCAAGGTTGTTGGTGGATTAAGT
CTTTCATGGCAGTTATCATTCGGAATTCTTGTACTTCTATACTTCTACTCCCACTATTTC
TTTGCAAGTGGAGCTGCTCATATCGGAGCAATGTTCACAGCATTCTTATCTGTGGCCAGT
GCACTAGGTACTCCACCATACTTGGGAGCATTGGTGCTCTCATTCCTCTCGAACCTTATG
GGTGGCATTACTCACTATGGAATTGGATCAGCCCCTGTATTCTATGGTGCAAACTATGTC
CCCCTTGCGAAATGGTGGGGATACGGGTTTGTATGTTCTGTTGTCAACCTTATTATCTGG
CTTGGTGTTGGTGGAATTTGGTGGAAGGCCATTGGCTTATGGTAG