Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400018903
CDS Infomation

pacid=37424306 polypeptide=PGSC0003DMP400012977 locus=PGSC0003DMG400007329 ID=PGSC0003DMT400018903.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTCTTTTTCTCCCTCCCTACCAAACAGTTCACCTCAAAGCTAATCCCATGTAAGTCT
TTCTCTAACTTCACCATTAACCGTTTATTCTCAGCTCTTTCGAACCCTTCTCATACTGAC
CAAGAACCTGAAATAGACTATGCAATTTCTACTTTGAAAACTGAAATGGGACTACCCAAA
TTGAGTTCTTGTGGAGCTGAAATGGAAATACCCATATCTGATAACTCAATGAAAATTTCC
CCTATATCCAACTTTAATTCTTGTGGAGCTGAAGTAGAAGAACCCCTTTCTGATAATTCA
TTTAAAGTTACCCTAAAACCCAACTTGGGTTCTTGTAAAACTGAAGTGGAAGTACCAATT
TCAGATAAGTTATTTAAAGAGGCTCCAAAGTTGGGTTCTTTCAAATTGGGTGATTCTACA
TTCTATTCTCTTATTGAGAAGTATGCCAATTCCGGGGACTTTACGTCTTTGGAGAAGGTT
TTTGATAGAATGAAGTGTGAAAAAAGAGTCTTTATTGAGAAGAGTTTTATCTTAGTGTTT
AGAGCTTATGGAAAAGCCCGTTTGCCTGAAAAAGCTGTTGAATTGTTTGAAAGAATGGTG
GATGAGTTTCAATGTAAACGAACTGTGAAGTCGTTTAATTCTGTTCTTAATGTGATAGTT
CAGACAGGATTATATCGTCATGCTTTAGATTTTTATGCTGATGTTGTGAATAATAGGAAT
ATTATGCCAAATGTGCTTTCTTTTAATTTAGTTATTAAGACAATGTGTAAGCTTCGGATG
GTCGATAGAGCTATGGAGGTGTTTAGAGAAATGCCTACTTGGAAATGTGAGCCGGATGTT
TATACATACTGCACTTTGATGGATGGGTTGTGCAAGGATGACCGGATTGATGAGGCAGTT
ATTCTTTTGGATGAAATGCAGGTAGAGGGATGTCTTCCTGTTCCAGTGACATTTAATGTG
TTGATTAATGGGCTTTGTCGGAAAGGTGACTTGGCTCGAGCTGCAAAGCTTGTGGATAAC
ATGTTTCTTAAAGGGTGTGTTCCAAATGAAGTGACTTATAACACACTTATACACGGTTTG
TGCCTGAAAGGTAAATTGGAGAAAGCAGTTAGTTTAGTGGATAGAATGGTGTCAAATAAG
TATATACCAACTGATATAACCTATGGAACGATTATCAATGGGTTTGTTAAGCAAAGAAGA
GCCACAGATGGTGTGCAGATCTTGTTGGCAATGCAGGAGAAAGGGCATCTGGCAAATGAA
TATGTCTACTCAGCACTAGTTAGTGGGTTGTTCAAGGAGGGAAAACCTGAAGAGGCGTTA
AAAATATGGAAGGGAATGATAGAAAAGGGAGTGAAGCCTAATACAGTTGCTTATTCTGCT
TTTATAGATGGTTTGTGTCGAGAAGGCAGACCTGACGAAGCTAAGGAGATCCTTTCTGAG
ATGAATAAAATGGGTTGCACTCCCAATGCTTATACTTACTGCTCTCTGATGAAGGGTTAT
TTTAAAACCGGTGACAGCAACAAGGCTATACTTTTGTGGAAAGACATGGCAACCAGTGGT
ATCACATGCAATGAAATCTGCTACAGTGTACTTACCCATGGACTGTGTCAAGATGGGAAG
CTCAAAGAGGCTATGATGGTGTGGAAGCACATGTTAGGCAAAGGATTGGTCCCTGATGTC
GTGGCTTATAGTTCAATGATTCATGGCCTTTGCAATGCTGGTTCTGTGGACCAGGGATTG
AGACTCTTCAATGAGATGCAATGTAGAGGATCTGATTCTCAGCCTGACGTAATAGCATAT
AACATAATTATTAATGCTTTATGCAAGGTGGACAGAATTTCTCTAGCAATTGATCTTTTG
AATACCATGTTGGATCGAGGTTGTGATCCTGACACAATTACATGTAATATTTTCTTGAAA
ACCTTAAATGACAAAGCAAATCCATCCCAAGATGGGGAAGACTTTCTGGATAAGCTGGTG
CTACAACTGTACAGGCGGCAGAGAATCGTAGGAGCTTCAAGAATTATAGAAGTGATGCTT
CAAAAAATTATTTATCCCAAGTCGTCCACTTGGGAAATGATTATTCGAGAACTTTGCAAA
CCAAAGAAGGTTCAAGGAGCTATTAACAAGTGTTGGAGTGACCTTTTCATCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400012977
PEP Infomation

pacid=37424306 transcript=PGSC0003DMT400018903 locus=PGSC0003DMG400007329 ID=PGSC0003DMT400018903.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MLFFSLPTKQFTSKLIPCKSFSNFTINRLFSALSNPSHTDQEPEIDYAISTLKTEMGLPK
LSSCGAEMEIPISDNSMKISPISNFNSCGAEVEEPLSDNSFKVTLKPNLGSCKTEVEVPI
SDKLFKEAPKLGSFKLGDSTFYSLIEKYANSGDFTSLEKVFDRMKCEKRVFIEKSFILVF
RAYGKARLPEKAVELFERMVDEFQCKRTVKSFNSVLNVIVQTGLYRHALDFYADVVNNRN
IMPNVLSFNLVIKTMCKLRMVDRAMEVFREMPTWKCEPDVYTYCTLMDGLCKDDRIDEAV
ILLDEMQVEGCLPVPVTFNVLINGLCRKGDLARAAKLVDNMFLKGCVPNEVTYNTLIHGL
CLKGKLEKAVSLVDRMVSNKYIPTDITYGTIINGFVKQRRATDGVQILLAMQEKGHLANE
YVYSALVSGLFKEGKPEEALKIWKGMIEKGVKPNTVAYSAFIDGLCREGRPDEAKEILSE
MNKMGCTPNAYTYCSLMKGYFKTGDSNKAILLWKDMATSGITCNEICYSVLTHGLCQDGK
LKEAMMVWKHMLGKGLVPDVVAYSSMIHGLCNAGSVDQGLRLFNEMQCRGSDSQPDVIAY
NIIINALCKVDRISLAIDLLNTMLDRGCDPDTITCNIFLKTLNDKANPSQDGEDFLDKLV
LQLYRRQRIVGASRIIEVMLQKIIYPKSSTWEMIIRELCKPKKVQGAINKCWSDLFI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400018903
Transcript Infomation

pacid=37424306 locus=PGSC0003DMG400007329 ID=PGSC0003DMT400018903.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCTCTTTTTCTCCCTCCCTACCAAACAGTTCACCTCAAAGCTAATCCCATGTAAGTCT
TTCTCTAACTTCACCATTAACCGTTTATTCTCAGCTCTTTCGAACCCTTCTCATACTGAC
CAAGAACCTGAAATAGACTATGCAATTTCTACTTTGAAAACTGAAATGGGACTACCCAAA
TTGAGTTCTTGTGGAGCTGAAATGGAAATACCCATATCTGATAACTCAATGAAAATTTCC
CCTATATCCAACTTTAATTCTTGTGGAGCTGAAGTAGAAGAACCCCTTTCTGATAATTCA
TTTAAAGTTACCCTAAAACCCAACTTGGGTTCTTGTAAAACTGAAGTGGAAGTACCAATT
TCAGATAAGTTATTTAAAGAGGCTCCAAAGTTGGGTTCTTTCAAATTGGGTGATTCTACA
TTCTATTCTCTTATTGAGAAGTATGCCAATTCCGGGGACTTTACGTCTTTGGAGAAGGTT
TTTGATAGAATGAAGTGTGAAAAAAGAGTCTTTATTGAGAAGAGTTTTATCTTAGTGTTT
AGAGCTTATGGAAAAGCCCGTTTGCCTGAAAAAGCTGTTGAATTGTTTGAAAGAATGGTG
GATGAGTTTCAATGTAAACGAACTGTGAAGTCGTTTAATTCTGTTCTTAATGTGATAGTT
CAGACAGGATTATATCGTCATGCTTTAGATTTTTATGCTGATGTTGTGAATAATAGGAAT
ATTATGCCAAATGTGCTTTCTTTTAATTTAGTTATTAAGACAATGTGTAAGCTTCGGATG
GTCGATAGAGCTATGGAGGTGTTTAGAGAAATGCCTACTTGGAAATGTGAGCCGGATGTT
TATACATACTGCACTTTGATGGATGGGTTGTGCAAGGATGACCGGATTGATGAGGCAGTT
ATTCTTTTGGATGAAATGCAGGTAGAGGGATGTCTTCCTGTTCCAGTGACATTTAATGTG
TTGATTAATGGGCTTTGTCGGAAAGGTGACTTGGCTCGAGCTGCAAAGCTTGTGGATAAC
ATGTTTCTTAAAGGGTGTGTTCCAAATGAAGTGACTTATAACACACTTATACACGGTTTG
TGCCTGAAAGGTAAATTGGAGAAAGCAGTTAGTTTAGTGGATAGAATGGTGTCAAATAAG
TATATACCAACTGATATAACCTATGGAACGATTATCAATGGGTTTGTTAAGCAAAGAAGA
GCCACAGATGGTGTGCAGATCTTGTTGGCAATGCAGGAGAAAGGGCATCTGGCAAATGAA
TATGTCTACTCAGCACTAGTTAGTGGGTTGTTCAAGGAGGGAAAACCTGAAGAGGCGTTA
AAAATATGGAAGGGAATGATAGAAAAGGGAGTGAAGCCTAATACAGTTGCTTATTCTGCT
TTTATAGATGGTTTGTGTCGAGAAGGCAGACCTGACGAAGCTAAGGAGATCCTTTCTGAG
ATGAATAAAATGGGTTGCACTCCCAATGCTTATACTTACTGCTCTCTGATGAAGGGTTAT
TTTAAAACCGGTGACAGCAACAAGGCTATACTTTTGTGGAAAGACATGGCAACCAGTGGT
ATCACATGCAATGAAATCTGCTACAGTGTACTTACCCATGGACTGTGTCAAGATGGGAAG
CTCAAAGAGGCTATGATGGTGTGGAAGCACATGTTAGGCAAAGGATTGGTCCCTGATGTC
GTGGCTTATAGTTCAATGATTCATGGCCTTTGCAATGCTGGTTCTGTGGACCAGGGATTG
AGACTCTTCAATGAGATGCAATGTAGAGGATCTGATTCTCAGCCTGACGTAATAGCATAT
AACATAATTATTAATGCTTTATGCAAGGTGGACAGAATTTCTCTAGCAATTGATCTTTTG
AATACCATGTTGGATCGAGGTTGTGATCCTGACACAATTACATGTAATATTTTCTTGAAA
ACCTTAAATGACAAAGCAAATCCATCCCAAGATGGGGAAGACTTTCTGGATAAGCTGGTG
CTACAACTGTACAGGCGGCAGAGAATCGTAGGAGCTTCAAGAATTATAGAAGTGATGCTT
CAAAAAATTATTTATCCCAAGTCGTCCACTTGGGAAATGATTATTCGAGAACTTTGCAAA
CCAAAGAAGGTTCAAGGAGCTATTAACAAGTGTTGGAGTGACCTTTTCATCTGA