Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400018411
CDS Infomation

pacid=37451888 polypeptide=PGSC0003DMP400012667 locus=PGSC0003DMG400007148 ID=PGSC0003DMT400018411.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAGATTTTGCTTCTTGTTTCAATGAATATGCTGTACAAGTTTCTGATAATACTTCT
TGTTCTAGTTACTCAAACTCTGCTTGTATCCCTCCTTCTATAATTCCTTCAGTACAAAAC
ACTGTCAATTGTTTGTACAAAGTCAATTTACCCAATAAAAAACATGTCTTGATCACAATT
TCATGGTGCAAAACAAATGTAACACAAGGCCTAAGTGTACACTTTGGTGATGATCATCCA
AATGTATTCAAACTCAACATGAATACGCGTCTTTTTAGGAAGAAAAAGGGAAGTAAATCA
ATGGATTTGGATAATTTTAAGGTTGAAATTATATGGGATTTGTGTGGAGCTAGGTACTTA
AGTAGTGGTCCTGAACCAATTGATGGATATTATGTATTAGTCATAGTTGATTCACAAGTT
GGACTAATTCTTGGTGATATGGCTGAAGAAGCATCATTAAGGAAGTTGAAAAATGGAATT
CCAATGGCTAAATTTTCATTGGTTTCAAGACAAGAACATTTTTCTGGAAATACAATTTAT
TCAACCAAGGCTCAATTTTGTGATAATGGTAACATACATGATGTTTTAATTCGTTGTAAC
GGCGAAAATGATGGACTAAAACATCCTGTTTTGACAGTTTATATTGATAAGAAGATGGTG
ATTAGAGTTAAAAGATTGCAATGGAACTTCAGGGGAAATCAGAGTATTTTTTTGGATGGA
TTGCTTGTTGATCTAATGTGGAATGTTCATGATTGGTTCTTTAATCCAGCTTCTGGTATT
GCACTGTTTATGTTTAGGACAAGAAGTGGTATGGATAGTAGATTGTGGCTAGATGATAAA
GACAAATTCCTCATCAAAGATCAAGAAAAAGTTGAATTCTCATTGTTGATCTATGCTTCT
AAGAGCACATAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400012667
PEP Infomation

pacid=37451888 transcript=PGSC0003DMT400018411 locus=PGSC0003DMG400007148 ID=PGSC0003DMT400018411.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRDFASCFNEYAVQVSDNTSCSSYSNSACIPPSIIPSVQNTVNCLYKVNLPNKKHVLITI
SWCKTNVTQGLSVHFGDDHPNVFKLNMNTRLFRKKKGSKSMDLDNFKVEIIWDLCGARYL
SSGPEPIDGYYVLVIVDSQVGLILGDMAEEASLRKLKNGIPMAKFSLVSRQEHFSGNTIY
STKAQFCDNGNIHDVLIRCNGENDGLKHPVLTVYIDKKMVIRVKRLQWNFRGNQSIFLDG
LLVDLMWNVHDWFFNPASGIALFMFRTRSGMDSRLWLDDKDKFLIKDQEKVEFSLLIYAS
KST*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400018411
Transcript Infomation

pacid=37451888 locus=PGSC0003DMG400007148 ID=PGSC0003DMT400018411.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGAGATTTTGCTTCTTGTTTCAATGAATATGCTGTACAAGTTTCTGATAATACTTCT
TGTTCTAGTTACTCAAACTCTGCTTGTATCCCTCCTTCTATAATTCCTTCAGTACAAAAC
ACTGTCAATTGTTTGTACAAAGTCAATTTACCCAATAAAAAACATGTCTTGATCACAATT
TCATGGTGCAAAACAAATGTAACACAAGGCCTAAGTGTACACTTTGGTGATGATCATCCA
AATGTATTCAAACTCAACATGAATACGCGTCTTTTTAGGAAGAAAAAGGGAAGTAAATCA
ATGGATTTGGATAATTTTAAGGTTGAAATTATATGGGATTTGTGTGGAGCTAGGTACTTA
AGTAGTGGTCCTGAACCAATTGATGGATATTATGTATTAGTCATAGTTGATTCACAAGTT
GGACTAATTCTTGGTGATATGGCTGAAGAAGCATCATTAAGGAAGTTGAAAAATGGAATT
CCAATGGCTAAATTTTCATTGGTTTCAAGACAAGAACATTTTTCTGGAAATACAATTTAT
TCAACCAAGGCTCAATTTTGTGATAATGGTAACATACATGATGTTTTAATTCGTTGTAAC
GGCGAAAATGATGGACTAAAACATCCTGTTTTGACAGTTTATATTGATAAGAAGATGGTG
ATTAGAGTTAAAAGATTGCAATGGAACTTCAGGGGAAATCAGAGTATTTTTTTGGATGGA
TTGCTTGTTGATCTAATGTGGAATGTTCATGATTGGTTCTTTAATCCAGCTTCTGGTATT
GCACTGTTTATGTTTAGGACAAGAAGTGGTATGGATAGTAGATTGTGGCTAGATGATAAA
GACAAATTCCTCATCAAAGATCAAGAAAAAGTTGAATTCTCATTGTTGATCTATGCTTCT
AAGAGCACATAA