Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400017929
CDS Infomation

pacid=37424997 polypeptide=PGSC0003DMP400012333 locus=PGSC0003DMG400006963 ID=PGSC0003DMT400017929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGCAAAAGAAGGAGTTATCTCATAGACCCAAGTTGCTGAAATATGTTTTATTTGGG
ATGATTGTGTTCTTGGGTTTGGTTTGTCTTTATAATTGTTCGTTTATGGGTCCTGGTCTT
CCTATAGCGCGTGACCCTTTAGCTATTGATGATGGTTCTGATCCAGTTACTGGGATTTCT
TACCATGGCCGCATGGATATGGATATGGAAGATCAAGAACTTGAAGTTCCTAAAAGTATT
CCTGTTTGTGATATGAGCTACTCGGAGTTGATACCCTGTCTTGACAGAAATTTGATATAT
CAATTGAGATTGAGGCTCAATTTGACTGTTATGGAGCATTATGAGAGGCATTGTCCTCCT
CCTCAACGTCGTTTCAATTGTCTTATCCCACCTCCAGCTGGTTACAAGATCCCAATTAGA
TGGCCAGCTAGTAGAGACCAAGTGTGGAAAGCAAACATACCCCATACACATCTTGCTCAG
GAAAAGTCGGATCAAAACTGGATGATTGTGGATGGAGACAAGATAAAATTCCCTGGCGGA
GGAACACATTTTCATTATGGAGCTGACATATACATTGCAGCAATTGCAGGGATGCTCAAA
TTGCCTGGTGAGAAACTCAGCAATGGTGGAAACATAAGAAATGTTCTTGATGTTGGCTGT
GGTGTTGCGAGCTTTGGGGCTTATCTTCTTTCCCATGATATTATAGCTATGTCACTTGCT
CCTAATGATGTACATGAGAATCAGATACAGTTTGCTTTGGAAAGGGGAATCCCATCTACA
CTAGGAGTCTTGGGCACCAAAAGACTACCTTATCCTAGCAGGTCATTTGAGTTGGCACAT
TGTTCACGCTGTAGAATTGATTGGCTCCAAAGAGATGGCATTCTTCTGTTAGAACTTGAC
AGATTGCTCAGACCAGGTGGTTATTTTGTGTACTCTTCACCTGAAGCTTATGCGCATGAT
GCCGAGAATCGAAGAATTTGGAATGCTATGTATGATCTATTGAGAAGAATGTGTTGGAGA
GTTGTTTCAAGGAGAGACCAAACTGTGATATGGGCCAAACCTCTGAGTAACAGTTGTTAT
ATGAAGAGAAGTCGGGGGACACAACCTCCCTTGTGCATGTCTGGTGATGAGCCCGATGAA
TCTTGGAATGTACCAATGAAAGCTTGCATAACTCCTTACTCAGCGAAGGTGCATAAGGAA
AAAGGGACCGGGCTAGAACCTTGGCCACGGAGGCTTATGGCTCCGCCACCTCGCTTGGAG
GAAATTGGTGTCACTTTGGATGAATTCCATAAAGACACTAACGTATGGCATGAAAGAGTA
GTCGACTATTGGAAGCAGATGAAGTCTGTTATCCTTAAGAACTCAGTTAGGAATGTGATG
GACATGAACTCAAACCTCGGTGGGTTTGCAGCTGCACTAAAGGATAAGGACATTTGGGTG
ATGAATGTTGCTCCTGTTAATATGTCATCAAGATTGAAAATAATTTATGATCGAGGCTTA
ATCGGAACAGTTCATGACTGGTGTGAATCATTTTCAACATACCCACGCACGTATGACCTC
CTTCATGCGTGGATGATCCTCTCAGAGACAGAAGATCGAGGCTGCAGCATCGAGGATCTA
CTTATTGAGATGGACCGTATGCTAAGGCCAGAAGGATTCATCATTATAAGGGACAAGCCT
CATATAATAAACTCCGTAAGAAAATTCATGCCTGCTCTAAAATGGGATGGATGGTCATCA
GAGGTAGAACCACGGACTGATGCTCTCTCCTTGAGCGAAGAAAGAATTCTAATAGCAAGA
AAGAAATTTTGGCGCGAGAAGTTAACAATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400012333
PEP Infomation

pacid=37424997 transcript=PGSC0003DMT400017929 locus=PGSC0003DMG400006963 ID=PGSC0003DMT400017929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MKQKKELSHRPKLLKYVLFGMIVFLGLVCLYNCSFMGPGLPIARDPLAIDDGSDPVTGIS
YHGRMDMDMEDQELEVPKSIPVCDMSYSELIPCLDRNLIYQLRLRLNLTVMEHYERHCPP
PQRRFNCLIPPPAGYKIPIRWPASRDQVWKANIPHTHLAQEKSDQNWMIVDGDKIKFPGG
GTHFHYGADIYIAAIAGMLKLPGEKLSNGGNIRNVLDVGCGVASFGAYLLSHDIIAMSLA
PNDVHENQIQFALERGIPSTLGVLGTKRLPYPSRSFELAHCSRCRIDWLQRDGILLLELD
RLLRPGGYFVYSSPEAYAHDAENRRIWNAMYDLLRRMCWRVVSRRDQTVIWAKPLSNSCY
MKRSRGTQPPLCMSGDEPDESWNVPMKACITPYSAKVHKEKGTGLEPWPRRLMAPPPRLE
EIGVTLDEFHKDTNVWHERVVDYWKQMKSVILKNSVRNVMDMNSNLGGFAAALKDKDIWV
MNVAPVNMSSRLKIIYDRGLIGTVHDWCESFSTYPRTYDLLHAWMILSETEDRGCSIEDL
LIEMDRMLRPEGFIIIRDKPHIINSVRKFMPALKWDGWSSEVEPRTDALSLSEERILIAR
KKFWREKLTI*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400017929
Transcript Infomation

pacid=37424997 locus=PGSC0003DMG400006963 ID=PGSC0003DMT400017929.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAAGCAAAAGAAGGAGTTATCTCATAGACCCAAGTTGCTGAAATATGTTTTATTTGGG
ATGATTGTGTTCTTGGGTTTGGTTTGTCTTTATAATTGTTCGTTTATGGGTCCTGGTCTT
CCTATAGCGCGTGACCCTTTAGCTATTGATGATGGTTCTGATCCAGTTACTGGGATTTCT
TACCATGGCCGCATGGATATGGATATGGAAGATCAAGAACTTGAAGTTCCTAAAAGTATT
CCTGTTTGTGATATGAGCTACTCGGAGTTGATACCCTGTCTTGACAGAAATTTGATATAT
CAATTGAGATTGAGGCTCAATTTGACTGTTATGGAGCATTATGAGAGGCATTGTCCTCCT
CCTCAACGTCGTTTCAATTGTCTTATCCCACCTCCAGCTGGTTACAAGATCCCAATTAGA
TGGCCAGCTAGTAGAGACCAAGTGTGGAAAGCAAACATACCCCATACACATCTTGCTCAG
GAAAAGTCGGATCAAAACTGGATGATTGTGGATGGAGACAAGATAAAATTCCCTGGCGGA
GGAACACATTTTCATTATGGAGCTGACATATACATTGCAGCAATTGCAGGGATGCTCAAA
TTGCCTGGTGAGAAACTCAGCAATGGTGGAAACATAAGAAATGTTCTTGATGTTGGCTGT
GGTGTTGCGAGCTTTGGGGCTTATCTTCTTTCCCATGATATTATAGCTATGTCACTTGCT
CCTAATGATGTACATGAGAATCAGATACAGTTTGCTTTGGAAAGGGGAATCCCATCTACA
CTAGGAGTCTTGGGCACCAAAAGACTACCTTATCCTAGCAGGTCATTTGAGTTGGCACAT
TGTTCACGCTGTAGAATTGATTGGCTCCAAAGAGATGGCATTCTTCTGTTAGAACTTGAC
AGATTGCTCAGACCAGGTGGTTATTTTGTGTACTCTTCACCTGAAGCTTATGCGCATGAT
GCCGAGAATCGAAGAATTTGGAATGCTATGTATGATCTATTGAGAAGAATGTGTTGGAGA
GTTGTTTCAAGGAGAGACCAAACTGTGATATGGGCCAAACCTCTGAGTAACAGTTGTTAT
ATGAAGAGAAGTCGGGGGACACAACCTCCCTTGTGCATGTCTGGTGATGAGCCCGATGAA
TCTTGGAATGTACCAATGAAAGCTTGCATAACTCCTTACTCAGCGAAGGTGCATAAGGAA
AAAGGGACCGGGCTAGAACCTTGGCCACGGAGGCTTATGGCTCCGCCACCTCGCTTGGAG
GAAATTGGTGTCACTTTGGATGAATTCCATAAAGACACTAACGTATGGCATGAAAGAGTA
GTCGACTATTGGAAGCAGATGAAGTCTGTTATCCTTAAGAACTCAGTTAGGAATGTGATG
GACATGAACTCAAACCTCGGTGGGTTTGCAGCTGCACTAAAGGATAAGGACATTTGGGTG
ATGAATGTTGCTCCTGTTAATATGTCATCAAGATTGAAAATAATTTATGATCGAGGCTTA
ATCGGAACAGTTCATGACTGGTGTGAATCATTTTCAACATACCCACGCACGTATGACCTC
CTTCATGCGTGGATGATCCTCTCAGAGACAGAAGATCGAGGCTGCAGCATCGAGGATCTA
CTTATTGAGATGGACCGTATGCTAAGGCCAGAAGGATTCATCATTATAAGGGACAAGCCT
CATATAATAAACTCCGTAAGAAAATTCATGCCTGCTCTAAAATGGGATGGATGGTCATCA
GAGGTAGAACCACGGACTGATGCTCTCTCCTTGAGCGAAGAAAGAATTCTAATAGCAAGA
AAGAAATTTTGGCGCGAGAAGTTAACAATTTAG