Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400017823
CDS Infomation	pacid=37428762 polypeptide=PGSC0003DMP400012253 locus=PGSC0003DMG400006922 ID=PGSC0003DMT400017823.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCCGGGAATCGAGGAGAGGGAAGCTCATCTGGGATCAAGTTCGATGAAGGGGGTGGA TTTAGTTTTGATTGGGAAGAAGAGGAGCTTGATGAAAATGCTGATTTGTTGCCTTCGGAT CCGTTTAATATGGAATGTAGGAACCAAAGGACGGGTTTTTCAACCATGACCAGTTGGTTA GAGGATTTTGGGTTTAAGATAGATGAGAATGAGGTTGCGAAACTTGATTCTTTCTTGATT CGCAAGATGGGAATTGATCAGGGTGCGGGTTTCCAGTTGATTGATGGAAATTGTGTGCCG TTCGGGATGATTTTCAGAGAGGGGTTGAACGGTGGTCATGGTCTGATGGATGGTGATACA ACAGATAATGATCAAGGGAGGATTAATGATCATTGTGGTGTGGATGGAGGTAATCCACCG CAGGCGTTGTTGCTGTCCCTTGGTTATTTAGGCTTGGGGGACCTATTTGTAGTTGAAAGA GTAAGCAAGCCTTTACGGGATGCTGTTGTAGGAGATCCACTTTTATGGAAAAATATTAAC ATAACTCATCCATTTTGTACTAATATCACAAATGATATCCTTATAAACTTAACGAATAGA GCTCAAGGCCATCTTCATTCTCTCAGTCTATTTCACTGCTCAAAGCTCACTGATGCTGGT TTGAAGCATGTACTTGATAGGAATCCCAACCTGTCAAAGTTAAATGTCCAAGGATGTGCG AGACTCACAGCAGATGGTATGCTCTCTAACTTAAAAGTCTGGAAGACTGCTGGAAAAACG AGACTTAAATATTTAGGGATTTATGGATTGTCTGGCTTGACAGACAAGCACATGGATGAG TTCAAGCTCTTAACAGGTGTAGATAATAGCAAGCTGCCAACTACTCGTAAGCCACGATTT TTTGGTGGTGGCCGGTCGCGTGTCACTTTTGATGATGACCGTGCTATTGACGTTGAAGTT TGCCCGATATGCCAGAGGTTTGAACTAGTTTATGATTGCACTTCGGAGAGTTGCCAAAAG AAGCAATCTTCCTCTCAGTTGTGCAGGGGTTGTGTTAAATGCATTAAGCGTTGTTTCGAT TGTGGATGCTGCTTAATTAATTGCGATTACGTGGAGCTGTTCCATTTCGAGTCGCTTTGT TTAGATTGCCCGATAAATCCCTTGGGTTCGCAAAAGGGGGAGCAGAAAACCGCCCCTTTG TCTGAAACCACTGTTGGTCACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400012253
PEP Infomation	pacid=37428762 transcript=PGSC0003DMT400017823 locus=PGSC0003DMG400006922 ID=PGSC0003DMT400017823.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MAGNRGEGSSSGIKFDEGGGFSFDWEEEELDENADLLPSDPFNMECRNQRTGFSTMTSWL EDFGFKIDENEVAKLDSFLIRKMGIDQGAGFQLIDGNCVPFGMIFREGLNGGHGLMDGDT TDNDQGRINDHCGVDGGNPPQALLLSLGYLGLGDLFVVERVSKPLRDAVVGDPLLWKNIN ITHPFCTNITNDILINLTNRAQGHLHSLSLFHCSKLTDAGLKHVLDRNPNLSKLNVQGCA RLTADGMLSNLKVWKTAGKTRLKYLGIYGLSGLTDKHMDEFKLLTGVDNSKLPTTRKPRF FGGGRSRVTFDDDRAIDVEVCPICQRFELVYDCTSESCQKKQSSSQLCRGCVKCIKRCFD CGCCLINCDYVELFHFESLCLDCPINPLGSQKGEQKTAPLSETTVGH*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400017823
Transcript Infomation	pacid=37428762 locus=PGSC0003DMG400006922 ID=PGSC0003DMT400017823.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGCCGGGAATCGAGGAGAGGGAAGCTCATCTGGGATCAAGTTCGATGAAGGGGGTGGA TTTAGTTTTGATTGGGAAGAAGAGGAGCTTGATGAAAATGCTGATTTGTTGCCTTCGGAT CCGTTTAATATGGAATGTAGGAACCAAAGGACGGGTTTTTCAACCATGACCAGTTGGTTA GAGGATTTTGGGTTTAAGATAGATGAGAATGAGGTTGCGAAACTTGATTCTTTCTTGATT CGCAAGATGGGAATTGATCAGGGTGCGGGTTTCCAGTTGATTGATGGAAATTGTGTGCCG TTCGGGATGATTTTCAGAGAGGGGTTGAACGGTGGTCATGGTCTGATGGATGGTGATACA ACAGATAATGATCAAGGGAGGATTAATGATCATTGTGGTGTGGATGGAGGTAATCCACCG CAGGCGTTGTTGCTGTCCCTTGGTTATTTAGGCTTGGGGGACCTATTTGTAGTTGAAAGA GTAAGCAAGCCTTTACGGGATGCTGTTGTAGGAGATCCACTTTTATGGAAAAATATTAAC ATAACTCATCCATTTTGTACTAATATCACAAATGATATCCTTATAAACTTAACGAATAGA GCTCAAGGCCATCTTCATTCTCTCAGTCTATTTCACTGCTCAAAGCTCACTGATGCTGGT TTGAAGCATGTACTTGATAGGAATCCCAACCTGTCAAAGTTAAATGTCCAAGGATGTGCG AGACTCACAGCAGATGGTATGCTCTCTAACTTAAAAGTCTGGAAGACTGCTGGAAAAACG AGACTTAAATATTTAGGGATTTATGGATTGTCTGGCTTGACAGACAAGCACATGGATGAG TTCAAGCTCTTAACAGGTGTAGATAATAGCAAGCTGCCAACTACTCGTAAGCCACGATTT TTTGGTGGTGGCCGGTCGCGTGTCACTTTTGATGATGACCGTGCTATTGACGTTGAAGTT TGCCCGATATGCCAGAGGTTTGAACTAGTTTATGATTGCACTTCGGAGAGTTGCCAAAAG AAGCAATCTTCCTCTCAGTTGTGCAGGGGTTGTGTTAAATGCATTAAGCGTTGTTTCGAT TGTGGATGCTGCTTAATTAATTGCGATTACGTGGAGCTGTTCCATTTCGAGTCGCTTTGT TTAGATTGCCCGATAAATCCCTTGGGTTCGCAAAAGGGGGAGCAGAAAACCGCCCCTTTG TCTGAAACCACTGTTGGTCACTAG