Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400017586
CDS Infomation

pacid=37435848 polypeptide=PGSC0003DMP400012083 locus=PGSC0003DMG400006821 ID=PGSC0003DMT400017586.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGAATTGGAACAGAAGAAGATGGATACCCAGAAAGAACTACAAGCAGGAAGATTTC
CCCCCTTCTCAGCCGTACCATTACAACCAATCTCCTTATCATGCTATCCAGCAAAACAGT
GTCCCATTATGGGAAATAGATTTCTGCAGAGCAGCCGGGATTCCCTGGCACAAGGTTGTG
AGTGCAAAAACATATATGTACTGTTATGAAAATGTGGTTAAGTGGGATGATTCTGCAGGT
CAAGAAGCATTCAACGATGCAAAAAGGAGATATTGGGCGGAGATTCGTGGTCTTCCCCCT
CAGAATCCTCCTCCCAATCCAGATTTGTACATTGATAAAGTTGATTGGGACTCAGCTATC
GATCCGGAGCTGATATTAGATTTGGACAGAGAATATTTTAACCCTAATGAAGTTAAAAAC
TCTGTCAAGTCTGAGAACAACTTAGTTCCTGGATGCACCCTGGTATGGGAGGATAAAAAT
GCTGATAATGGTGAAAATCATTGGGGAAGTGGTAATGTTCAGGGCTCTAAAACTGCTGCT
AATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGT
GAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAAT
CCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGG
GAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGT
GGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAAT
GTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAG
GGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCT
AAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACT
GCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCT
AATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGT
GAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCAAAGCCTGGTGACAATCGTGAAAAT
CCTTGGGAAAGTGCTTCTATTGAGGATACGAAGCAGACTTGGAATGAATGGTATACCCCT
GTAAACATCAAAGATGATAATCCGTGGGAAAGGAGTTCCCCTAAAACCCAGGGCATCTTG
AAGGACACTGCCTGGGGAGGCTGTGGAAATGAGTCATGGGGTTGGAACACGGGGATGAAT
TATGAGAATGGATATGCTTGTGTTGATAACAGTTTCAGCAATTTGTGGCATCAAAGTGGT
GCATGTGTTTCTGGTGCTAAAGGAAATGAATGGGTTGATAATAGCGTTGGTTCCTGGGGT
CAAACCTATTGGAATACTGGGGGGCATGAGCAGCGGAATTCAGACTATGGCTCTCGTTGG
AATAGGAATCTTAGTCGAGGTGGTGGAACAACCTCAAAAGACAGAAGATGGAGAGGATCT
GAGGTCACGTCTTGGGATTATCAGCAACAACCAAGGCAGAGTAATGAGAGAAATGTGGAT
TTTGGAAGACCTAGCAGAGGTGATAAAACCTTTTATACTGGTTCGCGCAAGAGGGAAAGT
TCTTCACAACATGTGCCGAGGTACAAAAGCTCAAGGTTTCAAAGTGATGAACAGAGGACT
GCGACCAATTGGAGAGAAGAAAAAACACAGAAGAGGGTTACTTTTAACATGTATGACTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400012083
PEP Infomation

pacid=37435848 transcript=PGSC0003DMT400017586 locus=PGSC0003DMG400006821 ID=PGSC0003DMT400017586.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MGNWNRRRWIPRKNYKQEDFPPSQPYHYNQSPYHAIQQNSVPLWEIDFCRAAGIPWHKVV
SAKTYMYCYENVVKWDDSAGQEAFNDAKRRYWAEIRGLPPQNPPPNPDLYIDKVDWDSAI
DPELILDLDREYFNPNEVKNSVKSENNLVPGCTLVWEDKNADNGENHWGSGNVQGSKTAA
NGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPW
ESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQ
GSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKTAA
NGENPWESGNVQGSKTAANGENPWESGNVQGSKPGDNRENPWESASIEDTKQTWNEWYTP
VNIKDDNPWERSSPKTQGILKDTAWGGCGNESWGWNTGMNYENGYACVDNSFSNLWHQSG
ACVSGAKGNEWVDNSVGSWGQTYWNTGGHEQRNSDYGSRWNRNLSRGGGTTSKDRRWRGS
EVTSWDYQQQPRQSNERNVDFGRPSRGDKTFYTGSRKRESSSQHVPRYKSSRFQSDEQRT
ATNWREEKTQKRVTFNMYD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400017586
Transcript Infomation

pacid=37435848 locus=PGSC0003DMG400006821 ID=PGSC0003DMT400017586.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGGGAATTGGAACAGAAGAAGATGGATACCCAGAAAGAACTACAAGCAGGAAGATTTC
CCCCCTTCTCAGCCGTACCATTACAACCAATCTCCTTATCATGCTATCCAGCAAAACAGT
GTCCCATTATGGGAAATAGATTTCTGCAGAGCAGCCGGGATTCCCTGGCACAAGGTTGTG
AGTGCAAAAACATATATGTACTGTTATGAAAATGTGGTTAAGTGGGATGATTCTGCAGGT
CAAGAAGCATTCAACGATGCAAAAAGGAGATATTGGGCGGAGATTCGTGGTCTTCCCCCT
CAGAATCCTCCTCCCAATCCAGATTTGTACATTGATAAAGTTGATTGGGACTCAGCTATC
GATCCGGAGCTGATATTAGATTTGGACAGAGAATATTTTAACCCTAATGAAGTTAAAAAC
TCTGTCAAGTCTGAGAACAACTTAGTTCCTGGATGCACCCTGGTATGGGAGGATAAAAAT
GCTGATAATGGTGAAAATCATTGGGGAAGTGGTAATGTTCAGGGCTCTAAAACTGCTGCT
AATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGT
GAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAAT
CCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGG
GAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGT
GGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAAT
GTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAG
GGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCT
AAAACTGCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACT
GCTGCTAATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCT
AATGGTGAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCTAAAACTGCTGCTAATGGT
GAAAATCCTTGGGAAAGTGGCAATGTGCAGGGCTCAAAGCCTGGTGACAATCGTGAAAAT
CCTTGGGAAAGTGCTTCTATTGAGGATACGAAGCAGACTTGGAATGAATGGTATACCCCT
GTAAACATCAAAGATGATAATCCGTGGGAAAGGAGTTCCCCTAAAACCCAGGGCATCTTG
AAGGACACTGCCTGGGGAGGCTGTGGAAATGAGTCATGGGGTTGGAACACGGGGATGAAT
TATGAGAATGGATATGCTTGTGTTGATAACAGTTTCAGCAATTTGTGGCATCAAAGTGGT
GCATGTGTTTCTGGTGCTAAAGGAAATGAATGGGTTGATAATAGCGTTGGTTCCTGGGGT
CAAACCTATTGGAATACTGGGGGGCATGAGCAGCGGAATTCAGACTATGGCTCTCGTTGG
AATAGGAATCTTAGTCGAGGTGGTGGAACAACCTCAAAAGACAGAAGATGGAGAGGATCT
GAGGTCACGTCTTGGGATTATCAGCAACAACCAAGGCAGAGTAATGAGAGAAATGTGGAT
TTTGGAAGACCTAGCAGAGGTGATAAAACCTTTTATACTGGTTCGCGCAAGAGGGAAAGT
TCTTCACAACATGTGCCGAGGTACAAAAGCTCAAGGTTTCAAAGTGATGAACAGAGGACT
GCGACCAATTGGAGAGAAGAAAAAACACAGAAGAGGGTTACTTTTAACATGTATGACTAG