Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400017535
CDS Infomation

pacid=37437829 polypeptide=PGSC0003DMP400012046 locus=PGSC0003DMG400006799 ID=PGSC0003DMT400017535.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCCAGAAGGTGATGTGAAGGGGAAGTCCTTGAAGACCTTAGGTGGTCAAGTCTGT
CAGATCTGTGGTGATGGTGTTGGCACTACTGTGAATGGCGAGCCATTTGTTGCTTGCGAT
GTCTGTGCCTTCCCTGTTTGTAGGCCATGCTATGAATATGAGAGGAAGGACGGGAATCAA
TCTTGCCCACAGTGCAAGACCAGATACAAGAGACATAAAGGAAGTCCTGCTATTAGTGGT
GAAAGTGTAGAAGATGGTGATGCTGATGATGGTGCCAGTGAACTAAATTACTCTTCTGAA
AATCTGAATGAGAAGCAAAAAGTGGCTGACCGTGTGTTGAGCTGGCACGCGACTTACGGG
CGGGGTGAGGAGACTGGTGCTCCAAAGTATGATAAGGAGGTCTCCCACAATCATATTCCT
CTGCTTACAAATGGAACAGATGTTTCTGGGGAATTGTCTGCAGCATCACCTGAACGCTAT
TCAATGGCATCTCCTGGACCTGCTGGTGGTGCAAAACACATCCATCCACTTACATATTCA
ACAGATGCTAACCAATCACCTAACATCAGGGTTGTGGACCCGGTAAGGGAGTTTGGATCC
CCTGGACTTGGCAATGTTGCTTGGAAAGAAAGAGTTGATGGCTGGAAAATGAAGCAGGAT
AAGAATGTTGTTCCGATGACCACTAGCCATCCTCCTTCGGAACGAGGAGTTGGAGATATT
GATGCTAGTACTGATATTCTGGGGGATGACTCTTTACTCAATGATGAGGCTAGACAACCT
CTTTCAAGGAAGGTGTCTATTCCATCGTCTAGGATAAATCCTTACAGGATGGTTATTGTC
CTCCGGCTTGTCATTCTTTGTATTTTCTTGCACTATCGGATAATGAATCCAGTGCCCAAT
GCAATTCCGTTATGGTTGTTATCTGTGATATGCGAGATTTGGTTTGCAGTATCTTGGATT
TTGGATCAGTTCCCCAAGTGGCTTCCAATCAACCGTGAGACATATCTTGATAGGCTTGCA
CTTAGGTATGATCGTGAAGGAGAGCCATCACAATTAGCTGCTGTTGACATATTTGTTAGT
ACTGTGGATCCTTTGAAGGAGCCTCCTCTTGTTACAGCAAATACTGTCCTGTCCATTCTT
GCAGTTGACTATCCTGTTGATAAGGTGTCCTGTTATGTGTCTGATGATGGTGCTGCCATG
TTGACATTTGAAGCCCTATCTGAAACAGCAGAGTTTGCAAGGAAATGGGTTCCTTTCTCT
AAGAAGTACAGCATAGAGCCACGAGCTCCAGAGTGGTATTTTTCTCAGAAGGTTGACTAC
TTGAAGGATAAAGTTCAAACATCATTTGTAAAAGACCGCAGGGCAATGAAGAGGGAGTAT
GAAGAGTTCAAAATTCGCATCAATGCCCTCGTTGCAAAAGCTCAAAAGGTCCCTGAAGAA
GGATGGATTATGCAAGATGGTACACCATGGCCTGGAAATAACACTAGGGATCATCCTGGG
ATGATTCAGGTTTTCTTGGGACAAAGTGGAGGACTTGACAGTGATGGAAATGAGTTGCCA
CGACTAGTGTATGTTTCTCGTGAGAAGCGTCCTGGCTTCCAACATCACAAAAAGGCCGGT
GCCATGAATGCACTGGTTCGCGTGTCAGCGGTTCTTACTAATGGACCGTTTATGTTGAAT
CTTGATTGTGATCATTACATAAACAACAGCAAGGCATTGAGAGAAGCAATGTGCTTTTTG
ATGGATCCTAACCTTGGAAAATATGTCTGCTATGTACAATTCCCTCAGAGATTCGATGGT
ATTGATAGGAACGATCGATATGCCAACAGGAATACAGTTTTTTTCGATATTAACTTGAGA
GGTTTGGATGGAATTCAAGGCCCAGTGTATGTGGGTACTGGATGTGTCTTCAATAGAACA
GCTTTATATGGTTATGAACCTCCAATTAAGCCAAAGCATAAGAAGGCAGGGTTCCTCTCT
TCCTGCTTCGGTGGATCAAGAAAGAAGGGTTCTAAATCAAGTAAAAAAGGCTCAGACAAG
AAGAAATCTAGTAAGAATGTTGATCCCACTGTGCCAATATTCAATCTGGAGGATATAGAG
GAGGGAGTTGAAGGTGCTGGATTTGATGATGAGAAGTCACTTCTCATGTCACAAATGAGC
CTGGAGAAGAGATTTGGGCAATCGGCTGTTTTTGTTGCTTCAACACTCATGGAGAATGGT
GGTGTTCCTCAATCGGCTACCCCGGAGACCCTTTTGAAAGAGGCTATTCATGTTATCAGT
TGTGGTTATGAAGATAAATCAGAATGGGGAACTGAGATTGGATGGATCTATGGTTCCGTC
ACAGAGGATATTCTTACTGGATTTAAGATGCATGCCCGTGGTTGGCGATCTATTTACTGT
ATGCCCAAGAGACCCGCCTTCAAAGGGTCAGCTCCTATTAATCTTTCAGATCGTCTGAAC
CAAGTGCTTCGATGGGCTTTAGGGTCAGTGGAAATTCTTTTCAGTAGGCATTGTCCTATA
TGGTATGGATACAATGGACGGTTGAAGTGGTTGGAGAGATTTGCTTATGTCAACACCACC
ATTTATCCAATCACTTCCATTCCACTTCTTATATACTGCATGCTTCCAGCTATCTGTCTA
CTTACTGGGAAATTCATTATCCCTCAGATTAGTAACCTTGCAAGCATCTGGTTTATATCC
CTCTTTCTTTCCATTTTCGCTACTGGTATTCTGGAGATGAGATGGAGTGGGGTTGGAATT
GATGAATGGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTCATTGGTGGTGTGTCAGCTCACCTGTTT
GCCGTCTTCCAAGGGTTGCTCAAAGTGCTTGCTGGTATTGATACCAACTTTACTGTCACA
TCCAAGGCATCAGATGAAGATGGGGACTTTGCGGAACTCTACTTGTTCAAATGGACAACT
CTTCTTATACCCCCCACTACTCTCCTCATTGTAAACCTGGTAGGAGTTGTGGCAGGCATC
TCATATGCCATCAACAGTGGTTACCAATCATGGGGTCCCCTCTTTGGTAAATTATTCTTT
GCTTTCTGGGTGATCGTTCACCTTTACCCCTTCCTCAAAGGTCTTATGGGTCGTCAGAAC
CGGACACCCACTATCGTGGTCGTGTGGTCTATTCTTCTGGCCTCCATTTTCTCTTTGTTA
TGGGTGCGGATTGATCCCTTCACAACAAGAGTTACTGGACCAGATGTTCAGGCGTGTGGT
ATCAATTGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400012046
PEP Infomation

pacid=37437829 transcript=PGSC0003DMT400017535 locus=PGSC0003DMG400006799 ID=PGSC0003DMT400017535.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDPEGDVKGKSLKTLGGQVCQICGDGVGTTVNGEPFVACDVCAFPVCRPCYEYERKDGNQ
SCPQCKTRYKRHKGSPAISGESVEDGDADDGASELNYSSENLNEKQKVADRVLSWHATYG
RGEETGAPKYDKEVSHNHIPLLTNGTDVSGELSAASPERYSMASPGPAGGAKHIHPLTYS
TDANQSPNIRVVDPVREFGSPGLGNVAWKERVDGWKMKQDKNVVPMTTSHPPSERGVGDI
DASTDILGDDSLLNDEARQPLSRKVSIPSSRINPYRMVIVLRLVILCIFLHYRIMNPVPN
AIPLWLLSVICEIWFAVSWILDQFPKWLPINRETYLDRLALRYDREGEPSQLAAVDIFVS
TVDPLKEPPLVTANTVLSILAVDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETAEFARKWVPFS
KKYSIEPRAPEWYFSQKVDYLKDKVQTSFVKDRRAMKREYEEFKIRINALVAKAQKVPEE
GWIMQDGTPWPGNNTRDHPGMIQVFLGQSGGLDSDGNELPRLVYVSREKRPGFQHHKKAG
AMNALVRVSAVLTNGPFMLNLDCDHYINNSKALREAMCFLMDPNLGKYVCYVQFPQRFDG
IDRNDRYANRNTVFFDINLRGLDGIQGPVYVGTGCVFNRTALYGYEPPIKPKHKKAGFLS
SCFGGSRKKGSKSSKKGSDKKKSSKNVDPTVPIFNLEDIEEGVEGAGFDDEKSLLMSQMS
LEKRFGQSAVFVASTLMENGGVPQSATPETLLKEAIHVISCGYEDKSEWGTEIGWIYGSV
TEDILTGFKMHARGWRSIYCMPKRPAFKGSAPINLSDRLNQVLRWALGSVEILFSRHCPI
WYGYNGRLKWLERFAYVNTTIYPITSIPLLIYCMLPAICLLTGKFIIPQISNLASIWFIS
LFLSIFATGILEMRWSGVGIDEWWRNEQFWVIGGVSAHLFAVFQGLLKVLAGIDTNFTVT
SKASDEDGDFAELYLFKWTTLLIPPTTLLIVNLVGVVAGISYAINSGYQSWGPLFGKLFF
AFWVIVHLYPFLKGLMGRQNRTPTIVVVWSILLASIFSLLWVRIDPFTTRVTGPDVQACG
INC*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400017535
Transcript Infomation

pacid=37437829 locus=PGSC0003DMG400006799 ID=PGSC0003DMT400017535.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATCCAGAAGGTGATGTGAAGGGGAAGTCCTTGAAGACCTTAGGTGGTCAAGTCTGT
CAGATCTGTGGTGATGGTGTTGGCACTACTGTGAATGGCGAGCCATTTGTTGCTTGCGAT
GTCTGTGCCTTCCCTGTTTGTAGGCCATGCTATGAATATGAGAGGAAGGACGGGAATCAA
TCTTGCCCACAGTGCAAGACCAGATACAAGAGACATAAAGGAAGTCCTGCTATTAGTGGT
GAAAGTGTAGAAGATGGTGATGCTGATGATGGTGCCAGTGAACTAAATTACTCTTCTGAA
AATCTGAATGAGAAGCAAAAAGTGGCTGACCGTGTGTTGAGCTGGCACGCGACTTACGGG
CGGGGTGAGGAGACTGGTGCTCCAAAGTATGATAAGGAGGTCTCCCACAATCATATTCCT
CTGCTTACAAATGGAACAGATGTTTCTGGGGAATTGTCTGCAGCATCACCTGAACGCTAT
TCAATGGCATCTCCTGGACCTGCTGGTGGTGCAAAACACATCCATCCACTTACATATTCA
ACAGATGCTAACCAATCACCTAACATCAGGGTTGTGGACCCGGTAAGGGAGTTTGGATCC
CCTGGACTTGGCAATGTTGCTTGGAAAGAAAGAGTTGATGGCTGGAAAATGAAGCAGGAT
AAGAATGTTGTTCCGATGACCACTAGCCATCCTCCTTCGGAACGAGGAGTTGGAGATATT
GATGCTAGTACTGATATTCTGGGGGATGACTCTTTACTCAATGATGAGGCTAGACAACCT
CTTTCAAGGAAGGTGTCTATTCCATCGTCTAGGATAAATCCTTACAGGATGGTTATTGTC
CTCCGGCTTGTCATTCTTTGTATTTTCTTGCACTATCGGATAATGAATCCAGTGCCCAAT
GCAATTCCGTTATGGTTGTTATCTGTGATATGCGAGATTTGGTTTGCAGTATCTTGGATT
TTGGATCAGTTCCCCAAGTGGCTTCCAATCAACCGTGAGACATATCTTGATAGGCTTGCA
CTTAGGTATGATCGTGAAGGAGAGCCATCACAATTAGCTGCTGTTGACATATTTGTTAGT
ACTGTGGATCCTTTGAAGGAGCCTCCTCTTGTTACAGCAAATACTGTCCTGTCCATTCTT
GCAGTTGACTATCCTGTTGATAAGGTGTCCTGTTATGTGTCTGATGATGGTGCTGCCATG
TTGACATTTGAAGCCCTATCTGAAACAGCAGAGTTTGCAAGGAAATGGGTTCCTTTCTCT
AAGAAGTACAGCATAGAGCCACGAGCTCCAGAGTGGTATTTTTCTCAGAAGGTTGACTAC
TTGAAGGATAAAGTTCAAACATCATTTGTAAAAGACCGCAGGGCAATGAAGAGGGAGTAT
GAAGAGTTCAAAATTCGCATCAATGCCCTCGTTGCAAAAGCTCAAAAGGTCCCTGAAGAA
GGATGGATTATGCAAGATGGTACACCATGGCCTGGAAATAACACTAGGGATCATCCTGGG
ATGATTCAGGTTTTCTTGGGACAAAGTGGAGGACTTGACAGTGATGGAAATGAGTTGCCA
CGACTAGTGTATGTTTCTCGTGAGAAGCGTCCTGGCTTCCAACATCACAAAAAGGCCGGT
GCCATGAATGCACTGGTTCGCGTGTCAGCGGTTCTTACTAATGGACCGTTTATGTTGAAT
CTTGATTGTGATCATTACATAAACAACAGCAAGGCATTGAGAGAAGCAATGTGCTTTTTG
ATGGATCCTAACCTTGGAAAATATGTCTGCTATGTACAATTCCCTCAGAGATTCGATGGT
ATTGATAGGAACGATCGATATGCCAACAGGAATACAGTTTTTTTCGATATTAACTTGAGA
GGTTTGGATGGAATTCAAGGCCCAGTGTATGTGGGTACTGGATGTGTCTTCAATAGAACA
GCTTTATATGGTTATGAACCTCCAATTAAGCCAAAGCATAAGAAGGCAGGGTTCCTCTCT
TCCTGCTTCGGTGGATCAAGAAAGAAGGGTTCTAAATCAAGTAAAAAAGGCTCAGACAAG
AAGAAATCTAGTAAGAATGTTGATCCCACTGTGCCAATATTCAATCTGGAGGATATAGAG
GAGGGAGTTGAAGGTGCTGGATTTGATGATGAGAAGTCACTTCTCATGTCACAAATGAGC
CTGGAGAAGAGATTTGGGCAATCGGCTGTTTTTGTTGCTTCAACACTCATGGAGAATGGT
GGTGTTCCTCAATCGGCTACCCCGGAGACCCTTTTGAAAGAGGCTATTCATGTTATCAGT
TGTGGTTATGAAGATAAATCAGAATGGGGAACTGAGATTGGATGGATCTATGGTTCCGTC
ACAGAGGATATTCTTACTGGATTTAAGATGCATGCCCGTGGTTGGCGATCTATTTACTGT
ATGCCCAAGAGACCCGCCTTCAAAGGGTCAGCTCCTATTAATCTTTCAGATCGTCTGAAC
CAAGTGCTTCGATGGGCTTTAGGGTCAGTGGAAATTCTTTTCAGTAGGCATTGTCCTATA
TGGTATGGATACAATGGACGGTTGAAGTGGTTGGAGAGATTTGCTTATGTCAACACCACC
ATTTATCCAATCACTTCCATTCCACTTCTTATATACTGCATGCTTCCAGCTATCTGTCTA
CTTACTGGGAAATTCATTATCCCTCAGATTAGTAACCTTGCAAGCATCTGGTTTATATCC
CTCTTTCTTTCCATTTTCGCTACTGGTATTCTGGAGATGAGATGGAGTGGGGTTGGAATT
GATGAATGGTGGAGAAATGAACAGTTTTGGGTCATTGGTGGTGTGTCAGCTCACCTGTTT
GCCGTCTTCCAAGGGTTGCTCAAAGTGCTTGCTGGTATTGATACCAACTTTACTGTCACA
TCCAAGGCATCAGATGAAGATGGGGACTTTGCGGAACTCTACTTGTTCAAATGGACAACT
CTTCTTATACCCCCCACTACTCTCCTCATTGTAAACCTGGTAGGAGTTGTGGCAGGCATC
TCATATGCCATCAACAGTGGTTACCAATCATGGGGTCCCCTCTTTGGTAAATTATTCTTT
GCTTTCTGGGTGATCGTTCACCTTTACCCCTTCCTCAAAGGTCTTATGGGTCGTCAGAAC
CGGACACCCACTATCGTGGTCGTGTGGTCTATTCTTCTGGCCTCCATTTTCTCTTTGTTA
TGGGTGCGGATTGATCCCTTCACAACAAGAGTTACTGGACCAGATGTTCAGGCGTGTGGT
ATCAATTGCTAG