Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400017413
CDS Infomation

pacid=37440709 polypeptide=PGSC0003DMP400011973 locus=PGSC0003DMG400006770 ID=PGSC0003DMT400017413.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATGTTGCGTGATGTGTCATCTTGCAATACATACAATTATGGTGATGCCCTTTACTGG
GATACCCGGTATGTTCAAGAAGCAGGCTCTTTTGATTGGTATCAATGTTACTCTGCTCTT
CGTCCTTATGTTCGCCATTGTGTTTCTACCTCTTCAAGGGTACTCATGGTTGGCTGTGGA
AATGCTGTGATGTCGGAGGATATGGTTAAGGATGGATATGAAGAAATAGTGAATGTTGAT
ATATCAACAGTAGCTATTGATATGATGAAAAGGAAGTATGAGGACGTCCCGCAGATGAAA
TACTTGCAAATGGATGTCAGAGATATGAGCTTCTTTCCTGATGAATCATTTGACGCCGTC
ATTGATAAGGGAACCCTTGATTCATTAATGTGTGGTACCAATGCTCCAATGTGTGCTGCA
CAAATGCTGGGAGAAGTGAGCAGGCTTCTCAAAAATGGAGGTGTTTATATGTTGATAACA
TATGGTGATCCTAGAGCAAGGATGCCTCATCTGAATCGATCAGTGTTTAACTGGAAAATT
GAGTTGTACATTATACCTAGACCGGGATTTCAAAAGCCTGGTGATCCCCCTTCTAATGTG
AAGCCATGCTTGGAACCTATTCCCCTAACCGAGAAGGGCCTACTTCCGGAAGATTATACT
ATGGAAGATCCGGATTCTCATTTTATATACATCTGTACAAAAGTTGATGAATCAGTGGAG
CTGAGCTACAAATCCACAGATCCTTTGACTGATGATTTACTATTGGAATCGCTAAGCCTC
GGGAAGGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011973
PEP Infomation

pacid=37440709 transcript=PGSC0003DMT400017413 locus=PGSC0003DMG400006770 ID=PGSC0003DMT400017413.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MMLRDVSSCNTYNYGDALYWDTRYVQEAGSFDWYQCYSALRPYVRHCVSTSSRVLMVGCG
NAVMSEDMVKDGYEEIVNVDISTVAIDMMKRKYEDVPQMKYLQMDVRDMSFFPDESFDAV
IDKGTLDSLMCGTNAPMCAAQMLGEVSRLLKNGGVYMLITYGDPRARMPHLNRSVFNWKI
ELYIIPRPGFQKPGDPPSNVKPCLEPIPLTEKGLLPEDYTMEDPDSHFIYICTKVDESVE
LSYKSTDPLTDDLLLESLSLGKD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400017413
Transcript Infomation

pacid=37440709 locus=PGSC0003DMG400006770 ID=PGSC0003DMT400017413.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATGTTGCGTGATGTGTCATCTTGCAATACATACAATTATGGTGATGCCCTTTACTGG
GATACCCGGTATGTTCAAGAAGCAGGCTCTTTTGATTGGTATCAATGTTACTCTGCTCTT
CGTCCTTATGTTCGCCATTGTGTTTCTACCTCTTCAAGGGTACTCATGGTTGGCTGTGGA
AATGCTGTGATGTCGGAGGATATGGTTAAGGATGGATATGAAGAAATAGTGAATGTTGAT
ATATCAACAGTAGCTATTGATATGATGAAAAGGAAGTATGAGGACGTCCCGCAGATGAAA
TACTTGCAAATGGATGTCAGAGATATGAGCTTCTTTCCTGATGAATCATTTGACGCCGTC
ATTGATAAGGGAACCCTTGATTCATTAATGTGTGGTACCAATGCTCCAATGTGTGCTGCA
CAAATGCTGGGAGAAGTGAGCAGGCTTCTCAAAAATGGAGGTGTTTATATGTTGATAACA
TATGGTGATCCTAGAGCAAGGATGCCTCATCTGAATCGATCAGTGTTTAACTGGAAAATT
GAGTTGTACATTATACCTAGACCGGGATTTCAAAAGCCTGGTGATCCCCCTTCTAATGTG
AAGCCATGCTTGGAACCTATTCCCCTAACCGAGAAGGGCCTACTTCCGGAAGATTATACT
ATGGAAGATCCGGATTCTCATTTTATATACATCTGTACAAAAGTTGATGAATCAGTGGAG
CTGAGCTACAAATCCACAGATCCTTTGACTGATGATTTACTATTGGAATCGCTAAGCCTC
GGGAAGGATTGA