Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400017056
CDS Infomation

pacid=37471729 polypeptide=PGSC0003DMP400011771 locus=PGSC0003DMG400006660 ID=PGSC0003DMT400017056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATACTAAAGGGAGGCTTATTGCTGGTTCACATAATAGAAATGAATTTGTTCTCATC
AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTAAGTGGACAGATTTGCCAG
ATTTGTGGAGATGAGATTGAAGTTACAGTAGATGGGGAGACATTTGTTGCTTGCAATGAG
TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGTTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAATCAAGCT
TGCCCTCAATGTAAAACTAGGTACAAGCGTATTAAAGGGAGCCAAAGAGTTGATGGAGAT
GATGAGGAAGATGAATTTGATGATTTAGATCATGAATTTGATTATGATGGTACACCTAGA
CATCTTTCTGAGGCTGCACTTGCTGCTCGCCTTGGCCGCGGTACCAATTATAATGCTTCT
GGGCTTAATACACCAGCAGAAGTAGATCCTGCTGCCCTTAACTCAGAGATCCCTCTTCTT
ACTTATGGTCAAGAGGATGATACAATTTCAGCTGATAAACATGCACTTATCATACCACCT
TTTATGGGTCGTGGGAGGAAAATTCATCCTGTGCCTTATACTGATTCATCCATGTCTTTG
CCGCCTCGCCCCATGGATCCTAAGAAAGATTTGGCAGTTTATGGATATGGTACTGTTGCA
TGGAAGGAAAGAATGGAGGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGATAAACTACAGGTGGTTAAA
CATGGAGGCAAAGGTGGTGATAACGATGGAGATGAGCTGGATGATCCCGATCTCCCCAAG
ATGGATGAAGGAAGACAACCACTTTCGAGAAAGCGGCCTATTGCCTCTAGCAGGCTAAGC
CCATACAGATTATCCATTTTAGTTCGTCTTGCTGTTGTTGGGCTCTTTTTCCACTATCGA
ATAACGCACCCTGTCAATGATGCATATGTATTATGGCTGCTATCTATTATATGTGAAATA
TGGTTTGCTGTGTCATGGATATTTGATCAGTTCCCTAAATGGTGTCCAATTCGTCGAGAG
ACATACTTGGATAGGCTATCTCTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGGGTTAGCC
CCTGTAGATATATTTGTTAGTACGGTGGATCCCCTAAAAGAACCTCCACTTATTACTGCA
AATACTGTTCTCTCCATTCTCGCTTGTGACTATCCAGTGGACAGGGTTTCGTGCTATGTC
TCTGATGATGGTGCTGCCATGCTTACTTTTGAGGCTCTCTCTGAAACATCCGAGTTCGCA
AGGAAATGGGTCCCATTCTGCAAAAAGTTCAACATAGAGCCTCGAGCGCCGGAGTGGTAT
TTTTCTCTGAAGGTTGATTATCTGAAAAATAAAGTACACCCATCATTTGTGAGGGAACGT
CGTGCTATGAAGAGAGATTATGAAGAATTCAAGGTTCGGATAAATGGGCTGGTTGCCACA
GCACAAAAGGTTCCCGAAGATGGCTGGACCATGCAAGATGGAACGCCTTGGCCAGGAAAT
CTTGTCAGGGATCATCCTGGAATGATTCAGGTCTTCCTGGGTAATGATGGTGTCCGTGAT
ATTGAAGGGAATGTATTGCCTCGCCTTATCTATGTTTCTCGTGAAAAACGTCCTGGATTT
GACCACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTTTGATGCGTGTATCAGCAGTCATATCA
AATGCTCCTTACATGCTCAATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCACTG
AGAGAAGCTATGTGCTTTATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAA
TTTCCTCAAAGATTTGATGGTATTGACAGGCATGACAGATATTCCAACCGCAATGTGGTC
TTCTTTGATATCAATATGAAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTGGGCACT
GGATGTGTCTTCAGGAGGCAAGCCCTTTATGGTTATGATGCTCCAAAGAAGACAAAACCT
CCAGGAAAAACATGCAACTGCTGGCCGAAATGGTGTTGCTGTTGTTTCGGTTCTCGAAAG
AAGCATAAGAAAGCGAAAACAACCAAGGATAACAAAAAAAAGCCAAAGAGCAAAGAGGCT
TCACCACAAATTCATGCCCTTGAAAATATTGAGGAAGGAATTGAAGGAATTGATAGTGAA
AAAGCAGCCCTCATGCCTCAGATAAAACTTGAGAAGAAATTTGGCCAATCACCGGTATTT
GTTGCTTCAACACTTCTAGAAGATGGTGGCATTCCTCCAGGAGCAACATCAGCATCTCTC
TTGAAAGAAGCAATACATGTTATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGCAAA
GAGATTGGATGGATTTATGGATCTGTTACTGAGGATATCCTTACTGGATTTAAGATGCAC
TGCCATGGTTGGAGATCCGTCTACTGCATGCCCGATAGGCCTGCATTTAAAGGGTCAGCT
CCTATCAATCTTTCAGATCGTCTTCACCAGGTTCTGCGATGGGCTTTGGGATCTGTTGAA
ATTTTCTTCAGTAGACATTGTCCAATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTGAAGCCTCTG
GAGCGGTTTTCGTACATAAACTCAGTGGTCTACCCATTGACTTCTATTCCTTTGATCATA
TATTGTACATTGCCGGCCGTCTGTTTGCTTACAGGGAAATTTATTGTTCCAGAGATTAGC
AACTATGCTAGCATTCTTTTCATGGGACTTTTCATAATGATTGCTGTGACGAGTGTTATT
GAGATGCAATGGGGAGGTGTTTCTATTGATGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTG
ATTGGTGGTGCCTCAGCTCACCTATTTGCTCTTTTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTGGCT
GGTGTCAACACTAGCTTCACTGTTACTTCCAAAGCAGCAGACGATGGGGAGTTTTCTGAG
CTTTATCTGTTCAAGTGGACATCTTTGTTGATTCCTCCTATGACTTTGTTAATTCTTAAC
ATCATTGGAGTTGTAGTCGGTGTCTCAGATGCAATCAACAATGGTTATGATTCTTGGGGT
CCTCTATTCGGTAGACTTTTCTTCGCCTTATGGGTCATTGTTCATCTGTATCCCTTCCTC
AAGGGTGTCATGGGTAGACAAAACAACGTTCCAACCATCATTATTGTCTGGTCCATCCTT
CTCGCATCTATCTGCTCCTTATTGTGGGTCCGACTCAACCCATTCACCGCCAAAGGTGGA
CTCAGTTTAGAGGTATGTGGCTTGGACTGTGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011771
PEP Infomation

pacid=37471729 transcript=PGSC0003DMT400017056 locus=PGSC0003DMG400006660 ID=PGSC0003DMT400017056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDTKGRLIAGSHNRNEFVLINADEVGRVTSVKELSGQICQICGDEIEVTVDGETFVACNE
CAFPVCRPCYEYERREGNQACPQCKTRYKRIKGSQRVDGDDEEDEFDDLDHEFDYDGTPR
HLSEAALAARLGRGTNYNASGLNTPAEVDPAALNSEIPLLTYGQEDDTISADKHALIIPP
FMGRGRKIHPVPYTDSSMSLPPRPMDPKKDLAVYGYGTVAWKERMEDWKKKQNDKLQVVK
HGGKGGDNDGDELDDPDLPKMDEGRQPLSRKRPIASSRLSPYRLSILVRLAVVGLFFHYR
ITHPVNDAYVLWLLSIICEIWFAVSWIFDQFPKWCPIRRETYLDRLSLRYEKEGKPSGLA
PVDIFVSTVDPLKEPPLITANTVLSILACDYPVDRVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFA
RKWVPFCKKFNIEPRAPEWYFSLKVDYLKNKVHPSFVRERRAMKRDYEEFKVRINGLVAT
AQKVPEDGWTMQDGTPWPGNLVRDHPGMIQVFLGNDGVRDIEGNVLPRLIYVSREKRPGF
DHHKKAGAMNALMRVSAVISNAPYMLNVDCDHYINNSKALREAMCFMMDPTSGKKICYVQ
FPQRFDGIDRHDRYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQALYGYDAPKKTKP
PGKTCNCWPKWCCCCFGSRKKHKKAKTTKDNKKKPKSKEASPQIHALENIEEGIEGIDSE
KAALMPQIKLEKKFGQSPVFVASTLLEDGGIPPGATSASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGK
EIGWIYGSVTEDILTGFKMHCHGWRSVYCMPDRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVE
IFFSRHCPIWYGYGCGLKPLERFSYINSVVYPLTSIPLIIYCTLPAVCLLTGKFIVPEIS
NYASILFMGLFIMIAVTSVIEMQWGGVSIDDWWRNEQFWVIGGASAHLFALFQGLLKVLA
GVNTSFTVTSKAADDGEFSELYLFKWTSLLIPPMTLLILNIIGVVVGVSDAINNGYDSWG
PLFGRLFFALWVIVHLYPFLKGVMGRQNNVPTIIIVWSILLASICSLLWVRLNPFTAKGG
LSLEVCGLDCD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400017056
Transcript Infomation

pacid=37471729 locus=PGSC0003DMG400006660 ID=PGSC0003DMT400017056.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATACTAAAGGGAGGCTTATTGCTGGTTCACATAATAGAAATGAATTTGTTCTCATC
AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTAAGTGGACAGATTTGCCAG
ATTTGTGGAGATGAGATTGAAGTTACAGTAGATGGGGAGACATTTGTTGCTTGCAATGAG
TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGTTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAATCAAGCT
TGCCCTCAATGTAAAACTAGGTACAAGCGTATTAAAGGGAGCCAAAGAGTTGATGGAGAT
GATGAGGAAGATGAATTTGATGATTTAGATCATGAATTTGATTATGATGGTACACCTAGA
CATCTTTCTGAGGCTGCACTTGCTGCTCGCCTTGGCCGCGGTACCAATTATAATGCTTCT
GGGCTTAATACACCAGCAGAAGTAGATCCTGCTGCCCTTAACTCAGAGATCCCTCTTCTT
ACTTATGGTCAAGAGGATGATACAATTTCAGCTGATAAACATGCACTTATCATACCACCT
TTTATGGGTCGTGGGAGGAAAATTCATCCTGTGCCTTATACTGATTCATCCATGTCTTTG
CCGCCTCGCCCCATGGATCCTAAGAAAGATTTGGCAGTTTATGGATATGGTACTGTTGCA
TGGAAGGAAAGAATGGAGGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGATAAACTACAGGTGGTTAAA
CATGGAGGCAAAGGTGGTGATAACGATGGAGATGAGCTGGATGATCCCGATCTCCCCAAG
ATGGATGAAGGAAGACAACCACTTTCGAGAAAGCGGCCTATTGCCTCTAGCAGGCTAAGC
CCATACAGATTATCCATTTTAGTTCGTCTTGCTGTTGTTGGGCTCTTTTTCCACTATCGA
ATAACGCACCCTGTCAATGATGCATATGTATTATGGCTGCTATCTATTATATGTGAAATA
TGGTTTGCTGTGTCATGGATATTTGATCAGTTCCCTAAATGGTGTCCAATTCGTCGAGAG
ACATACTTGGATAGGCTATCTCTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGGGTTAGCC
CCTGTAGATATATTTGTTAGTACGGTGGATCCCCTAAAAGAACCTCCACTTATTACTGCA
AATACTGTTCTCTCCATTCTCGCTTGTGACTATCCAGTGGACAGGGTTTCGTGCTATGTC
TCTGATGATGGTGCTGCCATGCTTACTTTTGAGGCTCTCTCTGAAACATCCGAGTTCGCA
AGGAAATGGGTCCCATTCTGCAAAAAGTTCAACATAGAGCCTCGAGCGCCGGAGTGGTAT
TTTTCTCTGAAGGTTGATTATCTGAAAAATAAAGTACACCCATCATTTGTGAGGGAACGT
CGTGCTATGAAGAGAGATTATGAAGAATTCAAGGTTCGGATAAATGGGCTGGTTGCCACA
GCACAAAAGGTTCCCGAAGATGGCTGGACCATGCAAGATGGAACGCCTTGGCCAGGAAAT
CTTGTCAGGGATCATCCTGGAATGATTCAGGTCTTCCTGGGTAATGATGGTGTCCGTGAT
ATTGAAGGGAATGTATTGCCTCGCCTTATCTATGTTTCTCGTGAAAAACGTCCTGGATTT
GACCACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTTTGATGCGTGTATCAGCAGTCATATCA
AATGCTCCTTACATGCTCAATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCACTG
AGAGAAGCTATGTGCTTTATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAA
TTTCCTCAAAGATTTGATGGTATTGACAGGCATGACAGATATTCCAACCGCAATGTGGTC
TTCTTTGATATCAATATGAAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTGGGCACT
GGATGTGTCTTCAGGAGGCAAGCCCTTTATGGTTATGATGCTCCAAAGAAGACAAAACCT
CCAGGAAAAACATGCAACTGCTGGCCGAAATGGTGTTGCTGTTGTTTCGGTTCTCGAAAG
AAGCATAAGAAAGCGAAAACAACCAAGGATAACAAAAAAAAGCCAAAGAGCAAAGAGGCT
TCACCACAAATTCATGCCCTTGAAAATATTGAGGAAGGAATTGAAGGAATTGATAGTGAA
AAAGCAGCCCTCATGCCTCAGATAAAACTTGAGAAGAAATTTGGCCAATCACCGGTATTT
GTTGCTTCAACACTTCTAGAAGATGGTGGCATTCCTCCAGGAGCAACATCAGCATCTCTC
TTGAAAGAAGCAATACATGTTATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGCAAA
GAGATTGGATGGATTTATGGATCTGTTACTGAGGATATCCTTACTGGATTTAAGATGCAC
TGCCATGGTTGGAGATCCGTCTACTGCATGCCCGATAGGCCTGCATTTAAAGGGTCAGCT
CCTATCAATCTTTCAGATCGTCTTCACCAGGTTCTGCGATGGGCTTTGGGATCTGTTGAA
ATTTTCTTCAGTAGACATTGTCCAATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTGAAGCCTCTG
GAGCGGTTTTCGTACATAAACTCAGTGGTCTACCCATTGACTTCTATTCCTTTGATCATA
TATTGTACATTGCCGGCCGTCTGTTTGCTTACAGGGAAATTTATTGTTCCAGAGATTAGC
AACTATGCTAGCATTCTTTTCATGGGACTTTTCATAATGATTGCTGTGACGAGTGTTATT
GAGATGCAATGGGGAGGTGTTTCTATTGATGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTG
ATTGGTGGTGCCTCAGCTCACCTATTTGCTCTTTTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTGGCT
GGTGTCAACACTAGCTTCACTGTTACTTCCAAAGCAGCAGACGATGGGGAGTTTTCTGAG
CTTTATCTGTTCAAGTGGACATCTTTGTTGATTCCTCCTATGACTTTGTTAATTCTTAAC
ATCATTGGAGTTGTAGTCGGTGTCTCAGATGCAATCAACAATGGTTATGATTCTTGGGGT
CCTCTATTCGGTAGACTTTTCTTCGCCTTATGGGTCATTGTTCATCTGTATCCCTTCCTC
AAGGGTGTCATGGGTAGACAAAACAACGTTCCAACCATCATTATTGTCTGGTCCATCCTT
CTCGCATCTATCTGCTCCTTATTGTGGGTCCGACTCAACCCATTCACCGCCAAAGGTGGA
CTCAGTTTAGAGGTATGTGGCTTGGACTGTGATTAA