Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400016768
CDS Infomation

pacid=37439916 polypeptide=PGSC0003DMP400011588 locus=PGSC0003DMG400006557 ID=PGSC0003DMT400016768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCATATTGTGATATTTCTAGTTTGTTTTCTTGCAATTGCCTCATTTGTCAAGGGA
TATGGTAAAGGAAAGTGGATCAATGCTCATGCTACATTCTATGGAGGTGGTGATGCCTCA
GGGACAATGGGTGGTGCTTGTGGTTATGGGAATCTATACAACCAAGGTTATGGAACAAAA
ACTGCAGCTTTAAGCACAGCTTTATTCAACAATGGATTGAGTTGTGGATCTTGCTATGAG
ATTAAATGTGTGAATGAACATAAATGGTGTTTGTCAGGTTCTATTAAAGTAACAGCAACC
AATTTATGTCCACCTGGTGGCTGGTGCAATCCTCCTCTTCACCACTTTGACCTTTCTCAG
CCTATTTTTCAGCACATTGCCCAATATAGAGCTGGAATTGTCCCTATTGCTTATAGAAGG
ATACCCTGCAGAAGAAAGGGAGGCATCAGGTTCACAATCAATGGACACTCTTACTTCAAC
TTAGTACTTGTGACTAACGTTGGCGGTGCTGGTGATGTTCATGCTGTAGCCATTAAAGGA
TCGAAAACACAATGGCAATCTATGTCAAGAAATTGGGGCCAAAACTGGCAAAGCAACAGT
TTACTAAATGGACAAAGCCTTTCATTTAAAGTTACTACTAGTGATGGACATAGTGTAGTC
TCTAAGAATGTTGCCCCTGCTAGTTGGTCTTTTGGGCAGACATACACTGGTGGACAGTTT
CATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011588
PEP Infomation

pacid=37439916 transcript=PGSC0003DMT400016768 locus=PGSC0003DMG400006557 ID=PGSC0003DMT400016768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MAHIVIFLVCFLAIASFVKGYGKGKWINAHATFYGGGDASGTMGGACGYGNLYNQGYGTK
TAALSTALFNNGLSCGSCYEIKCVNEHKWCLSGSIKVTATNLCPPGGWCNPPLHHFDLSQ
PIFQHIAQYRAGIVPIAYRRIPCRRKGGIRFTINGHSYFNLVLVTNVGGAGDVHAVAIKG
SKTQWQSMSRNWGQNWQSNSLLNGQSLSFKVTTSDGHSVVSKNVAPASWSFGQTYTGGQF
H*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400016768
Transcript Infomation

pacid=37439916 locus=PGSC0003DMG400006557 ID=PGSC0003DMT400016768.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTCATATTGTGATATTTCTAGTTTGTTTTCTTGCAATTGCCTCATTTGTCAAGGGA
TATGGTAAAGGAAAGTGGATCAATGCTCATGCTACATTCTATGGAGGTGGTGATGCCTCA
GGGACAATGGGTGGTGCTTGTGGTTATGGGAATCTATACAACCAAGGTTATGGAACAAAA
ACTGCAGCTTTAAGCACAGCTTTATTCAACAATGGATTGAGTTGTGGATCTTGCTATGAG
ATTAAATGTGTGAATGAACATAAATGGTGTTTGTCAGGTTCTATTAAAGTAACAGCAACC
AATTTATGTCCACCTGGTGGCTGGTGCAATCCTCCTCTTCACCACTTTGACCTTTCTCAG
CCTATTTTTCAGCACATTGCCCAATATAGAGCTGGAATTGTCCCTATTGCTTATAGAAGG
ATACCCTGCAGAAGAAAGGGAGGCATCAGGTTCACAATCAATGGACACTCTTACTTCAAC
TTAGTACTTGTGACTAACGTTGGCGGTGCTGGTGATGTTCATGCTGTAGCCATTAAAGGA
TCGAAAACACAATGGCAATCTATGTCAAGAAATTGGGGCCAAAACTGGCAAAGCAACAGT
TTACTAAATGGACAAAGCCTTTCATTTAAAGTTACTACTAGTGATGGACATAGTGTAGTC
TCTAAGAATGTTGCCCCTGCTAGTTGGTCTTTTGGGCAGACATACACTGGTGGACAGTTT
CATTGA