Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400016448
CDS Infomation

pacid=37431781 polypeptide=PGSC0003DMP400011398 locus=PGSC0003DMG400006426 ID=PGSC0003DMT400016448.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGGGAAGAAGATGGTTAGGATTCGTTCCTACCGGATTTCAGTTACGTCGTTTCAGT
TCATTTGAAGCTCCTCCTGTTCCTCCTCTTCGAAGAGTTGTTGTTACTGGTGTAGGGATG
GTGACTCCCCTTGGATGTGGAGTGGAAACCACATGGAAGAGGCTAATAGAAGGGGAATGT
GGTGTAAGAGCAATATGTCCTGATGATTTGAAGATGAATGGTTTTGAACCGGAAGTTAAG
ATGTATACATTTGATCAGTTGACATCCAAAGTTGCTGCAATTGTGCCCTATGGTTCTAGC
TCAGGTGAATTCGACGAGCAGTTGTGGCTAAACTCTAAGGAGCATAGATCAATTGCAAGA
TTTATAGGATATGCTTTATGTGCTGCTGATGAAGCTCTTAAAGATGCTAATTGGATGCCC
ACTGCGCAGGATGAAAAGGAACAGACGGGTGTTTCCTTAGGTGCTGGAACTGGAAGTATC
AGTGACATATTGGAAGCATCCAGAATGATCTGTGAAAAGAATATACGCCGGCTTAGTCCA
TTTTTCATCCCACGGATATTGATCAACATGGCTTCTGGTCATGTAAGCATGAAGTATGGA
TTTCAGGGACCAAACCATTCTTCAGTTACAGCTTGTGCCACTGGAGCTCATTCAATTGGT
GATGCTGCCAGGATGATTCAGTTTGGATATACAAATGTGATGGTTGCAGGGGGGACAGAA
GCCAGTATTGATGCTTTGTCTATTGCTGGATTCTGTAGGTTAAGGGCATTGAGTACCAAG
TATAATTCAAAACCCCATGAAGCTTCCAGGCCATTTGATTGTGGTCGTGATGGATTTGTG
ATAGGTGAGGGGTCTGGTGTCATGGTATTAGAGGAATTGGAGCATGCAAGAAAGCGAGGA
GCTAAGATATACGCAGAGCTACGTGGCTATGGAACATCAGGTGATGCACATCATATTACA
CAGCCACATATTGGTGGAAGAGGTGCAGTTTTGGCTATGACACGTGCTTTGAAACAGTCT
GGTCTTCATCCTAGTCAAGTGGATTATATAAATGCTCACGCTACATCTACACCCCTTGGT
GATGCAGCAGAAGCAAATGCAATAAAATGTGTATTCTCTGATCATGCTACATCAGGGGCC
TTGTCCTTATCCTCTACAAAGGGTGCTACTGGTCATCTCCTTGGAGCCGCTGGAGCTGTT
GAAGCAATTTTTACTGTCTTGGCAATACACCACGGTATCGCGCCTTTGACACTGAACCTT
TCTGAACCAGATCCAATATTCAATGGTGGTTTCATGCCTTTGACTGCTTCAAAGGAGATG
ACCATTAAATCTGGTTTATCAAACTCATTTGGATTTGGAGGAACGAATTCTTGCTTGCTT
TTTACTTCAACCAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011398
PEP Infomation

pacid=37431781 transcript=PGSC0003DMT400016448 locus=PGSC0003DMG400006426 ID=PGSC0003DMT400016448.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRGRRWLGFVPTGFQLRRFSSFEAPPVPPLRRVVVTGVGMVTPLGCGVETTWKRLIEGEC
GVRAICPDDLKMNGFEPEVKMYTFDQLTSKVAAIVPYGSSSGEFDEQLWLNSKEHRSIAR
FIGYALCAADEALKDANWMPTAQDEKEQTGVSLGAGTGSISDILEASRMICEKNIRRLSP
FFIPRILINMASGHVSMKYGFQGPNHSSVTACATGAHSIGDAARMIQFGYTNVMVAGGTE
ASIDALSIAGFCRLRALSTKYNSKPHEASRPFDCGRDGFVIGEGSGVMVLEELEHARKRG
AKIYAELRGYGTSGDAHHITQPHIGGRGAVLAMTRALKQSGLHPSQVDYINAHATSTPLG
DAAEANAIKCVFSDHATSGALSLSSTKGATGHLLGAAGAVEAIFTVLAIHHGIAPLTLNL
SEPDPIFNGGFMPLTASKEMTIKSGLSNSFGFGGTNSCLLFTSTN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400016448
Transcript Infomation

pacid=37431781 locus=PGSC0003DMG400006426 ID=PGSC0003DMT400016448.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGAGGGGAAGAAGATGGTTAGGATTCGTTCCTACCGGATTTCAGTTACGTCGTTTCAGT
TCATTTGAAGCTCCTCCTGTTCCTCCTCTTCGAAGAGTTGTTGTTACTGGTGTAGGGATG
GTGACTCCCCTTGGATGTGGAGTGGAAACCACATGGAAGAGGCTAATAGAAGGGGAATGT
GGTGTAAGAGCAATATGTCCTGATGATTTGAAGATGAATGGTTTTGAACCGGAAGTTAAG
ATGTATACATTTGATCAGTTGACATCCAAAGTTGCTGCAATTGTGCCCTATGGTTCTAGC
TCAGGTGAATTCGACGAGCAGTTGTGGCTAAACTCTAAGGAGCATAGATCAATTGCAAGA
TTTATAGGATATGCTTTATGTGCTGCTGATGAAGCTCTTAAAGATGCTAATTGGATGCCC
ACTGCGCAGGATGAAAAGGAACAGACGGGTGTTTCCTTAGGTGCTGGAACTGGAAGTATC
AGTGACATATTGGAAGCATCCAGAATGATCTGTGAAAAGAATATACGCCGGCTTAGTCCA
TTTTTCATCCCACGGATATTGATCAACATGGCTTCTGGTCATGTAAGCATGAAGTATGGA
TTTCAGGGACCAAACCATTCTTCAGTTACAGCTTGTGCCACTGGAGCTCATTCAATTGGT
GATGCTGCCAGGATGATTCAGTTTGGATATACAAATGTGATGGTTGCAGGGGGGACAGAA
GCCAGTATTGATGCTTTGTCTATTGCTGGATTCTGTAGGTTAAGGGCATTGAGTACCAAG
TATAATTCAAAACCCCATGAAGCTTCCAGGCCATTTGATTGTGGTCGTGATGGATTTGTG
ATAGGTGAGGGGTCTGGTGTCATGGTATTAGAGGAATTGGAGCATGCAAGAAAGCGAGGA
GCTAAGATATACGCAGAGCTACGTGGCTATGGAACATCAGGTGATGCACATCATATTACA
CAGCCACATATTGGTGGAAGAGGTGCAGTTTTGGCTATGACACGTGCTTTGAAACAGTCT
GGTCTTCATCCTAGTCAAGTGGATTATATAAATGCTCACGCTACATCTACACCCCTTGGT
GATGCAGCAGAAGCAAATGCAATAAAATGTGTATTCTCTGATCATGCTACATCAGGGGCC
TTGTCCTTATCCTCTACAAAGGGTGCTACTGGTCATCTCCTTGGAGCCGCTGGAGCTGTT
GAAGCAATTTTTACTGTCTTGGCAATACACCACGGTATCGCGCCTTTGACACTGAACCTT
TCTGAACCAGATCCAATATTCAATGGTGGTTTCATGCCTTTGACTGCTTCAAAGGAGATG
ACCATTAAATCTGGTTTATCAAACTCATTTGGATTTGGAGGAACGAATTCTTGCTTGCTT
TTTACTTCAACCAATTGA