Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400016392
CDS Infomation

pacid=37474166 polypeptide=PGSC0003DMP400011364 locus=PGSC0003DMG400006407 ID=PGSC0003DMT400016392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGCTAGACTTGCAATCTTGTGCTCGACTGCTCAATACTGTTAACAGCAACCAATCT
CTTCCAAATGGGAAGCAACTCCACCTCGTTTTCCTCAAAAGGGGTATCCTTAACTCTGCT
CTAACAATAGCCAATCGCCTTCTTCAAATGTACACTAGGTGTGGACAAATGGCTGATGCA
GAGTTACTGTTCGATGAAATGTCTCAGAGAAACTGCTTCACTTGGAATACCATGATTGAA
GGGTATATGAAATGGGGAAAGATAAACAACTCTTTGGACTTGTTTCGTTTAATGCCTTCC
AAGAATGAATTTTCTTGGAATGTGGTCATTCTTGGTCTTGTTAAAGCAGAGGAGTTGGGT
GTTGCTAGAAGTCTATTGAGTGAAATGCCACGGAAGAATGAAGTAGTTTGGAATGGACTT
ATTCATGGGTATGCGAAAATGGGATTCCCTGGAGTGGCTTTATGCTTGTTTAAGGAGTTT
ATAGACTGGGATTTTCGTGAGACGGGTGCTGCATCACATATAGATTCATTTGTTTTGGCA
ACTGCATTAGGAGCTTGTGCTAACGCAAGAAGTGTTGATTTGGGGAAGCAAATTCATGCT
CGTATTATAGTCGATGAAGTTGAAGTTGATTCTGTGTTGGCAAGTTCTTTAGTTAACATG
TATGGAAAGGGTGGTGATTTGGATAATGCGAGCTATATTTTGAATAGAATGCAGAATCCT
GATAACTTTTCCTTGTCAGCACTAATTTCAGCATATTCAAAATGTGGTCGAATGGATGAT
GCTAGAAAGATATTCAACCTGATAACTGATCCTTGTATTGTATTATGGAACTCCATGATT
TCTGGGTATGTGTCATGCTATGAAGTGTTAGAAGCATTATTGCTTTTTGAGGAGATGCTC
AGAGAAGGAGTTATAGGGGATTCCTCTACATTAGCTAGTGTATTGAATGCCTGTGCTAGT
GCACATGCCCTTAAAAATTGTTTGCAAGTGCATGTTTATGGTTTTAAGCGTGGACTGTTG
GATGACCTTGTCGTTGCTAGTGCGCTCATCGACACATATGCTAAATGTGGATGTCCTGAT
GAAGCTTCCAAAGTTTTTAATGAACTCAAAACACATGATACCATCTTGCTAAATTCTATG
ATTACCATATATTTTAACTGCAACAGAATTGAAGATGCGAGGCAATTATTTGAGTCAATG
CCCTACAAGAGCTTAATATCTTGGAACTCTATGATAATTGGTCTTAATCAAAATGGTTGT
CCAGTTGAAGCACTGAATCTTTTCTACAGGATGAATAGGATGGATTTTAGGATGGACAAA
TTTAGCTTTTCAAGTGTGATCAGTGCCTGTGCAAGCATTGCTTCAGTTGAACTTGGTGAA
CAGATTTTTGCAAGAGCTGTTATCATCGGCATTGATTGTGATCAAATAATTTCTACCTCC
TTAATTGATTTCTATTGCAAGTGTGGTTTTGTTAGTGATGCCAGGAAGCTCTTTGACCAA
ATGATGAAATCCGATGAGGTTTCGTGGAATTCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGT
TACGGAAATGAAGCTTTGAATCTATTCCACGAAATGAGAAGTGCAGGTGTTTCGCCAACA
AATATCACATTTATTGGTGTCTTATCTGCCTGTGATCATTGTGGTTTACTAGAAGAGGGA
AAAAGGTGGTTTTATTCAATGAATTACGATTACCACATTGATCCAGGGATTGAACATTAC
TCCTGTATGGTAGATCTTTATGCACGAGCAGGATGTCTTGAAGAAGCTGTGAACCTCATC
GAAAAGATGCCATTTGATGCAGATTCAAGCATGTGGTTATCCATTTTGAGAGGATGTGTA
GCTCATGGTAACAAGATACTAGGACAGCTCGTGGCCCAACGCATTATAGAGCTTGATCCT
GAGAATTCAGGTGCTTTCGTGCAGTTATCAAACATATTTGCTACTTCTGAGGACTGGGAA
AGATCTGCTTTGGTCAGGAGGCTGATGGTAGAAAAGAAAATCCATAAGAGTTCTGGTCGA
AGCTGGAGTGATATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011364
PEP Infomation

pacid=37474166 transcript=PGSC0003DMT400016392 locus=PGSC0003DMG400006407 ID=PGSC0003DMT400016392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MELDLQSCARLLNTVNSNQSLPNGKQLHLVFLKRGILNSALTIANRLLQMYTRCGQMADA
ELLFDEMSQRNCFTWNTMIEGYMKWGKINNSLDLFRLMPSKNEFSWNVVILGLVKAEELG
VARSLLSEMPRKNEVVWNGLIHGYAKMGFPGVALCLFKEFIDWDFRETGAASHIDSFVLA
TALGACANARSVDLGKQIHARIIVDEVEVDSVLASSLVNMYGKGGDLDNASYILNRMQNP
DNFSLSALISAYSKCGRMDDARKIFNLITDPCIVLWNSMISGYVSCYEVLEALLLFEEML
REGVIGDSSTLASVLNACASAHALKNCLQVHVYGFKRGLLDDLVVASALIDTYAKCGCPD
EASKVFNELKTHDTILLNSMITIYFNCNRIEDARQLFESMPYKSLISWNSMIIGLNQNGC
PVEALNLFYRMNRMDFRMDKFSFSSVISACASIASVELGEQIFARAVIIGIDCDQIISTS
LIDFYCKCGFVSDARKLFDQMMKSDEVSWNSMLMGYATNGYGNEALNLFHEMRSAGVSPT
NITFIGVLSACDHCGLLEEGKRWFYSMNYDYHIDPGIEHYSCMVDLYARAGCLEEAVNLI
EKMPFDADSSMWLSILRGCVAHGNKILGQLVAQRIIELDPENSGAFVQLSNIFATSEDWE
RSALVRRLMVEKKIHKSSGRSWSDM*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400016392
Transcript Infomation

pacid=37474166 locus=PGSC0003DMG400006407 ID=PGSC0003DMT400016392.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGCTAGACTTGCAATCTTGTGCTCGACTGCTCAATACTGTTAACAGCAACCAATCT
CTTCCAAATGGGAAGCAACTCCACCTCGTTTTCCTCAAAAGGGGTATCCTTAACTCTGCT
CTAACAATAGCCAATCGCCTTCTTCAAATGTACACTAGGTGTGGACAAATGGCTGATGCA
GAGTTACTGTTCGATGAAATGTCTCAGAGAAACTGCTTCACTTGGAATACCATGATTGAA
GGGTATATGAAATGGGGAAAGATAAACAACTCTTTGGACTTGTTTCGTTTAATGCCTTCC
AAGAATGAATTTTCTTGGAATGTGGTCATTCTTGGTCTTGTTAAAGCAGAGGAGTTGGGT
GTTGCTAGAAGTCTATTGAGTGAAATGCCACGGAAGAATGAAGTAGTTTGGAATGGACTT
ATTCATGGGTATGCGAAAATGGGATTCCCTGGAGTGGCTTTATGCTTGTTTAAGGAGTTT
ATAGACTGGGATTTTCGTGAGACGGGTGCTGCATCACATATAGATTCATTTGTTTTGGCA
ACTGCATTAGGAGCTTGTGCTAACGCAAGAAGTGTTGATTTGGGGAAGCAAATTCATGCT
CGTATTATAGTCGATGAAGTTGAAGTTGATTCTGTGTTGGCAAGTTCTTTAGTTAACATG
TATGGAAAGGGTGGTGATTTGGATAATGCGAGCTATATTTTGAATAGAATGCAGAATCCT
GATAACTTTTCCTTGTCAGCACTAATTTCAGCATATTCAAAATGTGGTCGAATGGATGAT
GCTAGAAAGATATTCAACCTGATAACTGATCCTTGTATTGTATTATGGAACTCCATGATT
TCTGGGTATGTGTCATGCTATGAAGTGTTAGAAGCATTATTGCTTTTTGAGGAGATGCTC
AGAGAAGGAGTTATAGGGGATTCCTCTACATTAGCTAGTGTATTGAATGCCTGTGCTAGT
GCACATGCCCTTAAAAATTGTTTGCAAGTGCATGTTTATGGTTTTAAGCGTGGACTGTTG
GATGACCTTGTCGTTGCTAGTGCGCTCATCGACACATATGCTAAATGTGGATGTCCTGAT
GAAGCTTCCAAAGTTTTTAATGAACTCAAAACACATGATACCATCTTGCTAAATTCTATG
ATTACCATATATTTTAACTGCAACAGAATTGAAGATGCGAGGCAATTATTTGAGTCAATG
CCCTACAAGAGCTTAATATCTTGGAACTCTATGATAATTGGTCTTAATCAAAATGGTTGT
CCAGTTGAAGCACTGAATCTTTTCTACAGGATGAATAGGATGGATTTTAGGATGGACAAA
TTTAGCTTTTCAAGTGTGATCAGTGCCTGTGCAAGCATTGCTTCAGTTGAACTTGGTGAA
CAGATTTTTGCAAGAGCTGTTATCATCGGCATTGATTGTGATCAAATAATTTCTACCTCC
TTAATTGATTTCTATTGCAAGTGTGGTTTTGTTAGTGATGCCAGGAAGCTCTTTGACCAA
ATGATGAAATCCGATGAGGTTTCGTGGAATTCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGT
TACGGAAATGAAGCTTTGAATCTATTCCACGAAATGAGAAGTGCAGGTGTTTCGCCAACA
AATATCACATTTATTGGTGTCTTATCTGCCTGTGATCATTGTGGTTTACTAGAAGAGGGA
AAAAGGTGGTTTTATTCAATGAATTACGATTACCACATTGATCCAGGGATTGAACATTAC
TCCTGTATGGTAGATCTTTATGCACGAGCAGGATGTCTTGAAGAAGCTGTGAACCTCATC
GAAAAGATGCCATTTGATGCAGATTCAAGCATGTGGTTATCCATTTTGAGAGGATGTGTA
GCTCATGGTAACAAGATACTAGGACAGCTCGTGGCCCAACGCATTATAGAGCTTGATCCT
GAGAATTCAGGTGCTTTCGTGCAGTTATCAAACATATTTGCTACTTCTGAGGACTGGGAA
AGATCTGCTTTGGTCAGGAGGCTGATGGTAGAAAAGAAAATCCATAAGAGTTCTGGTCGA
AGCTGGAGTGATATGTAA