Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400016255
CDS Infomation

pacid=37474285 polypeptide=PGSC0003DMP400011267 locus=PGSC0003DMG400006350 ID=PGSC0003DMT400016255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTACTGATGGTTATGCGAAGATGATGTCGGAAATTGGAATGCGATCAATGCTAGGA
GGAAGCAATGATTTTAGCGAAGAGTTAGGGATGTTACTTAGTGAACGAAGGAGGCAGCAG
CTGCAGCAACAAGAGGTGAGTGATCGAGAGAGAGAGCTCAGTATTTACCGTAGTGGGTCA
GCTCCACCGACTGTTGAAGGATCGTTGAACGCTTTCAGTGGCTTGATGATAGGCGGTGGC
GGTGGTGGTGGTGACAATGGTTATGATTTCGGCGGACTTTCAGAAGAGGAGTTAAGGTCT
GATCCAGCGTACATTTCGTATTACTACTCGAATGTGAATCTGAACCCAAGGCTTCCGCCA
CCTCTTTTGTCTAAAGAAGACTGGCGGTACTCCCAGCGTCTGCAGGGTAGCGGTGGAGGT
GGTAATGTTGGTAGTGGTGGTAATGTTGGTAGTGGTGGTAATTCACCAGTATTAGGGGGG
ATTGGTGATAGAAGGAAAGGAAATCGTGGTGAGGCTGATAAGGGAAGGGATGTTGAATCA
CTTTTTTCAATGCCGATGGGATTTGGTACTATAAATGGAGAAAATGGACGTGAGGCGCGG
AAGGAGTGGGGTGGTGATGGTCTTATTGGATTGCCTGGATTAGGTTTAGGAAGCCGGCAG
ATGAGCATTACTGAGATGATTCAGGACCATATGAGCCAAACAACATCGAGGCATCCATCA
CGTCCTGCTTCCCGTGCATATGATGATATTGTTGATCCTTCTGAGTCCCAATTCGCTCAT
CTCCATCAAAATATGGCATCTTTGGATGCGTTACATTCTAGGGAAAAGGTTCAAGGCGTG
TCCCTCCATAATGTCAGCTCATCAGGGTCTCAGTCTTATGGTTCGGCCATGGGTACATCA
CTGTCGCGAAGTGCCATCCCTGATCCTCAGCTTGTAGCTAGAGCTCCTAGCCCTCGTATT
CCTTCTGCTGGAGGAGGGAGGATAGCATCACTAGAGGATGTTTCATCTCATATGGGTGAG
CATGCTGATTTGGCTGCTGCATTGTCTGGCATGAGTCTATCAGGGAACAATATGGGAGAT
GAAGGGAAACATCAAAAGTATCAAATTCATAATGAGATTGACGATCATCAGAACCTCTTC
CGATTGCAGAATGGTCAGAATCCTATGAAGCAACATCCATATGGAAAAAAGTCTGAATCT
GTTCATTTTCATAAGTCTGCAGGTTCCTCTACTGCATACATGATTGGGCCCTCTATGCCA
ACTCTCAACAGTGGAGAAAGTTCTTTATCTCAATATCCAACTGTCGATAGTCCTAATTCA
ACATTTTCTGCTTATGCTTTAGGAGGTTATGGTATGAACCCTTCATCACCAACCATGTTT
GAAAACCAGGTTGGGGCTGGTAATTTACCTTCCGTACTGGGAAATATAGCTTCTCCGGTA
GGTGCATGTGGAATTGATGCTCGTGTAACAGGAGGCGGATTGAGTTTGGGTCCTAATTTA
ATGGCTGCAGCAGCTGAACTGCAGAACCTTAATAGACTTGGTAATCAGACCTTGGGGGGG
TCTCTGCCAATGTCTCAGATGGATCCATTGTACTTACAGTACTTGAGGTCACCTGAGTAT
CTTGCTGCTCAGCTAGCAGCTCTCAATGACCCAACAGTGAATAGGGAATCTTTAGGGACT
TCATACATGGAGTTGATTGAGCTTCAGAAAGCTTATCTGGAGACGTTGGTTGCATCTCAA
AATTCACAATATGGTATTCCGTATCTTGGCAAATCCGGTGGCTTAAATCATGGTTACTAT
GGGAACCCAGCACTTGGCCTTAGTATGTCATATCCTGGAAGCCCTTTGGCAGGTGCAGGT
CTTCCAAATTCCCCATTTGGACCTGGTAGTCCTGTAAGGTATGGGGAAAGGAACATGCGT
TTTCATTCAGGGATGAGAAACTTAGCTGGTGGTGTCATGGGAGCTTGGCATTCTGAGGCT
GTTTCTAACTTGGGTGAAACCTTTGCTTCCTCGTTACTAGACGAGTTTAAGAGCAATAAG
AGCAAGTGTTTTGAGCTATCAGAGATTGAAGGCCATGTGGTCCAGTTCAGTGCGGATCAG
TATGGCAGTCGGTTCATTCAACAAAAACTTGAGACTGCTACCACAGAAGAGAAGAACATG
GTCTTCCAAGAAATTATGCCGCAAGCCCTTTCTTTGATGACTGATGTGTTTGGTAATTAT
GTGATCCAGAAGTTTTTCGAGCATGGAAGTTCACCTCAGATAAGAGAACTGGCTGACCAG
CTCAATGGGCATGTACTCACCCTTAGCCTTCAGATGTATGGTTGCCGAGTAATCCAAAAG
GCCATAGAGATGGTTGATCTGGATCAGCAGACTAAAATGGTCGCCGAGCTTGATGGTCAT
GTTATGCGCTGTGTTAGAGATCAAAATGGGAATCATGTAATCCAGAAGTGCATCGAATGC
ATTCCACAGGATGCTATCCAGTTCATTGTTTCCACATTTTATGATCAAGTTGTGACATTG
TCCACCCATCCATATGGATGTCGGGTCATACAGAGAGTCTTGGAACATTGCCATAATCCT
GAAACCCAGAACATTGTAATGAATGAGATTTTGCAAACAGTTTGCATGTTGGCGCAAGAT
CAATATGGGAATTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAACACGGAAAGCCTGAGGAGCGTACT
TCTATAATTAGTAAGCTGACGGGACAGATAGTTCAGATGAGCCAGCAGAAATTTGCCTCT
AATGTTGTGGAGAAGTGCTTAAGCTTTGGAACTCCCGAAGAACGTCAGACCTTGGTAAAT
GAGATGATTGGCACCACTGATGAAAATGAACCTCTTCAGGCGATGATGAAAGATCAGTTT
GCAAACTACGTTGTACAGAAAGTGCTGGAGACTTGTGATGACCAGCAACTTGAACTCATT
CTCAACCGAATCAAGGTTCATCTAAATGCTCTGAAGAAATATACTTACGGAAAGCATATA
GTTGCCCGTGTAGAGAAACTGGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATCAGTTTCCTGGCGTCA
TATTCTGCTGCTGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400011267
PEP Infomation

pacid=37474285 transcript=PGSC0003DMT400016255 locus=PGSC0003DMG400006350 ID=PGSC0003DMT400016255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MITDGYAKMMSEIGMRSMLGGSNDFSEELGMLLSERRRQQLQQQEVSDRERELSIYRSGS
APPTVEGSLNAFSGLMIGGGGGGGDNGYDFGGLSEEELRSDPAYISYYYSNVNLNPRLPP
PLLSKEDWRYSQRLQGSGGGGNVGSGGNVGSGGNSPVLGGIGDRRKGNRGEADKGRDVES
LFSMPMGFGTINGENGREARKEWGGDGLIGLPGLGLGSRQMSITEMIQDHMSQTTSRHPS
RPASRAYDDIVDPSESQFAHLHQNMASLDALHSREKVQGVSLHNVSSSGSQSYGSAMGTS
LSRSAIPDPQLVARAPSPRIPSAGGGRIASLEDVSSHMGEHADLAAALSGMSLSGNNMGD
EGKHQKYQIHNEIDDHQNLFRLQNGQNPMKQHPYGKKSESVHFHKSAGSSTAYMIGPSMP
TLNSGESSLSQYPTVDSPNSTFSAYALGGYGMNPSSPTMFENQVGAGNLPSVLGNIASPV
GACGIDARVTGGGLSLGPNLMAAAAELQNLNRLGNQTLGGSLPMSQMDPLYLQYLRSPEY
LAAQLAALNDPTVNRESLGTSYMELIELQKAYLETLVASQNSQYGIPYLGKSGGLNHGYY
GNPALGLSMSYPGSPLAGAGLPNSPFGPGSPVRYGERNMRFHSGMRNLAGGVMGAWHSEA
VSNLGETFASSLLDEFKSNKSKCFELSEIEGHVVQFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNM
VFQEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFFEHGSSPQIRELADQLNGHVLTLSLQMYGCRVIQK
AIEMVDLDQQTKMVAELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECIPQDAIQFIVSTFYDQVVTL
STHPYGCRVIQRVLEHCHNPETQNIVMNEILQTVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPEERT
SIISKLTGQIVQMSQQKFASNVVEKCLSFGTPEERQTLVNEMIGTTDENEPLQAMMKDQF
ANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRISFLAS
YSAAA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400016255
Transcript Infomation

pacid=37474285 locus=PGSC0003DMG400006350 ID=PGSC0003DMT400016255.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATTACTGATGGTTATGCGAAGATGATGTCGGAAATTGGAATGCGATCAATGCTAGGA
GGAAGCAATGATTTTAGCGAAGAGTTAGGGATGTTACTTAGTGAACGAAGGAGGCAGCAG
CTGCAGCAACAAGAGGTGAGTGATCGAGAGAGAGAGCTCAGTATTTACCGTAGTGGGTCA
GCTCCACCGACTGTTGAAGGATCGTTGAACGCTTTCAGTGGCTTGATGATAGGCGGTGGC
GGTGGTGGTGGTGACAATGGTTATGATTTCGGCGGACTTTCAGAAGAGGAGTTAAGGTCT
GATCCAGCGTACATTTCGTATTACTACTCGAATGTGAATCTGAACCCAAGGCTTCCGCCA
CCTCTTTTGTCTAAAGAAGACTGGCGGTACTCCCAGCGTCTGCAGGGTAGCGGTGGAGGT
GGTAATGTTGGTAGTGGTGGTAATGTTGGTAGTGGTGGTAATTCACCAGTATTAGGGGGG
ATTGGTGATAGAAGGAAAGGAAATCGTGGTGAGGCTGATAAGGGAAGGGATGTTGAATCA
CTTTTTTCAATGCCGATGGGATTTGGTACTATAAATGGAGAAAATGGACGTGAGGCGCGG
AAGGAGTGGGGTGGTGATGGTCTTATTGGATTGCCTGGATTAGGTTTAGGAAGCCGGCAG
ATGAGCATTACTGAGATGATTCAGGACCATATGAGCCAAACAACATCGAGGCATCCATCA
CGTCCTGCTTCCCGTGCATATGATGATATTGTTGATCCTTCTGAGTCCCAATTCGCTCAT
CTCCATCAAAATATGGCATCTTTGGATGCGTTACATTCTAGGGAAAAGGTTCAAGGCGTG
TCCCTCCATAATGTCAGCTCATCAGGGTCTCAGTCTTATGGTTCGGCCATGGGTACATCA
CTGTCGCGAAGTGCCATCCCTGATCCTCAGCTTGTAGCTAGAGCTCCTAGCCCTCGTATT
CCTTCTGCTGGAGGAGGGAGGATAGCATCACTAGAGGATGTTTCATCTCATATGGGTGAG
CATGCTGATTTGGCTGCTGCATTGTCTGGCATGAGTCTATCAGGGAACAATATGGGAGAT
GAAGGGAAACATCAAAAGTATCAAATTCATAATGAGATTGACGATCATCAGAACCTCTTC
CGATTGCAGAATGGTCAGAATCCTATGAAGCAACATCCATATGGAAAAAAGTCTGAATCT
GTTCATTTTCATAAGTCTGCAGGTTCCTCTACTGCATACATGATTGGGCCCTCTATGCCA
ACTCTCAACAGTGGAGAAAGTTCTTTATCTCAATATCCAACTGTCGATAGTCCTAATTCA
ACATTTTCTGCTTATGCTTTAGGAGGTTATGGTATGAACCCTTCATCACCAACCATGTTT
GAAAACCAGGTTGGGGCTGGTAATTTACCTTCCGTACTGGGAAATATAGCTTCTCCGGTA
GGTGCATGTGGAATTGATGCTCGTGTAACAGGAGGCGGATTGAGTTTGGGTCCTAATTTA
ATGGCTGCAGCAGCTGAACTGCAGAACCTTAATAGACTTGGTAATCAGACCTTGGGGGGG
TCTCTGCCAATGTCTCAGATGGATCCATTGTACTTACAGTACTTGAGGTCACCTGAGTAT
CTTGCTGCTCAGCTAGCAGCTCTCAATGACCCAACAGTGAATAGGGAATCTTTAGGGACT
TCATACATGGAGTTGATTGAGCTTCAGAAAGCTTATCTGGAGACGTTGGTTGCATCTCAA
AATTCACAATATGGTATTCCGTATCTTGGCAAATCCGGTGGCTTAAATCATGGTTACTAT
GGGAACCCAGCACTTGGCCTTAGTATGTCATATCCTGGAAGCCCTTTGGCAGGTGCAGGT
CTTCCAAATTCCCCATTTGGACCTGGTAGTCCTGTAAGGTATGGGGAAAGGAACATGCGT
TTTCATTCAGGGATGAGAAACTTAGCTGGTGGTGTCATGGGAGCTTGGCATTCTGAGGCT
GTTTCTAACTTGGGTGAAACCTTTGCTTCCTCGTTACTAGACGAGTTTAAGAGCAATAAG
AGCAAGTGTTTTGAGCTATCAGAGATTGAAGGCCATGTGGTCCAGTTCAGTGCGGATCAG
TATGGCAGTCGGTTCATTCAACAAAAACTTGAGACTGCTACCACAGAAGAGAAGAACATG
GTCTTCCAAGAAATTATGCCGCAAGCCCTTTCTTTGATGACTGATGTGTTTGGTAATTAT
GTGATCCAGAAGTTTTTCGAGCATGGAAGTTCACCTCAGATAAGAGAACTGGCTGACCAG
CTCAATGGGCATGTACTCACCCTTAGCCTTCAGATGTATGGTTGCCGAGTAATCCAAAAG
GCCATAGAGATGGTTGATCTGGATCAGCAGACTAAAATGGTCGCCGAGCTTGATGGTCAT
GTTATGCGCTGTGTTAGAGATCAAAATGGGAATCATGTAATCCAGAAGTGCATCGAATGC
ATTCCACAGGATGCTATCCAGTTCATTGTTTCCACATTTTATGATCAAGTTGTGACATTG
TCCACCCATCCATATGGATGTCGGGTCATACAGAGAGTCTTGGAACATTGCCATAATCCT
GAAACCCAGAACATTGTAATGAATGAGATTTTGCAAACAGTTTGCATGTTGGCGCAAGAT
CAATATGGGAATTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAACACGGAAAGCCTGAGGAGCGTACT
TCTATAATTAGTAAGCTGACGGGACAGATAGTTCAGATGAGCCAGCAGAAATTTGCCTCT
AATGTTGTGGAGAAGTGCTTAAGCTTTGGAACTCCCGAAGAACGTCAGACCTTGGTAAAT
GAGATGATTGGCACCACTGATGAAAATGAACCTCTTCAGGCGATGATGAAAGATCAGTTT
GCAAACTACGTTGTACAGAAAGTGCTGGAGACTTGTGATGACCAGCAACTTGAACTCATT
CTCAACCGAATCAAGGTTCATCTAAATGCTCTGAAGAAATATACTTACGGAAAGCATATA
GTTGCCCGTGTAGAGAAACTGGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATCAGTTTCCTGGCGTCA
TATTCTGCTGCTGCTTAG