Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400016234
CDS Infomation	pacid=37475428 polypeptide=PGSC0003DMP400011251 locus=PGSC0003DMG400006344 ID=PGSC0003DMT400016234.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCGTCAACGTATTGGTGTTATAGATGCAATAGATTTTACAGAGTATGGAGCGAGGAA TCGATTGCTTGTCCTGATTGTAACACGGGATTTGTTGAAGAAATTGAGGCTCCGACCCGA TCCACGTTGTCCGGGTCACGGCGTCGGCGTATCCCTCCGGCGGTGATGCAGACGGCAGCG CGGAGTACGGAGCAGTCTCCTGCTTCGGGTTATGGTTCCGGGTCAAGTCCGGGTGTTCGT AGGAACCGGAGGAATACTGGTGACCGGTCGCCGTTTAATCCTGTGATAGTCCTTCGTGGT TCTACCAATGGAGGTGGCGCGGGAGGGGAAGGTGGTGGAGGCGGTGGAGGGGGGTTTGAA CTGTATTATGATGATGGAACCGGGTCGGGTTTGAGACCTTTACCTACGAGTATGTCTGAG TTTTTACTCGGGTCAGGTTTCGATAGGCTTTTGGATCAGCTAGCACAGATTGAAGCTAAT GGTATTGGAAGAATAGAGAATCCACCAGCTTCAAAAGCTGCAATTGAGTCGTTGCCAACA ATTGAGATAATTCATTCTCATATTGTTACTGAATCTTGTTGTGCAGTGTGTAAAGAGGCA TTCGAGTTAGGCACTGAGGCCCGCGAAATGCCCTGTAAGCATTTATACCATTCAGATTGC ATACTCCCATGGCTTTCGTTGCGCAATTCGTGTCCAGTTTGTAGGCATGAATTGCCTTCA GAGAGTCGGGATGTTGTCGATCCGAATAGAGCACCAAGCGAACAGAGTGAACAGAGTGTA GCAACAAATAATGAGGTGGAGGAAGCTGTTGGATTGACCATATGGAGATTACCTGGTGGT GGATTTGCTGTTGGGAGGTTAGGTAGGAGAGGTGGGGAGAGAGCTCTTCCGGTTGTATTC ACTGAAATGGATGGTGGTTTTAATAATAATAACAATAATGGAGTTCCAAGGAGGATTTCA TGGGGTTCTAGAGGAAGCGAATCGCGACAAAGTGGTGGCTTTAGGAGGTTTTTTGGCAAC TTGTTTTCGTGTTTCGGTGGTGTTGGTTCATCAGGGTCAAGCTCTAGTTCAGATTCTAGG ATAAATCAGAGCAGAAGTAGTTCAATGTCATCTGTCTTTCTTGCTACAGCAAGAAGGCGC AGAGGCTGGGGTTTCGAAGCTAATAATGGAGTTAGAAGATGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400011251
PEP Infomation	pacid=37475428 transcript=PGSC0003DMT400016234 locus=PGSC0003DMG400006344 ID=PGSC0003DMT400016234.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MSSTYWCYRCNRFYRVWSEESIACPDCNTGFVEEIEAPTRSTLSGSRRRRIPPAVMQTAA RSTEQSPASGYGSGSSPGVRRNRRNTGDRSPFNPVIVLRGSTNGGGAGGEGGGGGGGGFE LYYDDGTGSGLRPLPTSMSEFLLGSGFDRLLDQLAQIEANGIGRIENPPASKAAIESLPT IEIIHSHIVTESCCAVCKEAFELGTEAREMPCKHLYHSDCILPWLSLRNSCPVCRHELPS ESRDVVDPNRAPSEQSEQSVATNNEVEEAVGLTIWRLPGGGFAVGRLGRRGGERALPVVF TEMDGGFNNNNNNGVPRRISWGSRGSESRQSGGFRRFFGNLFSCFGGVGSSGSSSSSDSR INQSRSSSMSSVFLATARRRRGWGFEANNGVRRW*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400016234
Transcript Infomation	pacid=37475428 locus=PGSC0003DMG400006344 ID=PGSC0003DMT400016234.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCGTCAACGTATTGGTGTTATAGATGCAATAGATTTTACAGAGTATGGAGCGAGGAA TCGATTGCTTGTCCTGATTGTAACACGGGATTTGTTGAAGAAATTGAGGCTCCGACCCGA TCCACGTTGTCCGGGTCACGGCGTCGGCGTATCCCTCCGGCGGTGATGCAGACGGCAGCG CGGAGTACGGAGCAGTCTCCTGCTTCGGGTTATGGTTCCGGGTCAAGTCCGGGTGTTCGT AGGAACCGGAGGAATACTGGTGACCGGTCGCCGTTTAATCCTGTGATAGTCCTTCGTGGT TCTACCAATGGAGGTGGCGCGGGAGGGGAAGGTGGTGGAGGCGGTGGAGGGGGGTTTGAA CTGTATTATGATGATGGAACCGGGTCGGGTTTGAGACCTTTACCTACGAGTATGTCTGAG TTTTTACTCGGGTCAGGTTTCGATAGGCTTTTGGATCAGCTAGCACAGATTGAAGCTAAT GGTATTGGAAGAATAGAGAATCCACCAGCTTCAAAAGCTGCAATTGAGTCGTTGCCAACA ATTGAGATAATTCATTCTCATATTGTTACTGAATCTTGTTGTGCAGTGTGTAAAGAGGCA TTCGAGTTAGGCACTGAGGCCCGCGAAATGCCCTGTAAGCATTTATACCATTCAGATTGC ATACTCCCATGGCTTTCGTTGCGCAATTCGTGTCCAGTTTGTAGGCATGAATTGCCTTCA GAGAGTCGGGATGTTGTCGATCCGAATAGAGCACCAAGCGAACAGAGTGAACAGAGTGTA GCAACAAATAATGAGGTGGAGGAAGCTGTTGGATTGACCATATGGAGATTACCTGGTGGT GGATTTGCTGTTGGGAGGTTAGGTAGGAGAGGTGGGGAGAGAGCTCTTCCGGTTGTATTC ACTGAAATGGATGGTGGTTTTAATAATAATAACAATAATGGAGTTCCAAGGAGGATTTCA TGGGGTTCTAGAGGAAGCGAATCGCGACAAAGTGGTGGCTTTAGGAGGTTTTTTGGCAAC TTGTTTTCGTGTTTCGGTGGTGTTGGTTCATCAGGGTCAAGCTCTAGTTCAGATTCTAGG ATAAATCAGAGCAGAAGTAGTTCAATGTCATCTGTCTTTCTTGCTACAGCAAGAAGGCGC AGAGGCTGGGGTTTCGAAGCTAATAATGGAGTTAGAAGATGGTAA