Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400015640
CDS Infomation

pacid=37455130 polypeptide=PGSC0003DMP400010837 locus=PGSC0003DMG400006105 ID=PGSC0003DMT400015640.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATGTGAAATTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCCATATACTGAACTCAACT
AAACCCACTCCCAGTGTAGGAATTTCAATCCCACCCACCAAGAAATACAAGGACCAGAAC
AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGATTCTTGGGGTCAAATTCAGG
CCGGGTGTTGGGTATGGTGATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAAC
TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGTTTTGAAGACCCAAAATGGATTCTTGAGAAAA
CCAGTTGATGAAATTGAGAGTGAGGAGAAAATTGATGGTCGGTCGAGCTGGAGTAATGGG
GTGCAGACCAAGTGTTCGACAAAATGGCGCAATGACGTGAAGGAGACCCAAAATGGTTTC
TTGAGAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAAAAAATTGATGGAAAATTGAGCTCG
GTAAATGTGGTGCAGACCAACTGTTCGACAAAATGGTGCAATGACGTGAAGGAGACCCAA
AATGGTGTTTTTAGGAAACCAGTTGATAGAACTGAGAATAAGAAAAAAGTTGGTGGTCAA
TTGAGCTCGGGGAATGCGATGGAGAAAGTACAGACTAAGGGTTTGAAAAAATGGGCCAGA
TATGGAGGATGTATTCCTGTAATGCTGGAAGCTTTGGAGACAGTTAGTAATTTGGATGAG
GCATTAAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAAAGGACTATTATATTGAAGGAG
CAGGTGGAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGGTTTAAGAGAAGAGGATGCCAT
GAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATTCTTGGGAAATCACAGAGGTGG
GATGAGATTGAGAGACTGTGGGGCAAAATGAGGGAAAGGAGAATCGAGCCTATAAATTCA
ACGTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGGCGTAGGGAGCAGGCAATGGAA
TGGTTGAAGTTGATGAATGAACGAGGTATGGTACCAGATGAGGTGACAATGGGAATTGTT
GTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCGGAAGAGTTTTTGAAAAAGTGG
TCTTTATGCAAATGTCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGTGGACCAAGAAGTGGTATTAGG
GTCAATGGTTCTTCGGGCTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCACATACCTATAACAATTTAATT
GACACTTATGGGAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATACGAGACTTTTCACCAGATGCTG
AGGGAAGGGATCCTGCCGACAACAGTTACTTTCAATACAATGATTCACATGTGTGGTAAT
AATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGAAAGATGGAGGGGCTTCAGTGTCAT
CCTGATACAAGAACATACAATATTCTTATTTCCCTTCACGCCAAGCATGACAACATAGAA
ATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCTCTAGAGCCAGATGCAGTGACC
TATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCTATAAGGAATATGGTTAGTGAAGCAGAGAAGCTC
ATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTACAGATTGACGAATTCACTCAGTCAGCTTTGACT
AGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGGTCCTGGTTCCAGAGGTTTCAT
CTTGCAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCCAACATTGATGCCTACGGTGAACGT
GGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAATTGTTGTAGTGAGGGAAAAAGGCTTACT
GTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAGGCGTATGGAATTAGCAAGAAATACAACGAGGCG
TGCTACTTGTTCGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCTCCTGATAAATGCAGTTATAGT
TCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTGAAAGCAGCATCTTATGTGAGG
GAAATGAAGGAGGCGGGATTAGTTGATGATTGTATCCCTTATTGTGCTGTGATATCTAGT
TTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTATTCGATGAAATGATTGTGTTT
GGCATCAAGCCTGATGTTGTTGTTTATGGTGTACTGATAAATGCCTTTGCTGACATGGGA
AGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGAAACTCTGGTTTAGAGGCAAAT
GCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAGGTTGGGTATTTGAGAGAAGCA
CAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTTGAGGAAGGGCTTGATGTATATTCTTCAAAT
TGCATGATTGACTTGTACAGTGAGCGCTCTATGGTTAAACAAGCAGAAGAGATTTTTGAG
CACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTATGCAATGATGCTGTGCATGTAC
AGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCCCGGAAAATGAAAGAACTAGGA
CTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGATTGTGTGCATCTGATGGGAGG
TATAAAGAAGCTTTGGCGACTTACAAGGAAATGCTTTCTTCTGCCATCCAACCTGATGAT
TCAACATTCAAATCACTTGGAATTGTTCTTCTTAAATGCGGTGTTCCAAAGGAGGCTATT
AGTAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGTGGCGTGCAAGAGTGGACTTCA
GCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCTCCTGATAGTAAAGATGCCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010837
PEP Infomation

pacid=37455130 transcript=PGSC0003DMT400015640 locus=PGSC0003DMG400006105 ID=PGSC0003DMT400015640.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MYVKFQYVDTSNCFHILNSTKPTPSVGISIPPTKKYKDQNKLNDPNGRIEKSKILGVKFR
PGVGYGDDVKEKLDYQIGKNSHTRVWKNGVLKTQNGFLRKPVDEIESEEKIDGRSSWSNG
VQTKCSTKWRNDVKETQNGFLRKPVDRTESEEKIDGKLSSVNVVQTNCSTKWCNDVKETQ
NGVFRKPVDRTENKKKVGGQLSSGNAMEKVQTKGLKKWARYGGCIPVMLEALETVSNLDE
ALKPWEKSLTKKERTIILKEQVEWQRAMEIFEWFKRRGCHELNVIHYNIVLRILGKSQRW
DEIERLWGKMRERRIEPINSTYGTLIDVYSKGGRREQAMEWLKLMNERGMVPDEVTMGIV
VQMYKMAGEFKKAEEFLKKWSLCKCQVEERVNGGPRSGIRVNGSSGSSVCLSSHTYNNLI
DTYGKAGQVKEAYETFHQMLREGILPTTVTFNTMIHMCGNNGRMEEVASLMRKMEGLQCH
PDTRTYNILISLHAKHDNIEMAATYFKIMKDASLEPDAVTYRTLLYAFSIRNMVSEAEKL
ILEMDKKDLQIDEFTQSALTRMYLEAGMVEMSWSWFQRFHLAGKMSSECYSANIDAYGER
GHISEAERAFNCCSEGKRLTVLEFNVMIKAYGISKKYNEACYLFDSMEKHGLSPDKCSYS
SLIQMLAGADLPLKAASYVREMKEAGLVDDCIPYCAVISSFVKVGQLEMAVSLFDEMIVF
GIKPDVVVYGVLINAFADMGSVKDATKYLVEMRNSGLEANAVIYTSLIKLYTKVGYLREA
QETYKMLQSFEEGLDVYSSNCMIDLYSERSMVKQAEEIFEHLKKKGNANEFSYAMMLCMY
RRNGMFKEAIQNARKMKELGLLTDLLSYNNVLGLCASDGRYKEALATYKEMLSSAIQPDD
STFKSLGIVLLKCGVPKEAISKLESMRKKDPQSGVQEWTSALSSVIGVLDTDSPDSKDA*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400015640
Transcript Infomation

pacid=37455130 locus=PGSC0003DMG400006105 ID=PGSC0003DMT400015640.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTATGTGAAATTTCAGTATGTTGACACCAGTAATTGTTTCCATATACTGAACTCAACT
AAACCCACTCCCAGTGTAGGAATTTCAATCCCACCCACCAAGAAATACAAGGACCAGAAC
AAATTGAATGACCCAAATGGAAGAATTGAGAAAAGCAAGATTCTTGGGGTCAAATTCAGG
CCGGGTGTTGGGTATGGTGATGATGTAAAAGAGAAGTTGGATTATCAAATTGGGAAAAAC
TCGCATACCCGTGTTTGGAAAAATGGTGTTTTGAAGACCCAAAATGGATTCTTGAGAAAA
CCAGTTGATGAAATTGAGAGTGAGGAGAAAATTGATGGTCGGTCGAGCTGGAGTAATGGG
GTGCAGACCAAGTGTTCGACAAAATGGCGCAATGACGTGAAGGAGACCCAAAATGGTTTC
TTGAGAAAACCAGTTGATAGAACTGAGAGTGAGGAAAAAATTGATGGAAAATTGAGCTCG
GTAAATGTGGTGCAGACCAACTGTTCGACAAAATGGTGCAATGACGTGAAGGAGACCCAA
AATGGTGTTTTTAGGAAACCAGTTGATAGAACTGAGAATAAGAAAAAAGTTGGTGGTCAA
TTGAGCTCGGGGAATGCGATGGAGAAAGTACAGACTAAGGGTTTGAAAAAATGGGCCAGA
TATGGAGGATGTATTCCTGTAATGCTGGAAGCTTTGGAGACAGTTAGTAATTTGGATGAG
GCATTAAAGCCATGGGAAAAGAGTTTGACTAAAAAAGAAAGGACTATTATATTGAAGGAG
CAGGTGGAGTGGCAACGAGCAATGGAGATTTTTGAGTGGTTTAAGAGAAGAGGATGCCAT
GAATTGAATGTTATACATTATAATATTGTACTTAGGATTCTTGGGAAATCACAGAGGTGG
GATGAGATTGAGAGACTGTGGGGCAAAATGAGGGAAAGGAGAATCGAGCCTATAAATTCA
ACGTATGGGACTCTGATTGATGTCTACAGCAAGGGTGGGCGTAGGGAGCAGGCAATGGAA
TGGTTGAAGTTGATGAATGAACGAGGTATGGTACCAGATGAGGTGACAATGGGAATTGTT
GTTCAGATGTATAAAATGGCGGGGGAGTTTAAGAAAGCGGAAGAGTTTTTGAAAAAGTGG
TCTTTATGCAAATGTCAAGTGGAGGAACGTGTAAATGGTGGACCAAGAAGTGGTATTAGG
GTCAATGGTTCTTCGGGCTCAAGTGTTTGTTTGAGCTCACATACCTATAACAATTTAATT
GACACTTATGGGAAGGCAGGACAAGTGAAAGAAGCATACGAGACTTTTCACCAGATGCTG
AGGGAAGGGATCCTGCCGACAACAGTTACTTTCAATACAATGATTCACATGTGTGGTAAT
AATGGCCGAATGGAAGAAGTTGCTTCCTTGATGAGAAAGATGGAGGGGCTTCAGTGTCAT
CCTGATACAAGAACATACAATATTCTTATTTCCCTTCACGCCAAGCATGACAACATAGAA
ATGGCTGCCACCTACTTTAAAATTATGAAAGATGCTTCTCTAGAGCCAGATGCAGTGACC
TATCGCACTCTTTTGTATGCATTTTCTATAAGGAATATGGTTAGTGAAGCAGAGAAGCTC
ATTTTGGAGATGGATAAGAAAGATCTACAGATTGACGAATTCACTCAGTCAGCTTTGACT
AGGATGTATCTAGAAGCTGGGATGGTAGAAATGTCATGGTCCTGGTTCCAGAGGTTTCAT
CTTGCAGGAAAAATGTCTTCTGAATGTTATTCTGCCAACATTGATGCCTACGGTGAACGT
GGCCATATTTCGGAAGCTGAGAGAGCTTTTAATTGTTGTAGTGAGGGAAAAAGGCTTACT
GTTCTTGAGTTCAATGTAATGATCAAGGCGTATGGAATTAGCAAGAAATACAACGAGGCG
TGCTACTTGTTCGATAGCATGGAGAAGCATGGCTTATCTCCTGATAAATGCAGTTATAGT
TCACTCATCCAAATGCTAGCTGGTGCAGATCTGCCTCTGAAAGCAGCATCTTATGTGAGG
GAAATGAAGGAGGCGGGATTAGTTGATGATTGTATCCCTTATTGTGCTGTGATATCTAGT
TTTGTTAAAGTAGGTCAGCTGGAAATGGCAGTAAGCTTATTCGATGAAATGATTGTGTTT
GGCATCAAGCCTGATGTTGTTGTTTATGGTGTACTGATAAATGCCTTTGCTGACATGGGA
AGTGTTAAAGACGCTACAAAATACTTGGTTGAAATGAGAAACTCTGGTTTAGAGGCAAAT
GCTGTTATATACACTTCCTTAATTAAGCTATACACCAAGGTTGGGTATTTGAGAGAAGCA
CAAGAAACGTATAAAATGCTTCAGTCGTTTGAGGAAGGGCTTGATGTATATTCTTCAAAT
TGCATGATTGACTTGTACAGTGAGCGCTCTATGGTTAAACAAGCAGAAGAGATTTTTGAG
CACCTGAAGAAAAAGGGAAATGCAAATGAATTTTCTTATGCAATGATGCTGTGCATGTAC
AGGAGAAATGGAATGTTTAAGGAAGCCATTCAAAATGCCCGGAAAATGAAAGAACTAGGA
CTTCTGACTGACTTGTTGAGTTACAACAATGTGCTTGGATTGTGTGCATCTGATGGGAGG
TATAAAGAAGCTTTGGCGACTTACAAGGAAATGCTTTCTTCTGCCATCCAACCTGATGAT
TCAACATTCAAATCACTTGGAATTGTTCTTCTTAAATGCGGTGTTCCAAAGGAGGCTATT
AGTAAGCTGGAATCTATGAGGAAAAAGGATCCTCAGAGTGGCGTGCAAGAGTGGACTTCA
GCCCTATCTTCCGTTATCGGTGTGCTTGATACTGACTCTCCTGATAGTAAAGATGCCTAG