Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400015099
CDS Infomation

pacid=37452823 polypeptide=PGSC0003DMP400010455 locus=PGSC0003DMG400005903 ID=PGSC0003DMT400015099.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTGGATTCAACGATGTCATCCGAATCCGATCACGCAGAGAATAAAGGCGCGTCG
TCGGAGCAGCTAAACGGCCAGTCATCAGCCGGGGGATCTCCGCCGGAGACTCCTAAGGAT
GAGCAGCAGCCGGCAACTTCTCAGCCTCAGCAGCAGCAGGGCAGTACTCCGGTGGCGGGG
CCGAGGTGTGCTCCGACCTATTCTGTGGTGCACGCAGTTATGGAGAAGAAGGAGGATGGT
CCAGGGCCAAGGTGTGGGCATACGTTAACGGCTGTACCGGCTGTTGGAGAGGAAGGTAGC
CCCAATTACATTGGTCCTAGGCTTATTCTCTTTGGTGGGGCAACTGCTCTTGAAGGGAAT
TCTGCTGGTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAGTGCTGGAATTCGTTTAGCTGGGGCT
ACTGCTGATGTGCACTGCTATGATGTTTTGACAAATAAATGGTCTAGGATGACCCCAATA
GGAGAGCCACCCACACCACGGGCTGCTCATGTTGCTACCGCGGTTGGAACTATGGTTGTT
ATTCAGGGTGGAATTGGTCCAGCTGGATTGTCAGCTGAGGATCTTCATGTTCTGGACCTT
ACACAACAACGCCCACGATGGCACAGGGTTGTCGTCCAAGGACCTGGTCCAGGGCCACGT
TATGGCCACGTCATGGCTTTGGTAGGGCAAAGATATCTCATGGCTATCGGTGGAAATGAT
GGTAAGCGACCTCTAGCTGATGTTTGGGCTTTGGACACAGCTGCCAAGCCATATGAATGG
CGCAAATTGGAGCCTGAGGGTGAAGGCCCACCTCCTTGCATGTATGCAACTGCAAGTGCG
AGATCGGATGGTCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTGCCACTAGCC
AGCGCATATGGACTTGCCAAACATAGAGATGGGCGCTGGGAATGGGCCATTGCTCCTGGT
GTGTCACCATCCTCTAGATATCAACATGCCGCTGTTTTTGTTAATGCTCGGCTCCATGTA
TCTGGAGGGGCACTTGGTGGTGGCCGCATGGTGGAGGACTCATCCAGTATAGCAGTTCTT
GATACAGCTGCAGGAGTGTGGTGTGACACAACCTCTGTTGTCACTAGTCCTAGAACTGGC
AGATTCAGTGCAGATGCAGCTGGCGGTGATGCTGCAGTTGAATTGACCAGGCGTTGTAGA
CATGCAGCTGTTGCTGTTGGTGACTTGATATTTATTTATGGTGGTCTGCGTGGCGGGGTA
TTGCTAGATGACTTACTTGTTGCTGAAGACTTGGCTGCTGCTGAAACAACTAGTGCAGCT
TCACATGCAGCAGCTGCAGCTGCTGCAGTTAATGTACAGGCGGGGAGGTTAACAGGAAGG
TATGGTTTTGGTGATGAAAGAACAAGACAAACAGACCCTGAAGCAGTTAATGATGGCTCA
GTTGTACTGGGAACTCCTGTCGCACCACCTGTAAATGGTGATATGTATTCCGATATAAGC
TCTGAAAATGCGACGTTTCAAGGACCTCGGAGACTCATCAAAGGTGTTGAATATTTAGTG
GAGGCTTCTGCTGCAGAAGCTGAGGCTATTACTGCTACACTAGCAGCTGCAAAAGCTCGT
CAACAAGGGAATGGAGAAGTTGAACTTCCAGATAGAGACCGTGGAGCGGAGGCAACGCCA
AGTGGAAAACAGGCGTCTACTCTGATCAAGCCTGACTTTGCCTTATCAAATAATTCTGCC
CCAGCTGGAGTTCGGCTGCATCACCGTGCTGTGGTTATAGCTGCAGAGACTGGTGGTGCT
CTAGGTGGCATGGTGCGGCAGCTTTCGATTGATCAGTTTGAAAATGAAGGCAGGCGAGTT
AGTTATGGAACCCCAGAAAATGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTGGATCGTCAAATGTCC
ATCAACAGTGTTCCTAAAAAGGTGATTACCCATCTTCTGAAGCCTCGTGGCTGGAAGCCG
CCTGTTCGACGACAGTTTTTCTTGGACTGCAATGAGATAGCTGATCTTTGTGACAGTGCT
GAAAGGATATTTGCGAGTGAACCTAGTGTTATACAGCTTAAGGCTCCTATTAAGATATTT
GGTGACTTGCATGGGCAATTTGGGGATCTTATGCGTCTTTTCGATGAGTATGGTTCCCCA
TCGACTGCTGGGGATATATCGTATATTGACTATCTCTTCTTAGGAGATTATGTTGATAGG
GGCCAGCACAGTTTGGAAACAATGACCCTTCTTCTCGCTTTAAAGGTTGAGTATCCCCTC
AATGTACATCTAATTCGTGGGAACCATGAAGCTGCTGATATTAATGCGCTTTTCGGCTTT
CGAATTGAGTGCATTGAACGCATGGGTGAGCGAGATGGAATTTGGGCATGGCATCGATTT
AATAGGTTGTTCAACTGGCTTCCTCTGGCAGCATTAATCGAGAAAAAGATTATCTGTATG
CATGGTGGTATTGGAAGGTCAATTAATCATGTTGAACAAATAGAAAATATCCAACGCCCT
ATTACTATGGATGCTGGCTCAATTGTTCTTATGGATTTGTTGTGGTCTGACCCTACAGAA
AATGATAGTGTTGAAGGATTAAGACCAAATGCAAGAGGGCCTGGGTTGGTCACTTTTGGG
CCCGATCGTGTGATGGAATTCTGCAACAATAATGATCTTCAATTGATTGTCCGAGCGCAT
GAATGTGTGATGGATGGATTTGAACGATTTGCTCAGGGACATTTAATTACGCTTTTCTCA
GCCACTAATTATTGTGGTACTGCTAATAATGCTGGTGCTATCTTGGTATTGGGTAGAGAT
CTTGTTGTGGTTCCAAAACTTATTCACCCGCTGCCGCCGGCAATTTCCTCTCCTGAAACT
TCACCTGAGCGGCATATGGAAGATATTTGGATGCAGGAGCTAAATGCCAACAGACCACCG
ACACCAACCAGAGGACGTCCTCAAGTAGCCAATGATCGAGGTTCTGTTGCTTGGACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010455
PEP Infomation

pacid=37452823 transcript=PGSC0003DMT400015099 locus=PGSC0003DMG400005903 ID=PGSC0003DMT400015099.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDVDSTMSSESDHAENKGASSEQLNGQSSAGGSPPETPKDEQQPATSQPQQQQGSTPVAG
PRCAPTYSVVHAVMEKKEDGPGPRCGHTLTAVPAVGEEGSPNYIGPRLILFGGATALEGN
SAGSGTPSSAGSAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRMTPIGEPPTPRAAHVATAVGTMVV
IQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQRPRWHRVVVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGND
GKRPLADVWALDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLA
SAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSSRYQHAAVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSIAVL
DTAAGVWCDTTSVVTSPRTGRFSADAAGGDAAVELTRRCRHAAVAVGDLIFIYGGLRGGV
LLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAAVNVQAGRLTGRYGFGDERTRQTDPEAVNDGS
VVLGTPVAPPVNGDMYSDISSENATFQGPRRLIKGVEYLVEASAAEAEAITATLAAAKAR
QQGNGEVELPDRDRGAEATPSGKQASTLIKPDFALSNNSAPAGVRLHHRAVVIAAETGGA
LGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSINSVPKKVITHLLKPRGWKP
PVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFASEPSVIQLKAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGSP
STAGDISYIDYLFLGDYVDRGQHSLETMTLLLALKVEYPLNVHLIRGNHEAADINALFGF
RIECIERMGERDGIWAWHRFNRLFNWLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINHVEQIENIQRP
ITMDAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVMEFCNNNDLQLIVRAH
ECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISSPET
SPERHMEDIWMQELNANRPPTPTRGRPQVANDRGSVAWT*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400015099
Transcript Infomation

pacid=37452823 locus=PGSC0003DMG400005903 ID=PGSC0003DMT400015099.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGTGGATTCAACGATGTCATCCGAATCCGATCACGCAGAGAATAAAGGCGCGTCG
TCGGAGCAGCTAAACGGCCAGTCATCAGCCGGGGGATCTCCGCCGGAGACTCCTAAGGAT
GAGCAGCAGCCGGCAACTTCTCAGCCTCAGCAGCAGCAGGGCAGTACTCCGGTGGCGGGG
CCGAGGTGTGCTCCGACCTATTCTGTGGTGCACGCAGTTATGGAGAAGAAGGAGGATGGT
CCAGGGCCAAGGTGTGGGCATACGTTAACGGCTGTACCGGCTGTTGGAGAGGAAGGTAGC
CCCAATTACATTGGTCCTAGGCTTATTCTCTTTGGTGGGGCAACTGCTCTTGAAGGGAAT
TCTGCTGGTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAGTGCTGGAATTCGTTTAGCTGGGGCT
ACTGCTGATGTGCACTGCTATGATGTTTTGACAAATAAATGGTCTAGGATGACCCCAATA
GGAGAGCCACCCACACCACGGGCTGCTCATGTTGCTACCGCGGTTGGAACTATGGTTGTT
ATTCAGGGTGGAATTGGTCCAGCTGGATTGTCAGCTGAGGATCTTCATGTTCTGGACCTT
ACACAACAACGCCCACGATGGCACAGGGTTGTCGTCCAAGGACCTGGTCCAGGGCCACGT
TATGGCCACGTCATGGCTTTGGTAGGGCAAAGATATCTCATGGCTATCGGTGGAAATGAT
GGTAAGCGACCTCTAGCTGATGTTTGGGCTTTGGACACAGCTGCCAAGCCATATGAATGG
CGCAAATTGGAGCCTGAGGGTGAAGGCCCACCTCCTTGCATGTATGCAACTGCAAGTGCG
AGATCGGATGGTCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTGCCACTAGCC
AGCGCATATGGACTTGCCAAACATAGAGATGGGCGCTGGGAATGGGCCATTGCTCCTGGT
GTGTCACCATCCTCTAGATATCAACATGCCGCTGTTTTTGTTAATGCTCGGCTCCATGTA
TCTGGAGGGGCACTTGGTGGTGGCCGCATGGTGGAGGACTCATCCAGTATAGCAGTTCTT
GATACAGCTGCAGGAGTGTGGTGTGACACAACCTCTGTTGTCACTAGTCCTAGAACTGGC
AGATTCAGTGCAGATGCAGCTGGCGGTGATGCTGCAGTTGAATTGACCAGGCGTTGTAGA
CATGCAGCTGTTGCTGTTGGTGACTTGATATTTATTTATGGTGGTCTGCGTGGCGGGGTA
TTGCTAGATGACTTACTTGTTGCTGAAGACTTGGCTGCTGCTGAAACAACTAGTGCAGCT
TCACATGCAGCAGCTGCAGCTGCTGCAGTTAATGTACAGGCGGGGAGGTTAACAGGAAGG
TATGGTTTTGGTGATGAAAGAACAAGACAAACAGACCCTGAAGCAGTTAATGATGGCTCA
GTTGTACTGGGAACTCCTGTCGCACCACCTGTAAATGGTGATATGTATTCCGATATAAGC
TCTGAAAATGCGACGTTTCAAGGACCTCGGAGACTCATCAAAGGTGTTGAATATTTAGTG
GAGGCTTCTGCTGCAGAAGCTGAGGCTATTACTGCTACACTAGCAGCTGCAAAAGCTCGT
CAACAAGGGAATGGAGAAGTTGAACTTCCAGATAGAGACCGTGGAGCGGAGGCAACGCCA
AGTGGAAAACAGGCGTCTACTCTGATCAAGCCTGACTTTGCCTTATCAAATAATTCTGCC
CCAGCTGGAGTTCGGCTGCATCACCGTGCTGTGGTTATAGCTGCAGAGACTGGTGGTGCT
CTAGGTGGCATGGTGCGGCAGCTTTCGATTGATCAGTTTGAAAATGAAGGCAGGCGAGTT
AGTTATGGAACCCCAGAAAATGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTGGATCGTCAAATGTCC
ATCAACAGTGTTCCTAAAAAGGTGATTACCCATCTTCTGAAGCCTCGTGGCTGGAAGCCG
CCTGTTCGACGACAGTTTTTCTTGGACTGCAATGAGATAGCTGATCTTTGTGACAGTGCT
GAAAGGATATTTGCGAGTGAACCTAGTGTTATACAGCTTAAGGCTCCTATTAAGATATTT
GGTGACTTGCATGGGCAATTTGGGGATCTTATGCGTCTTTTCGATGAGTATGGTTCCCCA
TCGACTGCTGGGGATATATCGTATATTGACTATCTCTTCTTAGGAGATTATGTTGATAGG
GGCCAGCACAGTTTGGAAACAATGACCCTTCTTCTCGCTTTAAAGGTTGAGTATCCCCTC
AATGTACATCTAATTCGTGGGAACCATGAAGCTGCTGATATTAATGCGCTTTTCGGCTTT
CGAATTGAGTGCATTGAACGCATGGGTGAGCGAGATGGAATTTGGGCATGGCATCGATTT
AATAGGTTGTTCAACTGGCTTCCTCTGGCAGCATTAATCGAGAAAAAGATTATCTGTATG
CATGGTGGTATTGGAAGGTCAATTAATCATGTTGAACAAATAGAAAATATCCAACGCCCT
ATTACTATGGATGCTGGCTCAATTGTTCTTATGGATTTGTTGTGGTCTGACCCTACAGAA
AATGATAGTGTTGAAGGATTAAGACCAAATGCAAGAGGGCCTGGGTTGGTCACTTTTGGG
CCCGATCGTGTGATGGAATTCTGCAACAATAATGATCTTCAATTGATTGTCCGAGCGCAT
GAATGTGTGATGGATGGATTTGAACGATTTGCTCAGGGACATTTAATTACGCTTTTCTCA
GCCACTAATTATTGTGGTACTGCTAATAATGCTGGTGCTATCTTGGTATTGGGTAGAGAT
CTTGTTGTGGTTCCAAAACTTATTCACCCGCTGCCGCCGGCAATTTCCTCTCCTGAAACT
TCACCTGAGCGGCATATGGAAGATATTTGGATGCAGGAGCTAAATGCCAACAGACCACCG
ACACCAACCAGAGGACGTCCTCAAGTAGCCAATGATCGAGGTTCTGTTGCTTGGACTTAA