Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400015087
CDS Infomation

pacid=37453083 polypeptide=PGSC0003DMP400010444 locus=PGSC0003DMG400005896 ID=PGSC0003DMT400015087.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTGTGTATATAAGTATTGTGATTTCAGAGGTGTTGTTATATACTTTTGTACATTAGGT
GTATTTCTTGTAAATGTTGTTTCTGGTGTAACAAATTTGAATGATTTCAAGATTTTGAGT
GATTTTAGAAATGGATTAGAGAATCCTGAACTATTGAAATGGCCTTCCAAGGGGAATGAT
CCTTGTGGTCCTCCTGCATGGCCTCATGTGTTCTGTTCTAGTGACAGAGTTACCCAAATT
CAGGTTCAGAGTTTGGGTTTAAAGGGTCCTTTACCTCAGAACTTGAATCAACTTGATAAG
CTTCAAAATCTTGGCCTTCAGGGGAATGGTTTTAGTGGGAAATTACCTACTTTCAATGGA
TTATCTGATTTGAAATATGCATACTTGGACAACAATGAATTCGATACGATTCCTGGTGAT
TTCTTTAATGGTCTTAGCAGTGTTCAAGTTTTGGCTTTGGATTATAATCCGTTTAATGAG
AGTGGATGGTCTATTCCGATTGAGTTGCAAGATTCAGCTCAGTTGACGAATTTTTCTTGT
GTGCAATGCAATATAGTTGGACCTGTGCCTGATTTTTTTGGGAAATTGCCTTCACTAAGT
GCGTTGAAGCTGTCGTATAATCGTTTGACCGGTGAGATACCAGACAGTTTTCGTGATTCA
ATGCTTCGGATTTTGTGGTTGAATAATCAAGATAGTCCTGGAATGACGGGTCCAATCGAC
TTAATTGGTACTATGGATCAGCTTATGTTGTTATGGCTTCAAGGCAACAGTTTTAGTGGA
CCAATTCCTGATACAATTGATGATTTAAATGACTTGAAGGAGCTGAATTTTAACGGAAAT
CAACTCGTTGGTCTGATTCCGCAAGGTTTGGCAAATCTAGACTTGAGTGTGTTAGACTTG
AACAATAATAAGCTCATGGGTCCTATCCCAAAGTTTAGAGCTGCGAATGCTACATATTCC
TCAAATTCTTTCTGTCAGCCAACTCCTGGTGTTCCTTGTGTTCCTCAAGTTAATGCACTT
TTAGATCTTCTTTGCGGTTGGAATTATCCAGCCAACCTTGCTCCTGAATGGAGTGGCAAT
GATCCATGTACAGGTCCTTGGTTGGGAATCAGTTGCAATCCTAAAGGCCAGATTACGATT
GTTAATCTACAGAACAAGAACCTTACGGGTACGCTTAGCCCTTCACTTGCAAACTTGGAT
TCACTGCTTGAAGTTCACTTAAAAAGAAATAGTTTGCATGGTCGAGTTCCTGCAAACTTA
ACAGAGCTCAGATCCTTGAGATTGTTGGACTTAAGTGGGAACAATTTTGATCCACCATTA
CCGAAATTCCGGGATAGTGTGAAAGTCATTACAGACGGAAATGCTCATCTTGTTGCTAAT
GTAACTGCGGCAGCTCCTCCTCTGAGTATTAGCCCATTTCCTCCATTGAGCCACAGTCCT
AAATCAAGCAAGGAGTTACCATCGAAAAGCCCATTTCCCGGTGATAATCAGCCAACATTA
CCAGATACACCGCCCTCCCCAGAGAAAAGTTCAGGTTCAGACTCAAAGTCTCCCAGTGGA
ACCAAAGGGCAGACCACATCAGAGAACCATGATAAGACCATGATCATTGTAGTTGTGAGT
GCAGCTTCTTTCGTTTTCACTCTTCTTGCCGTTGTTTTGTATTTCAAGAGCAAGAGAAAA
CGAGAGAAGGATTCAGGTACTATTGTTATCCACCCCAAAGAGCCATTCGATCAAGATAAC
ATTGTTAAGATCACTATCTTAGAAGATCCCATGATGTACAGCTTACAGAGTGGTACTACA
ACAACTACTACAACTAGTGGTGGAACAAAAGGTAGTCGAGTGATTGAGATTGGAAACCTT
GTCATTTCAACCCAGGACCTTCGGAGGGTAACCGATAATTTTGCACCAGAGAATGAGCTT
GGTCGTGGTGGCTTTGGAGTTGTTTACAAAGGCGTAATTGAAGATGGAATTCAAATTGCA
GTGAAGAGAATGGAATCTGCCATTATCAACAGCAAGGCATTGGATGAATTTCAAGCAGAA
ATAGCTGTGCTTTCTAAGGTTCGACATCGCCATTTAGTTTCACTTTTGGGTTATTCCATT
GAAGGAAATGAGAGGCTTTTGGTATATGAATATATGTCAAAGGGCGCTTTGAGTAGACAT
CTTTTTCGCTGGAAGATCCTGAACTTAGAGCCTTTATCGTGGACAAAGAGACTCAATATT
GCTCTAGATGTCGCTCGAGGGATGGAGTACCTTCATAATCTGGCACACCAGAGCTTCATA
CATCGCGATCTCAAATCATCAAACATTCTTCTAGATGATGATTTTAGAGCAAAAGTTTCT
GATTTTGGATTAGTGAAACTCGCTCCTGACAAAGAAAGGTCCGTTGCAACAAGGCTTGCA
GGAACATTTGGATACCTTGCTCCCGAGTATGCTGTGACCGGAAAAGTCACAACTAAAATA
GATGTCTTCAGCTTTGGGGTGGTGTTGATGGAACTTGTGACTGGACTAACTGCCCTTGAT
GAGCATCGGTCCGAGGAAACTCGATATCTAGTTGAGTGGTTCTGGCAGATAAAATCGAAT
AAAGAAAACCTCCTTGCTTCCGTTGATCCAGCTCTTGACGTGAAGGAAGATATCCACAAG
AGCATTTGCACTATGGCTGAATTAGCTGGACATTGCACTGCGAGAGACCCCAATCACAGG
CCTGACATGTCACACGTTGTGAATGTGCTTGGCCAACTAGTTGAGTCTTGGAAACCCGTA
GAAGAGTCGGATGACTATTCAGGAATTGACTACAGTCTACCTCTTCCAGAAATGTTGAAG
GACTGGCAGGATGAAGACACTGGAGACTTCACCAGTACTAGTCAAGATAGCAGAGGAAGT
ATTCCTGCTAAGCCAAATGGATTTGCGGATTCTTTTACATCCAACGATGCTCGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010444
PEP Infomation

pacid=37453083 transcript=PGSC0003DMT400015087 locus=PGSC0003DMG400005896 ID=PGSC0003DMT400015087.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MCVYKYCDFRGVVIYFCTLGVFLVNVVSGVTNLNDFKILSDFRNGLENPELLKWPSKGND
PCGPPAWPHVFCSSDRVTQIQVQSLGLKGPLPQNLNQLDKLQNLGLQGNGFSGKLPTFNG
LSDLKYAYLDNNEFDTIPGDFFNGLSSVQVLALDYNPFNESGWSIPIELQDSAQLTNFSC
VQCNIVGPVPDFFGKLPSLSALKLSYNRLTGEIPDSFRDSMLRILWLNNQDSPGMTGPID
LIGTMDQLMLLWLQGNSFSGPIPDTIDDLNDLKELNFNGNQLVGLIPQGLANLDLSVLDL
NNNKLMGPIPKFRAANATYSSNSFCQPTPGVPCVPQVNALLDLLCGWNYPANLAPEWSGN
DPCTGPWLGISCNPKGQITIVNLQNKNLTGTLSPSLANLDSLLEVHLKRNSLHGRVPANL
TELRSLRLLDLSGNNFDPPLPKFRDSVKVITDGNAHLVANVTAAAPPLSISPFPPLSHSP
KSSKELPSKSPFPGDNQPTLPDTPPSPEKSSGSDSKSPSGTKGQTTSENHDKTMIIVVVS
AASFVFTLLAVVLYFKSKRKREKDSGTIVIHPKEPFDQDNIVKITILEDPMMYSLQSGTT
TTTTTSGGTKGSRVIEIGNLVISTQDLRRVTDNFAPENELGRGGFGVVYKGVIEDGIQIA
VKRMESAIINSKALDEFQAEIAVLSKVRHRHLVSLLGYSIEGNERLLVYEYMSKGALSRH
LFRWKILNLEPLSWTKRLNIALDVARGMEYLHNLAHQSFIHRDLKSSNILLDDDFRAKVS
DFGLVKLAPDKERSVATRLAGTFGYLAPEYAVTGKVTTKIDVFSFGVVLMELVTGLTALD
EHRSEETRYLVEWFWQIKSNKENLLASVDPALDVKEDIHKSICTMAELAGHCTARDPNHR
PDMSHVVNVLGQLVESWKPVEESDDYSGIDYSLPLPEMLKDWQDEDTGDFTSTSQDSRGS
IPAKPNGFADSFTSNDAR*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400015087
Transcript Infomation

pacid=37453083 locus=PGSC0003DMG400005896 ID=PGSC0003DMT400015087.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTGTGTATATAAGTATTGTGATTTCAGAGGTGTTGTTATATACTTTTGTACATTAGGT
GTATTTCTTGTAAATGTTGTTTCTGGTGTAACAAATTTGAATGATTTCAAGATTTTGAGT
GATTTTAGAAATGGATTAGAGAATCCTGAACTATTGAAATGGCCTTCCAAGGGGAATGAT
CCTTGTGGTCCTCCTGCATGGCCTCATGTGTTCTGTTCTAGTGACAGAGTTACCCAAATT
CAGGTTCAGAGTTTGGGTTTAAAGGGTCCTTTACCTCAGAACTTGAATCAACTTGATAAG
CTTCAAAATCTTGGCCTTCAGGGGAATGGTTTTAGTGGGAAATTACCTACTTTCAATGGA
TTATCTGATTTGAAATATGCATACTTGGACAACAATGAATTCGATACGATTCCTGGTGAT
TTCTTTAATGGTCTTAGCAGTGTTCAAGTTTTGGCTTTGGATTATAATCCGTTTAATGAG
AGTGGATGGTCTATTCCGATTGAGTTGCAAGATTCAGCTCAGTTGACGAATTTTTCTTGT
GTGCAATGCAATATAGTTGGACCTGTGCCTGATTTTTTTGGGAAATTGCCTTCACTAAGT
GCGTTGAAGCTGTCGTATAATCGTTTGACCGGTGAGATACCAGACAGTTTTCGTGATTCA
ATGCTTCGGATTTTGTGGTTGAATAATCAAGATAGTCCTGGAATGACGGGTCCAATCGAC
TTAATTGGTACTATGGATCAGCTTATGTTGTTATGGCTTCAAGGCAACAGTTTTAGTGGA
CCAATTCCTGATACAATTGATGATTTAAATGACTTGAAGGAGCTGAATTTTAACGGAAAT
CAACTCGTTGGTCTGATTCCGCAAGGTTTGGCAAATCTAGACTTGAGTGTGTTAGACTTG
AACAATAATAAGCTCATGGGTCCTATCCCAAAGTTTAGAGCTGCGAATGCTACATATTCC
TCAAATTCTTTCTGTCAGCCAACTCCTGGTGTTCCTTGTGTTCCTCAAGTTAATGCACTT
TTAGATCTTCTTTGCGGTTGGAATTATCCAGCCAACCTTGCTCCTGAATGGAGTGGCAAT
GATCCATGTACAGGTCCTTGGTTGGGAATCAGTTGCAATCCTAAAGGCCAGATTACGATT
GTTAATCTACAGAACAAGAACCTTACGGGTACGCTTAGCCCTTCACTTGCAAACTTGGAT
TCACTGCTTGAAGTTCACTTAAAAAGAAATAGTTTGCATGGTCGAGTTCCTGCAAACTTA
ACAGAGCTCAGATCCTTGAGATTGTTGGACTTAAGTGGGAACAATTTTGATCCACCATTA
CCGAAATTCCGGGATAGTGTGAAAGTCATTACAGACGGAAATGCTCATCTTGTTGCTAAT
GTAACTGCGGCAGCTCCTCCTCTGAGTATTAGCCCATTTCCTCCATTGAGCCACAGTCCT
AAATCAAGCAAGGAGTTACCATCGAAAAGCCCATTTCCCGGTGATAATCAGCCAACATTA
CCAGATACACCGCCCTCCCCAGAGAAAAGTTCAGGTTCAGACTCAAAGTCTCCCAGTGGA
ACCAAAGGGCAGACCACATCAGAGAACCATGATAAGACCATGATCATTGTAGTTGTGAGT
GCAGCTTCTTTCGTTTTCACTCTTCTTGCCGTTGTTTTGTATTTCAAGAGCAAGAGAAAA
CGAGAGAAGGATTCAGGTACTATTGTTATCCACCCCAAAGAGCCATTCGATCAAGATAAC
ATTGTTAAGATCACTATCTTAGAAGATCCCATGATGTACAGCTTACAGAGTGGTACTACA
ACAACTACTACAACTAGTGGTGGAACAAAAGGTAGTCGAGTGATTGAGATTGGAAACCTT
GTCATTTCAACCCAGGACCTTCGGAGGGTAACCGATAATTTTGCACCAGAGAATGAGCTT
GGTCGTGGTGGCTTTGGAGTTGTTTACAAAGGCGTAATTGAAGATGGAATTCAAATTGCA
GTGAAGAGAATGGAATCTGCCATTATCAACAGCAAGGCATTGGATGAATTTCAAGCAGAA
ATAGCTGTGCTTTCTAAGGTTCGACATCGCCATTTAGTTTCACTTTTGGGTTATTCCATT
GAAGGAAATGAGAGGCTTTTGGTATATGAATATATGTCAAAGGGCGCTTTGAGTAGACAT
CTTTTTCGCTGGAAGATCCTGAACTTAGAGCCTTTATCGTGGACAAAGAGACTCAATATT
GCTCTAGATGTCGCTCGAGGGATGGAGTACCTTCATAATCTGGCACACCAGAGCTTCATA
CATCGCGATCTCAAATCATCAAACATTCTTCTAGATGATGATTTTAGAGCAAAAGTTTCT
GATTTTGGATTAGTGAAACTCGCTCCTGACAAAGAAAGGTCCGTTGCAACAAGGCTTGCA
GGAACATTTGGATACCTTGCTCCCGAGTATGCTGTGACCGGAAAAGTCACAACTAAAATA
GATGTCTTCAGCTTTGGGGTGGTGTTGATGGAACTTGTGACTGGACTAACTGCCCTTGAT
GAGCATCGGTCCGAGGAAACTCGATATCTAGTTGAGTGGTTCTGGCAGATAAAATCGAAT
AAAGAAAACCTCCTTGCTTCCGTTGATCCAGCTCTTGACGTGAAGGAAGATATCCACAAG
AGCATTTGCACTATGGCTGAATTAGCTGGACATTGCACTGCGAGAGACCCCAATCACAGG
CCTGACATGTCACACGTTGTGAATGTGCTTGGCCAACTAGTTGAGTCTTGGAAACCCGTA
GAAGAGTCGGATGACTATTCAGGAATTGACTACAGTCTACCTCTTCCAGAAATGTTGAAG
GACTGGCAGGATGAAGACACTGGAGACTTCACCAGTACTAGTCAAGATAGCAGAGGAAGT
ATTCCTGCTAAGCCAAATGGATTTGCGGATTCTTTTACATCCAACGATGCTCGATAG