Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400015038
CDS Infomation

pacid=37467963 polypeptide=PGSC0003DMP400010402 locus=PGSC0003DMG400005869 ID=PGSC0003DMT400015038.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCACTGCCCATTAACCCAACCTTCAATCCTCACACCCCTGGCCCTGGCACCTCT
AAACCCAATTCATTTCAGAAATTCCCACAGACCCATTTCATATCATACCAAGAAGATGGC
ACAAATGAAAAATTTCTCAATAAATCTCACTACTTCAAGCTCCTTGGGTCTCTATGCAAA
GAGGGTAAACTTCAAGAAGCTGTGGACTTTCTTAAGGAAATGGAGTATGGGAATTTATAT
GTTGGACCTGAGTTCTATGGTGAACTCCTCCAAGGCTGTGTCTATGAGAGAAACCAAAAA
TTGGGTAAGCAAATTCATGCCAAGATTCTAAAAAGGGGTGATTTTTTTGCCAGGAATGAG
TACATTGAGACAAAGCTTGTTATTTTTTATGCAAAATGTGATGTTTTTGATGTTTCCAAT
CATTTGTTTTGCAGACTGAGAAAACAGAATGTGTTTTCTTGGGCTGCAATTATTGGACTA
CATTGTAGGATGAATTTGTCTAAAGAAGCTTTGTTGAAATACATTGAAATGCTTGAAAGT
GGGATTCTTGGTGACAATTTTGTTCTCCCAAATGTATTGAAAGCTTGTGGTGCTTTGAAT
TTTGTTGAATTTGGGAAATGTGTACATGGGCATGTCTTGAAATTAAGTTATGAAGATTGT
GTATTTGTGGCTAGTAGTCTTATTGACATGTATGGGAAATGTGGGGTTTTGGATGATGCA
CGGAAGGTGTTTGATTGTATGTGTGAAAGAAACGTAGTTGCATGGAACTCGCTAATCGTA
AGTTATATGCAAAATGGATTCAGTGAGGAAGCTATTGGAGTCTTCTATGATATGAGAACT
GAAGAAATTGAACCAACTCATGTAACTCTGTCGAGTTTTCTTTCGGCTTCAGCCAATTTA
TGTGCTCTACAAGAAGGTAAGCAAGGCCATGCTATATCTATCGTGAGTGGATTAGATTTG
AATAACATATTGGGGAGCTCACTTATAAACTTTTATGCTAAAGTTGGTTTGGTTAATGAT
GCTGAGCTAATATTTGATAGGCTGTTTGAGAAAGATGTAGTAACATGGAACTTGCTGATG
TCTTGTTATGTACAATCTGGTAAAATTGACAAGGCTCTCAACTTGTCCCGTTGGATGAGA
TTAAAAGGTTTTAGGTTTGACTCCGTGACACTATCAACAATATTATCAGCCTCAGCAGAA
TTAAGGGATTTGAAACTTGGCAGAGAAGGGCATTGTTTTTGTATCAGAAACAATTTTGAG
GATGACATAGTTGTAGCAAGTGGTATTATAAATATGTACTCCAAATGTGAGAAAATCCCA
GATGCAAGACGGGTTTTTGACTACACAATGGAGAAAGATCTAGTCTTGTGGAATACATTA
TTGGCTGCTTATGCAGAAGTGGGTTTGAGTGGTGAGTCATTAAGATTATTTTACCAGATG
CAGCTTTATGGTTTACAACAAAATACCATATCTTGGAATTCTGTAATTCTTGGATTCTTA
AGAAATGGACAGATAAATGAGGCCATAGACATGTTTACACAAATGAAAACTGTTGGTTTA
GACCCTAACACGGTTACTTATACTACTCTTATCAGTGGTCTATCACAAAATGGTCACAAC
AGTGAGGCACTTACATATTTTAAGCAACTGCTTCAAGCAGGGTATCGACCAAATAGTGCA
AGTATTGTTGCCGCCCTCTCAGCCTCTACAAATATGGCGTCACTGCATGACGGAAGAGCC
ATTCATGGATACATTTTAAGGCAAAAGATTCCATTATCTCTTCCAGTAGCAACTTCATTA
GTTGATATGTATACTAAATGTGGAAGTCTAAATTGTGCAAAATGCATTTTTGATTTGATT
CCAGAAAAGGAGTTGGCGTTGTATAATGCTATGATATCTGGTTATGCTTTACATGGCCGT
GCTATTGAAGCACTTGCATTGTTCAAACGTCTGTGCAAGGAAGGCGTGGAACCAGACAGC
ATAACCTTCACCAGTGTGCTATCCTCTTGTTGTCATGCTGGACTGATAAAAGAAGGCTTA
GACGTTTTTTATGACATGCTCTCTGTGTATCATATGAAGCCAAGAGTGGAACATTATGGT
TGTATGATCACTCTTCTCTCTAGGTGTGGTGATCTCGATGAAGCTATGCAGCTCATTCAG
AGTATGCCTTTCAAACCTGATGCAAATGTTTTTGAATCACTGCTTGTGGCTTGTAGAGAA
CTCAGAGAGACAGAACTCGAGGAGCGTATAGCTAATTGTTTAATTAAGATGGAACCGGAT
AATTCAGGACACTATGTGTCACTTTCAAATGCATATGCAACAACTGGAAGATGGGATGAA
GTCTCAAAACTGAGGGATTTGATGAAGAAAAAGGGTCTTAGGAAGAGACCTGGATGCAGT
TGGATTCAGGTTGGAACAGAATTTCATATGTTTGTTTCAGGAGACAAGTGGCATTCGCAC
ACAGAGGAAATAAGTACAATGTTGGCTTTGCTGGATAGGGAAATGCAGCTTACTAGATTC
TTTTTCAACAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010402
PEP Infomation

pacid=37467963 transcript=PGSC0003DMT400015038 locus=PGSC0003DMG400005869 ID=PGSC0003DMT400015038.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASLPINPTFNPHTPGPGTSKPNSFQKFPQTHFISYQEDGTNEKFLNKSHYFKLLGSLCK
EGKLQEAVDFLKEMEYGNLYVGPEFYGELLQGCVYERNQKLGKQIHAKILKRGDFFARNE
YIETKLVIFYAKCDVFDVSNHLFCRLRKQNVFSWAAIIGLHCRMNLSKEALLKYIEMLES
GILGDNFVLPNVLKACGALNFVEFGKCVHGHVLKLSYEDCVFVASSLIDMYGKCGVLDDA
RKVFDCMCERNVVAWNSLIVSYMQNGFSEEAIGVFYDMRTEEIEPTHVTLSSFLSASANL
CALQEGKQGHAISIVSGLDLNNILGSSLINFYAKVGLVNDAELIFDRLFEKDVVTWNLLM
SCYVQSGKIDKALNLSRWMRLKGFRFDSVTLSTILSASAELRDLKLGREGHCFCIRNNFE
DDIVVASGIINMYSKCEKIPDARRVFDYTMEKDLVLWNTLLAAYAEVGLSGESLRLFYQM
QLYGLQQNTISWNSVILGFLRNGQINEAIDMFTQMKTVGLDPNTVTYTTLISGLSQNGHN
SEALTYFKQLLQAGYRPNSASIVAALSASTNMASLHDGRAIHGYILRQKIPLSLPVATSL
VDMYTKCGSLNCAKCIFDLIPEKELALYNAMISGYALHGRAIEALALFKRLCKEGVEPDS
ITFTSVLSSCCHAGLIKEGLDVFYDMLSVYHMKPRVEHYGCMITLLSRCGDLDEAMQLIQ
SMPFKPDANVFESLLVACRELRETELEERIANCLIKMEPDNSGHYVSLSNAYATTGRWDE
VSKLRDLMKKKGLRKRPGCSWIQVGTEFHMFVSGDKWHSHTEEISTMLALLDREMQLTRF
FFNN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400015038
Transcript Infomation

pacid=37467963 locus=PGSC0003DMG400005869 ID=PGSC0003DMT400015038.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCTTCACTGCCCATTAACCCAACCTTCAATCCTCACACCCCTGGCCCTGGCACCTCT
AAACCCAATTCATTTCAGAAATTCCCACAGACCCATTTCATATCATACCAAGAAGATGGC
ACAAATGAAAAATTTCTCAATAAATCTCACTACTTCAAGCTCCTTGGGTCTCTATGCAAA
GAGGGTAAACTTCAAGAAGCTGTGGACTTTCTTAAGGAAATGGAGTATGGGAATTTATAT
GTTGGACCTGAGTTCTATGGTGAACTCCTCCAAGGCTGTGTCTATGAGAGAAACCAAAAA
TTGGGTAAGCAAATTCATGCCAAGATTCTAAAAAGGGGTGATTTTTTTGCCAGGAATGAG
TACATTGAGACAAAGCTTGTTATTTTTTATGCAAAATGTGATGTTTTTGATGTTTCCAAT
CATTTGTTTTGCAGACTGAGAAAACAGAATGTGTTTTCTTGGGCTGCAATTATTGGACTA
CATTGTAGGATGAATTTGTCTAAAGAAGCTTTGTTGAAATACATTGAAATGCTTGAAAGT
GGGATTCTTGGTGACAATTTTGTTCTCCCAAATGTATTGAAAGCTTGTGGTGCTTTGAAT
TTTGTTGAATTTGGGAAATGTGTACATGGGCATGTCTTGAAATTAAGTTATGAAGATTGT
GTATTTGTGGCTAGTAGTCTTATTGACATGTATGGGAAATGTGGGGTTTTGGATGATGCA
CGGAAGGTGTTTGATTGTATGTGTGAAAGAAACGTAGTTGCATGGAACTCGCTAATCGTA
AGTTATATGCAAAATGGATTCAGTGAGGAAGCTATTGGAGTCTTCTATGATATGAGAACT
GAAGAAATTGAACCAACTCATGTAACTCTGTCGAGTTTTCTTTCGGCTTCAGCCAATTTA
TGTGCTCTACAAGAAGGTAAGCAAGGCCATGCTATATCTATCGTGAGTGGATTAGATTTG
AATAACATATTGGGGAGCTCACTTATAAACTTTTATGCTAAAGTTGGTTTGGTTAATGAT
GCTGAGCTAATATTTGATAGGCTGTTTGAGAAAGATGTAGTAACATGGAACTTGCTGATG
TCTTGTTATGTACAATCTGGTAAAATTGACAAGGCTCTCAACTTGTCCCGTTGGATGAGA
TTAAAAGGTTTTAGGTTTGACTCCGTGACACTATCAACAATATTATCAGCCTCAGCAGAA
TTAAGGGATTTGAAACTTGGCAGAGAAGGGCATTGTTTTTGTATCAGAAACAATTTTGAG
GATGACATAGTTGTAGCAAGTGGTATTATAAATATGTACTCCAAATGTGAGAAAATCCCA
GATGCAAGACGGGTTTTTGACTACACAATGGAGAAAGATCTAGTCTTGTGGAATACATTA
TTGGCTGCTTATGCAGAAGTGGGTTTGAGTGGTGAGTCATTAAGATTATTTTACCAGATG
CAGCTTTATGGTTTACAACAAAATACCATATCTTGGAATTCTGTAATTCTTGGATTCTTA
AGAAATGGACAGATAAATGAGGCCATAGACATGTTTACACAAATGAAAACTGTTGGTTTA
GACCCTAACACGGTTACTTATACTACTCTTATCAGTGGTCTATCACAAAATGGTCACAAC
AGTGAGGCACTTACATATTTTAAGCAACTGCTTCAAGCAGGGTATCGACCAAATAGTGCA
AGTATTGTTGCCGCCCTCTCAGCCTCTACAAATATGGCGTCACTGCATGACGGAAGAGCC
ATTCATGGATACATTTTAAGGCAAAAGATTCCATTATCTCTTCCAGTAGCAACTTCATTA
GTTGATATGTATACTAAATGTGGAAGTCTAAATTGTGCAAAATGCATTTTTGATTTGATT
CCAGAAAAGGAGTTGGCGTTGTATAATGCTATGATATCTGGTTATGCTTTACATGGCCGT
GCTATTGAAGCACTTGCATTGTTCAAACGTCTGTGCAAGGAAGGCGTGGAACCAGACAGC
ATAACCTTCACCAGTGTGCTATCCTCTTGTTGTCATGCTGGACTGATAAAAGAAGGCTTA
GACGTTTTTTATGACATGCTCTCTGTGTATCATATGAAGCCAAGAGTGGAACATTATGGT
TGTATGATCACTCTTCTCTCTAGGTGTGGTGATCTCGATGAAGCTATGCAGCTCATTCAG
AGTATGCCTTTCAAACCTGATGCAAATGTTTTTGAATCACTGCTTGTGGCTTGTAGAGAA
CTCAGAGAGACAGAACTCGAGGAGCGTATAGCTAATTGTTTAATTAAGATGGAACCGGAT
AATTCAGGACACTATGTGTCACTTTCAAATGCATATGCAACAACTGGAAGATGGGATGAA
GTCTCAAAACTGAGGGATTTGATGAAGAAAAAGGGTCTTAGGAAGAGACCTGGATGCAGT
TGGATTCAGGTTGGAACAGAATTTCATATGTTTGTTTCAGGAGACAAGTGGCATTCGCAC
ACAGAGGAAATAAGTACAATGTTGGCTTTGCTGGATAGGGAAATGCAGCTTACTAGATTC
TTTTTCAACAACTGA