Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400014815
CDS Infomation

pacid=37471207 polypeptide=PGSC0003DMP400010255 locus=PGSC0003DMG400005783 ID=PGSC0003DMT400014815.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTCCACCACAATCTCCAAATTCATCTAGAGATCAAGTTCGTCCTTTGGCACCTTCA
TCCCATCGTATACACACCGAAAATGAAGAAGGTGTTAATTACACGTCTACATCCAGTATA
GAGTTATCAAAGAAGCAACGTCGTAGGAAGAGGTGTATAAAATGTTGTGGTTGTTGTGGT
ATCACGACGATAATCATAGGTATCGTTATCTTGATCCTCGCGCTCACGGTTTTCAAGGTG
AAAGATCCAACGATAAGGATGAACTCGATCCGATTCGAGGGGTTGAGTTCCCTTACTAGT
AGTTCCAATCTTCAAACCAATATGAATATTACAGTTTCTGCTGATATTTCTATTAAAAAT
CCTAATGCGGTCTCGTTTAAGTTTAAGCCTGCGACTGCTAGTTTGATTTATAGCGATAGA
ATCATCGCGGAAGCCATGCTTCCACGAGGGTCCGCTAGGGCTCGACGGACGTTTAGTATG
AACGTGAAAGTCATGGTTATGGTTGAAAAATTAATCGTGATTCCTCGATTAACGATTGAT
TTGATAGCGGGGGAATTGCCGGTAAGTATGTCCACTAATATTAATGGAAAGGTTAATTTA
GGTGTGATTAAGAAGAGTGTTGATATAAGGATGAATTGTAATATGGTGGTAGATTTACAA
AGGCAAGATGTTAAGGATATTGATTGTGAGAGGAAAGTTTCTCTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010255
PEP Infomation

pacid=37471207 transcript=PGSC0003DMT400014815 locus=PGSC0003DMG400005783 ID=PGSC0003DMT400014815.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MSPPQSPNSSRDQVRPLAPSSHRIHTENEEGVNYTSTSSIELSKKQRRRKRCIKCCGCCG
ITTIIIGIVILILALTVFKVKDPTIRMNSIRFEGLSSLTSSSNLQTNMNITVSADISIKN
PNAVSFKFKPATASLIYSDRIIAEAMLPRGSARARRTFSMNVKVMVMVEKLIVIPRLTID
LIAGELPVSMSTNINGKVNLGVIKKSVDIRMNCNMVVDLQRQDVKDIDCERKVSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400014815
Transcript Infomation

pacid=37471207 locus=PGSC0003DMG400005783 ID=PGSC0003DMT400014815.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGTCTCCACCACAATCTCCAAATTCATCTAGAGATCAAGTTCGTCCTTTGGCACCTTCA
TCCCATCGTATACACACCGAAAATGAAGAAGGTGTTAATTACACGTCTACATCCAGTATA
GAGTTATCAAAGAAGCAACGTCGTAGGAAGAGGTGTATAAAATGTTGTGGTTGTTGTGGT
ATCACGACGATAATCATAGGTATCGTTATCTTGATCCTCGCGCTCACGGTTTTCAAGGTG
AAAGATCCAACGATAAGGATGAACTCGATCCGATTCGAGGGGTTGAGTTCCCTTACTAGT
AGTTCCAATCTTCAAACCAATATGAATATTACAGTTTCTGCTGATATTTCTATTAAAAAT
CCTAATGCGGTCTCGTTTAAGTTTAAGCCTGCGACTGCTAGTTTGATTTATAGCGATAGA
ATCATCGCGGAAGCCATGCTTCCACGAGGGTCCGCTAGGGCTCGACGGACGTTTAGTATG
AACGTGAAAGTCATGGTTATGGTTGAAAAATTAATCGTGATTCCTCGATTAACGATTGAT
TTGATAGCGGGGGAATTGCCGGTAAGTATGTCCACTAATATTAATGGAAAGGTTAATTTA
GGTGTGATTAAGAAGAGTGTTGATATAAGGATGAATTGTAATATGGTGGTAGATTTACAA
AGGCAAGATGTTAAGGATATTGATTGTGAGAGGAAAGTTTCTCTTTAG