Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400014752
CDS Infomation

pacid=37460592 polypeptide=PGSC0003DMP400010213 locus=PGSC0003DMG400005750 ID=PGSC0003DMT400014752.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATAACTTTATCTGATTTCTACCATGTTATGACTGCTGTTGTGCCACTTTATGTAGCT
ATGATACTAGCTTATGGCTCTGTTAAGTGGTGGAAGATTTTCTCACCAGATCAGTGTTCT
GGAATCAACAGATTTGTTGCACTTTTTGCAGTTCCACTTCTATCTTTTCACTTTATAGCT
GCTAATAATCCTTACACTATGAACATAAGATTCATTGCTGCAGATACTCTGCAGAAACTT
ATTGTTCTTGGGGTTCTTGCTGTTTGGGCTAATGTAAGCAAAAGGGGTAGTTTGGAATGG
AGTATAACTCTTTTTTCACTATCAACTCTTCCAAATACTTTAGTTATGGGTATTCCTTTG
TTAAAAGGAATGTATGGTGAATTCTCTGGGAGTTTAATGGTGCAAATTGTTGTATTACAG
TGTATCATTTGGTACACTTTGATGCTTTTTATGTTTGAGTTTAGAGGTGCAAGATTGCTA
ATTTCTGAGCAATTTCCTGATACTGCTGGTTCAATTGTATCTATTCATGTTGATTCTGAT
GTCATGTCATTAGATGGTAGACAAGTTTTAGAGACTGAAGCAGAGTTAAAAGAAGATGGA
AAGCTTCATGTTACTGTTAGAAAATCAAATGCCTCAAGGTCTGACATATTTTCAAGAAGG
TCAGGAGGATTTTCTTCTACTACACCAAGACCATCCAATTTGACAAATGCAGAGATTTAC
TCTCTCCAGTCATCAAGAAATCCAACACCAAGAGGATCTAGTTTTAATCATACTGATTTT
TACTCAATGGTGGCTGGTACTGCTGGGAGAAACTCAAACTTTGGTGCTAATGATGTTTAT
GGTATGTCTAATAATTCAAGAGGGCCAACTCCAAGACCTTCAAATTATGAGGAAGAAAGT
GGGAAGTCAAGATTCAATAATTATCTTGGTGGAGCAGCAGCACCAGCACCAACACAGAGT
AATAGTAACACTAATTATCCAGCACCAAATCCTGGCATGTTTTCACCTAGTAATAATGGT
ACCAAAGCACACAAGAATACAGCTAAAAAAGGAGATCAAGAAGGTGGCAAGGATCTTCAT
ATGTTTGTTTGGAGTTCAAGTAACTCTCCTGTTTCTGATGTTTTTGGAGGACATGATTAT
ACAGCTAATTTAGACCAGCCTGCAGCACCTAATAAGGATGTGAGAGTACCTATCTCCCCT
GGAAAAGTTGAGGGGCAAAGGAACAATAATCAAGAAAACTACATGGAGAGAGATGATTTC
AGCTTTGCAAATAGAGATGGAGCTGATCAAATGAACAATCAAGATGGTGAAAAAGCTGGA
GAAAACAAAGCAAAAGTAATGCCACCAACAAGTGTAATGACTAGGCTCATACTCATCATG
GTTTGGAGGAAACTTATTAGGAATCCAAACACTTATTCAAGCTTGTTTGGTCTCACTTGG
TCTCTAGTTTCATTCAGGTGGAATTTGAAGATGCCTGCTATAATTGCACAGTCCATATCT
ATACTGTCAGATGCAGGACTTGGCATGGCAATGTTCAGTCTTGGTCTGTTCATGGCTTTG
CAACCAAGGATCATAGCATGTGGAAATTCTGTTGCATCTTTTGCTATGGCTGTGAGATTC
CTTACAGGTCCAGCTGTTATGGCAGCTGCTTCCATTGCTGTTGGTCTTCGTGGAACTCTA
TTACACGTGGCAATTGTACAGGCAGCTCTACCACAAGGAATTGTTCCTTTTGTCTTCGCT
AAGGAATACAACGTTCATCCTGACATTCTTAGCACAGGTGTCATTTTTGGGATGTTGATT
GCCTTGCCGATTACATTGGTGTATTACATATTTATGGGACTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010213
PEP Infomation

pacid=37460592 transcript=PGSC0003DMT400014752 locus=PGSC0003DMG400005750 ID=PGSC0003DMT400014752.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MITLSDFYHVMTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIA
ANNPYTMNIRFIAADTLQKLIVLGVLAVWANVSKRGSLEWSITLFSLSTLPNTLVMGIPL
LKGMYGEFSGSLMVQIVVLQCIIWYTLMLFMFEFRGARLLISEQFPDTAGSIVSIHVDSD
VMSLDGRQVLETEAELKEDGKLHVTVRKSNASRSDIFSRRSGGFSSTTPRPSNLTNAEIY
SLQSSRNPTPRGSSFNHTDFYSMVAGTAGRNSNFGANDVYGMSNNSRGPTPRPSNYEEES
GKSRFNNYLGGAAAPAPTQSNSNTNYPAPNPGMFSPSNNGTKAHKNTAKKGDQEGGKDLH
MFVWSSSNSPVSDVFGGHDYTANLDQPAAPNKDVRVPISPGKVEGQRNNNQENYMERDDF
SFANRDGADQMNNQDGEKAGENKAKVMPPTSVMTRLILIMVWRKLIRNPNTYSSLFGLTW
SLVSFRWNLKMPAIIAQSISILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPRIIACGNSVASFAMAVRF
LTGPAVMAAASIAVGLRGTLLHVAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTGVIFGMLI
ALPITLVYYIFMGL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400014752
Transcript Infomation

pacid=37460592 locus=PGSC0003DMG400005750 ID=PGSC0003DMT400014752.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGATAACTTTATCTGATTTCTACCATGTTATGACTGCTGTTGTGCCACTTTATGTAGCT
ATGATACTAGCTTATGGCTCTGTTAAGTGGTGGAAGATTTTCTCACCAGATCAGTGTTCT
GGAATCAACAGATTTGTTGCACTTTTTGCAGTTCCACTTCTATCTTTTCACTTTATAGCT
GCTAATAATCCTTACACTATGAACATAAGATTCATTGCTGCAGATACTCTGCAGAAACTT
ATTGTTCTTGGGGTTCTTGCTGTTTGGGCTAATGTAAGCAAAAGGGGTAGTTTGGAATGG
AGTATAACTCTTTTTTCACTATCAACTCTTCCAAATACTTTAGTTATGGGTATTCCTTTG
TTAAAAGGAATGTATGGTGAATTCTCTGGGAGTTTAATGGTGCAAATTGTTGTATTACAG
TGTATCATTTGGTACACTTTGATGCTTTTTATGTTTGAGTTTAGAGGTGCAAGATTGCTA
ATTTCTGAGCAATTTCCTGATACTGCTGGTTCAATTGTATCTATTCATGTTGATTCTGAT
GTCATGTCATTAGATGGTAGACAAGTTTTAGAGACTGAAGCAGAGTTAAAAGAAGATGGA
AAGCTTCATGTTACTGTTAGAAAATCAAATGCCTCAAGGTCTGACATATTTTCAAGAAGG
TCAGGAGGATTTTCTTCTACTACACCAAGACCATCCAATTTGACAAATGCAGAGATTTAC
TCTCTCCAGTCATCAAGAAATCCAACACCAAGAGGATCTAGTTTTAATCATACTGATTTT
TACTCAATGGTGGCTGGTACTGCTGGGAGAAACTCAAACTTTGGTGCTAATGATGTTTAT
GGTATGTCTAATAATTCAAGAGGGCCAACTCCAAGACCTTCAAATTATGAGGAAGAAAGT
GGGAAGTCAAGATTCAATAATTATCTTGGTGGAGCAGCAGCACCAGCACCAACACAGAGT
AATAGTAACACTAATTATCCAGCACCAAATCCTGGCATGTTTTCACCTAGTAATAATGGT
ACCAAAGCACACAAGAATACAGCTAAAAAAGGAGATCAAGAAGGTGGCAAGGATCTTCAT
ATGTTTGTTTGGAGTTCAAGTAACTCTCCTGTTTCTGATGTTTTTGGAGGACATGATTAT
ACAGCTAATTTAGACCAGCCTGCAGCACCTAATAAGGATGTGAGAGTACCTATCTCCCCT
GGAAAAGTTGAGGGGCAAAGGAACAATAATCAAGAAAACTACATGGAGAGAGATGATTTC
AGCTTTGCAAATAGAGATGGAGCTGATCAAATGAACAATCAAGATGGTGAAAAAGCTGGA
GAAAACAAAGCAAAAGTAATGCCACCAACAAGTGTAATGACTAGGCTCATACTCATCATG
GTTTGGAGGAAACTTATTAGGAATCCAAACACTTATTCAAGCTTGTTTGGTCTCACTTGG
TCTCTAGTTTCATTCAGGTGGAATTTGAAGATGCCTGCTATAATTGCACAGTCCATATCT
ATACTGTCAGATGCAGGACTTGGCATGGCAATGTTCAGTCTTGGTCTGTTCATGGCTTTG
CAACCAAGGATCATAGCATGTGGAAATTCTGTTGCATCTTTTGCTATGGCTGTGAGATTC
CTTACAGGTCCAGCTGTTATGGCAGCTGCTTCCATTGCTGTTGGTCTTCGTGGAACTCTA
TTACACGTGGCAATTGTACAGGCAGCTCTACCACAAGGAATTGTTCCTTTTGTCTTCGCT
AAGGAATACAACGTTCATCCTGACATTCTTAGCACAGGTGTCATTTTTGGGATGTTGATT
GCCTTGCCGATTACATTGGTGTATTACATATTTATGGGACTTTGA