Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400014702
CDS Infomation

pacid=37461787 polypeptide=PGSC0003DMP400010182 locus=PGSC0003DMG400005736 ID=PGSC0003DMT400014702.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGCTTCAGAAGATTGCACAGCACCTGTTCGCGTTTACTACTGAATGAACCGGCGAGC
CATCTCAAAGCAGAATTGCCACGCACCAAATTAGCTGGCGGTGAACCACCGGCGAAGTCA
GCGAAAGTCAGTAGCTCAGATATTGTGCAATGGAACAGGTCTATCACCCAACACATGCGA
CAAGGAGAATGCGATTCCGCATTGAGCTTATTCAATTCTATGCCAGCAAAGTCCAGTGTA
TCCTGGAACGCAATGCTTTCTGGGTATTTGTTGAATGGCAAATTGGACCTCGCTCAGAAG
CTGTTCGACGAAATGCCTCAGAGAGATTTGGTATCCTGGAACATTATGCTTAGTGGGTAT
ATCAAGAATAAGAATTTTAGGGCAGCTAGGATTTTGTTTGATCAAATGCCTGTTAAAGAT
GTAGTGTCGTGGAATGCATTGCTTTCCGGGTATGCCCAGAATGGGTACGTTGATGATGCT
AGAAGGATCTTTCTCATGATGCCCGTGAAGAATGAGATCTCTTGGAATGGACTTCTCGCT
ACGTATGTTCAGAATGGGAGGATTGAGGAGGCTAGGAAATTGTTTGAGTCAAAGGATAAT
TGGTCGTTGGTTTCTTGGAATTGCTTGTTGGGTGGGTATTTGAGAAAGAAGATGCTGGCT
GAGGCAAAGGTGCTTTTCGATAAAATGCCTGTCAAGGATCAGGTGTCATGGAACACGATA
ATTTCTTGTTATGCCCAGAGTGATGATTTCGAGGAAGCGAGGAGGTTATTCGATGAGTCC
CCTATTAAGGATGTGTTTACCTGGACTTCATTGCTTTCTGGTTATGTACAGAATAGGATG
GTAGATGAAGCTAGGAGGATCTTCGATGAGATGCCAGAGAAGAATGAGGTTTCTTGGAAT
GCAATGATTGCAGGATATGTTCAGTCTAAAAGGATGGACTTGGCGAGGGAATTCTTTGAG
GCAATGCCTTGTAAAAACATCAGCTCTTGGAATACAATGATAACAGGTTATGCTCAAATT
GGGGATATAACTCATGCCAGAAGTTTGTTTGATTGTATGCCTAACCGTGATTGCATCTCT
TGGGCAGCAATTATTGCTGGGTATGCTCAAAGTGGCAACAGTGAGGAAGCATTACTCATG
TTTGTTCAAATGAAGAGAGATGGTGGGAGGATAAATAGGTCGGCATTTACTTGTGTTTTG
AGTACATCTGCTGACATTGCTGCATTCGAGTTTGGAAAGCAAATACATGGACGACTTGTC
AAGGCTGGATATCACACTGGGTGTTATGTCGGAAATGCACTCCTATCAATGTACTGTAAG
TGTGGAAGTATTGATGAGGCATATGATGTGTTCGAGGAGATAGCGGAGAAGGATGCTGTC
TCTTGGAACACAATGATCATCGGTTATGCAAGGCATGGATTTGGCAAACAAGCTCTTAGA
CAATTCGAATCAATGAAAGAAGTGGGTATCAGGCCGGATGATGTCACCATGGTTGGTGTA
TTATCTGCTTGTGGCCATACCGGCTTGATTGACAAAGGCATGGAACACTTTTACTCAATG
GCTCGAGATTATGGAATAGTTACAAATCCCAGGCATTATACTTGCATGATTGACCTTTTG
GGTCGAGCTGGGCGACTGGATGATGCTCAAAATCTAATGAAGGATATGCCTTGTGAACCA
GATGCTGCAACCTGGGGTGCTCTCCTTGGGGCAAGTAGGATTCACGGAAACACTGAATTA
GGAGAAAAGGCCGCTGAAATGATTTTCAGATTAGAGCCTTGGAATGCCGGGATGTATGTC
CTTCTCTCAAATTTATATGCAGCCTCTGGCAGATGGCGTGACGTTAGCAAGATGAGATTA
AAAATGAGGGACACAGGAGTAAGGAAAATGCCTGGTTACAGCTGGGTTGAGGTGCAAAAT
CAGATACATCTTTTTTCAGTTGGGGATACAATGCATCCAGACAGCAAGAGAATATATGCT
TTCTTGGAAGAGTTAGAATTATTAATGAAGCAGGAAGGTTATGTCTCTGCCACGAAATTG
GTCCTGCATGATGTAGATGAGGAGGAGAAGGCACACATGCTCAAGTATCACAGCGAAAAA
TTAGCCGTTGCCTTTGCAATTCTAAATATACCATCTGGGAGAGCAATTCGTGTGATGAAA
AATTTAAGGGTTTGTGGAGATTGTCATACTGCAATCAAACTCATATCGAAGATTGTGGGT
AGATTAATTATTGTTCGGGATAGTAACCGTTTTCATCACTTCAGTGAAGGTGTTTGTACC
TGTGGAGACTATTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400010182
PEP Infomation

pacid=37461787 transcript=PGSC0003DMT400014702 locus=PGSC0003DMG400005736 ID=PGSC0003DMT400014702.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MRFRRLHSTCSRLLLNEPASHLKAELPRTKLAGGEPPAKSAKVSSSDIVQWNRSITQHMR
QGECDSALSLFNSMPAKSSVSWNAMLSGYLLNGKLDLAQKLFDEMPQRDLVSWNIMLSGY
IKNKNFRAARILFDQMPVKDVVSWNALLSGYAQNGYVDDARRIFLMMPVKNEISWNGLLA
TYVQNGRIEEARKLFESKDNWSLVSWNCLLGGYLRKKMLAEAKVLFDKMPVKDQVSWNTI
ISCYAQSDDFEEARRLFDESPIKDVFTWTSLLSGYVQNRMVDEARRIFDEMPEKNEVSWN
AMIAGYVQSKRMDLAREFFEAMPCKNISSWNTMITGYAQIGDITHARSLFDCMPNRDCIS
WAAIIAGYAQSGNSEEALLMFVQMKRDGGRINRSAFTCVLSTSADIAAFEFGKQIHGRLV
KAGYHTGCYVGNALLSMYCKCGSIDEAYDVFEEIAEKDAVSWNTMIIGYARHGFGKQALR
QFESMKEVGIRPDDVTMVGVLSACGHTGLIDKGMEHFYSMARDYGIVTNPRHYTCMIDLL
GRAGRLDDAQNLMKDMPCEPDAATWGALLGASRIHGNTELGEKAAEMIFRLEPWNAGMYV
LLSNLYAASGRWRDVSKMRLKMRDTGVRKMPGYSWVEVQNQIHLFSVGDTMHPDSKRIYA
FLEELELLMKQEGYVSATKLVLHDVDEEEKAHMLKYHSEKLAVAFAILNIPSGRAIRVMK
NLRVCGDCHTAIKLISKIVGRLIIVRDSNRFHHFSEGVCTCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400014702
Transcript Infomation

pacid=37461787 locus=PGSC0003DMG400005736 ID=PGSC0003DMT400014702.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGCGCTTCAGAAGATTGCACAGCACCTGTTCGCGTTTACTACTGAATGAACCGGCGAGC
CATCTCAAAGCAGAATTGCCACGCACCAAATTAGCTGGCGGTGAACCACCGGCGAAGTCA
GCGAAAGTCAGTAGCTCAGATATTGTGCAATGGAACAGGTCTATCACCCAACACATGCGA
CAAGGAGAATGCGATTCCGCATTGAGCTTATTCAATTCTATGCCAGCAAAGTCCAGTGTA
TCCTGGAACGCAATGCTTTCTGGGTATTTGTTGAATGGCAAATTGGACCTCGCTCAGAAG
CTGTTCGACGAAATGCCTCAGAGAGATTTGGTATCCTGGAACATTATGCTTAGTGGGTAT
ATCAAGAATAAGAATTTTAGGGCAGCTAGGATTTTGTTTGATCAAATGCCTGTTAAAGAT
GTAGTGTCGTGGAATGCATTGCTTTCCGGGTATGCCCAGAATGGGTACGTTGATGATGCT
AGAAGGATCTTTCTCATGATGCCCGTGAAGAATGAGATCTCTTGGAATGGACTTCTCGCT
ACGTATGTTCAGAATGGGAGGATTGAGGAGGCTAGGAAATTGTTTGAGTCAAAGGATAAT
TGGTCGTTGGTTTCTTGGAATTGCTTGTTGGGTGGGTATTTGAGAAAGAAGATGCTGGCT
GAGGCAAAGGTGCTTTTCGATAAAATGCCTGTCAAGGATCAGGTGTCATGGAACACGATA
ATTTCTTGTTATGCCCAGAGTGATGATTTCGAGGAAGCGAGGAGGTTATTCGATGAGTCC
CCTATTAAGGATGTGTTTACCTGGACTTCATTGCTTTCTGGTTATGTACAGAATAGGATG
GTAGATGAAGCTAGGAGGATCTTCGATGAGATGCCAGAGAAGAATGAGGTTTCTTGGAAT
GCAATGATTGCAGGATATGTTCAGTCTAAAAGGATGGACTTGGCGAGGGAATTCTTTGAG
GCAATGCCTTGTAAAAACATCAGCTCTTGGAATACAATGATAACAGGTTATGCTCAAATT
GGGGATATAACTCATGCCAGAAGTTTGTTTGATTGTATGCCTAACCGTGATTGCATCTCT
TGGGCAGCAATTATTGCTGGGTATGCTCAAAGTGGCAACAGTGAGGAAGCATTACTCATG
TTTGTTCAAATGAAGAGAGATGGTGGGAGGATAAATAGGTCGGCATTTACTTGTGTTTTG
AGTACATCTGCTGACATTGCTGCATTCGAGTTTGGAAAGCAAATACATGGACGACTTGTC
AAGGCTGGATATCACACTGGGTGTTATGTCGGAAATGCACTCCTATCAATGTACTGTAAG
TGTGGAAGTATTGATGAGGCATATGATGTGTTCGAGGAGATAGCGGAGAAGGATGCTGTC
TCTTGGAACACAATGATCATCGGTTATGCAAGGCATGGATTTGGCAAACAAGCTCTTAGA
CAATTCGAATCAATGAAAGAAGTGGGTATCAGGCCGGATGATGTCACCATGGTTGGTGTA
TTATCTGCTTGTGGCCATACCGGCTTGATTGACAAAGGCATGGAACACTTTTACTCAATG
GCTCGAGATTATGGAATAGTTACAAATCCCAGGCATTATACTTGCATGATTGACCTTTTG
GGTCGAGCTGGGCGACTGGATGATGCTCAAAATCTAATGAAGGATATGCCTTGTGAACCA
GATGCTGCAACCTGGGGTGCTCTCCTTGGGGCAAGTAGGATTCACGGAAACACTGAATTA
GGAGAAAAGGCCGCTGAAATGATTTTCAGATTAGAGCCTTGGAATGCCGGGATGTATGTC
CTTCTCTCAAATTTATATGCAGCCTCTGGCAGATGGCGTGACGTTAGCAAGATGAGATTA
AAAATGAGGGACACAGGAGTAAGGAAAATGCCTGGTTACAGCTGGGTTGAGGTGCAAAAT
CAGATACATCTTTTTTCAGTTGGGGATACAATGCATCCAGACAGCAAGAGAATATATGCT
TTCTTGGAAGAGTTAGAATTATTAATGAAGCAGGAAGGTTATGTCTCTGCCACGAAATTG
GTCCTGCATGATGTAGATGAGGAGGAGAAGGCACACATGCTCAAGTATCACAGCGAAAAA
TTAGCCGTTGCCTTTGCAATTCTAAATATACCATCTGGGAGAGCAATTCGTGTGATGAAA
AATTTAAGGGTTTGTGGAGATTGTCATACTGCAATCAAACTCATATCGAAGATTGTGGGT
AGATTAATTATTGTTCGGGATAGTAACCGTTTTCATCACTTCAGTGAAGGTGTTTGTACC
TGTGGAGACTATTGGTAG