Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400014431
CDS Infomation

pacid=37458886 polypeptide=PGSC0003DMP400009971 locus=PGSC0003DMG400005661 ID=PGSC0003DMT400014431.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCTGAATATGGAAAATCATCCTCTGTAAAAACTCCATTGATAGATGACCGAGAA
AAACAGAGTATTCTTGATGAAACAAGAAAAAATGGTGGTGGGTTTAGCAAGGAAGAGATT
GTTGATGAAGTGAAGAGGCAAGTATGGCTAGCAGGACCCTTAGTGAGCGTTAACCTTTTG
CAGTTTTCTTTACAGCTTATATCCATTATGTTTGTGGGTCATCTTGGAAAATTGCCCCTT
TCTGGTGCTTCCATGGCTAATTCCTTCACTTCTGTTACTGGTATCAGCCTTTTGATGGGG
ATGTCAAGTGCATTGGACACATTTTGTGGACAGTCTTATGGAGCAAAACAGTATCATATG
CTTGGCATTCACATGCAGAGAGCTATGATTGTACTTTCACTTGTAAGCGTACCTCTTGCA
GTAATCTGGGCAAACACTGGCCCTATTCTCAAGGTTTTAGGCCAAGATCCTAGTATATCT
GATGAAGCTGGTCAATATGCCTTGTATTTTATCCCCGGTGTTTTTGCTTACGGCTTGCTC
CAATGTGTTGTGAGATTTTTACAAACACAAAGTATTGTCATCCCTATGGTGTTATGTGCT
GGAGTTACAACCTTAATCCACGTTGTTGTCTGTTGGATTTTGGTCTTCAAGACTGGACTT
GGTGTCAAAGGAGCTGCTCTAGCAAATTCAATCTCTTACTGGCTTAACTTCTTGTTTTTG
GTTCTTTATATCAAGTTTTCTCCTTCATGTGCAAAAACTTGGACAGGACTGTCAAAAGAA
GCTTTGAAGGATATGCTTACTTTCCTTAGACTTGCGGTTCCCTCGGCCATCATGGTCTGC
TTAGAAATGTGGTCGTTTGAGCTAATGGTTCTGCTTTCTGGCCTCCTTCCAAATCCACAG
TTGGAAACGTCAGTGCTCTCAATCTGTCTTAATACAGCCGCAACAGTTTGGATGATCCCT
TTTGGGCTGAGTGGTGCTGTGAGTACACGGGTCTCAAATGAACTAGGAGCAGCTCATCCT
CAACTTGCACGTTTGGCGCTGTATGTTGTCTTAGCGGTGGCTGTTATTGAGGGGCTTGTG
TTGGGATTGGTCTTGATATTGATACGTAAAGTATGGGGATATGCTTACAGCAACGAAACT
GAAGTTGTTAAATACATAGCCATCATGATGCCACTTCTTGCAACATCAAATTTCTTGGAT
GGCCTTCAATGTGTTCTCTCAGGTGCTGTAAGAGGATTTGGATGGCAGAAAATTGGGGCA
ATTATTAACCTCGGATCCTATTATTTGGTGGGAATTCCTTGTGCTGTCTTGTTGGCCTTT
TATCTTCACATTGGTGGGAAGGGATTATGGTTGGGTATTATTTGTGCACTTCTAGTACAA
GTGTTGTCTCTTCTTTTCATTACCATACGCACCAACTGGGAACAAGAAGCAAAGAAGGCT
CAAGAGAGAGTGGAAGAAACAACATTACCCGCGGAGATAGTGTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400009971
PEP Infomation

pacid=37458886 transcript=PGSC0003DMT400014431 locus=PGSC0003DMG400005661 ID=PGSC0003DMT400014431.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEAEYGKSSSVKTPLIDDREKQSILDETRKNGGGFSKEEIVDEVKRQVWLAGPLVSVNLL
QFSLQLISIMFVGHLGKLPLSGASMANSFTSVTGISLLMGMSSALDTFCGQSYGAKQYHM
LGIHMQRAMIVLSLVSVPLAVIWANTGPILKVLGQDPSISDEAGQYALYFIPGVFAYGLL
QCVVRFLQTQSIVIPMVLCAGVTTLIHVVVCWILVFKTGLGVKGAALANSISYWLNFLFL
VLYIKFSPSCAKTWTGLSKEALKDMLTFLRLAVPSAIMVCLEMWSFELMVLLSGLLPNPQ
LETSVLSICLNTAATVWMIPFGLSGAVSTRVSNELGAAHPQLARLALYVVLAVAVIEGLV
LGLVLILIRKVWGYAYSNETEVVKYIAIMMPLLATSNFLDGLQCVLSGAVRGFGWQKIGA
IINLGSYYLVGIPCAVLLAFYLHIGGKGLWLGIICALLVQVLSLLFITIRTNWEQEAKKA
QERVEETTLPAEIVY*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400014431
Transcript Infomation

pacid=37458886 locus=PGSC0003DMG400005661 ID=PGSC0003DMT400014431.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAAGCTGAATATGGAAAATCATCCTCTGTAAAAACTCCATTGATAGATGACCGAGAA
AAACAGAGTATTCTTGATGAAACAAGAAAAAATGGTGGTGGGTTTAGCAAGGAAGAGATT
GTTGATGAAGTGAAGAGGCAAGTATGGCTAGCAGGACCCTTAGTGAGCGTTAACCTTTTG
CAGTTTTCTTTACAGCTTATATCCATTATGTTTGTGGGTCATCTTGGAAAATTGCCCCTT
TCTGGTGCTTCCATGGCTAATTCCTTCACTTCTGTTACTGGTATCAGCCTTTTGATGGGG
ATGTCAAGTGCATTGGACACATTTTGTGGACAGTCTTATGGAGCAAAACAGTATCATATG
CTTGGCATTCACATGCAGAGAGCTATGATTGTACTTTCACTTGTAAGCGTACCTCTTGCA
GTAATCTGGGCAAACACTGGCCCTATTCTCAAGGTTTTAGGCCAAGATCCTAGTATATCT
GATGAAGCTGGTCAATATGCCTTGTATTTTATCCCCGGTGTTTTTGCTTACGGCTTGCTC
CAATGTGTTGTGAGATTTTTACAAACACAAAGTATTGTCATCCCTATGGTGTTATGTGCT
GGAGTTACAACCTTAATCCACGTTGTTGTCTGTTGGATTTTGGTCTTCAAGACTGGACTT
GGTGTCAAAGGAGCTGCTCTAGCAAATTCAATCTCTTACTGGCTTAACTTCTTGTTTTTG
GTTCTTTATATCAAGTTTTCTCCTTCATGTGCAAAAACTTGGACAGGACTGTCAAAAGAA
GCTTTGAAGGATATGCTTACTTTCCTTAGACTTGCGGTTCCCTCGGCCATCATGGTCTGC
TTAGAAATGTGGTCGTTTGAGCTAATGGTTCTGCTTTCTGGCCTCCTTCCAAATCCACAG
TTGGAAACGTCAGTGCTCTCAATCTGTCTTAATACAGCCGCAACAGTTTGGATGATCCCT
TTTGGGCTGAGTGGTGCTGTGAGTACACGGGTCTCAAATGAACTAGGAGCAGCTCATCCT
CAACTTGCACGTTTGGCGCTGTATGTTGTCTTAGCGGTGGCTGTTATTGAGGGGCTTGTG
TTGGGATTGGTCTTGATATTGATACGTAAAGTATGGGGATATGCTTACAGCAACGAAACT
GAAGTTGTTAAATACATAGCCATCATGATGCCACTTCTTGCAACATCAAATTTCTTGGAT
GGCCTTCAATGTGTTCTCTCAGGTGCTGTAAGAGGATTTGGATGGCAGAAAATTGGGGCA
ATTATTAACCTCGGATCCTATTATTTGGTGGGAATTCCTTGTGCTGTCTTGTTGGCCTTT
TATCTTCACATTGGTGGGAAGGGATTATGGTTGGGTATTATTTGTGCACTTCTAGTACAA
GTGTTGTCTCTTCTTTTCATTACCATACGCACCAACTGGGAACAAGAAGCAAAGAAGGCT
CAAGAGAGAGTGGAAGAAACAACATTACCCGCGGAGATAGTGTACTGA