Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400012953
CDS Infomation

pacid=37463667 polypeptide=PGSC0003DMP400008993 locus=PGSC0003DMG400005048 ID=PGSC0003DMT400012953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTCTTTAAGCAGAGTGATCCGCCGGACTTTCTCCACGGCTGAAGCCTCAGTATCT
CCGATCAGAACAATCTCCGACGACTTATACAAAGAGAGGAACCTCAAGAGACTCGTTGAG
AAATTCAAACAGTATTCAGATGTCACAAGATTCCGCACAAAAACCGGCATTTACGAATCT
ACAGTTCATCGATTAGCCTCTGCAAAACGGTACAAATGGATCGAAGAAATCCTCGAACAC
CAAAAACAATACCGACCCGACATCTCCAAAGAGAGTTTCGCGGCAAGGCTGGTTAGTTTG
TATGGAAAATCTGGGTTATTTGAGAATGCCCAGAAAGTGTTTGATGAAATGCCTGAGAGA
AATTGTAAGCAGAGTGTGAAATCTGTTAATGCCCTTTTAGGGGCTTGTGTTAATTCGCAG
AAATATGATAAACTTGAAGGTTTGTTTGAGGAATTGCTGGAGAAGTTGAAGGTGAAGCCG
GATGTTGTCACGTATAATATAATGATTAAGGGGTTGTGTGACAAAGGGGAGTTGGATAAA
GCAGCTGCCTTTGTTGATGAGATTGAGAAGAATGGGTTAAAGCCTGATTTGGTTACGTTT
AATACGATTCTTGGGGTGTTTTACTCGAATGGTAAGTTTGATGATGGCGAAAAGATGTGG
AAGCTAATGGTTAGCAAGAATGTTGTTCCGGATATTAGAAGTTACAATGCTAAGCTTGTT
GGACTGATGAATGAGAACAAAGTTTCAGAGGCTGCCAAGCTTGTTGGCGAATTGGGAAGT
TTTGAGTTAAAGCCTGATGTGTTTACTTATGGTGCGTTGATTAGAGGATTTTGTAAAATG
AGTAATTTGGAGGAAGCTAAAAAGTGGTATGAAGAACTTGTGAAGAGCAGTTCTGCTCCA
AACAAGGTGATATTTGCTAGTGTCATTTCATCTGCGTGCGAAAAGGGTGATTTTGATTGG
GCTCTTGAGTTGTGCAAAGAGGTTTTTAAAAGAAAGTGTAATGTTGATGCAAAGTTGTTG
CAAAGAGTGGTCGATGGGTTGGTGAGCTCGTCTAGGATTCGAGAAGCTAAGGAGGTTGTG
CATTTGGGCAAGTCAAATGACTACCATCTTTATAAGCTCAATCTACCTTCAGATGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400008993
PEP Infomation

pacid=37463667 transcript=PGSC0003DMT400012953 locus=PGSC0003DMG400005048 ID=PGSC0003DMT400012953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MASLSRVIRRTFSTAEASVSPIRTISDDLYKERNLKRLVEKFKQYSDVTRFRTKTGIYES
TVHRLASAKRYKWIEEILEHQKQYRPDISKESFAARLVSLYGKSGLFENAQKVFDEMPER
NCKQSVKSVNALLGACVNSQKYDKLEGLFEELLEKLKVKPDVVTYNIMIKGLCDKGELDK
AAAFVDEIEKNGLKPDLVTFNTILGVFYSNGKFDDGEKMWKLMVSKNVVPDIRSYNAKLV
GLMNENKVSEAAKLVGELGSFELKPDVFTYGALIRGFCKMSNLEEAKKWYEELVKSSSAP
NKVIFASVISSACEKGDFDWALELCKEVFKRKCNVDAKLLQRVVDGLVSSSRIREAKEVV
HLGKSNDYHLYKLNLPSDD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400012953
Transcript Infomation

pacid=37463667 locus=PGSC0003DMG400005048 ID=PGSC0003DMT400012953.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGCCTCTTTAAGCAGAGTGATCCGCCGGACTTTCTCCACGGCTGAAGCCTCAGTATCT
CCGATCAGAACAATCTCCGACGACTTATACAAAGAGAGGAACCTCAAGAGACTCGTTGAG
AAATTCAAACAGTATTCAGATGTCACAAGATTCCGCACAAAAACCGGCATTTACGAATCT
ACAGTTCATCGATTAGCCTCTGCAAAACGGTACAAATGGATCGAAGAAATCCTCGAACAC
CAAAAACAATACCGACCCGACATCTCCAAAGAGAGTTTCGCGGCAAGGCTGGTTAGTTTG
TATGGAAAATCTGGGTTATTTGAGAATGCCCAGAAAGTGTTTGATGAAATGCCTGAGAGA
AATTGTAAGCAGAGTGTGAAATCTGTTAATGCCCTTTTAGGGGCTTGTGTTAATTCGCAG
AAATATGATAAACTTGAAGGTTTGTTTGAGGAATTGCTGGAGAAGTTGAAGGTGAAGCCG
GATGTTGTCACGTATAATATAATGATTAAGGGGTTGTGTGACAAAGGGGAGTTGGATAAA
GCAGCTGCCTTTGTTGATGAGATTGAGAAGAATGGGTTAAAGCCTGATTTGGTTACGTTT
AATACGATTCTTGGGGTGTTTTACTCGAATGGTAAGTTTGATGATGGCGAAAAGATGTGG
AAGCTAATGGTTAGCAAGAATGTTGTTCCGGATATTAGAAGTTACAATGCTAAGCTTGTT
GGACTGATGAATGAGAACAAAGTTTCAGAGGCTGCCAAGCTTGTTGGCGAATTGGGAAGT
TTTGAGTTAAAGCCTGATGTGTTTACTTATGGTGCGTTGATTAGAGGATTTTGTAAAATG
AGTAATTTGGAGGAAGCTAAAAAGTGGTATGAAGAACTTGTGAAGAGCAGTTCTGCTCCA
AACAAGGTGATATTTGCTAGTGTCATTTCATCTGCGTGCGAAAAGGGTGATTTTGATTGG
GCTCTTGAGTTGTGCAAAGAGGTTTTTAAAAGAAAGTGTAATGTTGATGCAAAGTTGTTG
CAAAGAGTGGTCGATGGGTTGGTGAGCTCGTCTAGGATTCGAGAAGCTAAGGAGGTTGTG
CATTTGGGCAAGTCAAATGACTACCATCTTTATAAGCTCAATCTACCTTCAGATGATTAA