Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400012949
CDS Infomation

pacid=37460641 polypeptide=PGSC0003DMP400008990 locus=PGSC0003DMG400005046 ID=PGSC0003DMT400012949.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTGGTGGGAGGCAGTGTTATCTCCAGCTCTGCAGGTTCTTTTTGACAAATTAGCT
TCAGGGGATATATTAAACATACTTAAAGTATGGAATGTTAATGAATTGTTACTTGACAAA
CTTAAGATTTCTTACTTCATCAATACAGCTGTTCTTGATGATGCAGAAGAGAAACAGTAC
CTCAATCCAGCAGTCGAAACTTGGATCGATATGCTCAGAGATGCTGTCTTTGAAGCTGAG
GATACTCTTGATGAACTAGCTACTGAAGCCTTGAGATGCAAACTAGAGACAGATTCTCAG
AAATTTTCTCAGCAGGTGCGTAATAGTTGGAACTTTATCAGTATGAAATCAAGAATAGAA
GAGCTTATAACTAGACTAGAATATATTGCAAAACAAAAAGATGTTCTTGGTTTAGAAAGT
AACAAAAAGTGTTGTTATGGAAAGATGTACAGAGGTACTCCAAGTACTCCTTTGTTACTT
GGATCACATGTTTATGGAAGGTATACTGAAAAAGAGGAACTAATCGAGTTATTGGTTTCA
GATTGTGATGATACAAATAGAGTTGCTCCATTTTGTGTTATTCCTCTTATTGGTATGGGA
GGGATTGGGAAGACTACTCTTGCTCAGATTGTCTATAATGACAAGAGAATTTGTGAGGAG
TTTGACGTAAAAGCGTGGGCTTGGGTGTCTGATGATTTCAGTGTAACAAGTATAACCAAG
TCACTGCTTGAATCTGCTACTGCAAAACCCTTCGACACGAATAGTTTGGAAATTATTCAG
AATGGTCTGAAGAATATGTTCAGCAAAAAGAGAATTTTGATTGTTTTGGATGATGTATGG
AGTGAGAGCTGTGATGACTGGAATGAGCTTTTAATCCCTTTCTTCGAGGGAGATAAAAGA
AGTAAAATAATCGTGACAACACGAAATGAAGGAGTTGCATCAATCACTGGAATGCTTGCA
CCTTACCGTTTGCAGGAAATGTCACATGATGATTGTTGGTCTTTGTTCTTGCATCATGCT
TTTGGTGTTCGAGGCATGGACATGAATCCGAGACTGAAAGAAATTGGAGAAGAGATCGTG
AAGAGGTGTAAAGGCTTGCCTTTAGCTATCAAGACTCTAGGAGGTATGTTGTCTTTGAAA
TTGGACATTACTTATTGGACTGAAGTCTTGAATAGCAATTTATGGGATTTGCCTTCCAAG
AAATATTCTGTTCTACCATCTTTAAGATTGAGCTACCATCATCTTCCGCCAAATTTAAGG
AGATGCTTTGCATACTGTTCAATATTCCCGAAAGGGTATGAGTTCAACAAGAAAGATCTA
GTCTTGCTGTGGATGGCAGAAGGGTTCGTGCAGCCAATGGCGCAGATAACTATGGAGGAA
GTGGGAAATGGAAATTTTACTGAACTGCAATCTAGGTGTTTTTTCCAAGAATCCTCGCAA
AATAGATCTCTCTTTGTGATGCATGATCTAGTACATGATTTGGCACTTAGTGTTTCCAGG
AGAACATGTATTCAGCTGGAGGAAAATTGGAAATGCAGATTTTATGAGAATTGCGAGAAG
GCTCGCTATTTCTCATGCATTCGTAGTAAATACGATGTCTTCAGAAAATTTGAAATGCTT
AGTGAAATGAAGCGTTTACGCACATTCTTACCTTTAGCATCATCAGAAGGAGCTGAATTT
TGCTATTTAACAAAGAAGGTACTGTCTGATATTTTGCCTAAGCTAAGCTGCCTTCGGGTG
TTATCTCTGAGCTATTATTGTGTCACTGAGATTCCGGAATCCATTGGATTCTTGAAACAT
CTTCGCTTCCTCAATTTTTCCTACACAGAAATTAAATACCTTCCTCAGTCAATCAGTGAT
CTTTACAATCTACAAACGTTGCTACTATGCAACTGTTATTATCTCATTGAGTTGCCTGCT
GACATGGGGAAACTGCTCAATCTTCGCTACCTTGATGTTAGCGGAAGTGGTTTACAAAAG
ATCTCGCTTGGTCTGGACAAATTGGTGTGCCTCAGGACATTACCAGAGTTTGTTGTGGGT
AGTAATGTTTCTAGTAATAGGACATTACCAGAGTTCACAGTAGATACTAATACCGGTGGT
ACATTCGATCAAAAAAGTAAAGGTTCTGGTATAGGTGCATTGGGTAACTTGTTGCACCTT
GAGGGTTCACTTTCAATACTGAATTTGGAAAATGTGGATAACATTTGGGATGCGCACGGA
GCTAGTTTGATCACTAAGAAGCACCTTCGCGAGTTATTGCTTCAATGGAGTGATAGTTTT
GAGGACCCAGAGAAGGCTAGAATGGAAACTGATGTTCTTGAGCTGTTAAGACCCCATCAA
AATATAGAGAAGGTTACCATCAAGGGATATAGTGGTACAAAACTCCCTACTTGGACAGCG
AATCCTTCATTCCACAAGCTGGTTTCTTTGAGTTTAATCAATTGCAAAGGCTGTCGATTC
CTACCATCACTTGGTCAGCTTCCTTCACTCAAAAATCTCATGGTTAAAGGACTAAGTAAG
ATAAAAAGCATCGGTGATGAGTTTTTCGGCTATACTTCAACCATATTGACCCCTTTTGCA
TCTTTAGAGACTCTATCCTTTACGGATATGTTGGAATGGGAAGATTGGTTACTTGGTTAT
GATGGAGATAGAAAAGCATTCTGTAATCTCTTGGAGCTTCACTTGGAGGAGTGTCCTAAA
CTGCGGGGAGAATTACCTGACGTCCTTCCTTGCCTAGTAAAGCTTGTGATTTGTGAGTGT
AAGCAGTTGGATTCTTCTCTTCCGCGACTTCCACAGCTAAATGAGTTGGAACTAAGGAGT
TGTCATGTTAGGTTGATTAGCAGCATGCATGAGGTGACAAAACTCACTTCATTACAACTG
TCTAATCTTTCAAATGAATATGTACCTGAATGTTTCCTAGCATCTCTTCGGCATCTGGTA
ATTAGGCATTGTGACTTACTGGTGTCCCTTTTCGAGGAAGGGCAGAATCTGCCTCGCAGA
TTGGAGTATGTAGAACTGGAGAACTGTCATAATCTGCAGAAGTTACCATCGTTACTTCAT
ACTTTAACATCCCTTGAAGTAGTTATAATCACAAATTGTCCAAGGCTGGAATCTTTTGCA
AGGAAGATATTTCCTTCTAACTTAAAAGCCCTTGCCATTCAAGGATGCAGTTTGGAGTCT
TTACCTGAAGCTATGATGAACAGTATCTCATCTCTCAAGTATTTGTCCATCAACGGGTGT
TTAATGCTAGCTTCTTTTCCAAGAGGTAGTGAGTTGCTTCCAACCACATGTCAGCAGCTG
AAAATCGAGAAATGCCCGAATCTGGAGTTTCTGCCTGAAGGGATGATGCACATCAGCAAT
ACCTCTCTCCAAGTATTGGAGATTTTCGATTGTTCTTCTATATCATCGTTCCCGGGAGGC
CAACTGCCAGACACTTTGAAAACACTCACAGTTTGGAACTGCTTCAATCTCGAGGCATTA
CCTGATATCAGAACCTCAACAATGCTTCTTGAATCTTTACGAGTTGGGAATTGTACAAGT
CTGAAGCACTTACCTCATGGCTTGAACAAGCTGTTGAATCTTAGTTATTTTGAAGTTGAT
GGTTGCCATGGTATCAAATGCTTTCCTCTAGAAGGCCTTCCACAAAACCTTACAAAAGTA
CTAATCATCGACTGTGAGAATCTGACATTCCTTCCAAAGTGGATGCAGAATCTTACATCT
CTTCAAGAACTTCAGCTATCGAATTGTCCACTAATCACATCTTTCACGGAGGGTGGTTTT
CCCACTAGCCTTGTGTCTTTGGATGTCAAAGATTGTAAGAATCTTATGCCAATGTCTGAA
TGGGGATTGCACAGGCTTGCCTCTCTTAGAAGGCTGACAATTCATGGGATCAGTTCAAAT
CTTTCTTATTTTCCTCAATGGTTGCTTCCATCAACTCTAGAAACACTCAATATAGTTCAG
TTATCCAATCTTGAATCTCTTTCTCCCTGGCTGCAAAATCTCACTTCACTCGAAAATCTC
AAGGTCAAAGATTGTCGAAAGCTTCTTTCGTTACCAAAGGAAGACATGCCACCAATGCTT
TCCTATCTTGAGATAAGTGAATGTCCCTTGAGTGAACAAAAGTGTGACTTGTCCAAGATT
GATCATATCCCTTGCACTGTGATGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400008990
PEP Infomation

pacid=37460641 transcript=PGSC0003DMT400012949 locus=PGSC0003DMG400005046 ID=PGSC0003DMT400012949.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVWWEAVLSPALQVLFDKLASGDILNILKVWNVNELLLDKLKISYFINTAVLDDAEEKQY
LNPAVETWIDMLRDAVFEAEDTLDELATEALRCKLETDSQKFSQQVRNSWNFISMKSRIE
ELITRLEYIAKQKDVLGLESNKKCCYGKMYRGTPSTPLLLGSHVYGRYTEKEELIELLVS
DCDDTNRVAPFCVIPLIGMGGIGKTTLAQIVYNDKRICEEFDVKAWAWVSDDFSVTSITK
SLLESATAKPFDTNSLEIIQNGLKNMFSKKRILIVLDDVWSESCDDWNELLIPFFEGDKR
SKIIVTTRNEGVASITGMLAPYRLQEMSHDDCWSLFLHHAFGVRGMDMNPRLKEIGEEIV
KRCKGLPLAIKTLGGMLSLKLDITYWTEVLNSNLWDLPSKKYSVLPSLRLSYHHLPPNLR
RCFAYCSIFPKGYEFNKKDLVLLWMAEGFVQPMAQITMEEVGNGNFTELQSRCFFQESSQ
NRSLFVMHDLVHDLALSVSRRTCIQLEENWKCRFYENCEKARYFSCIRSKYDVFRKFEML
SEMKRLRTFLPLASSEGAEFCYLTKKVLSDILPKLSCLRVLSLSYYCVTEIPESIGFLKH
LRFLNFSYTEIKYLPQSISDLYNLQTLLLCNCYYLIELPADMGKLLNLRYLDVSGSGLQK
ISLGLDKLVCLRTLPEFVVGSNVSSNRTLPEFTVDTNTGGTFDQKSKGSGIGALGNLLHL
EGSLSILNLENVDNIWDAHGASLITKKHLRELLLQWSDSFEDPEKARMETDVLELLRPHQ
NIEKVTIKGYSGTKLPTWTANPSFHKLVSLSLINCKGCRFLPSLGQLPSLKNLMVKGLSK
IKSIGDEFFGYTSTILTPFASLETLSFTDMLEWEDWLLGYDGDRKAFCNLLELHLEECPK
LRGELPDVLPCLVKLVICECKQLDSSLPRLPQLNELELRSCHVRLISSMHEVTKLTSLQL
SNLSNEYVPECFLASLRHLVIRHCDLLVSLFEEGQNLPRRLEYVELENCHNLQKLPSLLH
TLTSLEVVIITNCPRLESFARKIFPSNLKALAIQGCSLESLPEAMMNSISSLKYLSINGC
LMLASFPRGSELLPTTCQQLKIEKCPNLEFLPEGMMHISNTSLQVLEIFDCSSISSFPGG
QLPDTLKTLTVWNCFNLEALPDIRTSTMLLESLRVGNCTSLKHLPHGLNKLLNLSYFEVD
GCHGIKCFPLEGLPQNLTKVLIIDCENLTFLPKWMQNLTSLQELQLSNCPLITSFTEGGF
PTSLVSLDVKDCKNLMPMSEWGLHRLASLRRLTIHGISSNLSYFPQWLLPSTLETLNIVQ
LSNLESLSPWLQNLTSLENLKVKDCRKLLSLPKEDMPPMLSYLEISECPLSEQKCDLSKI
DHIPCTVM*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400012949
Transcript Infomation

pacid=37460641 locus=PGSC0003DMG400005046 ID=PGSC0003DMT400012949.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTGGTGGGAGGCAGTGTTATCTCCAGCTCTGCAGGTTCTTTTTGACAAATTAGCT
TCAGGGGATATATTAAACATACTTAAAGTATGGAATGTTAATGAATTGTTACTTGACAAA
CTTAAGATTTCTTACTTCATCAATACAGCTGTTCTTGATGATGCAGAAGAGAAACAGTAC
CTCAATCCAGCAGTCGAAACTTGGATCGATATGCTCAGAGATGCTGTCTTTGAAGCTGAG
GATACTCTTGATGAACTAGCTACTGAAGCCTTGAGATGCAAACTAGAGACAGATTCTCAG
AAATTTTCTCAGCAGGTGCGTAATAGTTGGAACTTTATCAGTATGAAATCAAGAATAGAA
GAGCTTATAACTAGACTAGAATATATTGCAAAACAAAAAGATGTTCTTGGTTTAGAAAGT
AACAAAAAGTGTTGTTATGGAAAGATGTACAGAGGTACTCCAAGTACTCCTTTGTTACTT
GGATCACATGTTTATGGAAGGTATACTGAAAAAGAGGAACTAATCGAGTTATTGGTTTCA
GATTGTGATGATACAAATAGAGTTGCTCCATTTTGTGTTATTCCTCTTATTGGTATGGGA
GGGATTGGGAAGACTACTCTTGCTCAGATTGTCTATAATGACAAGAGAATTTGTGAGGAG
TTTGACGTAAAAGCGTGGGCTTGGGTGTCTGATGATTTCAGTGTAACAAGTATAACCAAG
TCACTGCTTGAATCTGCTACTGCAAAACCCTTCGACACGAATAGTTTGGAAATTATTCAG
AATGGTCTGAAGAATATGTTCAGCAAAAAGAGAATTTTGATTGTTTTGGATGATGTATGG
AGTGAGAGCTGTGATGACTGGAATGAGCTTTTAATCCCTTTCTTCGAGGGAGATAAAAGA
AGTAAAATAATCGTGACAACACGAAATGAAGGAGTTGCATCAATCACTGGAATGCTTGCA
CCTTACCGTTTGCAGGAAATGTCACATGATGATTGTTGGTCTTTGTTCTTGCATCATGCT
TTTGGTGTTCGAGGCATGGACATGAATCCGAGACTGAAAGAAATTGGAGAAGAGATCGTG
AAGAGGTGTAAAGGCTTGCCTTTAGCTATCAAGACTCTAGGAGGTATGTTGTCTTTGAAA
TTGGACATTACTTATTGGACTGAAGTCTTGAATAGCAATTTATGGGATTTGCCTTCCAAG
AAATATTCTGTTCTACCATCTTTAAGATTGAGCTACCATCATCTTCCGCCAAATTTAAGG
AGATGCTTTGCATACTGTTCAATATTCCCGAAAGGGTATGAGTTCAACAAGAAAGATCTA
GTCTTGCTGTGGATGGCAGAAGGGTTCGTGCAGCCAATGGCGCAGATAACTATGGAGGAA
GTGGGAAATGGAAATTTTACTGAACTGCAATCTAGGTGTTTTTTCCAAGAATCCTCGCAA
AATAGATCTCTCTTTGTGATGCATGATCTAGTACATGATTTGGCACTTAGTGTTTCCAGG
AGAACATGTATTCAGCTGGAGGAAAATTGGAAATGCAGATTTTATGAGAATTGCGAGAAG
GCTCGCTATTTCTCATGCATTCGTAGTAAATACGATGTCTTCAGAAAATTTGAAATGCTT
AGTGAAATGAAGCGTTTACGCACATTCTTACCTTTAGCATCATCAGAAGGAGCTGAATTT
TGCTATTTAACAAAGAAGGTACTGTCTGATATTTTGCCTAAGCTAAGCTGCCTTCGGGTG
TTATCTCTGAGCTATTATTGTGTCACTGAGATTCCGGAATCCATTGGATTCTTGAAACAT
CTTCGCTTCCTCAATTTTTCCTACACAGAAATTAAATACCTTCCTCAGTCAATCAGTGAT
CTTTACAATCTACAAACGTTGCTACTATGCAACTGTTATTATCTCATTGAGTTGCCTGCT
GACATGGGGAAACTGCTCAATCTTCGCTACCTTGATGTTAGCGGAAGTGGTTTACAAAAG
ATCTCGCTTGGTCTGGACAAATTGGTGTGCCTCAGGACATTACCAGAGTTTGTTGTGGGT
AGTAATGTTTCTAGTAATAGGACATTACCAGAGTTCACAGTAGATACTAATACCGGTGGT
ACATTCGATCAAAAAAGTAAAGGTTCTGGTATAGGTGCATTGGGTAACTTGTTGCACCTT
GAGGGTTCACTTTCAATACTGAATTTGGAAAATGTGGATAACATTTGGGATGCGCACGGA
GCTAGTTTGATCACTAAGAAGCACCTTCGCGAGTTATTGCTTCAATGGAGTGATAGTTTT
GAGGACCCAGAGAAGGCTAGAATGGAAACTGATGTTCTTGAGCTGTTAAGACCCCATCAA
AATATAGAGAAGGTTACCATCAAGGGATATAGTGGTACAAAACTCCCTACTTGGACAGCG
AATCCTTCATTCCACAAGCTGGTTTCTTTGAGTTTAATCAATTGCAAAGGCTGTCGATTC
CTACCATCACTTGGTCAGCTTCCTTCACTCAAAAATCTCATGGTTAAAGGACTAAGTAAG
ATAAAAAGCATCGGTGATGAGTTTTTCGGCTATACTTCAACCATATTGACCCCTTTTGCA
TCTTTAGAGACTCTATCCTTTACGGATATGTTGGAATGGGAAGATTGGTTACTTGGTTAT
GATGGAGATAGAAAAGCATTCTGTAATCTCTTGGAGCTTCACTTGGAGGAGTGTCCTAAA
CTGCGGGGAGAATTACCTGACGTCCTTCCTTGCCTAGTAAAGCTTGTGATTTGTGAGTGT
AAGCAGTTGGATTCTTCTCTTCCGCGACTTCCACAGCTAAATGAGTTGGAACTAAGGAGT
TGTCATGTTAGGTTGATTAGCAGCATGCATGAGGTGACAAAACTCACTTCATTACAACTG
TCTAATCTTTCAAATGAATATGTACCTGAATGTTTCCTAGCATCTCTTCGGCATCTGGTA
ATTAGGCATTGTGACTTACTGGTGTCCCTTTTCGAGGAAGGGCAGAATCTGCCTCGCAGA
TTGGAGTATGTAGAACTGGAGAACTGTCATAATCTGCAGAAGTTACCATCGTTACTTCAT
ACTTTAACATCCCTTGAAGTAGTTATAATCACAAATTGTCCAAGGCTGGAATCTTTTGCA
AGGAAGATATTTCCTTCTAACTTAAAAGCCCTTGCCATTCAAGGATGCAGTTTGGAGTCT
TTACCTGAAGCTATGATGAACAGTATCTCATCTCTCAAGTATTTGTCCATCAACGGGTGT
TTAATGCTAGCTTCTTTTCCAAGAGGTAGTGAGTTGCTTCCAACCACATGTCAGCAGCTG
AAAATCGAGAAATGCCCGAATCTGGAGTTTCTGCCTGAAGGGATGATGCACATCAGCAAT
ACCTCTCTCCAAGTATTGGAGATTTTCGATTGTTCTTCTATATCATCGTTCCCGGGAGGC
CAACTGCCAGACACTTTGAAAACACTCACAGTTTGGAACTGCTTCAATCTCGAGGCATTA
CCTGATATCAGAACCTCAACAATGCTTCTTGAATCTTTACGAGTTGGGAATTGTACAAGT
CTGAAGCACTTACCTCATGGCTTGAACAAGCTGTTGAATCTTAGTTATTTTGAAGTTGAT
GGTTGCCATGGTATCAAATGCTTTCCTCTAGAAGGCCTTCCACAAAACCTTACAAAAGTA
CTAATCATCGACTGTGAGAATCTGACATTCCTTCCAAAGTGGATGCAGAATCTTACATCT
CTTCAAGAACTTCAGCTATCGAATTGTCCACTAATCACATCTTTCACGGAGGGTGGTTTT
CCCACTAGCCTTGTGTCTTTGGATGTCAAAGATTGTAAGAATCTTATGCCAATGTCTGAA
TGGGGATTGCACAGGCTTGCCTCTCTTAGAAGGCTGACAATTCATGGGATCAGTTCAAAT
CTTTCTTATTTTCCTCAATGGTTGCTTCCATCAACTCTAGAAACACTCAATATAGTTCAG
TTATCCAATCTTGAATCTCTTTCTCCCTGGCTGCAAAATCTCACTTCACTCGAAAATCTC
AAGGTCAAAGATTGTCGAAAGCTTCTTTCGTTACCAAAGGAAGACATGCCACCAATGCTT
TCCTATCTTGAGATAAGTGAATGTCCCTTGAGTGAACAAAAGTGTGACTTGTCCAAGATT
GATCATATCCCTTGCACTGTGATGTAG