Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400012359
CDS Infomation

pacid=37451943 polypeptide=PGSC0003DMP400008591 locus=PGSC0003DMG400004842 ID=PGSC0003DMT400012359.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCAAGGCTAGTAAGGTTGAATGTGTTGTTGATGCTGTTAGCATTATTGGGTTCA
TGGGTTTTTTCTGGAATGTGTTCTGTGTCATATGACCGTAATGCTATTATTGTGAATGGT
CAAAGGAGAATTCTTGTTTCTGGATCTATTCACTACCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGG
CCGGATCTTATTCAGAAGGCCAAAGAAGGAGGGGTGGATGTGATTCAGACCTATGTTTTC
TGGAATGGGCATGAGCCTGAACAAGGCAAATATTACTTTGAAGAGAGGTATGATCTAGTG
AAGTTCATTAAGATAGTGCATCAAGCAGGTCTTTATGTGCATCTCAGGGTTGGACCTTAT
GCTTGTGCTGAATGGAATTTTGGGGGTTTTCCTGTTTGGTTGAAGTATGTTCCAGGCATC
AGTTTCAGAACAGATAATGAACCTTTCAAGTCTGCAATGCAAAAGTTCACTACCAAGATT
GTTAATATGATGAAAGCGGAACGGCTGTACGAATCACAGGGTGGCCCTATAATACTATCC
CAGATTGAGAATGAATATGGGCCAATTGAGAAGAGACTGGGTGAACCAGGTAAATCTTAC
TCAGACTGGGCAGCAAAAATGGCTTTGGATCTTGGTACTGGTGTACCTTGGGTCATGTGC
AAGCAAGATGATGCTCCAGATCCTGTTATCAACACTTGCAATGGTTTCTACTGTGACTAC
TTCTCACCAAATAAGGCTTATAAACCCAAGATATGGACTGAAGCTTGGACTGCCTGGTTC
ACTGAATTTGGAGGTCCAATTCCTTATCGTCCTGTTGAGGACTTGGCATTTGGGGTTGCT
AAATTCATACAGAACGGGGGATCATTCATCAATTACTACATGTATCATGGAGGAACAAAC
TTTGGTAGGACTGCTGGTGGCCCATTTATTGCTACTAGTTATGATTATGATGCACCACTT
GATGAATTTGGATTATTACGGCAACCTAAGTGGGGTCATCTGAAAGATCTGCATAGAGCA
ATAAAGCTTTGTGAACCAGCTTTAGTATCTGGCGATCCAACTGTGACATCCCTTGGAAAC
TTTCAAGAAGCTCATGTGTTTTCGTCAAAGTCTGGGGTGTGTGCTGCATTCCTTGCAAAC
TACAACCAACATTCTTTTGCTACAGTGACTTTTGGGAACAGGCATTATAACTTGCCACCT
TGGTCTATCAGCATTCTACCTGACTGCAAGAACACAGTTTATAATACTGCAAGGGTTGGT
GCTCAAAGTGCTCTGATGAAGATGACTCCAGCAGATAAAGGATTTTCTTGGCAGTCATAC
AATGACGAGCCATCATCTTATGAAGACAGTACTTTCACGGTTGTTGGGTTACTGGAGCAG
ATAAATACCACAAGAGATGTGTCTGATTATTTGTGGTATATGACCGATGTCAAGATTGAT
CCAAGCGAAGGGTTCTTGAGAAGCGGACAATGGCCATGGCTTAGAGTCTCTTCAGCTGGC
CCTGCTTTGCATGTTTTCGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGTATATGGAAGTTTAAAA
AGCCAGAAAATTACTTTCAATAAAGCAGTAAATCTAAGAGCTGGTGTAAACAAGATTTCT
CTGCTAAGCATTGCTGTTGGTCTTCCGAATATTGGCCCACATTTTGAGACATGGAATACT
GGTGTTCTTGGACCAGTTTCACTCAGTGGTCTTAACGAGGGGAAAAGAGATTTAGCTTGG
CAGAAATGGTCTTACAAGGTTGGTCTAAAAGGAGAAGCCTTGAATCTTCATTCGCTCAGT
GGCAGCTCATCTGTTGAGTGGGTTGAGGGCTCTTTGGTGACTCAAAGACAGCCTCTCACA
TGGTTCAAGACCACTTTCAATGCTCCAGCTGGAAATGAGCCTTTGGCTTTAGATATGAAT
ACCATGGGCAAAGGTCAAATGTGGATAAATGGACAAAGCCTTGGACGTTACTGGCCTGGA
TATAAATCATCTGGTACTTGTAGTGCCTGTAACTATGCAGGCTACTTTAATGAGAACAAG
TGCTTAAGTAACTGCGGAGAGGCCTCACAGAGATGGTATCACGTGCCACGTTCTTGGCTG
CATCCTACTGGAAACTTGTTAGTTGTATTTGAGGAATGGGGAGGAGATCCCAACGCAATC
TCTTTGGTCAAGAGAGAATTAGCAAGTGTCTGTGCAGATATAAATGAATGGCAACCACAG
TTGGTGAATTATAAGATGCAAGCATCTGGGGAAGTTGACAGGCCACTCAGGCCTAAAGCG
CACCTCCGTTGTGCTCCTGGTCAAAAGATCACTTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACA
CCAGTGGGGGTCTGTGGAAGCTTCAGTGAAGGAAGCTGTCGTGCCCACCACTCATACGAT
GCCTTTGAAAAGTATTGCATTGGGAAAGAGTCGTGTTCAGTACCTGTGACACCAGAAATT
TTTGGTGGTGATCCATGTCCAGGTGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAAGCTCTCTGCAGT
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400008591
PEP Infomation

pacid=37451943 transcript=PGSC0003DMT400012359 locus=PGSC0003DMG400004842 ID=PGSC0003DMT400012359.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MVSRLVRLNVLLMLLALLGSWVFSGMCSVSYDRNAIIVNGQRRILVSGSIHYPRSTPEMW
PDLIQKAKEGGVDVIQTYVFWNGHEPEQGKYYFEERYDLVKFIKIVHQAGLYVHLRVGPY
ACAEWNFGGFPVWLKYVPGISFRTDNEPFKSAMQKFTTKIVNMMKAERLYESQGGPIILS
QIENEYGPIEKRLGEPGKSYSDWAAKMALDLGTGVPWVMCKQDDAPDPVINTCNGFYCDY
FSPNKAYKPKIWTEAWTAWFTEFGGPIPYRPVEDLAFGVAKFIQNGGSFINYYMYHGGTN
FGRTAGGPFIATSYDYDAPLDEFGLLRQPKWGHLKDLHRAIKLCEPALVSGDPTVTSLGN
FQEAHVFSSKSGVCAAFLANYNQHSFATVTFGNRHYNLPPWSISILPDCKNTVYNTARVG
AQSALMKMTPADKGFSWQSYNDEPSSYEDSTFTVVGLLEQINTTRDVSDYLWYMTDVKID
PSEGFLRSGQWPWLRVSSAGPALHVFVNGQLAGTVYGSLKSQKITFNKAVNLRAGVNKIS
LLSIAVGLPNIGPHFETWNTGVLGPVSLSGLNEGKRDLAWQKWSYKVGLKGEALNLHSLS
GSSSVEWVEGSLVTQRQPLTWFKTTFNAPAGNEPLALDMNTMGKGQMWINGQSLGRYWPG
YKSSGTCSACNYAGYFNENKCLSNCGEASQRWYHVPRSWLHPTGNLLVVFEEWGGDPNAI
SLVKRELASVCADINEWQPQLVNYKMQASGEVDRPLRPKAHLRCAPGQKITSIKFASFGT
PVGVCGSFSEGSCRAHHSYDAFEKYCIGKESCSVPVTPEIFGGDPCPGVMKKLSVEALCS
*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400012359
Transcript Infomation

pacid=37451943 locus=PGSC0003DMG400004842 ID=PGSC0003DMT400012359.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGTTTCAAGGCTAGTAAGGTTGAATGTGTTGTTGATGCTGTTAGCATTATTGGGTTCA
TGGGTTTTTTCTGGAATGTGTTCTGTGTCATATGACCGTAATGCTATTATTGTGAATGGT
CAAAGGAGAATTCTTGTTTCTGGATCTATTCACTACCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGG
CCGGATCTTATTCAGAAGGCCAAAGAAGGAGGGGTGGATGTGATTCAGACCTATGTTTTC
TGGAATGGGCATGAGCCTGAACAAGGCAAATATTACTTTGAAGAGAGGTATGATCTAGTG
AAGTTCATTAAGATAGTGCATCAAGCAGGTCTTTATGTGCATCTCAGGGTTGGACCTTAT
GCTTGTGCTGAATGGAATTTTGGGGGTTTTCCTGTTTGGTTGAAGTATGTTCCAGGCATC
AGTTTCAGAACAGATAATGAACCTTTCAAGTCTGCAATGCAAAAGTTCACTACCAAGATT
GTTAATATGATGAAAGCGGAACGGCTGTACGAATCACAGGGTGGCCCTATAATACTATCC
CAGATTGAGAATGAATATGGGCCAATTGAGAAGAGACTGGGTGAACCAGGTAAATCTTAC
TCAGACTGGGCAGCAAAAATGGCTTTGGATCTTGGTACTGGTGTACCTTGGGTCATGTGC
AAGCAAGATGATGCTCCAGATCCTGTTATCAACACTTGCAATGGTTTCTACTGTGACTAC
TTCTCACCAAATAAGGCTTATAAACCCAAGATATGGACTGAAGCTTGGACTGCCTGGTTC
ACTGAATTTGGAGGTCCAATTCCTTATCGTCCTGTTGAGGACTTGGCATTTGGGGTTGCT
AAATTCATACAGAACGGGGGATCATTCATCAATTACTACATGTATCATGGAGGAACAAAC
TTTGGTAGGACTGCTGGTGGCCCATTTATTGCTACTAGTTATGATTATGATGCACCACTT
GATGAATTTGGATTATTACGGCAACCTAAGTGGGGTCATCTGAAAGATCTGCATAGAGCA
ATAAAGCTTTGTGAACCAGCTTTAGTATCTGGCGATCCAACTGTGACATCCCTTGGAAAC
TTTCAAGAAGCTCATGTGTTTTCGTCAAAGTCTGGGGTGTGTGCTGCATTCCTTGCAAAC
TACAACCAACATTCTTTTGCTACAGTGACTTTTGGGAACAGGCATTATAACTTGCCACCT
TGGTCTATCAGCATTCTACCTGACTGCAAGAACACAGTTTATAATACTGCAAGGGTTGGT
GCTCAAAGTGCTCTGATGAAGATGACTCCAGCAGATAAAGGATTTTCTTGGCAGTCATAC
AATGACGAGCCATCATCTTATGAAGACAGTACTTTCACGGTTGTTGGGTTACTGGAGCAG
ATAAATACCACAAGAGATGTGTCTGATTATTTGTGGTATATGACCGATGTCAAGATTGAT
CCAAGCGAAGGGTTCTTGAGAAGCGGACAATGGCCATGGCTTAGAGTCTCTTCAGCTGGC
CCTGCTTTGCATGTTTTCGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGTATATGGAAGTTTAAAA
AGCCAGAAAATTACTTTCAATAAAGCAGTAAATCTAAGAGCTGGTGTAAACAAGATTTCT
CTGCTAAGCATTGCTGTTGGTCTTCCGAATATTGGCCCACATTTTGAGACATGGAATACT
GGTGTTCTTGGACCAGTTTCACTCAGTGGTCTTAACGAGGGGAAAAGAGATTTAGCTTGG
CAGAAATGGTCTTACAAGGTTGGTCTAAAAGGAGAAGCCTTGAATCTTCATTCGCTCAGT
GGCAGCTCATCTGTTGAGTGGGTTGAGGGCTCTTTGGTGACTCAAAGACAGCCTCTCACA
TGGTTCAAGACCACTTTCAATGCTCCAGCTGGAAATGAGCCTTTGGCTTTAGATATGAAT
ACCATGGGCAAAGGTCAAATGTGGATAAATGGACAAAGCCTTGGACGTTACTGGCCTGGA
TATAAATCATCTGGTACTTGTAGTGCCTGTAACTATGCAGGCTACTTTAATGAGAACAAG
TGCTTAAGTAACTGCGGAGAGGCCTCACAGAGATGGTATCACGTGCCACGTTCTTGGCTG
CATCCTACTGGAAACTTGTTAGTTGTATTTGAGGAATGGGGAGGAGATCCCAACGCAATC
TCTTTGGTCAAGAGAGAATTAGCAAGTGTCTGTGCAGATATAAATGAATGGCAACCACAG
TTGGTGAATTATAAGATGCAAGCATCTGGGGAAGTTGACAGGCCACTCAGGCCTAAAGCG
CACCTCCGTTGTGCTCCTGGTCAAAAGATCACTTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACA
CCAGTGGGGGTCTGTGGAAGCTTCAGTGAAGGAAGCTGTCGTGCCCACCACTCATACGAT
GCCTTTGAAAAGTATTGCATTGGGAAAGAGTCGTGTTCAGTACCTGTGACACCAGAAATT
TTTGGTGGTGATCCATGTCCAGGTGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAAGCTCTCTGCAGT
TGA