Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400012322
CDS Infomation

pacid=37468911 polypeptide=PGSC0003DMP400008566 locus=PGSC0003DMG400004828 ID=PGSC0003DMT400012322.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGGTGTAGATTACTTGGCTGATGAGAGGAAGAAAGCTGGATTTGATGTGGATGAG
ATGAAGATTGTTTGGGCTGGTTCTCGTCATGATTTTGAACTGACAGATCGTATCTCTAAG
CTTGTTGCTAATGATCCTGGCTTCAGTAAGGAGGGAAGAACTATGCTTCCTAGGAAAGAG
CTATTCAAGAACACTCTAAGGAAGGCAGCATATGCATGGAAACGGATCATTGAACTTCGT
CTATCTCAAGAGGAAGCCACTATGTTAAGGCGTTACGTAGATGAGCCTGCTTTTACTGAT
CTTCATTGGGGAATGTTTATACCTGCCTTAAAAGGACAGGGCACAGATAAACAGCAGGAA
AAGTGGCTGCCGTTGGCTTACAAGATGCAAATAATTGGCTGTTATGCTCAAACTGAACTT
GGTCATGGGTCCAATGTGCAAGGCCTTGAGACCACTGCCACATTTGATCCTCAAACAGAT
GAATTTGTCATTCATAGTCCAACATTGACGTCAAGCAAGTGGTGGCCTGGTGGATTGGGT
AAAGTATCTACCCATGCTGTTGTGTATGCTCGTCTTATAACAGATGGTAAAGACTATGGG
GTTAATGGTTTTATTGTCCAACTACGGAGTTTGGAGGACCACAAACCTCTTCCAGGTGTT
ACTGTTGGAGACATTGGAATGAAATTTGGGAATGGAGCATACAATTCCATGGATAATGGG
GTGTTAAGCTTTGATCATGTGCGCATTCCAAGAGATCAAATGTTGATGAGGGTTTCACAA
GTTACAAAGGAAGGAAAATATGTTCAATCTGATATTCCCCGACAACTTCTTTATGGGACT
ATGGTATATGTACGGCAATCAATTGTATCAGATGCTTCCCTTGCAATGTCTCGGGCTGTG
TGCATTGCAACCAGATACAGTGCCGTTCGTAGACAATTTGGCTCTCAGAATGGTGGACAA
GAAACTCAGGTGATTGACTACAAAACTCAGCAAAACAGGCTCTTCCCCTTGTTGGCTTCT
GCATATGCCTTCAGATTTGTTGGTGAGTGGCTGAAATGGTTGTACACTGATGTTACCCAA
AGACTTGCAGCAAATGATTTCTCAACATTGCCTGAGGCACATGCATGTACCGCAGGATTG
AAGTCTTTGACCACCAGTGCCACTGCTGATGGAATTGAAGAATGCCGAAAGTTATGTGGA
GGTCATGGTTATCTTTGTAGCAGTGGGCTTCCAGAATTATTTGCCGTTTATGTCCCTGCC
TGTACTTACGAAGGAGATAATGTCGTGCTACAGCTACAGGTTGCAAGGTTTCTTATGAAG
ACCGTTTCACAACTGGGCACTGGAAAGAAGCCAGTAGGTACCGTATCTTATATGGGAAGA
ATTGAACAGTTGATGCAATGTCGTTCTGATGTGAAACAAGCCGAGGACTGGCTGAAACCT
AGTGCAGTATTGGAGGCATTTGAAGCAAGGTCTGCCAGGATGTCTGTTGCCTGTGCTAAG
AATCTTAGCAAGTTTGAGAATCAAGAAGAAGGCTTTGCAGAACTAGCAGCTGATTTAGTT
GAAGCAGCAGTTGCTCATTGTCAATTAATTGTTGTGTCCAAGTATATCGAGAAGTTGCAA
CAAAACATTCCCGGTAAAGGGGTTAAGCAACAGCTGGAGGTGCTTTGTGGCATCTACTCG
CTCTTCCTTCTTCACAAACATCAAGGAGATTTTCTCGGGACAGGCTACATCACCTCAAAG
CAGGGGTCTCTTGCTAACGACCAGCTCAGAGCCTTGTATTCCCAGCTTCGTCCAAATGCT
ATATCGCTGGTTGATGCATTTAACTATACCGATCACTACCTTGATTCAATTCTTGGACGT
TATGATGGAAACGTGTATCCAAAACTGTATGAGGCTGCATGGAAGGATCCTCTCAACAAA
TCAGACATAGCAGATGGCTTCCACGAATATATTAGGCCACTACTCAAGCAGCAACTACGA
ACTGCTAAGCTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400008566
PEP Infomation

pacid=37468911 transcript=PGSC0003DMT400012322 locus=PGSC0003DMG400004828 ID=PGSC0003DMT400012322.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEGVDYLADERKKAGFDVDEMKIVWAGSRHDFELTDRISKLVANDPGFSKEGRTMLPRKE
LFKNTLRKAAYAWKRIIELRLSQEEATMLRRYVDEPAFTDLHWGMFIPALKGQGTDKQQE
KWLPLAYKMQIIGCYAQTELGHGSNVQGLETTATFDPQTDEFVIHSPTLTSSKWWPGGLG
KVSTHAVVYARLITDGKDYGVNGFIVQLRSLEDHKPLPGVTVGDIGMKFGNGAYNSMDNG
VLSFDHVRIPRDQMLMRVSQVTKEGKYVQSDIPRQLLYGTMVYVRQSIVSDASLAMSRAV
CIATRYSAVRRQFGSQNGGQETQVIDYKTQQNRLFPLLASAYAFRFVGEWLKWLYTDVTQ
RLAANDFSTLPEAHACTAGLKSLTTSATADGIEECRKLCGGHGYLCSSGLPELFAVYVPA
CTYEGDNVVLQLQVARFLMKTVSQLGTGKKPVGTVSYMGRIEQLMQCRSDVKQAEDWLKP
SAVLEAFEARSARMSVACAKNLSKFENQEEGFAELAADLVEAAVAHCQLIVVSKYIEKLQ
QNIPGKGVKQQLEVLCGIYSLFLLHKHQGDFLGTGYITSKQGSLANDQLRALYSQLRPNA
ISLVDAFNYTDHYLDSILGRYDGNVYPKLYEAAWKDPLNKSDIADGFHEYIRPLLKQQLR
TAKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400012322
Transcript Infomation

pacid=37468911 locus=PGSC0003DMG400004828 ID=PGSC0003DMT400012322.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGGTGTAGATTACTTGGCTGATGAGAGGAAGAAAGCTGGATTTGATGTGGATGAG
ATGAAGATTGTTTGGGCTGGTTCTCGTCATGATTTTGAACTGACAGATCGTATCTCTAAG
CTTGTTGCTAATGATCCTGGCTTCAGTAAGGAGGGAAGAACTATGCTTCCTAGGAAAGAG
CTATTCAAGAACACTCTAAGGAAGGCAGCATATGCATGGAAACGGATCATTGAACTTCGT
CTATCTCAAGAGGAAGCCACTATGTTAAGGCGTTACGTAGATGAGCCTGCTTTTACTGAT
CTTCATTGGGGAATGTTTATACCTGCCTTAAAAGGACAGGGCACAGATAAACAGCAGGAA
AAGTGGCTGCCGTTGGCTTACAAGATGCAAATAATTGGCTGTTATGCTCAAACTGAACTT
GGTCATGGGTCCAATGTGCAAGGCCTTGAGACCACTGCCACATTTGATCCTCAAACAGAT
GAATTTGTCATTCATAGTCCAACATTGACGTCAAGCAAGTGGTGGCCTGGTGGATTGGGT
AAAGTATCTACCCATGCTGTTGTGTATGCTCGTCTTATAACAGATGGTAAAGACTATGGG
GTTAATGGTTTTATTGTCCAACTACGGAGTTTGGAGGACCACAAACCTCTTCCAGGTGTT
ACTGTTGGAGACATTGGAATGAAATTTGGGAATGGAGCATACAATTCCATGGATAATGGG
GTGTTAAGCTTTGATCATGTGCGCATTCCAAGAGATCAAATGTTGATGAGGGTTTCACAA
GTTACAAAGGAAGGAAAATATGTTCAATCTGATATTCCCCGACAACTTCTTTATGGGACT
ATGGTATATGTACGGCAATCAATTGTATCAGATGCTTCCCTTGCAATGTCTCGGGCTGTG
TGCATTGCAACCAGATACAGTGCCGTTCGTAGACAATTTGGCTCTCAGAATGGTGGACAA
GAAACTCAGGTGATTGACTACAAAACTCAGCAAAACAGGCTCTTCCCCTTGTTGGCTTCT
GCATATGCCTTCAGATTTGTTGGTGAGTGGCTGAAATGGTTGTACACTGATGTTACCCAA
AGACTTGCAGCAAATGATTTCTCAACATTGCCTGAGGCACATGCATGTACCGCAGGATTG
AAGTCTTTGACCACCAGTGCCACTGCTGATGGAATTGAAGAATGCCGAAAGTTATGTGGA
GGTCATGGTTATCTTTGTAGCAGTGGGCTTCCAGAATTATTTGCCGTTTATGTCCCTGCC
TGTACTTACGAAGGAGATAATGTCGTGCTACAGCTACAGGTTGCAAGGTTTCTTATGAAG
ACCGTTTCACAACTGGGCACTGGAAAGAAGCCAGTAGGTACCGTATCTTATATGGGAAGA
ATTGAACAGTTGATGCAATGTCGTTCTGATGTGAAACAAGCCGAGGACTGGCTGAAACCT
AGTGCAGTATTGGAGGCATTTGAAGCAAGGTCTGCCAGGATGTCTGTTGCCTGTGCTAAG
AATCTTAGCAAGTTTGAGAATCAAGAAGAAGGCTTTGCAGAACTAGCAGCTGATTTAGTT
GAAGCAGCAGTTGCTCATTGTCAATTAATTGTTGTGTCCAAGTATATCGAGAAGTTGCAA
CAAAACATTCCCGGTAAAGGGGTTAAGCAACAGCTGGAGGTGCTTTGTGGCATCTACTCG
CTCTTCCTTCTTCACAAACATCAAGGAGATTTTCTCGGGACAGGCTACATCACCTCAAAG
CAGGGGTCTCTTGCTAACGACCAGCTCAGAGCCTTGTATTCCCAGCTTCGTCCAAATGCT
ATATCGCTGGTTGATGCATTTAACTATACCGATCACTACCTTGATTCAATTCTTGGACGT
TATGATGGAAACGTGTATCCAAAACTGTATGAGGCTGCATGGAAGGATCCTCTCAACAAA
TCAGACATAGCAGATGGCTTCCACGAATATATTAGGCCACTACTCAAGCAGCAACTACGA
ACTGCTAAGCTGTGA