Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400011063
CDS Infomation

pacid=37477509 polypeptide=PGSC0003DMP400007698 locus=PGSC0003DMG400004329 ID=PGSC0003DMT400011063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAAGGTACAAAGTTAGAGTACAATTCTGTAAGGAATTGCAAAATGAAAGGAAAA
GGTGGATTTAGAGCTTCTTCCTTCATCTATGGTTTTGTGGGATTAGACAACATTGGATTT
GTAGCAAACATGGTGAGCATGGTACTATACTTGTCATTCAAGATGCATTTCGACCTGAGT
GGTTCAGCCAACACGGTCACCAACTTGTTAGGCTCAACATATTTGCTCTCTATAATTGGT
GGTTTCATTTCTGATACTTACCTCAACAGATTCAACACCATTATCATTTTTGGAACTGCT
GAAATACTCGCATGGGCATTGATGACGATTCAAGCTCGTTACTCATTTTTGCAACCAAAG
GCAAATTCATTAGAAGGTGGAATAGCAGTATTGTTCTATGTATCAGTGTGTTTGTTAGCA
TTGGGTACTGGTGGTGTTAGGGGAGCTTTACCAGCATTGGGTGCAGATCAATTTGATGAG
AATAATTCAAAAGGAGCAGTTGGAAAATACTTCAACTGGCTATTGTTAAGCTCAGTGTCA
GGTTCAGCTATTGGTGTAACAATTATTGTTTGGATTAGCACTAATAAAGGTTGGTGGATG
GGTTTCCTCATTAGTTTTGCTACTACTTTTCTTGGTTTCATTATTTTTGTCTTTGGAAAG
CCATTCTATCAACTTCAACTTCCTGCTCAAACCCCACCACTTACAAGGATACTCCAGGTT
ATCGTTGCGGCGATCAGAAACCGAAAGCTGCAATTACCAGATAACCCTCAACAATTGTAT
GAGAAAGACTCAGATTCATCAGACCCAAAAATTGCTCATACTAATCAATTCAGGTGTTTA
GACAAAGCTGCAGTTGTTCCAAAAAGTGTTGAAATAACAGAATGGAGAGTTTGCACAGTG
AGTAAAGTGGAAGAAGTGAAAATAGTAACAAGAATGTTGCCTATAATAGGCAGCACCATT
ATAATGAACACATGTTTAGCACAGCTTCAAACATTCTCAGTCCAACAAGGTTATCGAATG
AATCGTCATTTTGGTTCCTTTGAAGTACCAGCACCATCAGTACCAGTCATTCCATTACTC
TTCATGTGTATTCTCATACCTATTTATGATTTATTATTCGTCCCATTTGCTCGTAAGATC
ACAAATCATCCCTCTGGAATCACACAACTACAACGTGTAGGCGTTGGATTAGTCCTATCC
ATCATATCTATGGGTATAGCTGCATTGGTTGAGATAAAAAGGAAGAATCAATCATTGAAA
AATCCATTGCAACCTATACATGTGTTTTGGCTATCTTTCCAATATGCAATATTTGGTATT
GCTGACATGTTTACATTAGTTGGAATGCTTGAGTTTTTCTACAAAGAAGCACCTATTGGA
ATGAGGTCACTTTCTACTTCATTTACATGGATTTCACTATCGTTTGGATACTTTTTGAGC
AGCGCGTTTGTTGACATTATCAACTCAGTTACTAAAAGAGTTTCTTCAAGTAAAAAAGGA
TGGTTGGATGGACAAGATTTGGATCAGAATAATTTGCAACTTTTCTATTGGTTTTTGGCT
ATTCTAAGTTGCCTCAACTTTATAAATTATATTTATTGGGCTTGTTGGTACAAGTATAAA
TCAGATGATCATCAGACCTCAGCTAATGATATTGTTTTGCCTAAATCAGCTTCTGTTAGT
AGGGTGCCATTTCTCAAGGTAGATCATGAAAATGATGTCACACTACAAGGATTGGAGGAT
CACAAGAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400007698
PEP Infomation

pacid=37477509 transcript=PGSC0003DMT400011063 locus=PGSC0003DMG400004329 ID=PGSC0003DMT400011063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MEEGTKLEYNSVRNCKMKGKGGFRASSFIYGFVGLDNIGFVANMVSMVLYLSFKMHFDLS
GSANTVTNLLGSTYLLSIIGGFISDTYLNRFNTIIIFGTAEILAWALMTIQARYSFLQPK
ANSLEGGIAVLFYVSVCLLALGTGGVRGALPALGADQFDENNSKGAVGKYFNWLLLSSVS
GSAIGVTIIVWISTNKGWWMGFLISFATTFLGFIIFVFGKPFYQLQLPAQTPPLTRILQV
IVAAIRNRKLQLPDNPQQLYEKDSDSSDPKIAHTNQFRCLDKAAVVPKSVEITEWRVCTV
SKVEEVKIVTRMLPIIGSTIIMNTCLAQLQTFSVQQGYRMNRHFGSFEVPAPSVPVIPLL
FMCILIPIYDLLFVPFARKITNHPSGITQLQRVGVGLVLSIISMGIAALVEIKRKNQSLK
NPLQPIHVFWLSFQYAIFGIADMFTLVGMLEFFYKEAPIGMRSLSTSFTWISLSFGYFLS
SAFVDIINSVTKRVSSSKKGWLDGQDLDQNNLQLFYWFLAILSCLNFINYIYWACWYKYK
SDDHQTSANDIVLPKSASVSRVPFLKVDHENDVTLQGLEDHKN*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400011063
Transcript Infomation

pacid=37477509 locus=PGSC0003DMG400004329 ID=PGSC0003DMT400011063.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGAGGAAGGTACAAAGTTAGAGTACAATTCTGTAAGGAATTGCAAAATGAAAGGAAAA
GGTGGATTTAGAGCTTCTTCCTTCATCTATGGTTTTGTGGGATTAGACAACATTGGATTT
GTAGCAAACATGGTGAGCATGGTACTATACTTGTCATTCAAGATGCATTTCGACCTGAGT
GGTTCAGCCAACACGGTCACCAACTTGTTAGGCTCAACATATTTGCTCTCTATAATTGGT
GGTTTCATTTCTGATACTTACCTCAACAGATTCAACACCATTATCATTTTTGGAACTGCT
GAAATACTCGCATGGGCATTGATGACGATTCAAGCTCGTTACTCATTTTTGCAACCAAAG
GCAAATTCATTAGAAGGTGGAATAGCAGTATTGTTCTATGTATCAGTGTGTTTGTTAGCA
TTGGGTACTGGTGGTGTTAGGGGAGCTTTACCAGCATTGGGTGCAGATCAATTTGATGAG
AATAATTCAAAAGGAGCAGTTGGAAAATACTTCAACTGGCTATTGTTAAGCTCAGTGTCA
GGTTCAGCTATTGGTGTAACAATTATTGTTTGGATTAGCACTAATAAAGGTTGGTGGATG
GGTTTCCTCATTAGTTTTGCTACTACTTTTCTTGGTTTCATTATTTTTGTCTTTGGAAAG
CCATTCTATCAACTTCAACTTCCTGCTCAAACCCCACCACTTACAAGGATACTCCAGGTT
ATCGTTGCGGCGATCAGAAACCGAAAGCTGCAATTACCAGATAACCCTCAACAATTGTAT
GAGAAAGACTCAGATTCATCAGACCCAAAAATTGCTCATACTAATCAATTCAGGTGTTTA
GACAAAGCTGCAGTTGTTCCAAAAAGTGTTGAAATAACAGAATGGAGAGTTTGCACAGTG
AGTAAAGTGGAAGAAGTGAAAATAGTAACAAGAATGTTGCCTATAATAGGCAGCACCATT
ATAATGAACACATGTTTAGCACAGCTTCAAACATTCTCAGTCCAACAAGGTTATCGAATG
AATCGTCATTTTGGTTCCTTTGAAGTACCAGCACCATCAGTACCAGTCATTCCATTACTC
TTCATGTGTATTCTCATACCTATTTATGATTTATTATTCGTCCCATTTGCTCGTAAGATC
ACAAATCATCCCTCTGGAATCACACAACTACAACGTGTAGGCGTTGGATTAGTCCTATCC
ATCATATCTATGGGTATAGCTGCATTGGTTGAGATAAAAAGGAAGAATCAATCATTGAAA
AATCCATTGCAACCTATACATGTGTTTTGGCTATCTTTCCAATATGCAATATTTGGTATT
GCTGACATGTTTACATTAGTTGGAATGCTTGAGTTTTTCTACAAAGAAGCACCTATTGGA
ATGAGGTCACTTTCTACTTCATTTACATGGATTTCACTATCGTTTGGATACTTTTTGAGC
AGCGCGTTTGTTGACATTATCAACTCAGTTACTAAAAGAGTTTCTTCAAGTAAAAAAGGA
TGGTTGGATGGACAAGATTTGGATCAGAATAATTTGCAACTTTTCTATTGGTTTTTGGCT
ATTCTAAGTTGCCTCAACTTTATAAATTATATTTATTGGGCTTGTTGGTACAAGTATAAA
TCAGATGATCATCAGACCTCAGCTAATGATATTGTTTTGCCTAAATCAGCTTCTGTTAGT
AGGGTGCCATTTCTCAAGGTAGATCATGAAAATGATGTCACACTACAAGGATTGGAGGAT
CACAAGAATTAA