Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400010965
CDS Infomation	pacid=37448978 polypeptide=PGSC0003DMP400007644 locus=PGSC0003DMG400004294 ID=PGSC0003DMT400010965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATAGACAAATCAAGAAACACAAATTTCACTATGATCAAACTCATCCTATACATGGA TTTAATTCACTACCTCAAGAAATTGTCCTTGACATAGCCTCAAGGCTTCCCATAACATCT TTAGTCCAATTCACATTGTCTTGCAAATCATTTTACAACATGTTACATGACATAGACCTT GTGAATATGCACAAGAATCGCGTAGTTGAGACCGATCCTTGCATTATTATACACGCGGAT TACCCTTTGAGGAATCAACTCTACTTTCTTGAATTCTCCAATCATCGCGATGTTATGAGG AAAATCAGGACACCTTTTGCAAACTATGTGCCTGAATTTAAAGTAGTTGGTTCATGTCAA GGACTATTATGCATATGTGATTCTTTGTTTAGTGATGCACTTTATGTGTACAATCCTTTT ACAAGGGATTACAAACAACTCCCTAGATCAATCGAATTCGAGGTACAAAAATTGGTTTTT GGTTTTGGATTTCATCCTGTTACTAAAGAGTATAAAGTGATCAAGATCATAAACTATGCC AACATGTATTATAATGAACCTGGACGTTATCGTAGGTTTCGAGTCCCTTTCTTTGGTAAA TCAGATGTTCAAGTACTTAGTCTTGGTACTAACAACAGATGGAGGAGTGTTGGAGAAGTT GTATATCGTTTTGATCCAAGTTCTCAAGGAATTCTGTTGAACGGGAAGATGCATTGGTTG ACTCGATTTGGTAAGTATCATGGACGTCGTGATAAGCTTATTGTTTCGTTTGATTTGGCT GACGACGTGTTTGGTGAAGTACCAAAAGTTGATTTTGATGTTAAGCCAAGAATTGTTCAG TATCATTTAGTAGTTCTTGGTGATTGTCTTGCTGTTGGTCTAACTTTGCCTCACTATAAA GGGGGAGGATTTGAAATTTGGGTAATGAGAGAATATAATGTGAAAGAATCTTGGATGAAA GAGTTTAGAATTGGGGCTTATACACCAAATCCAAATTGTGTAACACAACATGTGAAACCA TTGGTGAAAGTTTTATGTTTGTTGAAGAATGGAGAGATCTTGTTGGAGTACAAAGGTGGA AATCTTGTTTCATATGATCCTAAAAATTGTGTCTTTAGGACTTTAAGGTTTCAAGGGATG CCTAATTTGTTTCAAACATTTGTTCATGTTGGTTGTCTTAATTGGGTTGATATTCCACCT CATGATCTTTTACAAAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400007644
PEP Infomation	pacid=37448978 transcript=PGSC0003DMT400010965 locus=PGSC0003DMG400004294 ID=PGSC0003DMT400010965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MDRQIKKHKFHYDQTHPIHGFNSLPQEIVLDIASRLPITSLVQFTLSCKSFYNMLHDIDL VNMHKNRVVETDPCIIIHADYPLRNQLYFLEFSNHRDVMRKIRTPFANYVPEFKVVGSCQ GLLCICDSLFSDALYVYNPFTRDYKQLPRSIEFEVQKLVFGFGFHPVTKEYKVIKIINYA NMYYNEPGRYRRFRVPFFGKSDVQVLSLGTNNRWRSVGEVVYRFDPSSQGILLNGKMHWL TRFGKYHGRRDKLIVSFDLADDVFGEVPKVDFDVKPRIVQYHLVVLGDCLAVGLTLPHYK GGGFEIWVMREYNVKESWMKEFRIGAYTPNPNCVTQHVKPLVKVLCLLKNGEILLEYKGG NLVSYDPKNCVFRTLRFQGMPNLFQTFVHVGCLNWVDIPPHDLLQN*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400010965
Transcript Infomation	pacid=37448978 locus=PGSC0003DMG400004294 ID=PGSC0003DMT400010965.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGGATAGACAAATCAAGAAACACAAATTTCACTATGATCAAACTCATCCTATACATGGA TTTAATTCACTACCTCAAGAAATTGTCCTTGACATAGCCTCAAGGCTTCCCATAACATCT TTAGTCCAATTCACATTGTCTTGCAAATCATTTTACAACATGTTACATGACATAGACCTT GTGAATATGCACAAGAATCGCGTAGTTGAGACCGATCCTTGCATTATTATACACGCGGAT TACCCTTTGAGGAATCAACTCTACTTTCTTGAATTCTCCAATCATCGCGATGTTATGAGG AAAATCAGGACACCTTTTGCAAACTATGTGCCTGAATTTAAAGTAGTTGGTTCATGTCAA GGACTATTATGCATATGTGATTCTTTGTTTAGTGATGCACTTTATGTGTACAATCCTTTT ACAAGGGATTACAAACAACTCCCTAGATCAATCGAATTCGAGGTACAAAAATTGGTTTTT GGTTTTGGATTTCATCCTGTTACTAAAGAGTATAAAGTGATCAAGATCATAAACTATGCC AACATGTATTATAATGAACCTGGACGTTATCGTAGGTTTCGAGTCCCTTTCTTTGGTAAA TCAGATGTTCAAGTACTTAGTCTTGGTACTAACAACAGATGGAGGAGTGTTGGAGAAGTT GTATATCGTTTTGATCCAAGTTCTCAAGGAATTCTGTTGAACGGGAAGATGCATTGGTTG ACTCGATTTGGTAAGTATCATGGACGTCGTGATAAGCTTATTGTTTCGTTTGATTTGGCT GACGACGTGTTTGGTGAAGTACCAAAAGTTGATTTTGATGTTAAGCCAAGAATTGTTCAG TATCATTTAGTAGTTCTTGGTGATTGTCTTGCTGTTGGTCTAACTTTGCCTCACTATAAA GGGGGAGGATTTGAAATTTGGGTAATGAGAGAATATAATGTGAAAGAATCTTGGATGAAA GAGTTTAGAATTGGGGCTTATACACCAAATCCAAATTGTGTAACACAACATGTGAAACCA TTGGTGAAAGTTTTATGTTTGTTGAAGAATGGAGAGATCTTGTTGGAGTACAAAGGTGGA AATCTTGTTTCATATGATCCTAAAAATTGTGTCTTTAGGACTTTAAGGTTTCAAGGGATG CCTAATTTGTTTCAAACATTTGTTCATGTTGGTTGTCTTAATTGGGTTGATATTCCACCT CATGATCTTTTACAAAATTAG