Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID

PGSC0003DMT400010422
CDS Infomation

pacid=37450091 polypeptide=PGSC0003DMP400007270 locus=PGSC0003DMG400004071 ID=PGSC0003DMT400010422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGAAAAATTTGAGGAACAGGGCAAGCTTCCCGAGCTTAAACTTGATGCGAGGCAA
GCTCAAGGGTTTCTTTCATTCTTCAAAACCCTACCCAAGGATGTTAGGGCAGTTCGTCTC
TTCGATCGTCGGGACTATTATACTGCCCATGGAGATGATGCAACTTTCATTGCAAAGACA
TATTACCATACCACAACTGCTTTACGGCAGTTGGGTAATGGAGTTGGTGCTCTTTCCAGT
GTTAGTGTGAGTAGAAACATGTTTGAAACAATAGCTCGTGATATTCTCTTGGAGAGGATG
GATCGTACTCTTGAATTGTATGAGGGCAGTGGTTCAAACTGGAAACTGGTCAAAAGTGGA
ACCCCAGGAAATTTTGGAAGTTTTGAGGATATTCTGTTTGCTAATAATGAAATGCAAGAT
TCTCCAGCGATTGTTGCTCTTGCGCCAAAATTTGATCAGAATGGATGTACAGTTGGGTTA
GGTTATGTTGATATTACTAAGAGAGTCCTTGGTTTAGCAGAATTTCTAGATGATAGCCAC
TTCACCAATTTGGAGTCTGCTTTGGTTGCTCTTGGTTGCAGAGAATGTCTTGTACCAACA
GAGACTGGGAAATCCAGTGAGAGCAGGCCTCTATATGATGCAATATCGAGATGCGGGGTG
ATGGTAACTGAAAGAAAGAAAACTGAATTTAAAGGTAGGGATTTGGTACAGGATCTTGGT
AGGCTTGTCAAGGGTTCAGTAGAACCTGTTCGAGATCTAGTCTCTAGTTTTGAATGTGCA
GCAGGTGCTTTGGGGTGCATACTTTCCTATGCAGAACTACTTGCGGATGAGAGCAATTAT
GGAAACTTCACAGTCAAACAATACAACCTCAATAGTTACATGAGATTAGATTCTGCTGCT
ATGAGAGCACTGAATGTTATGGAGAGCAAATCAGATGCTAATAAAATTTTTAGCTTGTTT
GGTCTCATGAATAGAACCTGTACTGCTGGAATGGGTAAAAGGTTATTGCACATGTGGCTG
AAACAGCCGTTACTAGATGTAGATGAGATTAACTGTAGACTGGATTTAGTTCAAGCATTT
GTGGAGGATGCTGCACTTCGCCAAGATTTGAGGCAGCATCTGAAAAGAATTTCAGATATT
GAGCGGCTGACACACAATCTTGAGAGGAAAAGAGCCAGTTTATTGCACGTTGTAAAACTC
TATCAGTCAGGCATCAGAATACCATATATCAAAAGTGTTTTGGAACGTTATGATGGGCAA
TTTGCACCACTAATCAGGGAAAGGTATATTGATTCTCTTGAGAAATGGAGTGATGATAAT
CATCTGAATAAGTTCATTGCTCTTGTGGAGACTGCTGTTGACCTTGATCAACTTGAGAAT
GGAGAATACATGATTTCTTCTGCATATGACTCAAATTTATCTGCTCTGAAGGATGAGCAA
GAGACATTGGAGCAACAGATTCATAATTTGCACAAACAAACTGCCAATGATCTTGATCTA
CCTATTGATAAGTCTCTTAAATTAGATAAAGGAACACAATTTGGACATGTCTTCAGAATT
ACCAAGAAAGAAGAACCAAAAGTCAGGAGACAGCTAAATTCTCACTACATTGTTCTTGAA
ACACGTAAGGATGGGGTAAAGTTCACCAATACAAAACTCAAAAAACTAGGAGATCGGTAC
CAGAAGATCTTAGATGAGTATAAGAGCTGTCAGAAAGAACTGGTAGCTCGGGTAGTTCAA
ACAGTTGCGAGTTTCTCCGAGGTGTTTGAAGGTTTAGCTGGTTCACTTTCTGAGTTGGAT
GTGCTACTGAGTTTTGCGGATTTGGCTTCCAGTTGCCCAACTGCCTACTCAAGACCAAAT
ATCAGTCCACCAGATACGGGAGATATTATTCTTGAAGGGTGTAGACATCCTTGTGTGGAA
GCTCAAGACTGGGTCAACTTCATCCCTAATGACTGTAGACTAGTTAGGGGAGAAAGTTGG
TTTCAGATTATCACAGGCCCTAACATGGGTGGAAAGTCTACCTACATTCGTCAGGTTGGT
GTGAATGTCCTGATGGCCCAAGTTGGCTCATTTGTTCCATGTGACAATGCTACCATTTCT
ATTCGTGATTGCATTTTTGCTCGTGTTGGCGCTGGAGATTGCCAGCTGAAGGGGGTTTCT
ACTTTTATGCAAGAGATGCTTGAGACTGCATCGATCTTGAAAGGAGCTACTAATAGATCA
TTGATTATAATTGATGAGTTGGGCCGTGGGACGTCGACTTATGATGGCTTTGGTTTAGCT
TGGGCTATTTGTGAGCACATTGTTGAAGAAATTAAAGCACCAACATTGTTTGCAACTCAC
TTTCACGAGCTGACTGCATTGGCCAATGAGAATGGAAACAATGGACATAAGCAAATTGCC
GGTGTGGCAAATTTTCATGTCAGTGCACACATTGACTCTTCTAGTCGCAAGCTAACTATG
CTTTACAAGGTTCAACCCGGTGCTTGTGATCAAAGTTTTGGTATTCACGTTGCAGAGTTT
GCCAATTTTCCACAAAGTGTTGTGGCCCTGGCCAGAGAAAAGGCTTCTGAGTTGGAGGAT
TTCTCTCCTAATGCTATGATGCCAACTGACAGTAAAAAGGCAGTCTCAAAGCGGAAGAGG
GAATTTGACCCACATGATGTGTCTAGAGGTACTGCCCGAGCTCGTCAATTCTTACAGGAT
TTCACTCAGTTGCCTCTGGATAAGATGGATCTAAAGCAGGCCTTGCAACAGTTGAGCCAA
ATGAAGACCGACCTTGAGAAGAATGCAGTTGACAGTCAGTGGCTTCAGCAGTTCTTTAGT
TCTTCAGATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

PGSC0003DMP400007270
PEP Infomation

pacid=37450091 transcript=PGSC0003DMT400010422 locus=PGSC0003DMG400004071 ID=PGSC0003DMT400010422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

MDEKFEEQGKLPELKLDARQAQGFLSFFKTLPKDVRAVRLFDRRDYYTAHGDDATFIAKT
YYHTTTALRQLGNGVGALSSVSVSRNMFETIARDILLERMDRTLELYEGSGSNWKLVKSG
TPGNFGSFEDILFANNEMQDSPAIVALAPKFDQNGCTVGLGYVDITKRVLGLAEFLDDSH
FTNLESALVALGCRECLVPTETGKSSESRPLYDAISRCGVMVTERKKTEFKGRDLVQDLG
RLVKGSVEPVRDLVSSFECAAGALGCILSYAELLADESNYGNFTVKQYNLNSYMRLDSAA
MRALNVMESKSDANKIFSLFGLMNRTCTAGMGKRLLHMWLKQPLLDVDEINCRLDLVQAF
VEDAALRQDLRQHLKRISDIERLTHNLERKRASLLHVVKLYQSGIRIPYIKSVLERYDGQ
FAPLIRERYIDSLEKWSDDNHLNKFIALVETAVDLDQLENGEYMISSAYDSNLSALKDEQ
ETLEQQIHNLHKQTANDLDLPIDKSLKLDKGTQFGHVFRITKKEEPKVRRQLNSHYIVLE
TRKDGVKFTNTKLKKLGDRYQKILDEYKSCQKELVARVVQTVASFSEVFEGLAGSLSELD
VLLSFADLASSCPTAYSRPNISPPDTGDIILEGCRHPCVEAQDWVNFIPNDCRLVRGESW
FQIITGPNMGGKSTYIRQVGVNVLMAQVGSFVPCDNATISIRDCIFARVGAGDCQLKGVS
TFMQEMLETASILKGATNRSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAICEHIVEEIKAPTLFATH
FHELTALANENGNNGHKQIAGVANFHVSAHIDSSSRKLTMLYKVQPGACDQSFGIHVAEF
ANFPQSVVALAREKASELEDFSPNAMMPTDSKKAVSKRKREFDPHDVSRGTARARQFLQD
FTQLPLDKMDLKQALQQLSQMKTDLEKNAVDSQWLQQFFSSSD*

Transcript Sequence

Transcript ID

PGSC0003DMT400010422
Transcript Infomation

pacid=37450091 locus=PGSC0003DMG400004071 ID=PGSC0003DMT400010422.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence

ATGGATGAAAAATTTGAGGAACAGGGCAAGCTTCCCGAGCTTAAACTTGATGCGAGGCAA
GCTCAAGGGTTTCTTTCATTCTTCAAAACCCTACCCAAGGATGTTAGGGCAGTTCGTCTC
TTCGATCGTCGGGACTATTATACTGCCCATGGAGATGATGCAACTTTCATTGCAAAGACA
TATTACCATACCACAACTGCTTTACGGCAGTTGGGTAATGGAGTTGGTGCTCTTTCCAGT
GTTAGTGTGAGTAGAAACATGTTTGAAACAATAGCTCGTGATATTCTCTTGGAGAGGATG
GATCGTACTCTTGAATTGTATGAGGGCAGTGGTTCAAACTGGAAACTGGTCAAAAGTGGA
ACCCCAGGAAATTTTGGAAGTTTTGAGGATATTCTGTTTGCTAATAATGAAATGCAAGAT
TCTCCAGCGATTGTTGCTCTTGCGCCAAAATTTGATCAGAATGGATGTACAGTTGGGTTA
GGTTATGTTGATATTACTAAGAGAGTCCTTGGTTTAGCAGAATTTCTAGATGATAGCCAC
TTCACCAATTTGGAGTCTGCTTTGGTTGCTCTTGGTTGCAGAGAATGTCTTGTACCAACA
GAGACTGGGAAATCCAGTGAGAGCAGGCCTCTATATGATGCAATATCGAGATGCGGGGTG
ATGGTAACTGAAAGAAAGAAAACTGAATTTAAAGGTAGGGATTTGGTACAGGATCTTGGT
AGGCTTGTCAAGGGTTCAGTAGAACCTGTTCGAGATCTAGTCTCTAGTTTTGAATGTGCA
GCAGGTGCTTTGGGGTGCATACTTTCCTATGCAGAACTACTTGCGGATGAGAGCAATTAT
GGAAACTTCACAGTCAAACAATACAACCTCAATAGTTACATGAGATTAGATTCTGCTGCT
ATGAGAGCACTGAATGTTATGGAGAGCAAATCAGATGCTAATAAAATTTTTAGCTTGTTT
GGTCTCATGAATAGAACCTGTACTGCTGGAATGGGTAAAAGGTTATTGCACATGTGGCTG
AAACAGCCGTTACTAGATGTAGATGAGATTAACTGTAGACTGGATTTAGTTCAAGCATTT
GTGGAGGATGCTGCACTTCGCCAAGATTTGAGGCAGCATCTGAAAAGAATTTCAGATATT
GAGCGGCTGACACACAATCTTGAGAGGAAAAGAGCCAGTTTATTGCACGTTGTAAAACTC
TATCAGTCAGGCATCAGAATACCATATATCAAAAGTGTTTTGGAACGTTATGATGGGCAA
TTTGCACCACTAATCAGGGAAAGGTATATTGATTCTCTTGAGAAATGGAGTGATGATAAT
CATCTGAATAAGTTCATTGCTCTTGTGGAGACTGCTGTTGACCTTGATCAACTTGAGAAT
GGAGAATACATGATTTCTTCTGCATATGACTCAAATTTATCTGCTCTGAAGGATGAGCAA
GAGACATTGGAGCAACAGATTCATAATTTGCACAAACAAACTGCCAATGATCTTGATCTA
CCTATTGATAAGTCTCTTAAATTAGATAAAGGAACACAATTTGGACATGTCTTCAGAATT
ACCAAGAAAGAAGAACCAAAAGTCAGGAGACAGCTAAATTCTCACTACATTGTTCTTGAA
ACACGTAAGGATGGGGTAAAGTTCACCAATACAAAACTCAAAAAACTAGGAGATCGGTAC
CAGAAGATCTTAGATGAGTATAAGAGCTGTCAGAAAGAACTGGTAGCTCGGGTAGTTCAA
ACAGTTGCGAGTTTCTCCGAGGTGTTTGAAGGTTTAGCTGGTTCACTTTCTGAGTTGGAT
GTGCTACTGAGTTTTGCGGATTTGGCTTCCAGTTGCCCAACTGCCTACTCAAGACCAAAT
ATCAGTCCACCAGATACGGGAGATATTATTCTTGAAGGGTGTAGACATCCTTGTGTGGAA
GCTCAAGACTGGGTCAACTTCATCCCTAATGACTGTAGACTAGTTAGGGGAGAAAGTTGG
TTTCAGATTATCACAGGCCCTAACATGGGTGGAAAGTCTACCTACATTCGTCAGGTTGGT
GTGAATGTCCTGATGGCCCAAGTTGGCTCATTTGTTCCATGTGACAATGCTACCATTTCT
ATTCGTGATTGCATTTTTGCTCGTGTTGGCGCTGGAGATTGCCAGCTGAAGGGGGTTTCT
ACTTTTATGCAAGAGATGCTTGAGACTGCATCGATCTTGAAAGGAGCTACTAATAGATCA
TTGATTATAATTGATGAGTTGGGCCGTGGGACGTCGACTTATGATGGCTTTGGTTTAGCT
TGGGCTATTTGTGAGCACATTGTTGAAGAAATTAAAGCACCAACATTGTTTGCAACTCAC
TTTCACGAGCTGACTGCATTGGCCAATGAGAATGGAAACAATGGACATAAGCAAATTGCC
GGTGTGGCAAATTTTCATGTCAGTGCACACATTGACTCTTCTAGTCGCAAGCTAACTATG
CTTTACAAGGTTCAACCCGGTGCTTGTGATCAAAGTTTTGGTATTCACGTTGCAGAGTTT
GCCAATTTTCCACAAAGTGTTGTGGCCCTGGCCAGAGAAAAGGCTTCTGAGTTGGAGGAT
TTCTCTCCTAATGCTATGATGCCAACTGACAGTAAAAAGGCAGTCTCAAAGCGGAAGAGG
GAATTTGACCCACATGATGTGTCTAGAGGTACTGCCCGAGCTCGTCAATTCTTACAGGAT
TTCACTCAGTTGCCTCTGGATAAGATGGATCTAAAGCAGGCCTTGCAACAGTTGAGCCAA
ATGAAGACCGACCTTGAGAAGAATGCAGTTGACAGTCAGTGGCTTCAGCAGTTCTTTAGT
TCTTCAGATTAG