Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum tuberosum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum tuberosum

CDS Sequence

CDS ID	PGSC0003DMT400010281
CDS Infomation	pacid=37428809 polypeptide=PGSC0003DMP400007169 locus=PGSC0003DMG401004019 ID=PGSC0003DMT400010281.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCGGAGAGGAAGCTTGTGGTTTTAGGCATCCCATGGGACGTGGATACAGAAGGTCTA AGGGAATATATGATCAAATATGGAGACTTGGAGGACTGTATTGTGATGAAGGAACGTGCT ACTGGTCGTTCTCGTGGATTCGGCTATGTCACATTTGCTACAGTTGAGGATGCTAAGAAT GCATTGTCTAAGGAGCACTTTCTTGGAAACAGAATGCTAGAAGTGAAAGTGGCGACACCG AAGGAGGAGATGAGGGCTCCTGCAAAGAAAGTGACCAGGATTTTCGTTGCTAGGATTCCT CCGTCTGTGTCTGAAGCTACTTTCAGAGGTTATTTTGAGAAGTACGGTGAAATAACAGAT CTATACATGCCAAAGGATCCATCTACCAAGGGACATCGTGGAATTGGGTTTATTACTTTT GCAAATGCTGAATCAGTTGATGATCTGATGAATGACACCCACGAACTGGGAGGTTCCACA ATTGTGGTTGACCGAGCAACACCCAAGGAAGAAGATTTCAGACCTGTTAGTCGGATGTCT CAGGGTGGAGGAGGATATGGTGCATATAATGCATATATGAGTGCAACTACTAGATATGGT GCGCTTGGTGCTCCCACCTTATATGATCATCCTAGTTCTATGTATGGAAGAGGAGGAGGA GGTGGAGGATTTCCATCTCGTGGCGGCATGGGCCAGAAGATCTTTGTTGGTCGACTACCT CAAGAGGCAACAACTGAAGATCTTCGCCAGTATTTTGGTAGATTTGGCCGTGTTTTAGAT GTATATGTCCCAAAGGATCCAAGAAGACCAGGGCACAGAGGGTTCGGTTTTGTCACATTT GCTGATGATGGTGTTGCAGATCGTGTTTCTAGAAGGCCTCATGAGATATGTGGACATCAG GTTGCAATCGATTCTGCTACTCCCCTTGATGATGCTGGTCCAAGTAATAATTACATGATG GATCCTCCTCCTCCTGCTCCTGAAGCATATGGGGGATATGGTGGTCCTATGCGTACTTAT GGAAGGATGTATGGGGGCCTAGATTATGATGATTGGGGTTACGGCCTGGGTGGTGGGAGA CCTTCAAGATCAGATATGAGATACAGGCCCTACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	PGSC0003DMP400007169
PEP Infomation	pacid=37428809 transcript=PGSC0003DMT400010281 locus=PGSC0003DMG401004019 ID=PGSC0003DMT400010281.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	MSERKLVVLGIPWDVDTEGLREYMIKYGDLEDCIVMKERATGRSRGFGYVTFATVEDAKN ALSKEHFLGNRMLEVKVATPKEEMRAPAKKVTRIFVARIPPSVSEATFRGYFEKYGEITD LYMPKDPSTKGHRGIGFITFANAESVDDLMNDTHELGGSTIVVDRATPKEEDFRPVSRMS QGGGGYGAYNAYMSATTRYGALGAPTLYDHPSSMYGRGGGGGGFPSRGGMGQKIFVGRLP QEATTEDLRQYFGRFGRVLDVYVPKDPRRPGHRGFGFVTFADDGVADRVSRRPHEICGHQ VAIDSATPLDDAGPSNNYMMDPPPPAPEAYGGYGGPMRTYGRMYGGLDYDDWGYGLGGGR PSRSDMRYRPY*

Transcript Sequence

Transcript ID	PGSC0003DMT400010281
Transcript Infomation	pacid=37428809 locus=PGSC0003DMG401004019 ID=PGSC0003DMT400010281.v4.03 annot-version=v4.03
Sequence	ATGTCGGAGAGGAAGCTTGTGGTTTTAGGCATCCCATGGGACGTGGATACAGAAGGTCTA AGGGAATATATGATCAAATATGGAGACTTGGAGGACTGTATTGTGATGAAGGAACGTGCT ACTGGTCGTTCTCGTGGATTCGGCTATGTCACATTTGCTACAGTTGAGGATGCTAAGAAT GCATTGTCTAAGGAGCACTTTCTTGGAAACAGAATGCTAGAAGTGAAAGTGGCGACACCG AAGGAGGAGATGAGGGCTCCTGCAAAGAAAGTGACCAGGATTTTCGTTGCTAGGATTCCT CCGTCTGTGTCTGAAGCTACTTTCAGAGGTTATTTTGAGAAGTACGGTGAAATAACAGAT CTATACATGCCAAAGGATCCATCTACCAAGGGACATCGTGGAATTGGGTTTATTACTTTT GCAAATGCTGAATCAGTTGATGATCTGATGAATGACACCCACGAACTGGGAGGTTCCACA ATTGTGGTTGACCGAGCAACACCCAAGGAAGAAGATTTCAGACCTGTTAGTCGGATGTCT CAGGGTGGAGGAGGATATGGTGCATATAATGCATATATGAGTGCAACTACTAGATATGGT GCGCTTGGTGCTCCCACCTTATATGATCATCCTAGTTCTATGTATGGAAGAGGAGGAGGA GGTGGAGGATTTCCATCTCGTGGCGGCATGGGCCAGAAGATCTTTGTTGGTCGACTACCT CAAGAGGCAACAACTGAAGATCTTCGCCAGTATTTTGGTAGATTTGGCCGTGTTTTAGAT GTATATGTCCCAAAGGATCCAAGAAGACCAGGGCACAGAGGGTTCGGTTTTGTCACATTT GCTGATGATGGTGTTGCAGATCGTGTTTCTAGAAGGCCTCATGAGATATGTGGACATCAG GTTGCAATCGATTCTGCTACTCCCCTTGATGATGCTGGTCCAAGTAATAATTACATGATG GATCCTCCTCCTCCTGCTCCTGAAGCATATGGGGGATATGGTGGTCCTATGCGTACTTAT GGAAGGATGTATGGGGGCCTAGATTATGATGATTGGGGTTACGGCCTGGGTGGTGGGAGA CCTTCAAGATCAGATATGAGATACAGGCCCTACTAG